3G8A - Sequence, Chains, Asymmetric and Biological Units

• Title: T. THERMOPHILUS 16S RRNA G527 METHYLTRANSFERASE IN COMPLEX W IN SPACE GROUP P61
• Keywords: METHYLTRANSFERASE, 16S RRNA METHYLTRANSFERASE, TRANSLATION, PROCESSING, S-ADENOSYL-L-METHIONINE, TRANSFERASE
• Experiment: X-ray diffraction
• Number of Models: 1

Database	ID code	Status	Coordinate files
			Header	Asymmetric unit	Biological unit
PDB	3G8A	released	available	available	Quaternary Structure Server

Asymmetric unit from PDB

Unit	Type	Name	Chain ID	Residues	Atoms	Hetatoms
1	Protein	RIBOSOMAL RNA SMALL SUBUNIT METHYLTRANSFERASE G	A	236	1793	11
2	Protein	RIBOSOMAL RNA SMALL SUBUNIT METHYLTRANSFERASE G	B	239	1811	11
3	Protein	RIBOSOMAL RNA SMALL SUBUNIT METHYLTRANSFERASE G	C	238	1806	11
4	Protein	RIBOSOMAL RNA SMALL SUBUNIT METHYLTRANSFERASE G	D	239	1811	11
5	Protein	RIBOSOMAL RNA SMALL SUBUNIT METHYLTRANSFERASE G	E	239	1811	11
6	Protein	RIBOSOMAL RNA SMALL SUBUNIT METHYLTRANSFERASE G	F	239	1811	11
7	Ligand	RIBOSOMAL RNA SMALL SUBUNIT METHYLTRANSFERASE G	A	1	0	26
8	Ligand	RIBOSOMAL RNA SMALL SUBUNIT METHYLTRANSFERASE G	B	1	0	26
9	Ligand	RIBOSOMAL RNA SMALL SUBUNIT METHYLTRANSFERASE G	C	1	0	26
10	Ligand	RIBOSOMAL RNA SMALL SUBUNIT METHYLTRANSFERASE G	D	1	0	26
11	Ligand	RIBOSOMAL RNA SMALL SUBUNIT METHYLTRANSFERASE G	E	1	0	26
12	Ligand	RIBOSOMAL RNA SMALL SUBUNIT METHYLTRANSFERASE G	F	1	0	26
13	Water			1347	0	1347
total				2783	10843	1569

Proteins

Unit 1	MET 1 PHE 2 HIC 3 GLY 4 LYS 5 HIS 6 PRO 7 GLY 8 GLY 9 LEU 10 SER 11 GLU 12 ARG 13 GLY 14 ARG 15 ALA 16 LEU 17 LEU 18 LEU 19 GLU 20 GLY 21 GLY 22 LYS 23 ALA 24 LEU 25 GLY 26 LEU 27 ASP 28 LEU 29 LYS 30 PRO 31 HIS 32 LEU 33 GLU 34 ALA 35 PHE 36 SER 37 ARG 38 LEU 39 TYR 40 ALA 41 LEU 42 LEU 43 GLN 44 GLU 58 GLU 59 GLU 60 VAL 61 VAL 62 VAL 63 LYS 64 HIS 65 PHE 66 LEU 67 ASP 68 SER 69 LEU 70 THR 71 LEU 72 LEU 73 ARG 74 LEU 75 PRO 76 LEU 77 TRP 78 GLN 79 GLY 80 PRO 81 LEU 82 ARG 83 VAL 84 LEU 85 ASP 86 LEU 87 GLY 88 THR 89 GLY 90 ALA 91 GLY 92 PHE 93 PRO 94 GLY 95 LEU 96 PRO 97 LEU 98 LYS 99 ILE 100 VAL 101 ARG 102 PRO 103 GLU 104 LEU 105 GLU 106 LEU 107 VAL 108 LEU 109 VAL 110 ASP 111 ALA 112 THR 113 ARG 114 LYS 115 LYS 116 VAL 117 ALA 118 PHE 119 VAL 120 GLU 121 ARG 122 ALA 123 ILE 124 GLU 125 VAL 126 LEU 127 GLY 128 LEU 129 LYS 130 GLY 131 ALA 132 ARG 133 ALA 134 LEU 135 TRP 136 GLY 137 ARG 138 ALA 139 GLU 140 VAL 141 LEU 142 ALA 143 ARG 144 GLU 145 ALA 146 GLY 147 HIS 148 ARG 149 GLU 150 ALA 151 TYR 152 ALA 153 ARG 154 ALA 155 VAL 156 ALA 157 ARG 158 ALA 159 VAL 160 ALA 161 PRO 162 LEU 163 CYS 164 VAL 165 LEU 166 SER 167 GLU 168 LEU 169 LEU 170 LEU 171 PRO 172 PHE 173 LEU 174 GLU 175 VAL 176 GLY 177 GLY 178 ALA 179 ALA 180 VAL 181 ALA 182 MET 183 LYS 184 GLY 185 PRO 186 ARG 187 VAL 188 GLU 189 GLU 190 GLU 191 LEU 192 ALA 193 PRO 194 LEU 195 PRO 196 PRO 197 ALA 198 LEU 199 GLU 200 ARG 201 LEU 202 GLY 203 GLY 204 ARG 205 LEU 206 GLY 207 GLU 208 VAL 209 LEU 210 ALA 211 LEU 212 GLN 213 LEU 214 PRO 215 LEU 216 SER 217 GLY 218 GLU 219 ALA 220 ARG 221 HIS 222 LEU 223 VAL 224 VAL 225 LEU 226 GLU 227 LYS 228 THR 229 ALA 230 PRO 231 THR 232 PRO 233 PRO 234 ALA 235 TYR 236 PRO 237 ARG 238 ARG 239 PRO 240 GLY 241 VAL 242 PRO 243 GLU 244 ARG 245 HIS 246 PRO 247 LEU 248 CYS 249
Unit 2	MET 1 PHE 2 HIC 3 GLY 4 LYS 5 HIS 6 PRO 7 GLY 8 GLY 9 LEU 10 SER 11 GLU 12 ARG 13 GLY 14 ARG 15 ALA 16 LEU 17 LEU 18 LEU 19 GLU 20 GLY 21 GLY 22 LYS 23 ALA 24 LEU 25 GLY 26 LEU 27 ASP 28 LEU 29 LYS 30 PRO 31 HIS 32 LEU 33 GLU 34 ALA 35 PHE 36 SER 37 ARG 38 LEU 39 TYR 40 ALA 41 LEU 42 LEU 43 GLN 44 GLU 45 ALA 46 GLY 57 GLU 58 GLU 59 GLU 60 VAL 61 VAL 62 VAL 63 LYS 64 HIS 65 PHE 66 LEU 67 ASP 68 SER 69 LEU 70 THR 71 LEU 72 LEU 73 ARG 74 LEU 75 PRO 76 LEU 77 TRP 78 GLN 79 GLY 80 PRO 81 LEU 82 ARG 83 VAL 84 LEU 85 ASP 86 LEU 87 GLY 88 THR 89 GLY 90 ALA 91 GLY 92 PHE 93 PRO 94 GLY 95 LEU 96 PRO 97 LEU 98 LYS 99 ILE 100 VAL 101 ARG 102 PRO 103 GLU 104 LEU 105 GLU 106 LEU 107 VAL 108 LEU 109 VAL 110 ASP 111 ALA 112 THR 113 ARG 114 LYS 115 LYS 116 VAL 117 ALA 118 PHE 119 VAL 120 GLU 121 ARG 122 ALA 123 ILE 124 GLU 125 VAL 126 LEU 127 GLY 128 LEU 129 LYS 130 GLY 131 ALA 132 ARG 133 ALA 134 LEU 135 TRP 136 GLY 137 ARG 138 ALA 139 GLU 140 VAL 141 LEU 142 ALA 143 ARG 144 GLU 145 ALA 146 GLY 147 HIS 148 ARG 149 GLU 150 ALA 151 TYR 152 ALA 153 ARG 154 ALA 155 VAL 156 ALA 157 ARG 158 ALA 159 VAL 160 ALA 161 PRO 162 LEU 163 CYS 164 VAL 165 LEU 166 SER 167 GLU 168 LEU 169 LEU 170 LEU 171 PRO 172 PHE 173 LEU 174 GLU 175 VAL 176 GLY 177 GLY 178 ALA 179 ALA 180 VAL 181 ALA 182 MET 183 LYS 184 GLY 185 PRO 186 ARG 187 VAL 188 GLU 189 GLU 190 GLU 191 LEU 192 ALA 193 PRO 194 LEU 195 PRO 196 PRO 197 ALA 198 LEU 199 GLU 200 ARG 201 LEU 202 GLY 203 GLY 204 ARG 205 LEU 206 GLY 207 GLU 208 VAL 209 LEU 210 ALA 211 LEU 212 GLN 213 LEU 214 PRO 215 LEU 216 SER 217 GLY 218 GLU 219 ALA 220 ARG 221 HIS 222 LEU 223 VAL 224 VAL 225 LEU 226 GLU 227 LYS 228 THR 229 ALA 230 PRO 231 THR 232 PRO 233 PRO 234 ALA 235 TYR 236 PRO 237 ARG 238 ARG 239 PRO 240 GLY 241 VAL 242 PRO 243 GLU 244 ARG 245 HIS 246 PRO 247 LEU 248 CYS 249
Unit 3	MET 1 PHE 2 HIC 3 GLY 4 LYS 5 HIS 6 PRO 7 GLY 8 GLY 9 LEU 10 SER 11 GLU 12 ARG 13 GLY 14 ARG 15 ALA 16 LEU 17 LEU 18 LEU 19 GLU 20 GLY 21 GLY 22 LYS 23 ALA 24 LEU 25 GLY 26 LEU 27 ASP 28 LEU 29 LYS 30 PRO 31 HIS 32 LEU 33 GLU 34 ALA 35 PHE 36 SER 37 ARG 38 LEU 39 TYR 40 ALA 41 LEU 42 LEU 43 GLN 44 GLU 45 GLY 57 GLU 58 GLU 59 GLU 60 VAL 61 VAL 62 VAL 63 LYS 64 HIS 65 PHE 66 LEU 67 ASP 68 SER 69 LEU 70 THR 71 LEU 72 LEU 73 ARG 74 LEU 75 PRO 76 LEU 77 TRP 78 GLN 79 GLY 80 PRO 81 LEU 82 ARG 83 VAL 84 LEU 85 ASP 86 LEU 87 GLY 88 THR 89 GLY 90 ALA 91 GLY 92 PHE 93 PRO 94 GLY 95 LEU 96 PRO 97 LEU 98 LYS 99 ILE 100 VAL 101 ARG 102 PRO 103 GLU 104 LEU 105 GLU 106 LEU 107 VAL 108 LEU 109 VAL 110 ASP 111 ALA 112 THR 113 ARG 114 LYS 115 LYS 116 VAL 117 ALA 118 PHE 119 VAL 120 GLU 121 ARG 122 ALA 123 ILE 124 GLU 125 VAL 126 LEU 127 GLY 128 LEU 129 LYS 130 GLY 131 ALA 132 ARG 133 ALA 134 LEU 135 TRP 136 GLY 137 ARG 138 ALA 139 GLU 140 VAL 141 LEU 142 ALA 143 ARG 144 GLU 145 ALA 146 GLY 147 HIS 148 ARG 149 GLU 150 ALA 151 TYR 152 ALA 153 ARG 154 ALA 155 VAL 156 ALA 157 ARG 158 ALA 159 VAL 160 ALA 161 PRO 162 LEU 163 CYS 164 VAL 165 LEU 166 SER 167 GLU 168 LEU 169 LEU 170 LEU 171 PRO 172 PHE 173 LEU 174 GLU 175 VAL 176 GLY 177 GLY 178 ALA 179 ALA 180 VAL 181 ALA 182 MET 183 LYS 184 GLY 185 PRO 186 ARG 187 VAL 188 GLU 189 GLU 190 GLU 191 LEU 192 ALA 193 PRO 194 LEU 195 PRO 196 PRO 197 ALA 198 LEU 199 GLU 200 ARG 201 LEU 202 GLY 203 GLY 204 ARG 205 LEU 206 GLY 207 GLU 208 VAL 209 LEU 210 ALA 211 LEU 212 GLN 213 LEU 214 PRO 215 LEU 216 SER 217 GLY 218 GLU 219 ALA 220 ARG 221 HIS 222 LEU 223 VAL 224 VAL 225 LEU 226 GLU 227 LYS 228 THR 229 ALA 230 PRO 231 THR 232 PRO 233 PRO 234 ALA 235 TYR 236 PRO 237 ARG 238 ARG 239 PRO 240 GLY 241 VAL 242 PRO 243 GLU 244 ARG 245 HIS 246 PRO 247 LEU 248 CYS 249
Unit 4	MET 1 PHE 2 HIC 3 GLY 4 LYS 5 HIS 6 PRO 7 GLY 8 GLY 9 LEU 10 SER 11 GLU 12 ARG 13 GLY 14 ARG 15 ALA 16 LEU 17 LEU 18 LEU 19 GLU 20 GLY 21 GLY 22 LYS 23 ALA 24 LEU 25 GLY 26 LEU 27 ASP 28 LEU 29 LYS 30 PRO 31 HIS 32 LEU 33 GLU 34 ALA 35 PHE 36 SER 37 ARG 38 LEU 39 TYR 40 ALA 41 LEU 42 LEU 43 GLN 44 GLU 45 ALA 46 GLY 57 GLU 58 GLU 59 GLU 60 VAL 61 VAL 62 VAL 63 LYS 64 HIS 65 PHE 66 LEU 67 ASP 68 SER 69 LEU 70 THR 71 LEU 72 LEU 73 ARG 74 LEU 75 PRO 76 LEU 77 TRP 78 GLN 79 GLY 80 PRO 81 LEU 82 ARG 83 VAL 84 LEU 85 ASP 86 LEU 87 GLY 88 THR 89 GLY 90 ALA 91 GLY 92 PHE 93 PRO 94 GLY 95 LEU 96 PRO 97 LEU 98 LYS 99 ILE 100 VAL 101 ARG 102 PRO 103 GLU 104 LEU 105 GLU 106 LEU 107 VAL 108 LEU 109 VAL 110 ASP 111 ALA 112 THR 113 ARG 114 LYS 115 LYS 116 VAL 117 ALA 118 PHE 119 VAL 120 GLU 121 ARG 122 ALA 123 ILE 124 GLU 125 VAL 126 LEU 127 GLY 128 LEU 129 LYS 130 GLY 131 ALA 132 ARG 133 ALA 134 LEU 135 TRP 136 GLY 137 ARG 138 ALA 139 GLU 140 VAL 141 LEU 142 ALA 143 ARG 144 GLU 145 ALA 146 GLY 147 HIS 148 ARG 149 GLU 150 ALA 151 TYR 152 ALA 153 ARG 154 ALA 155 VAL 156 ALA 157 ARG 158 ALA 159 VAL 160 ALA 161 PRO 162 LEU 163 CYS 164 VAL 165 LEU 166 SER 167 GLU 168 LEU 169 LEU 170 LEU 171 PRO 172 PHE 173 LEU 174 GLU 175 VAL 176 GLY 177 GLY 178 ALA 179 ALA 180 VAL 181 ALA 182 MET 183 LYS 184 GLY 185 PRO 186 ARG 187 VAL 188 GLU 189 GLU 190 GLU 191 LEU 192 ALA 193 PRO 194 LEU 195 PRO 196 PRO 197 ALA 198 LEU 199 GLU 200 ARG 201 LEU 202 GLY 203 GLY 204 ARG 205 LEU 206 GLY 207 GLU 208 VAL 209 LEU 210 ALA 211 LEU 212 GLN 213 LEU 214 PRO 215 LEU 216 SER 217 GLY 218 GLU 219 ALA 220 ARG 221 HIS 222 LEU 223 VAL 224 VAL 225 LEU 226 GLU 227 LYS 228 THR 229 ALA 230 PRO 231 THR 232 PRO 233 PRO 234 ALA 235 TYR 236 PRO 237 ARG 238 ARG 239 PRO 240 GLY 241 VAL 242 PRO 243 GLU 244 ARG 245 HIS 246 PRO 247 LEU 248 CYS 249
Unit 5	MET 1 PHE 2 HIC 3 GLY 4 LYS 5 HIS 6 PRO 7 GLY 8 GLY 9 LEU 10 SER 11 GLU 12 ARG 13 GLY 14 ARG 15 ALA 16 LEU 17 LEU 18 LEU 19 GLU 20 GLY 21 GLY 22 LYS 23 ALA 24 LEU 25 GLY 26 LEU 27 ASP 28 LEU 29 LYS 30 PRO 31 HIS 32 LEU 33 GLU 34 ALA 35 PHE 36 SER 37 ARG 38 LEU 39 TYR 40 ALA 41 LEU 42 LEU 43 GLN 44 GLU 45 ALA 46 GLY 57 GLU 58 GLU 59 GLU 60 VAL 61 VAL 62 VAL 63 LYS 64 HIS 65 PHE 66 LEU 67 ASP 68 SER 69 LEU 70 THR 71 LEU 72 LEU 73 ARG 74 LEU 75 PRO 76 LEU 77 TRP 78 GLN 79 GLY 80 PRO 81 LEU 82 ARG 83 VAL 84 LEU 85 ASP 86 LEU 87 GLY 88 THR 89 GLY 90 ALA 91 GLY 92 PHE 93 PRO 94 GLY 95 LEU 96 PRO 97 LEU 98 LYS 99 ILE 100 VAL 101 ARG 102 PRO 103 GLU 104 LEU 105 GLU 106 LEU 107 VAL 108 LEU 109 VAL 110 ASP 111 ALA 112 THR 113 ARG 114 LYS 115 LYS 116 VAL 117 ALA 118 PHE 119 VAL 120 GLU 121 ARG 122 ALA 123 ILE 124 GLU 125 VAL 126 LEU 127 GLY 128 LEU 129 LYS 130 GLY 131 ALA 132 ARG 133 ALA 134 LEU 135 TRP 136 GLY 137 ARG 138 ALA 139 GLU 140 VAL 141 LEU 142 ALA 143 ARG 144 GLU 145 ALA 146 GLY 147 HIS 148 ARG 149 GLU 150 ALA 151 TYR 152 ALA 153 ARG 154 ALA 155 VAL 156 ALA 157 ARG 158 ALA 159 VAL 160 ALA 161 PRO 162 LEU 163 CYS 164 VAL 165 LEU 166 SER 167 GLU 168 LEU 169 LEU 170 LEU 171 PRO 172 PHE 173 LEU 174 GLU 175 VAL 176 GLY 177 GLY 178 ALA 179 ALA 180 VAL 181 ALA 182 MET 183 LYS 184 GLY 185 PRO 186 ARG 187 VAL 188 GLU 189 GLU 190 GLU 191 LEU 192 ALA 193 PRO 194 LEU 195 PRO 196 PRO 197 ALA 198 LEU 199 GLU 200 ARG 201 LEU 202 GLY 203 GLY 204 ARG 205 LEU 206 GLY 207 GLU 208 VAL 209 LEU 210 ALA 211 LEU 212 GLN 213 LEU 214 PRO 215 LEU 216 SER 217 GLY 218 GLU 219 ALA 220 ARG 221 HIS 222 LEU 223 VAL 224 VAL 225 LEU 226 GLU 227 LYS 228 THR 229 ALA 230 PRO 231 THR 232 PRO 233 PRO 234 ALA 235 TYR 236 PRO 237 ARG 238 ARG 239 PRO 240 GLY 241 VAL 242 PRO 243 GLU 244 ARG 245 HIS 246 PRO 247 LEU 248 CYS 249
Unit 6	MET 1 PHE 2 HIC 3 GLY 4 LYS 5 HIS 6 PRO 7 GLY 8 GLY 9 LEU 10 SER 11 GLU 12 ARG 13 GLY 14 ARG 15 ALA 16 LEU 17 LEU 18 LEU 19 GLU 20 GLY 21 GLY 22 LYS 23 ALA 24 LEU 25 GLY 26 LEU 27 ASP 28 LEU 29 LYS 30 PRO 31 HIS 32 LEU 33 GLU 34 ALA 35 PHE 36 SER 37 ARG 38 LEU 39 TYR 40 ALA 41 LEU 42 LEU 43 GLN 44 GLU 45 ALA 46 GLY 57 GLU 58 GLU 59 GLU 60 VAL 61 VAL 62 VAL 63 LYS 64 HIS 65 PHE 66 LEU 67 ASP 68 SER 69 LEU 70 THR 71 LEU 72 LEU 73 ARG 74 LEU 75 PRO 76 LEU 77 TRP 78 GLN 79 GLY 80 PRO 81 LEU 82 ARG 83 VAL 84 LEU 85 ASP 86 LEU 87 GLY 88 THR 89 GLY 90 ALA 91 GLY 92 PHE 93 PRO 94 GLY 95 LEU 96 PRO 97 LEU 98 LYS 99 ILE 100 VAL 101 ARG 102 PRO 103 GLU 104 LEU 105 GLU 106 LEU 107 VAL 108 LEU 109 VAL 110 ASP 111 ALA 112 THR 113 ARG 114 LYS 115 LYS 116 VAL 117 ALA 118 PHE 119 VAL 120 GLU 121 ARG 122 ALA 123 ILE 124 GLU 125 VAL 126 LEU 127 GLY 128 LEU 129 LYS 130 GLY 131 ALA 132 ARG 133 ALA 134 LEU 135 TRP 136 GLY 137 ARG 138 ALA 139 GLU 140 VAL 141 LEU 142 ALA 143 ARG 144 GLU 145 ALA 146 GLY 147 HIS 148 ARG 149 GLU 150 ALA 151 TYR 152 ALA 153 ARG 154 ALA 155 VAL 156 ALA 157 ARG 158 ALA 159 VAL 160 ALA 161 PRO 162 LEU 163 CYS 164 VAL 165 LEU 166 SER 167 GLU 168 LEU 169 LEU 170 LEU 171 PRO 172 PHE 173 LEU 174 GLU 175 VAL 176 GLY 177 GLY 178 ALA 179 ALA 180 VAL 181 ALA 182 MET 183 LYS 184 GLY 185 PRO 186 ARG 187 VAL 188 GLU 189 GLU 190 GLU 191 LEU 192 ALA 193 PRO 194 LEU 195 PRO 196 PRO 197 ALA 198 LEU 199 GLU 200 ARG 201 LEU 202 GLY 203 GLY 204 ARG 205 LEU 206 GLY 207 GLU 208 VAL 209 LEU 210 ALA 211 LEU 212 GLN 213 LEU 214 PRO 215 LEU 216 SER 217 GLY 218 GLU 219 ALA 220 ARG 221 HIS 222 LEU 223 VAL 224 VAL 225 LEU 226 GLU 227 LYS 228 THR 229 ALA 230 PRO 231 THR 232 PRO 233 PRO 234 ALA 235 TYR 236 PRO 237 ARG 238 ARG 239 PRO 240 GLY 241 VAL 242 PRO 243 GLU 244 ARG 245 HIS 246 PRO 247 LEU 248 CYS 249

Ligands

Unit 7	SAH 303
Unit 8	SAH 303
Unit 9	SAH 303
Unit 10	SAH 303
Unit 11	SAH 303
Unit 12	SAH 303