3D5T - Sequence, Chains, Asymmetric and Biological Units

• Title: CRYSTAL STRUCTURE OF MALATE DEHYDROGENASE FROM BURKHOLDERIA PSEUDOMALLEI
• Keywords: SSGCID, STRUCTURAL GENOMICS, NIAID, DECODE BIOSTRUCTURES, MA DEHYDROGENASE, NAD, OXIDOREDUCTASE, TRICARBOXYLIC ACID CYCL SEATTLE STRUCTURAL GENOMICS CENTER FOR INFECTIOUS DISEASE
• Experiment: X-ray diffraction
• Number of Models: 1

Database	ID code	Status	Coordinate files
			Header	Asymmetric unit	Biological unit
PDB	3D5T	released	available	available	Quaternary Structure Server

Asymmetric unit from PDB

Unit	Type	Name	Chain ID	Residues	Atoms	Hetatoms
1	Protein	MALATE DEHYDROGENASE	A	321	2376	0
2	Protein	MALATE DEHYDROGENASE	B	321	2395	0
3	Protein	MALATE DEHYDROGENASE	C	323	2418	0
4	Protein	MALATE DEHYDROGENASE	D	321	2390	0
5	Ligand	MALATE DEHYDROGENASE	B	2	0	2
6	Water			427	0	427
total				1715	9579	429

Proteins

Unit 1	LYS 3 PRO 4 ALA 5 LYS 6 ARG 7 VAL 8 ALA 9 VAL 10 THR 11 GLY 12 ALA 13 ALA 14 GLY 15 GLN 16 ILE 17 ALA 18 TYR 19 SER 20 LEU 21 LEU 22 PHE 23 ARG 24 ILE 25 ALA 26 ASN 27 GLY 28 ASP 29 LEU 30 LEU 31 GLY 32 LYS 33 ASP 34 GLN 35 PRO 36 VAL 37 ILE 38 LEU 39 GLN 40 LEU 41 LEU 42 ASP 43 LEU 44 PRO 45 GLN 46 ALA 47 GLN 48 ALA 49 ALA 50 VAL 51 LYS 52 GLY 53 VAL 54 VAL 55 MET 56 GLU 57 LEU 58 ASP 59 ASP 60 CYS 61 ALA 62 PHE 63 PRO 64 LEU 65 LEU 66 ALA 67 GLY 68 VAL 69 VAL 70 ILE 71 THR 72 ASP 73 ASP 74 PRO 75 LYS 76 VAL 77 ALA 78 PHE 79 LYS 80 ASP 81 ALA 82 ASP 83 VAL 84 ALA 85 LEU 86 LEU 87 VAL 88 GLY 89 ALA 90 ARG 91 PRO 92 ARG 93 SER 94 MET 97 GLU 98 ARG 99 LYS 100 ASP 101 LEU 102 LEU 103 SER 104 ALA 105 ASN 106 ALA 107 GLU 108 ILE 109 PHE 110 THR 111 VAL 112 GLN 113 GLY 114 ALA 115 ALA 116 LEU 117 ASN 118 GLU 119 VAL 120 ALA 121 SER 122 ARG 123 ASP 124 VAL 125 LYS 126 VAL 127 LEU 128 VAL 129 VAL 130 GLY 131 ASN 132 PRO 133 ALA 134 ASN 135 THR 136 ASN 137 ALA 138 TYR 139 ILE 140 ALA 141 MET 142 LYS 143 SER 144 ALA 145 PRO 146 ASP 147 LEU 148 PRO 149 LYS 150 LYS 151 ASN 152 PHE 153 THR 154 ALA 155 MET 156 LEU 157 ARG 158 LEU 159 ASP 160 HIS 161 ASN 162 ARG 163 ALA 164 LEU 165 SER 166 GLN 167 LEU 168 ALA 169 ALA 170 LYS 171 SER 172 GLY 173 LYS 174 PRO 175 VAL 176 ALA 177 SER 178 ILE 179 GLU 180 LYS 181 LEU 182 ALA 183 VAL 184 TRP 185 GLY 186 ASN 187 HIS 188 SER 189 PRO 190 THR 191 MET 192 TYR 193 PRO 194 ASP 195 PHE 196 ARG 197 PHE 198 ALA 199 THR 200 ALA 201 GLU 202 GLY 203 GLU 204 SER 205 LEU 206 LEU 207 LYS 208 LEU 209 ILE 210 ASN 211 ASP 212 ASP 213 VAL 214 TRP 215 ASN 216 ARG 217 ASP 218 THR 219 PHE 220 ILE 221 PRO 222 THR 223 VAL 224 GLY 225 LYS 226 ARG 227 GLY 228 ALA 229 ALA 230 ILE 231 ILE 232 GLU 233 ALA 234 ARG 235 GLY 236 LEU 237 SER 238 SER 239 ALA 240 ALA 241 SER 242 ALA 243 ALA 244 ASN 245 ALA 246 ALA 247 ILE 248 ASP 249 HIS 250 VAL 251 ARG 252 ASP 253 TRP 254 VAL 255 LEU 256 GLY 257 THR 258 ASN 259 GLY 260 LYS 261 TRP 262 VAL 263 THR 264 MET 265 GLY 266 ILE 267 PRO 268 SER 269 ASP 270 GLY 271 SER 272 TYR 273 GLY 274 ILE 275 PRO 276 GLU 277 ASP 278 ILE 279 ILE 280 TYR 281 GLY 282 VAL 283 PRO 284 VAL 285 ILE 286 CYS 287 GLU 288 ASN 289 GLY 290 GLU 291 TYR 292 LYS 293 ARG 294 VAL 295 GLU 296 GLY 297 LEU 298 GLU 299 ILE 300 ASP 301 ALA 302 PHE 303 SER 304 ARG 305 GLU 306 LYS 307 MET 308 ASP 309 GLY 310 THR 311 LEU 312 ALA 313 GLU 314 LEU 315 LEU 316 GLU 317 GLU 318 ARG 319 ASP 320 GLY 321 VAL 322 ALA 323 HIS 324 LEU 325
Unit 2	LYS 3 PRO 4 ALA 5 LYS 6 ARG 7 VAL 8 ALA 9 VAL 10 THR 11 GLY 12 ALA 13 ALA 14 GLY 15 GLN 16 ILE 17 ALA 18 TYR 19 SER 20 LEU 21 LEU 22 PHE 23 ARG 24 ILE 25 ALA 26 ASN 27 GLY 28 ASP 29 LEU 30 LEU 31 GLY 32 LYS 33 ASP 34 GLN 35 PRO 36 VAL 37 ILE 38 LEU 39 GLN 40 LEU 41 LEU 42 ASP 43 LEU 44 PRO 45 GLN 46 ALA 47 GLN 48 ALA 49 ALA 50 VAL 51 LYS 52 GLY 53 VAL 54 VAL 55 MET 56 GLU 57 LEU 58 ASP 59 ASP 60 CYS 61 ALA 62 PHE 63 PRO 64 LEU 65 LEU 66 ALA 67 GLY 68 VAL 69 VAL 70 ILE 71 THR 72 ASP 73 ASP 74 PRO 75 LYS 76 VAL 77 ALA 78 PHE 79 LYS 80 ASP 81 ALA 82 ASP 83 VAL 84 ALA 85 LEU 86 LEU 87 VAL 88 GLY 89 ALA 90 ARG 91 PRO 92 ARG 93 SER 94 MET 97 GLU 98 ARG 99 LYS 100 ASP 101 LEU 102 LEU 103 SER 104 ALA 105 ASN 106 ALA 107 GLU 108 ILE 109 PHE 110 THR 111 VAL 112 GLN 113 GLY 114 ALA 115 ALA 116 LEU 117 ASN 118 GLU 119 VAL 120 ALA 121 SER 122 ARG 123 ASP 124 VAL 125 LYS 126 VAL 127 LEU 128 VAL 129 VAL 130 GLY 131 ASN 132 PRO 133 ALA 134 ASN 135 THR 136 ASN 137 ALA 138 TYR 139 ILE 140 ALA 141 MET 142 LYS 143 SER 144 ALA 145 PRO 146 ASP 147 LEU 148 PRO 149 LYS 150 LYS 151 ASN 152 PHE 153 THR 154 ALA 155 MET 156 LEU 157 ARG 158 LEU 159 ASP 160 HIS 161 ASN 162 ARG 163 ALA 164 LEU 165 SER 166 GLN 167 LEU 168 ALA 169 ALA 170 LYS 171 SER 172 GLY 173 LYS 174 PRO 175 VAL 176 ALA 177 SER 178 ILE 179 GLU 180 LYS 181 LEU 182 ALA 183 VAL 184 TRP 185 GLY 186 ASN 187 HIS 188 SER 189 PRO 190 THR 191 MET 192 TYR 193 PRO 194 ASP 195 PHE 196 ARG 197 PHE 198 ALA 199 THR 200 ALA 201 GLU 202 GLY 203 GLU 204 SER 205 LEU 206 LEU 207 LYS 208 LEU 209 ILE 210 ASN 211 ASP 212 ASP 213 VAL 214 TRP 215 ASN 216 ARG 217 ASP 218 THR 219 PHE 220 ILE 221 PRO 222 THR 223 VAL 224 GLY 225 LYS 226 ARG 227 GLY 228 ALA 229 ALA 230 ILE 231 ILE 232 GLU 233 ALA 234 ARG 235 GLY 236 LEU 237 SER 238 SER 239 ALA 240 ALA 241 SER 242 ALA 243 ALA 244 ASN 245 ALA 246 ALA 247 ILE 248 ASP 249 HIS 250 VAL 251 ARG 252 ASP 253 TRP 254 VAL 255 LEU 256 GLY 257 THR 258 ASN 259 GLY 260 LYS 261 TRP 262 VAL 263 THR 264 MET 265 GLY 266 ILE 267 PRO 268 SER 269 ASP 270 GLY 271 SER 272 TYR 273 GLY 274 ILE 275 PRO 276 GLU 277 ASP 278 ILE 279 ILE 280 TYR 281 GLY 282 VAL 283 PRO 284 VAL 285 ILE 286 CYS 287 GLU 288 ASN 289 GLY 290 GLU 291 TYR 292 LYS 293 ARG 294 VAL 295 GLU 296 GLY 297 LEU 298 GLU 299 ILE 300 ASP 301 ALA 302 PHE 303 SER 304 ARG 305 GLU 306 LYS 307 MET 308 ASP 309 GLY 310 THR 311 LEU 312 ALA 313 GLU 314 LEU 315 LEU 316 GLU 317 GLU 318 ARG 319 ASP 320 GLY 321 VAL 322 ALA 323 HIS 324 LEU 325
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Ligands

Unit 5

MG 401 NA 402