3HDJ - Sequence, Chains, Asymmetric and Biological Units

• Title: THE CRYSTAL STRUCTURE OF PROBABLE ORNITHINE CYCLODEAMINASE F BORDETELLA PERTUSSIS TOHAMA I
• Keywords: APC62486, ORNITHINE CYCLODEAMINASE, BORDETELLA PERTUSSIS TOH STRUCTURAL GENOMICS, PSI-2, PROTEIN STRUCTURE INITIATIVE, M CENTER FOR STRUCTURAL GENOMICS, MCSG, UNKNOWN FUNCTION
• Experiment: X-ray diffraction
• Number of Models: 1

Database	ID code	Status	Coordinate files
			Header	Asymmetric unit	Biological unit
PDB	3HDJ	released	available	available	Quaternary Structure Server

Asymmetric unit from PDB

Unit	Type	Name	Chain ID	Residues	Atoms	Hetatoms
1	Protein	PROBABLE ORNITHINE CYCLODEAMINASE	A	311	2246	32
2	Protein	PROBABLE ORNITHINE CYCLODEAMINASE	B	311	2246	32
3	Ligand	PROBABLE ORNITHINE CYCLODEAMINASE	A	7	0	21
4	Ligand	PROBABLE ORNITHINE CYCLODEAMINASE	B	5	0	13
5	Water			500	0	500
total				1134	4492	598

Proteins

Unit 1

ALA 0 MSE 1 LEU 2 HIS 3 ILE 4 ASP 5 ASP 6 ALA 7 MSE 8 ILE 9 GLU 10 ASP 11 ALA 12 VAL 13 THR 14 PRO 15 GLN 16 ALA 17 ALA 18 GLN 19 GLU 20 VAL 21 LEU 22 HIS 23 ALA 24 ALA 25 PHE 26 LEU 27 ASP 28 PHE 29 GLY 30 ARG 31 GLY 32 SER 33 ALA 34 ALA 35 MSE 36 GLN 37 ARG 38 ARG 39 VAL 40 ARG 41 THR 42 GLU 43 ALA 44 GLY 45 GLY 46 VAL 47 LYS 48 LEU 49 SER 50 THR 51 LEU 52 GLY 53 ALA 54 VAL 55 ILE 56 PRO 57 GLY 58 GLN 59 GLY 60 VAL 61 ALA 62 GLY 63 ALA 64 LYS 65 VAL 66 TYR 67 THR 68 THR 69 ILE 70 LYS 71 GLY 72 GLN 73 PHE 74 GLN 75 PHE 76 VAL 77 ILE 78 LEU 79 LEU 80 PHE 81 SER 82 ALA 83 ALA 84 ASP 85 GLY 86 ARG 87 PRO 88 LEU 89 ALA 90 THR 91 CYS 92 ASP 93 ALA 94 GLY 95 THR 96 LEU 97 THR 98 ARG 99 LYS 100 ARG 101 THR 102 ALA 103 ALA 104 CYS 105 THR 106 VAL 107 LEU 108 ALA 109 ALA 110 GLY 111 ALA 112 LEU 113 ALA 114 ARG 115 PRO 116 ARG 117 SER 118 SER 119 VAL 120 LEU 121 GLY 122 LEU 123 PHE 124 GLY 125 ALA 126 GLY 127 THR 128 GLN 129 GLY 130 ALA 131 GLU 132 HIS 133 ALA 134 ALA 135 GLN 136 LEU 137 SER 138 ALA 139 ARG 140 PHE 141 ALA 142 LEU 143 GLU 144 ALA 145 ILE 146 LEU 147 VAL 148 HIS 149 ASP 150 PRO 151 TYR 152 ALA 153 SER 154 PRO 155 GLU 156 ILE 157 LEU 158 GLU 159 ARG 160 ILE 161 GLY 162 ARG 163 ARG 164 CYS 165 GLY 166 VAL 167 PRO 168 ALA 169 ARG 170 MSE 171 ALA 172 ALA 173 PRO 174 ALA 175 ASP 176 ILE 177 ALA 178 ALA 179 GLN 180 ALA 181 ASP 182 ILE 183 VAL 184 VAL 185 THR 186 ALA 187 THR 188 ARG 189 SER 190 THR 191 THR 192 PRO 193 LEU 194 PHE 195 ALA 196 GLY 197 GLN 198 ALA 199 LEU 200 ARG 201 ALA 202 GLY 203 ALA 204 PHE 205 VAL 206 GLY 207 ALA 208 ILE 209 GLY 210 SER 211 SER 212 LEU 213 PRO 214 HIS 215 THR 216 ARG 217 GLU 218 LEU 219 ASP 220 ASP 221 GLU 222 ALA 223 LEU 224 ARG 225 ARG 226 ALA 227 ARG 228 ALA 229 VAL 230 VAL 231 VAL 232 GLU 233 TRP 234 ARG 235 GLU 236 GLN 237 THR 238 LEU 239 SER 240 GLU 241 ALA 242 GLY 243 ASP 244 LEU 245 VAL 246 LEU 247 ALA 248 ALA 249 PRO 250 ASP 251 THR 252 GLY 253 LEU 254 ASP 255 ALA 256 LYS 257 VAL 258 VAL 259 GLU 260 LEU 261 ALA 262 ASP 263 VAL 264 LEU 265 ALA 266 GLY 267 ARG 268 ALA 269 ALA 270 ALA 271 ARG 272 GLN 273 ALA 274 ASP 275 GLU 276 ASP 277 ILE 278 VAL 279 ILE 280 TYR 281 LYS 282 SER 283 VAL 284 GLY 285 VAL 286 GLY 287 LEU 288 GLU 289 ASP 290 VAL 291 ALA 292 LEU 293 ALA 294 GLY 295 TYR 296 ALA 297 TYR 298 ARG 299 ARG 300 LEU 301 ALA 302 ALA 303 GLN 304 ARG 305 GLY 306 TRP 307 PRO 308 ALA 309 PRO 310

Unit 2

ALA 0 MSE 1 LEU 2 HIS 3 ILE 4 ASP 5 ASP 6 ALA 7 MSE 8 ILE 9 GLU 10 ASP 11 ALA 12 VAL 13 THR 14 PRO 15 GLN 16 ALA 17 ALA 18 GLN 19 GLU 20 VAL 21 LEU 22 HIS 23 ALA 24 ALA 25 PHE 26 LEU 27 ASP 28 PHE 29 GLY 30 ARG 31 GLY 32 SER 33 ALA 34 ALA 35 MSE 36 GLN 37 ARG 38 ARG 39 VAL 40 ARG 41 THR 42 GLU 43 ALA 44 GLY 45 GLY 46 VAL 47 LYS 48 LEU 49 SER 50 THR 51 LEU 52 GLY 53 ALA 54 VAL 55 ILE 56 PRO 57 GLY 58 GLN 59 GLY 60 VAL 61 ALA 62 GLY 63 ALA 64 LYS 65 VAL 66 TYR 67 THR 68 THR 69 ILE 70 LYS 71 GLY 72 GLN 73 PHE 74 GLN 75 PHE 76 VAL 77 ILE 78 LEU 79 LEU 80 PHE 81 SER 82 ALA 83 ALA 84 ASP 85 GLY 86 ARG 87 PRO 88 LEU 89 ALA 90 THR 91 CYS 92 ASP 93 ALA 94 GLY 95 THR 96 LEU 97 THR 98 ARG 99 LYS 100 ARG 101 THR 102 ALA 103 ALA 104 CYS 105 THR 106 VAL 107 LEU 108 ALA 109 ALA 110 GLY 111 ALA 112 LEU 113 ALA 114 ARG 115 PRO 116 ARG 117 SER 118 SER 119 VAL 120 LEU 121 GLY 122 LEU 123 PHE 124 GLY 125 ALA 126 GLY 127 THR 128 GLN 129 GLY 130 ALA 131 GLU 132 HIS 133 ALA 134 ALA 135 GLN 136 LEU 137 SER 138 ALA 139 ARG 140 PHE 141 ALA 142 LEU 143 GLU 144 ALA 145 ILE 146 LEU 147 VAL 148 HIS 149 ASP 150 PRO 151 TYR 152 ALA 153 SER 154 PRO 155 GLU 156 ILE 157 LEU 158 GLU 159 ARG 160 ILE 161 GLY 162 ARG 163 ARG 164 CYS 165 GLY 166 VAL 167 PRO 168 ALA 169 ARG 170 MSE 171 ALA 172 ALA 173 PRO 174 ALA 175 ASP 176 ILE 177 ALA 178 ALA 179 GLN 180 ALA 181 ASP 182 ILE 183 VAL 184 VAL 185 THR 186 ALA 187 THR 188 ARG 189 SER 190 THR 191 THR 192 PRO 193 LEU 194 PHE 195 ALA 196 GLY 197 GLN 198 ALA 199 LEU 200 ARG 201 ALA 202 GLY 203 ALA 204 PHE 205 VAL 206 GLY 207 ALA 208 ILE 209 GLY 210 SER 211 SER 212 LEU 213 PRO 214 HIS 215 THR 216 ARG 217 GLU 218 LEU 219 ASP 220 ASP 221 GLU 222 ALA 223 LEU 224 ARG 225 ARG 226 ALA 227 ARG 228 ALA 229 VAL 230 VAL 231 VAL 232 GLU 233 TRP 234 ARG 235 GLU 236 GLN 237 THR 238 LEU 239 SER 240 GLU 241 ALA 242 GLY 243 ASP 244 LEU 245 VAL 246 LEU 247 ALA 248 ALA 249 PRO 250 ASP 251 THR 252 GLY 253 LEU 254 ASP 255 ALA 256 LYS 257 VAL 258 VAL 259 GLU 260 LEU 261 ALA 262 ASP 263 VAL 264 LEU 265 ALA 266 GLY 267 ARG 268 ALA 269 ALA 270 ALA 271 ARG 272 GLN 273 ALA 274 ASP 275 GLU 276 ASP 277 ILE 278 VAL 279 ILE 280 TYR 281 LYS 282 SER 283 VAL 284 GLY 285 VAL 286 GLY 287 LEU 288 GLU 289 ASP 290 VAL 291 ALA 292 LEU 293 ALA 294 GLY 295 TYR 296 ALA 297 TYR 298 ARG 299 ARG 300 LEU 301 ALA 302 ALA 303 GLN 304 ARG 305 GLY 306 TRP 307 PRO 308 ALA 309 PRO 310

Ligands

Unit 3	CL 311 CL 312 CL 313 CL 314 GOL 315 GOL 316 IMD 317
Unit 4	CL 311 CL 312 CL 313 IMD 314 IMD 315