3NAI - Sequence, Chains, Asymmetric and Biological Units

• Title: CRYSTAL STRUCTURES AND FUNCTIONAL ANALYSIS OF MURINE NOROVIR DEPENDENT RNA POLYMERASE
• Keywords: RNA-DEPENDENT RNA POLYMERASE, MURINE NOROVIRUS, TRANSFERASE
• Experiment: X-ray diffraction
• Number of Models: 1

Database	ID code	Status	Coordinate files
			Header	Asymmetric unit	Biological unit
PDB	3NAI	released	available	available	Quaternary Structure Server

Asymmetric unit from PDB

Unit	Type	Name	Chain ID	Residues	Atoms	Hetatoms
1	Protein	RNA DEPENDENT RNA POLYMERASE	A	486	3857	0
2	Protein	RNA DEPENDENT RNA POLYMERASE	B	486	3857	0
3	Protein	RNA DEPENDENT RNA POLYMERASE	C	486	3857	0
4	Ligand	RNA DEPENDENT RNA POLYMERASE	A	11	0	48
5	Ligand	RNA DEPENDENT RNA POLYMERASE	B	9	0	37
6	Ligand	RNA DEPENDENT RNA POLYMERASE	C	8	0	33
7	Water			348	0	348
total				1834	11571	466

Proteins

Unit 1	ARG 7 PRO 8 SER 9 GLY 10 THR 11 TYR 12 ALA 13 GLY 14 LEU 15 PRO 16 ILE 17 ALA 18 ASP 19 TYR 20 GLY 21 ASP 22 ALA 23 PRO 24 PRO 25 LEU 26 SER 27 THR 28 LYS 29 THR 30 MET 31 PHE 32 TRP 33 ARG 34 THR 35 SER 36 PRO 37 GLU 38 LYS 39 LEU 40 PRO 41 PRO 42 GLY 43 ALA 44 TRP 45 GLU 46 PRO 47 ALA 48 TYR 49 LEU 50 GLY 51 SER 52 LYS 53 ASP 54 GLU 55 ARG 56 VAL 57 ASP 58 GLY 59 PRO 60 SER 61 LEU 62 GLN 63 GLN 64 VAL 65 MET 66 ARG 67 ASP 68 GLN 69 LEU 70 LYS 71 PRO 72 TYR 73 SER 74 GLU 75 PRO 76 ARG 77 GLY 78 LEU 79 LEU 80 PRO 81 PRO 82 GLN 83 GLU 84 ILE 85 LEU 86 ASP 87 ALA 88 VAL 89 CYS 90 ASP 91 ALA 92 ILE 93 GLU 94 ASN 95 ARG 96 LEU 97 GLU 98 ASN 99 THR 100 LEU 101 GLU 102 PRO 103 GLN 104 LYS 105 PRO 106 TRP 107 THR 108 PHE 109 LYS 110 LYS 111 ALA 112 CYS 113 GLU 114 SER 115 LEU 116 ASP 117 LYS 118 ASN 119 THR 120 SER 121 SER 122 GLY 123 TYR 124 PRO 125 TYR 126 HIS 127 LYS 128 GLN 129 LYS 130 SER 131 LYS 132 ASP 133 TRP 134 THR 135 GLY 136 SER 137 ALA 138 PHE 139 ILE 140 GLY 141 ASP 142 LEU 143 GLY 144 ASP 145 GLN 146 ALA 147 THR 148 HIS 149 ALA 150 ASN 151 ASN 152 MET 153 TYR 154 GLU 155 MET 156 GLY 157 LYS 158 SER 159 MET 160 ARG 161 PRO 162 ILE 163 TYR 164 THR 165 ALA 166 ALA 167 LEU 168 LYS 169 ASP 170 GLU 171 LEU 172 VAL 173 LYS 174 PRO 175 ASP 176 LYS 177 ILE 178 TYR 179 GLY 180 LYS 181 ILE 182 LYS 183 LYS 184 ARG 185 LEU 186 LEU 187 TRP 188 GLY 189 SER 190 ASP 191 LEU 192 GLY 193 THR 194 MET 195 ILE 196 ARG 197 ALA 198 ALA 199 ARG 200 ALA 201 PHE 202 GLY 203 PRO 204 PHE 205 CYS 206 ASP 207 ALA 208 LEU 209 LYS 210 GLU 211 THR 212 CYS 213 ILE 214 PHE 215 ASN 216 PRO 217 ILE 218 ARG 219 VAL 220 GLY 221 MET 222 SER 223 MET 224 ASN 225 GLU 226 ASP 227 GLY 228 PRO 229 PHE 230 ILE 231 PHE 232 ALA 233 ARG 234 HIS 235 ALA 236 ASN 237 PHE 238 ARG 239 TYR 240 HIS 241 MET 242 ASP 243 ALA 244 ASP 245 TYR 246 THR 247 ARG 248 TRP 249 ASP 250 SER 251 THR 252 GLN 253 GLN 254 ARG 255 ALA 256 ILE 257 LEU 258 LYS 259 ARG 260 ALA 261 GLY 262 ASP 263 ILE 264 MET 265 VAL 266 ARG 267 LEU 268 SER 269 PRO 270 GLU 271 PRO 272 ASP 273 LEU 274 ALA 275 ARG 276 VAL 277 VAL 278 MET 279 ASP 280 ASP 281 LEU 282 LEU 283 ALA 284 PRO 285 SER 286 LEU 287 LEU 288 ASP 289 VAL 290 GLY 291 ASP 292 TYR 293 LYS 294 ILE 295 VAL 296 VAL 297 GLU 298 GLU 299 GLY 300 LEU 301 PRO 302 SER 303 GLY 304 CYS 305 PRO 306 CYS 307 THR 308 THR 309 GLN 310 LEU 311 ASN 312 SER 313 LEU 314 ALA 315 HIS 316 TRP 317 ILE 318 LEU 319 THR 320 LEU 321 CYS 322 ALA 323 MET 324 VAL 325 GLU 326 VAL 327 THR 328 ARG 329 VAL 330 ASP 331 PRO 332 ASP 333 ILE 334 VAL 335 MET 336 GLN 337 GLU 338 SER 339 GLU 340 PHE 341 SER 342 PHE 343 TYR 344 GLY 345 ASP 346 ASP 347 GLU 348 VAL 349 VAL 350 SER 351 THR 352 ASN 353 LEU 354 GLU 355 LEU 356 ASP 357 MET 358 VAL 359 LYS 360 TYR 361 THR 362 MET 363 ALA 364 LEU 365 ARG 366 ARG 367 TYR 368 GLY 369 LEU 370 LEU 371 PRO 372 THR 373 ARG 374 ALA 375 ASP 376 LYS 377 GLU 378 GLU 379 GLY 380 PRO 381 LEU 382 GLU 383 ARG 384 ARG 385 GLN 386 THR 387 LEU 388 GLN 389 GLY 390 ILE 391 SER 392 PHE 393 LEU 394 ARG 395 ARG 396 ALA 397 ILE 398 VAL 399 GLY 400 ASP 401 GLN 402 PHE 403 GLY 404 TRP 405 TYR 406 GLY 407 ARG 408 LEU 409 ASP 410 ARG 411 ALA 412 SER 413 ILE 414 ASP 415 ARG 416 GLN 417 LEU 418 LEU 419 TRP 420 THR 421 LYS 422 GLY 423 PRO 424 ASN 425 HIS 426 GLN 427 ASN 428 PRO 429 PHE 430 GLU 431 THR 432 LEU 433 PRO 434 GLY 435 HIS 436 ALA 437 GLN 438 ARG 439 PRO 440 SER 441 GLN 442 LEU 443 MET 444 ALA 445 LEU 446 LEU 447 GLY 448 GLU 449 ALA 450 ALA 451 MET 452 HIS 453 GLY 454 GLU 455 LYS 456 TYR 457 TYR 458 ARG 459 THR 460 VAL 461 ALA 462 SER 463 ARG 464 VAL 465 SER 466 LYS 467 GLU 468 ALA 469 ALA 470 GLN 471 SER 472 GLY 473 ILE 474 GLU 475 MET 476 VAL 477 VAL 478 PRO 479 ARG 480 HIS 481 ARG 482 SER 483 VAL 484 LEU 485 ARG 486 TRP 487 VAL 488 ARG 489 PHE 490 GLY 491 THR 492
Unit 2	ARG 7 PRO 8 SER 9 GLY 10 THR 11 TYR 12 ALA 13 GLY 14 LEU 15 PRO 16 ILE 17 ALA 18 ASP 19 TYR 20 GLY 21 ASP 22 ALA 23 PRO 24 PRO 25 LEU 26 SER 27 THR 28 LYS 29 THR 30 MET 31 PHE 32 TRP 33 ARG 34 THR 35 SER 36 PRO 37 GLU 38 LYS 39 LEU 40 PRO 41 PRO 42 GLY 43 ALA 44 TRP 45 GLU 46 PRO 47 ALA 48 TYR 49 LEU 50 GLY 51 SER 52 LYS 53 ASP 54 GLU 55 ARG 56 VAL 57 ASP 58 GLY 59 PRO 60 SER 61 LEU 62 GLN 63 GLN 64 VAL 65 MET 66 ARG 67 ASP 68 GLN 69 LEU 70 LYS 71 PRO 72 TYR 73 SER 74 GLU 75 PRO 76 ARG 77 GLY 78 LEU 79 LEU 80 PRO 81 PRO 82 GLN 83 GLU 84 ILE 85 LEU 86 ASP 87 ALA 88 VAL 89 CYS 90 ASP 91 ALA 92 ILE 93 GLU 94 ASN 95 ARG 96 LEU 97 GLU 98 ASN 99 THR 100 LEU 101 GLU 102 PRO 103 GLN 104 LYS 105 PRO 106 TRP 107 THR 108 PHE 109 LYS 110 LYS 111 ALA 112 CYS 113 GLU 114 SER 115 LEU 116 ASP 117 LYS 118 ASN 119 THR 120 SER 121 SER 122 GLY 123 TYR 124 PRO 125 TYR 126 HIS 127 LYS 128 GLN 129 LYS 130 SER 131 LYS 132 ASP 133 TRP 134 THR 135 GLY 136 SER 137 ALA 138 PHE 139 ILE 140 GLY 141 ASP 142 LEU 143 GLY 144 ASP 145 GLN 146 ALA 147 THR 148 HIS 149 ALA 150 ASN 151 ASN 152 MET 153 TYR 154 GLU 155 MET 156 GLY 157 LYS 158 SER 159 MET 160 ARG 161 PRO 162 ILE 163 TYR 164 THR 165 ALA 166 ALA 167 LEU 168 LYS 169 ASP 170 GLU 171 LEU 172 VAL 173 LYS 174 PRO 175 ASP 176 LYS 177 ILE 178 TYR 179 GLY 180 LYS 181 ILE 182 LYS 183 LYS 184 ARG 185 LEU 186 LEU 187 TRP 188 GLY 189 SER 190 ASP 191 LEU 192 GLY 193 THR 194 MET 195 ILE 196 ARG 197 ALA 198 ALA 199 ARG 200 ALA 201 PHE 202 GLY 203 PRO 204 PHE 205 CYS 206 ASP 207 ALA 208 LEU 209 LYS 210 GLU 211 THR 212 CYS 213 ILE 214 PHE 215 ASN 216 PRO 217 ILE 218 ARG 219 VAL 220 GLY 221 MET 222 SER 223 MET 224 ASN 225 GLU 226 ASP 227 GLY 228 PRO 229 PHE 230 ILE 231 PHE 232 ALA 233 ARG 234 HIS 235 ALA 236 ASN 237 PHE 238 ARG 239 TYR 240 HIS 241 MET 242 ASP 243 ALA 244 ASP 245 TYR 246 THR 247 ARG 248 TRP 249 ASP 250 SER 251 THR 252 GLN 253 GLN 254 ARG 255 ALA 256 ILE 257 LEU 258 LYS 259 ARG 260 ALA 261 GLY 262 ASP 263 ILE 264 MET 265 VAL 266 ARG 267 LEU 268 SER 269 PRO 270 GLU 271 PRO 272 ASP 273 LEU 274 ALA 275 ARG 276 VAL 277 VAL 278 MET 279 ASP 280 ASP 281 LEU 282 LEU 283 ALA 284 PRO 285 SER 286 LEU 287 LEU 288 ASP 289 VAL 290 GLY 291 ASP 292 TYR 293 LYS 294 ILE 295 VAL 296 VAL 297 GLU 298 GLU 299 GLY 300 LEU 301 PRO 302 SER 303 GLY 304 CYS 305 PRO 306 CYS 307 THR 308 THR 309 GLN 310 LEU 311 ASN 312 SER 313 LEU 314 ALA 315 HIS 316 TRP 317 ILE 318 LEU 319 THR 320 LEU 321 CYS 322 ALA 323 MET 324 VAL 325 GLU 326 VAL 327 THR 328 ARG 329 VAL 330 ASP 331 PRO 332 ASP 333 ILE 334 VAL 335 MET 336 GLN 337 GLU 338 SER 339 GLU 340 PHE 341 SER 342 PHE 343 TYR 344 GLY 345 ASP 346 ASP 347 GLU 348 VAL 349 VAL 350 SER 351 THR 352 ASN 353 LEU 354 GLU 355 LEU 356 ASP 357 MET 358 VAL 359 LYS 360 TYR 361 THR 362 MET 363 ALA 364 LEU 365 ARG 366 ARG 367 TYR 368 GLY 369 LEU 370 LEU 371 PRO 372 THR 373 ARG 374 ALA 375 ASP 376 LYS 377 GLU 378 GLU 379 GLY 380 PRO 381 LEU 382 GLU 383 ARG 384 ARG 385 GLN 386 THR 387 LEU 388 GLN 389 GLY 390 ILE 391 SER 392 PHE 393 LEU 394 ARG 395 ARG 396 ALA 397 ILE 398 VAL 399 GLY 400 ASP 401 GLN 402 PHE 403 GLY 404 TRP 405 TYR 406 GLY 407 ARG 408 LEU 409 ASP 410 ARG 411 ALA 412 SER 413 ILE 414 ASP 415 ARG 416 GLN 417 LEU 418 LEU 419 TRP 420 THR 421 LYS 422 GLY 423 PRO 424 ASN 425 HIS 426 GLN 427 ASN 428 PRO 429 PHE 430 GLU 431 THR 432 LEU 433 PRO 434 GLY 435 HIS 436 ALA 437 GLN 438 ARG 439 PRO 440 SER 441 GLN 442 LEU 443 MET 444 ALA 445 LEU 446 LEU 447 GLY 448 GLU 449 ALA 450 ALA 451 MET 452 HIS 453 GLY 454 GLU 455 LYS 456 TYR 457 TYR 458 ARG 459 THR 460 VAL 461 ALA 462 SER 463 ARG 464 VAL 465 SER 466 LYS 467 GLU 468 ALA 469 ALA 470 GLN 471 SER 472 GLY 473 ILE 474 GLU 475 MET 476 VAL 477 VAL 478 PRO 479 ARG 480 HIS 481 ARG 482 SER 483 VAL 484 LEU 485 ARG 486 TRP 487 VAL 488 ARG 489 PHE 490 GLY 491 THR 492
Unit 3	ARG 7 PRO 8 SER 9 GLY 10 THR 11 TYR 12 ALA 13 GLY 14 LEU 15 PRO 16 ILE 17 ALA 18 ASP 19 TYR 20 GLY 21 ASP 22 ALA 23 PRO 24 PRO 25 LEU 26 SER 27 THR 28 LYS 29 THR 30 MET 31 PHE 32 TRP 33 ARG 34 THR 35 SER 36 PRO 37 GLU 38 LYS 39 LEU 40 PRO 41 PRO 42 GLY 43 ALA 44 TRP 45 GLU 46 PRO 47 ALA 48 TYR 49 LEU 50 GLY 51 SER 52 LYS 53 ASP 54 GLU 55 ARG 56 VAL 57 ASP 58 GLY 59 PRO 60 SER 61 LEU 62 GLN 63 GLN 64 VAL 65 MET 66 ARG 67 ASP 68 GLN 69 LEU 70 LYS 71 PRO 72 TYR 73 SER 74 GLU 75 PRO 76 ARG 77 GLY 78 LEU 79 LEU 80 PRO 81 PRO 82 GLN 83 GLU 84 ILE 85 LEU 86 ASP 87 ALA 88 VAL 89 CYS 90 ASP 91 ALA 92 ILE 93 GLU 94 ASN 95 ARG 96 LEU 97 GLU 98 ASN 99 THR 100 LEU 101 GLU 102 PRO 103 GLN 104 LYS 105 PRO 106 TRP 107 THR 108 PHE 109 LYS 110 LYS 111 ALA 112 CYS 113 GLU 114 SER 115 LEU 116 ASP 117 LYS 118 ASN 119 THR 120 SER 121 SER 122 GLY 123 TYR 124 PRO 125 TYR 126 HIS 127 LYS 128 GLN 129 LYS 130 SER 131 LYS 132 ASP 133 TRP 134 THR 135 GLY 136 SER 137 ALA 138 PHE 139 ILE 140 GLY 141 ASP 142 LEU 143 GLY 144 ASP 145 GLN 146 ALA 147 THR 148 HIS 149 ALA 150 ASN 151 ASN 152 MET 153 TYR 154 GLU 155 MET 156 GLY 157 LYS 158 SER 159 MET 160 ARG 161 PRO 162 ILE 163 TYR 164 THR 165 ALA 166 ALA 167 LEU 168 LYS 169 ASP 170 GLU 171 LEU 172 VAL 173 LYS 174 PRO 175 ASP 176 LYS 177 ILE 178 TYR 179 GLY 180 LYS 181 ILE 182 LYS 183 LYS 184 ARG 185 LEU 186 LEU 187 TRP 188 GLY 189 SER 190 ASP 191 LEU 192 GLY 193 THR 194 MET 195 ILE 196 ARG 197 ALA 198 ALA 199 ARG 200 ALA 201 PHE 202 GLY 203 PRO 204 PHE 205 CYS 206 ASP 207 ALA 208 LEU 209 LYS 210 GLU 211 THR 212 CYS 213 ILE 214 PHE 215 ASN 216 PRO 217 ILE 218 ARG 219 VAL 220 GLY 221 MET 222 SER 223 MET 224 ASN 225 GLU 226 ASP 227 GLY 228 PRO 229 PHE 230 ILE 231 PHE 232 ALA 233 ARG 234 HIS 235 ALA 236 ASN 237 PHE 238 ARG 239 TYR 240 HIS 241 MET 242 ASP 243 ALA 244 ASP 245 TYR 246 THR 247 ARG 248 TRP 249 ASP 250 SER 251 THR 252 GLN 253 GLN 254 ARG 255 ALA 256 ILE 257 LEU 258 LYS 259 ARG 260 ALA 261 GLY 262 ASP 263 ILE 264 MET 265 VAL 266 ARG 267 LEU 268 SER 269 PRO 270 GLU 271 PRO 272 ASP 273 LEU 274 ALA 275 ARG 276 VAL 277 VAL 278 MET 279 ASP 280 ASP 281 LEU 282 LEU 283 ALA 284 PRO 285 SER 286 LEU 287 LEU 288 ASP 289 VAL 290 GLY 291 ASP 292 TYR 293 LYS 294 ILE 295 VAL 296 VAL 297 GLU 298 GLU 299 GLY 300 LEU 301 PRO 302 SER 303 GLY 304 CYS 305 PRO 306 CYS 307 THR 308 THR 309 GLN 310 LEU 311 ASN 312 SER 313 LEU 314 ALA 315 HIS 316 TRP 317 ILE 318 LEU 319 THR 320 LEU 321 CYS 322 ALA 323 MET 324 VAL 325 GLU 326 VAL 327 THR 328 ARG 329 VAL 330 ASP 331 PRO 332 ASP 333 ILE 334 VAL 335 MET 336 GLN 337 GLU 338 SER 339 GLU 340 PHE 341 SER 342 PHE 343 TYR 344 GLY 345 ASP 346 ASP 347 GLU 348 VAL 349 VAL 350 SER 351 THR 352 ASN 353 LEU 354 GLU 355 LEU 356 ASP 357 MET 358 VAL 359 LYS 360 TYR 361 THR 362 MET 363 ALA 364 LEU 365 ARG 366 ARG 367 TYR 368 GLY 369 LEU 370 LEU 371 PRO 372 THR 373 ARG 374 ALA 375 ASP 376 LYS 377 GLU 378 GLU 379 GLY 380 PRO 381 LEU 382 GLU 383 ARG 384 ARG 385 GLN 386 THR 387 LEU 388 GLN 389 GLY 390 ILE 391 SER 392 PHE 393 LEU 394 ARG 395 ARG 396 ALA 397 ILE 398 VAL 399 GLY 400 ASP 401 GLN 402 PHE 403 GLY 404 TRP 405 TYR 406 GLY 407 ARG 408 LEU 409 ASP 410 ARG 411 ALA 412 SER 413 ILE 414 ASP 415 ARG 416 GLN 417 LEU 418 LEU 419 TRP 420 THR 421 LYS 422 GLY 423 PRO 424 ASN 425 HIS 426 GLN 427 ASN 428 PRO 429 PHE 430 GLU 431 THR 432 LEU 433 PRO 434 GLY 435 HIS 436 ALA 437 GLN 438 ARG 439 PRO 440 SER 441 GLN 442 LEU 443 MET 444 ALA 445 LEU 446 LEU 447 GLY 448 GLU 449 ALA 450 ALA 451 MET 452 HIS 453 GLY 454 GLU 455 LYS 456 TYR 457 TYR 458 ARG 459 THR 460 VAL 461 ALA 462 SER 463 ARG 464 VAL 465 SER 466 LYS 467 GLU 468 ALA 469 ALA 470 GLN 471 SER 472 GLY 473 ILE 474 GLU 475 MET 476 VAL 477 VAL 478 PRO 479 ARG 480 HIS 481 ARG 482 SER 483 VAL 484 LEU 485 ARG 486 TRP 487 VAL 488 ARG 489 PHE 490 GLY 491 THR 492

Ligands

Unit 4	MG 1 SO4 2 SO4 3 URF 521 MN3 522 MN3 523 SO4 524 SO4 525 SO4 526 SO4 527 GOL 528
Unit 5	MG 2 URF 521 MN3 522 MN3 523 SO4 524 SO4 525 SO4 526 SO4 527 SO4 528
Unit 6	GOL 2 MG 3 URF 521 MN3 522 MN3 523 SO4 524 SO4 525 SO4 526