3DAH - Sequence, Chains, Asymmetric and Biological Units

• Title: 2.3 A CRYSTAL STRUCTURE OF RIBOSE-PHOSPHATE PYROPHOSPHOKINAS BURKHOLDERIA PSEUDOMALLEI
• Keywords: BURKHOLDERIA, PSEUDOMALLEI, RIBOSE, PHOSPHATE, PYROPHOSPHOKI SEATTLE STRUCTURAL GENOMICS CENTER FOR INFECTIOUS DISEASE, MAGNESIUM, METAL BINDING, NUCLEOTIDE BIOSYNTHESIS, TRANSFER
• Experiment: X-ray diffraction
• Number of Models: 1

Database	ID code	Status	Coordinate files
			Header	Asymmetric unit	Biological unit
PDB	3DAH	released	available	available	Quaternary Structure Server

Asymmetric unit from PDB

Unit	Type	Name	Chain ID	Residues	Atoms	Hetatoms
1	Protein	RIBOSE-PHOSPHATE PYROPHOSPHOKINASE	A	290	2174	0
2	Protein	RIBOSE-PHOSPHATE PYROPHOSPHOKINASE	B	294	2205	0
3	Protein	RIBOSE-PHOSPHATE PYROPHOSPHOKINASE	C	300	2258	0
4	Ligand	RIBOSE-PHOSPHATE PYROPHOSPHOKINASE	A	3	0	33
5	Ligand	RIBOSE-PHOSPHATE PYROPHOSPHOKINASE	B	6	0	66
6	Ligand	RIBOSE-PHOSPHATE PYROPHOSPHOKINASE	C	1	0	5
7	Water			138	0	138
total				1032	6637	242

Proteins

Unit 1	ASP 5 GLY 6 LEU 7 MET 8 VAL 9 PHE 10 THR 11 GLY 12 ASN 13 ALA 14 ASN 15 PRO 16 ALA 17 LEU 18 ALA 19 GLN 20 GLU 21 VAL 22 VAL 23 LYS 24 ILE 25 LEU 26 GLY 27 ILE 28 PRO 29 LEU 30 GLY 31 LYS 32 ALA 33 MET 34 VAL 35 SER 36 ARG 37 PHE 38 SER 39 ASP 40 GLY 41 GLU 42 ILE 43 GLN 44 VAL 45 GLU 46 ILE 47 GLN 48 GLU 49 ASN 50 VAL 51 ARG 52 GLY 53 LYS 54 ASP 55 VAL 56 PHE 57 VAL 58 LEU 59 GLN 60 SER 61 THR 62 CYS 63 ALA 64 PRO 65 THR 66 ASN 67 ASP 68 ASN 69 LEU 70 MET 71 GLU 72 LEU 73 MET 74 ILE 75 MET 76 VAL 77 ASP 78 ALA 79 LEU 80 LYS 81 ARG 82 ALA 83 SER 84 ALA 85 GLY 86 ARG 87 ILE 88 THR 89 ALA 90 ALA 91 ILE 92 PRO 93 TYR 94 PHE 95 GLY 96 TYR 97 ALA 98 ARG 99 GLN 100 ASP 101 ARG 102 ARG 103 PRO 104 ARG 105 SER 106 ALA 107 ARG 108 VAL 109 ALA 110 ILE 111 SER 112 ALA 113 LYS 114 VAL 115 VAL 116 ALA 117 ASN 118 MET 119 LEU 120 GLU 121 ILE 122 ALA 123 GLY 124 VAL 125 GLU 126 ARG 127 ILE 128 ILE 129 THR 130 MET 131 ASP 132 LEU 133 HIS 134 ALA 135 ASP 136 GLN 137 ILE 138 GLN 139 GLY 140 PHE 141 PHE 142 ASP 143 ILE 144 PRO 145 VAL 146 ASP 147 ASN 148 ILE 149 TYR 150 ALA 151 THR 152 PRO 153 ILE 154 LEU 155 LEU 156 GLY 157 ASP 158 LEU 159 ARG 160 LYS 161 GLN 162 ASN 163 TYR 164 PRO 165 ASP 166 LEU 167 LEU 168 VAL 169 VAL 170 SER 171 PRO 172 ASP 173 VAL 174 GLY 175 GLY 176 VAL 177 VAL 178 ARG 179 ALA 180 ARG 181 ALA 182 LEU 183 ALA 184 LYS 185 GLN 186 LEU 187 ASN 188 CYS 189 ASP 190 LEU 191 ALA 192 ILE 193 GLU 214 GLY 215 ARG 216 THR 217 CYS 218 VAL 219 ILE 220 MET 221 ASP 222 ASP 223 MET 224 VAL 225 ASP 226 THR 227 ALA 228 GLY 229 THR 230 LEU 231 CYS 232 LYS 233 ALA 234 ALA 235 GLN 236 VAL 237 LEU 238 LYS 239 GLU 240 ARG 241 GLY 242 ALA 243 LYS 244 GLN 245 VAL 246 PHE 247 ALA 248 TYR 249 ALA 250 THR 251 HIS 252 PRO 253 VAL 254 LEU 255 SER 256 GLY 257 GLY 258 ALA 259 ALA 260 ASP 261 ARG 262 ILE 263 ALA 264 ALA 265 SER 266 ALA 267 LEU 268 ASP 269 GLU 270 LEU 271 VAL 272 VAL 273 THR 274 ASP 275 THR 276 ILE 277 PRO 278 LEU 279 SER 280 ALA 281 GLU 282 SER 283 LEU 284 ALA 285 CYS 286 PRO 287 LYS 288 ILE 289 ARG 290 ALA 291 LEU 292 SER 293 SER 294 ALA 295 GLY 296 LEU 297 LEU 298 ALA 299 GLU 300 THR 301 PHE 302 SER 303 ARG 304 ILE 305 ARG 306 ARG 307 GLY 308 ASP 309 SER 310 VAL 311 MET 312 SER 313 LEU 314
Unit 2	ASP 5 GLY 6 LEU 7 MET 8 VAL 9 PHE 10 THR 11 GLY 12 ASN 13 ALA 14 ASN 15 PRO 16 ALA 17 LEU 18 ALA 19 GLN 20 GLU 21 VAL 22 VAL 23 LYS 24 ILE 25 LEU 26 GLY 27 ILE 28 PRO 29 LEU 30 GLY 31 LYS 32 ALA 33 MET 34 VAL 35 SER 36 ARG 37 PHE 38 SER 39 ASP 40 GLY 41 GLU 42 ILE 43 GLN 44 VAL 45 GLU 46 ILE 47 GLN 48 GLU 49 ASN 50 VAL 51 ARG 52 GLY 53 LYS 54 ASP 55 VAL 56 PHE 57 VAL 58 LEU 59 GLN 60 SER 61 THR 62 CYS 63 ALA 64 PRO 65 THR 66 ASN 67 ASP 68 ASN 69 LEU 70 MET 71 GLU 72 LEU 73 MET 74 ILE 75 MET 76 VAL 77 ASP 78 ALA 79 LEU 80 LYS 81 ARG 82 ALA 83 SER 84 ALA 85 GLY 86 ARG 87 ILE 88 THR 89 ALA 90 ALA 91 ILE 92 PRO 93 TYR 94 PHE 95 GLY 96 TYR 97 ALA 98 ARG 99 GLN 100 ASP 101 ARG 102 ARG 103 PRO 104 ARG 105 SER 106 ALA 107 ARG 108 VAL 109 ALA 110 ILE 111 SER 112 ALA 113 LYS 114 VAL 115 VAL 116 ALA 117 ASN 118 MET 119 LEU 120 GLU 121 ILE 122 ALA 123 GLY 124 VAL 125 GLU 126 ARG 127 ILE 128 ILE 129 THR 130 MET 131 ASP 132 LEU 133 HIS 134 ALA 135 ASP 136 GLN 137 ILE 138 GLN 139 GLY 140 PHE 141 PHE 142 ASP 143 ILE 144 PRO 145 VAL 146 ASP 147 ASN 148 ILE 149 TYR 150 ALA 151 THR 152 PRO 153 ILE 154 LEU 155 LEU 156 GLY 157 ASP 158 LEU 159 ARG 160 LYS 161 GLN 162 ASN 163 TYR 164 PRO 165 ASP 166 LEU 167 LEU 168 VAL 169 VAL 170 SER 171 PRO 172 ASP 173 VAL 174 GLY 175 GLY 176 VAL 177 VAL 178 ARG 179 ALA 180 ARG 181 ALA 182 LEU 183 ALA 184 LYS 185 GLN 186 LEU 187 ASN 188 CYS 189 ASP 190 LEU 191 ALA 192 ILE 193 GLY 211 GLU 212 VAL 213 GLU 214 GLY 215 ARG 216 THR 217 CYS 218 VAL 219 ILE 220 MET 221 ASP 222 ASP 223 MET 224 VAL 225 ASP 226 THR 227 ALA 228 GLY 229 THR 230 LEU 231 CYS 232 LYS 233 ALA 234 ALA 235 GLN 236 VAL 237 LEU 238 LYS 239 GLU 240 ARG 241 GLY 242 ALA 243 LYS 244 GLN 245 VAL 246 PHE 247 ALA 248 TYR 249 ALA 250 THR 251 HIS 252 PRO 253 VAL 254 LEU 255 SER 256 GLY 257 GLY 258 ALA 259 ALA 260 ASP 261 ARG 262 ILE 263 ALA 264 ALA 265 SER 266 ALA 267 LEU 268 ASP 269 GLU 270 LEU 271 VAL 272 VAL 273 THR 274 ASP 275 THR 276 ILE 277 PRO 278 LEU 279 SER 280 ALA 281 GLU 282 SER 283 LEU 284 ALA 285 CYS 286 PRO 287 LYS 288 ILE 289 ARG 290 ALA 291 LEU 292 SER 293 SER 294 ALA 295 GLY 296 LEU 297 LEU 298 ALA 299 GLU 300 THR 301 PHE 302 SER 303 ARG 304 ILE 305 ARG 306 ARG 307 GLY 308 ASP 309 SER 310 VAL 311 MET 312 SER 313 LEU 314 PHE 315
Unit 3	GLY 6 LEU 7 MET 8 VAL 9 PHE 10 THR 11 GLY 12 ASN 13 ALA 14 ASN 15 PRO 16 ALA 17 LEU 18 ALA 19 GLN 20 GLU 21 VAL 22 VAL 23 LYS 24 ILE 25 LEU 26 GLY 27 ILE 28 PRO 29 LEU 30 GLY 31 LYS 32 ALA 33 MET 34 VAL 35 SER 36 ARG 37 PHE 38 SER 39 ASP 40 GLY 41 GLU 42 ILE 43 GLN 44 VAL 45 GLU 46 ILE 47 GLN 48 GLU 49 ASN 50 VAL 51 ARG 52 GLY 53 LYS 54 ASP 55 VAL 56 PHE 57 VAL 58 LEU 59 GLN 60 SER 61 THR 62 CYS 63 ALA 64 PRO 65 THR 66 ASN 67 ASP 68 ASN 69 LEU 70 MET 71 GLU 72 LEU 73 MET 74 ILE 75 MET 76 VAL 77 ASP 78 ALA 79 LEU 80 LYS 81 ARG 82 ALA 83 SER 84 ALA 85 GLY 86 ARG 87 ILE 88 THR 89 ALA 90 ALA 91 ILE 92 PRO 93 TYR 94 PHE 95 GLY 96 TYR 97 ALA 98 ARG 99 GLN 100 ASP 101 ARG 102 ARG 103 PRO 104 ARG 105 SER 106 ALA 107 ARG 108 VAL 109 ALA 110 ILE 111 SER 112 ALA 113 LYS 114 VAL 115 VAL 116 ALA 117 ASN 118 MET 119 LEU 120 GLU 121 ILE 122 ALA 123 GLY 124 VAL 125 GLU 126 ARG 127 ILE 128 ILE 129 THR 130 MET 131 ASP 132 LEU 133 HIS 134 ALA 135 ASP 136 GLN 137 ILE 138 GLN 139 GLY 140 PHE 141 PHE 142 ASP 143 ILE 144 PRO 145 VAL 146 ASP 147 ASN 148 ILE 149 TYR 150 ALA 151 THR 152 PRO 153 ILE 154 LEU 155 LEU 156 GLY 157 ASP 158 LEU 159 ARG 160 LYS 161 GLN 162 ASN 163 TYR 164 PRO 165 ASP 166 LEU 167 LEU 168 VAL 169 VAL 170 SER 171 PRO 172 ASP 173 VAL 174 GLY 175 GLY 176 VAL 177 VAL 178 ARG 179 ALA 180 ARG 181 ALA 182 LEU 183 ALA 184 LYS 185 GLN 186 LEU 187 ASN 188 CYS 189 ASP 190 LEU 191 ALA 192 ILE 193 ILE 194 ASP 195 LYS 196 ARG 197 ARG 198 VAL 206 MET 207 ASN 208 ILE 209 ILE 210 GLY 211 GLU 212 VAL 213 GLU 214 GLY 215 ARG 216 THR 217 CYS 218 VAL 219 ILE 220 MET 221 ASP 222 ASP 223 MET 224 VAL 225 ASP 226 THR 227 ALA 228 GLY 229 THR 230 LEU 231 CYS 232 LYS 233 ALA 234 ALA 235 GLN 236 VAL 237 LEU 238 LYS 239 GLU 240 ARG 241 GLY 242 ALA 243 LYS 244 GLN 245 VAL 246 PHE 247 ALA 248 TYR 249 ALA 250 THR 251 HIS 252 PRO 253 VAL 254 LEU 255 SER 256 GLY 257 GLY 258 ALA 259 ALA 260 ASP 261 ARG 262 ILE 263 ALA 264 ALA 265 SER 266 ALA 267 LEU 268 ASP 269 GLU 270 LEU 271 VAL 272 VAL 273 THR 274 ASP 275 THR 276 ILE 277 PRO 278 LEU 279 SER 280 ALA 281 GLU 282 SER 283 LEU 284 ALA 285 CYS 286 PRO 287 LYS 288 ILE 289 ARG 290 ALA 291 LEU 292 SER 293 SER 294 ALA 295 GLY 296 LEU 297 LEU 298 ALA 299 GLU 300 THR 301 PHE 302 SER 303 ARG 304 ILE 305 ARG 306 ARG 307 GLY 308 ASP 309 SER 310 VAL 311 MET 312

Ligands

Unit 4	PO4 319 PO4 320 AMP 401
Unit 5	PO4 319 PO4 320 PO4 321 PO4 322 AMP 401 AMP 402
Unit 6	PO4 319