3J9J - Sequence, Chains, Asymmetric and Biological Units

• Title: STRUCTURE OF THE CAPSAICIN RECEPTOR, TRPV1, DETERMINED BY SI PARTICLE ELECTRON CRYO-MICROSCOPY
• Keywords: ALPHA HELICAL, MEMBRANE PROTEIN
• Experiment: ELECTRON MICROSCOPY
• Number of Models: 1

Database	ID code	Status	Coordinate files
			Header	Asymmetric unit	Biological unit
PDB	3J9J	released	available	available	Quaternary Structure Server

Asymmetric unit from PDB

Unit	Type	Name	Chain ID	Residues	Atoms	Hetatoms
1	Protein	TRANSIENT RECEPTOR POTENTIAL CATION CHANNEL SUBFA MEMBER 1	A	315	5267	0
2	Protein	TRANSIENT RECEPTOR POTENTIAL CATION CHANNEL SUBFA MEMBER 1	B	315	5267	0
3	Protein	TRANSIENT RECEPTOR POTENTIAL CATION CHANNEL SUBFA MEMBER 1	C	315	5267	0
4	Protein	TRANSIENT RECEPTOR POTENTIAL CATION CHANNEL SUBFA MEMBER 1	D	315	5267	0
total				1260	21068	0

Proteins

Unit 1	LEU 1 TYR 2 ASP 3 LEU 4 SER 5 CYS 6 ILE 7 ASP 8 THR 9 CYS 10 GLU 11 LYS 12 ASN 13 SER 14 VAL 15 LEU 16 GLU 17 VAL 18 ILE 19 ALA 20 TYR 21 SER 22 SER 23 SER 24 GLU 25 THR 26 PRO 27 ASN 28 ARG 29 HIS 30 ASP 31 MET 32 LEU 33 LEU 34 VAL 35 GLU 36 PRO 37 LEU 38 ASN 39 ARG 40 LEU 41 LEU 42 GLN 43 ASP 44 LYS 45 TRP 46 ASP 47 ARG 48 PHE 49 VAL 50 LYS 51 ARG 52 ILE 53 PHE 54 TYR 55 PHE 56 ASN 57 PHE 58 PHE 59 VAL 60 TYR 61 CYS 62 LEU 63 TYR 64 MET 65 ILE 66 ILE 67 PHE 68 THR 69 ALA 70 ALA 71 ALA 72 TYR 73 TYR 74 ARG 75 PRO 76 VAL 77 GLU 78 GLY 79 LEU 80 PRO 81 PRO 82 TYR 83 LYS 84 LEU 85 LYS 86 ASN 87 THR 88 VAL 89 GLY 90 ASP 91 TYR 92 PHE 93 ARG 94 VAL 95 THR 96 GLY 97 GLU 98 ILE 99 LEU 100 SER 101 VAL 102 SER 103 GLY 104 GLY 105 VAL 106 TYR 107 PHE 108 PHE 109 PHE 110 ARG 111 GLY 112 ILE 113 GLN 114 TYR 115 PHE 116 LEU 117 GLN 118 ARG 119 ARG 120 PRO 121 SER 122 LEU 123 LYS 124 SER 125 LEU 126 PHE 127 VAL 128 ASP 129 SER 130 TYR 131 SER 132 GLU 133 ILE 134 LEU 135 PHE 136 PHE 137 VAL 138 GLN 139 SER 140 LEU 141 PHE 142 MET 143 LEU 144 VAL 145 SER 146 VAL 147 VAL 148 LEU 149 TYR 150 PHE 151 SER 152 GLN 153 ARG 154 LYS 155 GLU 156 TYR 157 VAL 158 ALA 159 SER 160 MET 161 VAL 162 PHE 163 SER 164 LEU 165 ALA 166 MET 167 GLY 168 TRP 169 THR 170 ASN 171 MET 172 LEU 173 TYR 174 TYR 175 THR 176 ARG 177 GLY 178 PHE 179 GLN 180 GLN 181 MET 182 GLY 183 ILE 184 TYR 185 ALA 186 VAL 187 MET 188 ILE 189 GLU 190 LYS 191 MET 192 ILE 193 LEU 194 ARG 195 ASP 196 LEU 197 CYS 198 ARG 199 PHE 200 MET 201 PHE 202 VAL 203 TYR 204 LEU 205 VAL 206 PHE 207 LEU 208 PHE 209 GLY 210 PHE 211 SER 212 THR 213 ALA 214 VAL 215 VAL 216 THR 217 LEU 218 ILE 219 GLU 220 ASP 221 GLY 222 LYS 223 TYR 224 ASN 225 SER 226 LEU 227 TYR 228 SER 229 THR 230 CYS 231 LEU 232 GLU 233 LEU 234 PHE 235 LYS 236 PHE 237 THR 238 ILE 239 GLY 240 MET 241 GLY 242 ASP 243 LEU 244 GLU 245 PHE 246 THR 247 GLU 248 ASN 249 TYR 250 ASP 251 PHE 252 LYS 253 ALA 254 VAL 255 PHE 256 ILE 257 ILE 258 LEU 259 LEU 260 LEU 261 ALA 262 TYR 263 VAL 264 ILE 265 LEU 266 THR 267 TYR 268 ILE 269 LEU 270 LEU 271 LEU 272 GLN 273 MET 274 LEU 275 ILE 276 ALA 277 LEU 278 MET 279 GLY 280 GLU 281 THR 282 VAL 283 ASN 284 LYS 285 ILE 286 ALA 287 GLN 288 GLU 289 SER 290 LYS 291 ASN 292 ILE 293 TRP 294 LYS 295 LEU 296 GLN 297 ARG 298 ALA 299 ILE 300 THR 301 ILE 302 LEU 303 ASP 304 THR 305 GLU 306 LYS 307 SER 308 PHE 309 LEU 310 LYS 311 CYS 312 MET 313 ARG 314 LYS 315
Unit 2	LEU 1 TYR 2 ASP 3 LEU 4 SER 5 CYS 6 ILE 7 ASP 8 THR 9 CYS 10 GLU 11 LYS 12 ASN 13 SER 14 VAL 15 LEU 16 GLU 17 VAL 18 ILE 19 ALA 20 TYR 21 SER 22 SER 23 SER 24 GLU 25 THR 26 PRO 27 ASN 28 ARG 29 HIS 30 ASP 31 MET 32 LEU 33 LEU 34 VAL 35 GLU 36 PRO 37 LEU 38 ASN 39 ARG 40 LEU 41 LEU 42 GLN 43 ASP 44 LYS 45 TRP 46 ASP 47 ARG 48 PHE 49 VAL 50 LYS 51 ARG 52 ILE 53 PHE 54 TYR 55 PHE 56 ASN 57 PHE 58 PHE 59 VAL 60 TYR 61 CYS 62 LEU 63 TYR 64 MET 65 ILE 66 ILE 67 PHE 68 THR 69 ALA 70 ALA 71 ALA 72 TYR 73 TYR 74 ARG 75 PRO 76 VAL 77 GLU 78 GLY 79 LEU 80 PRO 81 PRO 82 TYR 83 LYS 84 LEU 85 LYS 86 ASN 87 THR 88 VAL 89 GLY 90 ASP 91 TYR 92 PHE 93 ARG 94 VAL 95 THR 96 GLY 97 GLU 98 ILE 99 LEU 100 SER 101 VAL 102 SER 103 GLY 104 GLY 105 VAL 106 TYR 107 PHE 108 PHE 109 PHE 110 ARG 111 GLY 112 ILE 113 GLN 114 TYR 115 PHE 116 LEU 117 GLN 118 ARG 119 ARG 120 PRO 121 SER 122 LEU 123 LYS 124 SER 125 LEU 126 PHE 127 VAL 128 ASP 129 SER 130 TYR 131 SER 132 GLU 133 ILE 134 LEU 135 PHE 136 PHE 137 VAL 138 GLN 139 SER 140 LEU 141 PHE 142 MET 143 LEU 144 VAL 145 SER 146 VAL 147 VAL 148 LEU 149 TYR 150 PHE 151 SER 152 GLN 153 ARG 154 LYS 155 GLU 156 TYR 157 VAL 158 ALA 159 SER 160 MET 161 VAL 162 PHE 163 SER 164 LEU 165 ALA 166 MET 167 GLY 168 TRP 169 THR 170 ASN 171 MET 172 LEU 173 TYR 174 TYR 175 THR 176 ARG 177 GLY 178 PHE 179 GLN 180 GLN 181 MET 182 GLY 183 ILE 184 TYR 185 ALA 186 VAL 187 MET 188 ILE 189 GLU 190 LYS 191 MET 192 ILE 193 LEU 194 ARG 195 ASP 196 LEU 197 CYS 198 ARG 199 PHE 200 MET 201 PHE 202 VAL 203 TYR 204 LEU 205 VAL 206 PHE 207 LEU 208 PHE 209 GLY 210 PHE 211 SER 212 THR 213 ALA 214 VAL 215 VAL 216 THR 217 LEU 218 ILE 219 GLU 220 ASP 221 GLY 222 LYS 223 TYR 224 ASN 225 SER 226 LEU 227 TYR 228 SER 229 THR 230 CYS 231 LEU 232 GLU 233 LEU 234 PHE 235 LYS 236 PHE 237 THR 238 ILE 239 GLY 240 MET 241 GLY 242 ASP 243 LEU 244 GLU 245 PHE 246 THR 247 GLU 248 ASN 249 TYR 250 ASP 251 PHE 252 LYS 253 ALA 254 VAL 255 PHE 256 ILE 257 ILE 258 LEU 259 LEU 260 LEU 261 ALA 262 TYR 263 VAL 264 ILE 265 LEU 266 THR 267 TYR 268 ILE 269 LEU 270 LEU 271 LEU 272 GLN 273 MET 274 LEU 275 ILE 276 ALA 277 LEU 278 MET 279 GLY 280 GLU 281 THR 282 VAL 283 ASN 284 LYS 285 ILE 286 ALA 287 GLN 288 GLU 289 SER 290 LYS 291 ASN 292 ILE 293 TRP 294 LYS 295 LEU 296 GLN 297 ARG 298 ALA 299 ILE 300 THR 301 ILE 302 LEU 303 ASP 304 THR 305 GLU 306 LYS 307 SER 308 PHE 309 LEU 310 LYS 311 CYS 312 MET 313 ARG 314 LYS 315
Unit 3	LEU 1 TYR 2 ASP 3 LEU 4 SER 5 CYS 6 ILE 7 ASP 8 THR 9 CYS 10 GLU 11 LYS 12 ASN 13 SER 14 VAL 15 LEU 16 GLU 17 VAL 18 ILE 19 ALA 20 TYR 21 SER 22 SER 23 SER 24 GLU 25 THR 26 PRO 27 ASN 28 ARG 29 HIS 30 ASP 31 MET 32 LEU 33 LEU 34 VAL 35 GLU 36 PRO 37 LEU 38 ASN 39 ARG 40 LEU 41 LEU 42 GLN 43 ASP 44 LYS 45 TRP 46 ASP 47 ARG 48 PHE 49 VAL 50 LYS 51 ARG 52 ILE 53 PHE 54 TYR 55 PHE 56 ASN 57 PHE 58 PHE 59 VAL 60 TYR 61 CYS 62 LEU 63 TYR 64 MET 65 ILE 66 ILE 67 PHE 68 THR 69 ALA 70 ALA 71 ALA 72 TYR 73 TYR 74 ARG 75 PRO 76 VAL 77 GLU 78 GLY 79 LEU 80 PRO 81 PRO 82 TYR 83 LYS 84 LEU 85 LYS 86 ASN 87 THR 88 VAL 89 GLY 90 ASP 91 TYR 92 PHE 93 ARG 94 VAL 95 THR 96 GLY 97 GLU 98 ILE 99 LEU 100 SER 101 VAL 102 SER 103 GLY 104 GLY 105 VAL 106 TYR 107 PHE 108 PHE 109 PHE 110 ARG 111 GLY 112 ILE 113 GLN 114 TYR 115 PHE 116 LEU 117 GLN 118 ARG 119 ARG 120 PRO 121 SER 122 LEU 123 LYS 124 SER 125 LEU 126 PHE 127 VAL 128 ASP 129 SER 130 TYR 131 SER 132 GLU 133 ILE 134 LEU 135 PHE 136 PHE 137 VAL 138 GLN 139 SER 140 LEU 141 PHE 142 MET 143 LEU 144 VAL 145 SER 146 VAL 147 VAL 148 LEU 149 TYR 150 PHE 151 SER 152 GLN 153 ARG 154 LYS 155 GLU 156 TYR 157 VAL 158 ALA 159 SER 160 MET 161 VAL 162 PHE 163 SER 164 LEU 165 ALA 166 MET 167 GLY 168 TRP 169 THR 170 ASN 171 MET 172 LEU 173 TYR 174 TYR 175 THR 176 ARG 177 GLY 178 PHE 179 GLN 180 GLN 181 MET 182 GLY 183 ILE 184 TYR 185 ALA 186 VAL 187 MET 188 ILE 189 GLU 190 LYS 191 MET 192 ILE 193 LEU 194 ARG 195 ASP 196 LEU 197 CYS 198 ARG 199 PHE 200 MET 201 PHE 202 VAL 203 TYR 204 LEU 205 VAL 206 PHE 207 LEU 208 PHE 209 GLY 210 PHE 211 SER 212 THR 213 ALA 214 VAL 215 VAL 216 THR 217 LEU 218 ILE 219 GLU 220 ASP 221 GLY 222 LYS 223 TYR 224 ASN 225 SER 226 LEU 227 TYR 228 SER 229 THR 230 CYS 231 LEU 232 GLU 233 LEU 234 PHE 235 LYS 236 PHE 237 THR 238 ILE 239 GLY 240 MET 241 GLY 242 ASP 243 LEU 244 GLU 245 PHE 246 THR 247 GLU 248 ASN 249 TYR 250 ASP 251 PHE 252 LYS 253 ALA 254 VAL 255 PHE 256 ILE 257 ILE 258 LEU 259 LEU 260 LEU 261 ALA 262 TYR 263 VAL 264 ILE 265 LEU 266 THR 267 TYR 268 ILE 269 LEU 270 LEU 271 LEU 272 GLN 273 MET 274 LEU 275 ILE 276 ALA 277 LEU 278 MET 279 GLY 280 GLU 281 THR 282 VAL 283 ASN 284 LYS 285 ILE 286 ALA 287 GLN 288 GLU 289 SER 290 LYS 291 ASN 292 ILE 293 TRP 294 LYS 295 LEU 296 GLN 297 ARG 298 ALA 299 ILE 300 THR 301 ILE 302 LEU 303 ASP 304 THR 305 GLU 306 LYS 307 SER 308 PHE 309 LEU 310 LYS 311 CYS 312 MET 313 ARG 314 LYS 315
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