3K1Y - Sequence, Chains, Asymmetric and Biological Units

• Title: X-RAY STRUCTURE OF OXIDOREDUCTASE FROM CORYNEBACTERIUM DIPHT ORTHOROMBIC CRYSTAL FORM, NORTHEAST STRUCTURAL GENOMICS CON TARGET CDR100D
• Keywords: STRUCTURAL GENOMICS, PSI-2, PROTEIN STRUCTURE INITIATIVE, NO STRUCTURAL GENOMICS CONSORTIUM, NESG, CDR100D, Q6NGS1, OXIDOREDUCTASE
• Experiment: X-ray diffraction
• Number of Models: 1

Database	ID code	Status	Coordinate files
			Header	Asymmetric unit	Biological unit
PDB	3K1Y	released	available	available	Quaternary Structure Server

Asymmetric unit from PDB

Unit	Type	Name	Chain ID	Residues	Atoms	Hetatoms
1	Protein	OXIDOREDUCTASE	A	182	1286	48
2	Protein	OXIDOREDUCTASE	B	180	1270	48
3	Protein	OXIDOREDUCTASE	C	181	1280	48
4	Protein	OXIDOREDUCTASE	D	182	1286	48
5	Protein	OXIDOREDUCTASE	E	180	1270	48
6	Protein	OXIDOREDUCTASE	F	180	1270	48
7	Ligand	OXIDOREDUCTASE	A	4	0	20
8	Ligand	OXIDOREDUCTASE	B	2	0	10
9	Ligand	OXIDOREDUCTASE	C	2	0	10
10	Ligand	OXIDOREDUCTASE	D	3	0	15
11	Ligand	OXIDOREDUCTASE	E	3	0	15
12	Ligand	OXIDOREDUCTASE	F	2	0	10
13	Water			205	0	205
total				1306	7662	573

Proteins

Unit 1	SER -1 HIS 0 MSE 1 ARG 2 THR 3 LEU 4 ALA 5 VAL 6 ILE 7 SER 8 ALA 9 GLY 10 LEU 11 SER 12 THR 13 PRO 14 SER 15 SER 16 THR 17 ARG 18 GLN 19 ILE 20 ALA 21 ASP 22 SER 23 ILE 24 SER 25 GLU 26 ALA 27 VAL 28 THR 29 ALA 30 ALA 31 VAL 32 SER 33 ALA 34 ARG 35 GLY 36 GLU 37 ALA 38 LEU 39 SER 40 VAL 41 SER 42 THR 43 ILE 44 GLU 45 LEU 46 SER 47 GLU 48 LEU 49 ILE 50 PRO 51 ASP 52 LEU 53 MSE 54 THR 55 ALA 56 MSE 57 THR 58 THR 59 ARG 60 VAL 61 HIS 62 THR 63 THR 64 LYS 65 LEU 66 GLU 67 GLU 68 ILE 69 THR 70 SER 71 ALA 72 LEU 73 SER 74 ALA 75 SER 76 ASP 77 GLY 78 LEU 79 VAL 80 VAL 81 ALA 82 THR 83 PRO 84 VAL 85 PHE 86 LYS 87 ALA 88 SER 89 TYR 90 THR 91 GLY 92 LEU 93 PHE 94 LYS 95 MSE 96 PHE 97 PHE 98 ASP 99 ILE 100 LEU 101 ASP 102 THR 103 ASP 104 ALA 105 LEU 106 THR 107 GLY 108 MSE 109 PRO 110 THR 111 ILE 112 ILE 113 ALA 114 ALA 115 THR 116 ALA 117 GLY 118 SER 119 ALA 120 ARG 121 HIS 122 SER 123 LEU 124 VAL 125 LEU 126 ASP 127 TYR 128 ALA 129 LEU 130 ARG 131 PRO 132 LEU 133 LEU 134 SER 135 TYR 136 MSE 137 ARG 138 ALA 139 VAL 140 VAL 141 VAL 142 PRO 143 THR 144 GLY 145 VAL 146 PHE 147 ALA 148 ALA 149 THR 150 GLU 151 ASP 152 PHE 153 GLY 154 GLY 155 PRO 156 GLU 157 GLY 158 ALA 159 GLU 160 PHE 161 ASN 162 LYS 163 ARG 164 ILE 165 ALA 166 ARG 167 ALA 168 ALA 169 GLY 170 GLU 171 LEU 172 ALA 173 SER 174 LEU 175 ILE 176 VAL 177 GLU 178 GLU 179 SER 180
Unit 2	MSE 1 ARG 2 THR 3 LEU 4 ALA 5 VAL 6 ILE 7 SER 8 ALA 9 GLY 10 LEU 11 SER 12 THR 13 PRO 14 SER 15 SER 16 THR 17 ARG 18 GLN 19 ILE 20 ALA 21 ASP 22 SER 23 ILE 24 SER 25 GLU 26 ALA 27 VAL 28 THR 29 ALA 30 ALA 31 VAL 32 SER 33 ALA 34 ARG 35 GLY 36 GLU 37 ALA 38 LEU 39 SER 40 VAL 41 SER 42 THR 43 ILE 44 GLU 45 LEU 46 SER 47 GLU 48 LEU 49 ILE 50 PRO 51 ASP 52 LEU 53 MSE 54 THR 55 ALA 56 MSE 57 THR 58 THR 59 ARG 60 VAL 61 HIS 62 THR 63 THR 64 LYS 65 LEU 66 GLU 67 GLU 68 ILE 69 THR 70 SER 71 ALA 72 LEU 73 SER 74 ALA 75 SER 76 ASP 77 GLY 78 LEU 79 VAL 80 VAL 81 ALA 82 THR 83 PRO 84 VAL 85 PHE 86 LYS 87 ALA 88 SER 89 TYR 90 THR 91 GLY 92 LEU 93 PHE 94 LYS 95 MSE 96 PHE 97 PHE 98 ASP 99 ILE 100 LEU 101 ASP 102 THR 103 ASP 104 ALA 105 LEU 106 THR 107 GLY 108 MSE 109 PRO 110 THR 111 ILE 112 ILE 113 ALA 114 ALA 115 THR 116 ALA 117 GLY 118 SER 119 ALA 120 ARG 121 HIS 122 SER 123 LEU 124 VAL 125 LEU 126 ASP 127 TYR 128 ALA 129 LEU 130 ARG 131 PRO 132 LEU 133 LEU 134 SER 135 TYR 136 MSE 137 ARG 138 ALA 139 VAL 140 VAL 141 VAL 142 PRO 143 THR 144 GLY 145 VAL 146 PHE 147 ALA 148 ALA 149 THR 150 GLU 151 ASP 152 PHE 153 GLY 154 GLY 155 PRO 156 GLU 157 GLY 158 ALA 159 GLU 160 PHE 161 ASN 162 LYS 163 ARG 164 ILE 165 ALA 166 ARG 167 ALA 168 ALA 169 GLY 170 GLU 171 LEU 172 ALA 173 SER 174 LEU 175 ILE 176 VAL 177 GLU 178 GLU 179 SER 180
Unit 3	HIS 0 MSE 1 ARG 2 THR 3 LEU 4 ALA 5 VAL 6 ILE 7 SER 8 ALA 9 GLY 10 LEU 11 SER 12 THR 13 PRO 14 SER 15 SER 16 THR 17 ARG 18 GLN 19 ILE 20 ALA 21 ASP 22 SER 23 ILE 24 SER 25 GLU 26 ALA 27 VAL 28 THR 29 ALA 30 ALA 31 VAL 32 SER 33 ALA 34 ARG 35 GLY 36 GLU 37 ALA 38 LEU 39 SER 40 VAL 41 SER 42 THR 43 ILE 44 GLU 45 LEU 46 SER 47 GLU 48 LEU 49 ILE 50 PRO 51 ASP 52 LEU 53 MSE 54 THR 55 ALA 56 MSE 57 THR 58 THR 59 ARG 60 VAL 61 HIS 62 THR 63 THR 64 LYS 65 LEU 66 GLU 67 GLU 68 ILE 69 THR 70 SER 71 ALA 72 LEU 73 SER 74 ALA 75 SER 76 ASP 77 GLY 78 LEU 79 VAL 80 VAL 81 ALA 82 THR 83 PRO 84 VAL 85 PHE 86 LYS 87 ALA 88 SER 89 TYR 90 THR 91 GLY 92 LEU 93 PHE 94 LYS 95 MSE 96 PHE 97 PHE 98 ASP 99 ILE 100 LEU 101 ASP 102 THR 103 ASP 104 ALA 105 LEU 106 THR 107 GLY 108 MSE 109 PRO 110 THR 111 ILE 112 ILE 113 ALA 114 ALA 115 THR 116 ALA 117 GLY 118 SER 119 ALA 120 ARG 121 HIS 122 SER 123 LEU 124 VAL 125 LEU 126 ASP 127 TYR 128 ALA 129 LEU 130 ARG 131 PRO 132 LEU 133 LEU 134 SER 135 TYR 136 MSE 137 ARG 138 ALA 139 VAL 140 VAL 141 VAL 142 PRO 143 THR 144 GLY 145 VAL 146 PHE 147 ALA 148 ALA 149 THR 150 GLU 151 ASP 152 PHE 153 GLY 154 GLY 155 PRO 156 GLU 157 GLY 158 ALA 159 GLU 160 PHE 161 ASN 162 LYS 163 ARG 164 ILE 165 ALA 166 ARG 167 ALA 168 ALA 169 GLY 170 GLU 171 LEU 172 ALA 173 SER 174 LEU 175 ILE 176 VAL 177 GLU 178 GLU 179 SER 180
Unit 4	SER -1 HIS 0 MSE 1 ARG 2 THR 3 LEU 4 ALA 5 VAL 6 ILE 7 SER 8 ALA 9 GLY 10 LEU 11 SER 12 THR 13 PRO 14 SER 15 SER 16 THR 17 ARG 18 GLN 19 ILE 20 ALA 21 ASP 22 SER 23 ILE 24 SER 25 GLU 26 ALA 27 VAL 28 THR 29 ALA 30 ALA 31 VAL 32 SER 33 ALA 34 ARG 35 GLY 36 GLU 37 ALA 38 LEU 39 SER 40 VAL 41 SER 42 THR 43 ILE 44 GLU 45 LEU 46 SER 47 GLU 48 LEU 49 ILE 50 PRO 51 ASP 52 LEU 53 MSE 54 THR 55 ALA 56 MSE 57 THR 58 THR 59 ARG 60 VAL 61 HIS 62 THR 63 THR 64 LYS 65 LEU 66 GLU 67 GLU 68 ILE 69 THR 70 SER 71 ALA 72 LEU 73 SER 74 ALA 75 SER 76 ASP 77 GLY 78 LEU 79 VAL 80 VAL 81 ALA 82 THR 83 PRO 84 VAL 85 PHE 86 LYS 87 ALA 88 SER 89 TYR 90 THR 91 GLY 92 LEU 93 PHE 94 LYS 95 MSE 96 PHE 97 PHE 98 ASP 99 ILE 100 LEU 101 ASP 102 THR 103 ASP 104 ALA 105 LEU 106 THR 107 GLY 108 MSE 109 PRO 110 THR 111 ILE 112 ILE 113 ALA 114 ALA 115 THR 116 ALA 117 GLY 118 SER 119 ALA 120 ARG 121 HIS 122 SER 123 LEU 124 VAL 125 LEU 126 ASP 127 TYR 128 ALA 129 LEU 130 ARG 131 PRO 132 LEU 133 LEU 134 SER 135 TYR 136 MSE 137 ARG 138 ALA 139 VAL 140 VAL 141 VAL 142 PRO 143 THR 144 GLY 145 VAL 146 PHE 147 ALA 148 ALA 149 THR 150 GLU 151 ASP 152 PHE 153 GLY 154 GLY 155 PRO 156 GLU 157 GLY 158 ALA 159 GLU 160 PHE 161 ASN 162 LYS 163 ARG 164 ILE 165 ALA 166 ARG 167 ALA 168 ALA 169 GLY 170 GLU 171 LEU 172 ALA 173 SER 174 LEU 175 ILE 176 VAL 177 GLU 178 GLU 179 SER 180
Unit 5	MSE 1 ARG 2 THR 3 LEU 4 ALA 5 VAL 6 ILE 7 SER 8 ALA 9 GLY 10 LEU 11 SER 12 THR 13 PRO 14 SER 15 SER 16 THR 17 ARG 18 GLN 19 ILE 20 ALA 21 ASP 22 SER 23 ILE 24 SER 25 GLU 26 ALA 27 VAL 28 THR 29 ALA 30 ALA 31 VAL 32 SER 33 ALA 34 ARG 35 GLY 36 GLU 37 ALA 38 LEU 39 SER 40 VAL 41 SER 42 THR 43 ILE 44 GLU 45 LEU 46 SER 47 GLU 48 LEU 49 ILE 50 PRO 51 ASP 52 LEU 53 MSE 54 THR 55 ALA 56 MSE 57 THR 58 THR 59 ARG 60 VAL 61 HIS 62 THR 63 THR 64 LYS 65 LEU 66 GLU 67 GLU 68 ILE 69 THR 70 SER 71 ALA 72 LEU 73 SER 74 ALA 75 SER 76 ASP 77 GLY 78 LEU 79 VAL 80 VAL 81 ALA 82 THR 83 PRO 84 VAL 85 PHE 86 LYS 87 ALA 88 SER 89 TYR 90 THR 91 GLY 92 LEU 93 PHE 94 LYS 95 MSE 96 PHE 97 PHE 98 ASP 99 ILE 100 LEU 101 ASP 102 THR 103 ASP 104 ALA 105 LEU 106 THR 107 GLY 108 MSE 109 PRO 110 THR 111 ILE 112 ILE 113 ALA 114 ALA 115 THR 116 ALA 117 GLY 118 SER 119 ALA 120 ARG 121 HIS 122 SER 123 LEU 124 VAL 125 LEU 126 ASP 127 TYR 128 ALA 129 LEU 130 ARG 131 PRO 132 LEU 133 LEU 134 SER 135 TYR 136 MSE 137 ARG 138 ALA 139 VAL 140 VAL 141 VAL 142 PRO 143 THR 144 GLY 145 VAL 146 PHE 147 ALA 148 ALA 149 THR 150 GLU 151 ASP 152 PHE 153 GLY 154 GLY 155 PRO 156 GLU 157 GLY 158 ALA 159 GLU 160 PHE 161 ASN 162 LYS 163 ARG 164 ILE 165 ALA 166 ARG 167 ALA 168 ALA 169 GLY 170 GLU 171 LEU 172 ALA 173 SER 174 LEU 175 ILE 176 VAL 177 GLU 178 GLU 179 SER 180
Unit 6	MSE 1 ARG 2 THR 3 LEU 4 ALA 5 VAL 6 ILE 7 SER 8 ALA 9 GLY 10 LEU 11 SER 12 THR 13 PRO 14 SER 15 SER 16 THR 17 ARG 18 GLN 19 ILE 20 ALA 21 ASP 22 SER 23 ILE 24 SER 25 GLU 26 ALA 27 VAL 28 THR 29 ALA 30 ALA 31 VAL 32 SER 33 ALA 34 ARG 35 GLY 36 GLU 37 ALA 38 LEU 39 SER 40 VAL 41 SER 42 THR 43 ILE 44 GLU 45 LEU 46 SER 47 GLU 48 LEU 49 ILE 50 PRO 51 ASP 52 LEU 53 MSE 54 THR 55 ALA 56 MSE 57 THR 58 THR 59 ARG 60 VAL 61 HIS 62 THR 63 THR 64 LYS 65 LEU 66 GLU 67 GLU 68 ILE 69 THR 70 SER 71 ALA 72 LEU 73 SER 74 ALA 75 SER 76 ASP 77 GLY 78 LEU 79 VAL 80 VAL 81 ALA 82 THR 83 PRO 84 VAL 85 PHE 86 LYS 87 ALA 88 SER 89 TYR 90 THR 91 GLY 92 LEU 93 PHE 94 LYS 95 MSE 96 PHE 97 PHE 98 ASP 99 ILE 100 LEU 101 ASP 102 THR 103 ASP 104 ALA 105 LEU 106 THR 107 GLY 108 MSE 109 PRO 110 THR 111 ILE 112 ILE 113 ALA 114 ALA 115 THR 116 ALA 117 GLY 118 SER 119 ALA 120 ARG 121 HIS 122 SER 123 LEU 124 VAL 125 LEU 126 ASP 127 TYR 128 ALA 129 LEU 130 ARG 131 PRO 132 LEU 133 LEU 134 SER 135 TYR 136 MSE 137 ARG 138 ALA 139 VAL 140 VAL 141 VAL 142 PRO 143 THR 144 GLY 145 VAL 146 PHE 147 ALA 148 ALA 149 THR 150 GLU 151 ASP 152 PHE 153 GLY 154 GLY 155 PRO 156 GLU 157 GLY 158 ALA 159 GLU 160 PHE 161 ASN 162 LYS 163 ARG 164 ILE 165 ALA 166 ARG 167 ALA 168 ALA 169 GLY 170 GLU 171 LEU 172 ALA 173 SER 174 LEU 175 ILE 176 VAL 177 GLU 178 GLU 179 SER 180

Ligands

Unit 7	SO4 182 SO4 183 SO4 184 SO4 185
Unit 8	SO4 182 SO4 183
Unit 9	SO4 182 SO4 183
Unit 10	SO4 182 SO4 183 SO4 184
Unit 11	SO4 182 SO4 183 SO4 184
Unit 12	SO4 182 SO4 183