3CVT - Sequence, Chains, Asymmetric and Biological Units

• Title: CRYSTAL STRUCTURE OF AN ALKA HOST/GUEST COMPLEX 8OXOGUANINE: BASE PAIR
• Keywords: ALKA, 8OXOGUANINE, DNA REPAIR, HOST-GUEST COMPLEX, DNA STRUC DAMAGE, HYDROLASE, HYDROLASE-DNA COMPLEX
• Experiment: X-ray diffraction
• Number of Models: 1

Database	ID code	Status	Coordinate files
			Header	Asymmetric unit	Biological unit
PDB	3CVT	released	available	available	Quaternary Structure Server

Asymmetric unit from PDB

Unit	Type	Name	Chain ID	Residues	Atoms	Hetatoms
1	Protein	DNA-3-METHYLADENINE GLYCOSYLASE 2	A	282	2215	0
2	Protein	DNA-3-METHYLADENINE GLYCOSYLASE 2	B	282	2215	0
3	Protein	DNA-3-METHYLADENINE GLYCOSYLASE 2	C	282	2215	0
4	Protein	DNA-3-METHYLADENINE GLYCOSYLASE 2	D	282	2215	0
5	Other macromolecule	DNA (5'-D(*DGP*DAP*DCP*DAP*DTP*(8OG) P*DAP*DGP*DTP*DGP*DCP*DC)-3')	E	12	223	23
6	Other macromolecule	DNA (5'-D(*DGP*DGP*DCP*DAP*DCP*DTP*DCP*DAP*DTP*DG 3')	F	12	241	0
7	Other macromolecule	DNA (5'-D(*DGP*DAP*DCP*DAP*DTP*(8OG) P*DAP*DGP*DTP*DGP*DCP*DC)-3')	G	12	223	23
8	Other macromolecule	DNA (5'-D(*DGP*DGP*DCP*DAP*DCP*DTP*DCP*DAP*DTP*DG 3')	H	12	241	0
9	Water			29	0	29
total				1205	9788	75

Proteins

Unit 1	MET 1 TYR 2 THR 3 LEU 4 ASN 5 TRP 6 GLN 7 PRO 8 PRO 9 TYR 10 ASP 11 TRP 12 SER 13 TRP 14 MET 15 LEU 16 GLY 17 PHE 18 LEU 19 ALA 20 ALA 21 ARG 22 ALA 23 VAL 24 SER 25 SER 26 VAL 27 GLU 28 THR 29 VAL 30 ALA 31 ASP 32 SER 33 TYR 34 TYR 35 ALA 36 ARG 37 SER 38 LEU 39 ALA 40 VAL 41 GLY 42 GLU 43 TYR 44 ARG 45 GLY 46 VAL 47 VAL 48 THR 49 ALA 50 ILE 51 PRO 52 ASP 53 ILE 54 ALA 55 ARG 56 HIS 57 THR 58 LEU 59 HIS 60 ILE 61 ASN 62 LEU 63 SER 64 ALA 65 GLY 66 LEU 67 GLU 68 PRO 69 VAL 70 ALA 71 ALA 72 GLU 73 CYS 74 LEU 75 ALA 76 LYS 77 MET 78 SER 79 ARG 80 LEU 81 PHE 82 ASP 83 LEU 84 GLN 85 CYS 86 ASN 87 PRO 88 GLN 89 ILE 90 VAL 91 ASN 92 GLY 93 ALA 94 LEU 95 GLY 96 ARG 97 LEU 98 GLY 99 ALA 100 ALA 101 ARG 102 PRO 103 GLY 104 LEU 105 ARG 106 LEU 107 PRO 108 GLY 109 CYS 110 VAL 111 ASP 112 ALA 113 PHE 114 GLU 115 GLN 116 GLY 117 VAL 118 ARG 119 ALA 120 ILE 121 LEU 122 GLY 123 GLN 124 LEU 125 VAL 126 SER 127 VAL 128 ALA 129 MET 130 ALA 131 ALA 132 LYS 133 LEU 134 THR 135 ALA 136 ARG 137 VAL 138 ALA 139 GLN 140 LEU 141 TYR 142 GLY 143 GLU 144 ARG 145 LEU 146 ASP 147 ASP 148 PHE 149 PRO 150 GLU 151 TYR 152 ILE 153 CYS 154 PHE 155 PRO 156 THR 157 PRO 158 GLN 159 ARG 160 LEU 161 ALA 162 ALA 163 ALA 164 ASP 165 PRO 166 GLN 167 ALA 168 LEU 169 LYS 170 ALA 171 LEU 172 GLY 173 MET 174 PRO 175 LEU 176 LYS 177 ARG 178 ALA 179 GLU 180 ALA 181 LEU 182 ILE 183 HIS 184 LEU 185 ALA 186 ASN 187 ALA 188 ALA 189 LEU 190 GLU 191 GLY 192 THR 193 LEU 194 PRO 195 MET 196 THR 197 ILE 198 PRO 199 GLY 200 ASP 201 VAL 202 GLU 203 GLN 204 ALA 205 MET 206 LYS 207 THR 208 LEU 209 GLN 210 THR 211 PHE 212 PRO 213 GLY 214 ILE 215 GLY 216 ARG 217 TRP 218 THR 219 ALA 220 ASN 221 TYR 222 PHE 223 ALA 224 LEU 225 ARG 226 GLY 227 TRP 228 GLN 229 ALA 230 LYS 231 ASP 232 VAL 233 PHE 234 LEU 235 PRO 236 ASP 237 ASP 238 TYR 239 LEU 240 ILE 241 LYS 242 GLN 243 ARG 244 PHE 245 PRO 246 GLY 247 MET 248 THR 249 PRO 250 ALA 251 GLN 252 ILE 253 ARG 254 ARG 255 TYR 256 ALA 257 GLU 258 ARG 259 TRP 260 LYS 261 PRO 262 TRP 263 ARG 264 SER 265 TYR 266 ALA 267 LEU 268 LEU 269 HIS 270 ILE 271 TRP 272 TYR 273 THR 274 GLU 275 GLY 276 TRP 277 GLN 278 PRO 279 ASP 280 GLU 281 ALA 282
Unit 2	MET 1 TYR 2 THR 3 LEU 4 ASN 5 TRP 6 GLN 7 PRO 8 PRO 9 TYR 10 ASP 11 TRP 12 SER 13 TRP 14 MET 15 LEU 16 GLY 17 PHE 18 LEU 19 ALA 20 ALA 21 ARG 22 ALA 23 VAL 24 SER 25 SER 26 VAL 27 GLU 28 THR 29 VAL 30 ALA 31 ASP 32 SER 33 TYR 34 TYR 35 ALA 36 ARG 37 SER 38 LEU 39 ALA 40 VAL 41 GLY 42 GLU 43 TYR 44 ARG 45 GLY 46 VAL 47 VAL 48 THR 49 ALA 50 ILE 51 PRO 52 ASP 53 ILE 54 ALA 55 ARG 56 HIS 57 THR 58 LEU 59 HIS 60 ILE 61 ASN 62 LEU 63 SER 64 ALA 65 GLY 66 LEU 67 GLU 68 PRO 69 VAL 70 ALA 71 ALA 72 GLU 73 CYS 74 LEU 75 ALA 76 LYS 77 MET 78 SER 79 ARG 80 LEU 81 PHE 82 ASP 83 LEU 84 GLN 85 CYS 86 ASN 87 PRO 88 GLN 89 ILE 90 VAL 91 ASN 92 GLY 93 ALA 94 LEU 95 GLY 96 ARG 97 LEU 98 GLY 99 ALA 100 ALA 101 ARG 102 PRO 103 GLY 104 LEU 105 ARG 106 LEU 107 PRO 108 GLY 109 CYS 110 VAL 111 ASP 112 ALA 113 PHE 114 GLU 115 GLN 116 GLY 117 VAL 118 ARG 119 ALA 120 ILE 121 LEU 122 GLY 123 GLN 124 LEU 125 VAL 126 SER 127 VAL 128 ALA 129 MET 130 ALA 131 ALA 132 LYS 133 LEU 134 THR 135 ALA 136 ARG 137 VAL 138 ALA 139 GLN 140 LEU 141 TYR 142 GLY 143 GLU 144 ARG 145 LEU 146 ASP 147 ASP 148 PHE 149 PRO 150 GLU 151 TYR 152 ILE 153 CYS 154 PHE 155 PRO 156 THR 157 PRO 158 GLN 159 ARG 160 LEU 161 ALA 162 ALA 163 ALA 164 ASP 165 PRO 166 GLN 167 ALA 168 LEU 169 LYS 170 ALA 171 LEU 172 GLY 173 MET 174 PRO 175 LEU 176 LYS 177 ARG 178 ALA 179 GLU 180 ALA 181 LEU 182 ILE 183 HIS 184 LEU 185 ALA 186 ASN 187 ALA 188 ALA 189 LEU 190 GLU 191 GLY 192 THR 193 LEU 194 PRO 195 MET 196 THR 197 ILE 198 PRO 199 GLY 200 ASP 201 VAL 202 GLU 203 GLN 204 ALA 205 MET 206 LYS 207 THR 208 LEU 209 GLN 210 THR 211 PHE 212 PRO 213 GLY 214 ILE 215 GLY 216 ARG 217 TRP 218 THR 219 ALA 220 ASN 221 TYR 222 PHE 223 ALA 224 LEU 225 ARG 226 GLY 227 TRP 228 GLN 229 ALA 230 LYS 231 ASP 232 VAL 233 PHE 234 LEU 235 PRO 236 ASP 237 ASP 238 TYR 239 LEU 240 ILE 241 LYS 242 GLN 243 ARG 244 PHE 245 PRO 246 GLY 247 MET 248 THR 249 PRO 250 ALA 251 GLN 252 ILE 253 ARG 254 ARG 255 TYR 256 ALA 257 GLU 258 ARG 259 TRP 260 LYS 261 PRO 262 TRP 263 ARG 264 SER 265 TYR 266 ALA 267 LEU 268 LEU 269 HIS 270 ILE 271 TRP 272 TYR 273 THR 274 GLU 275 GLY 276 TRP 277 GLN 278 PRO 279 ASP 280 GLU 281 ALA 282
Unit 3	MET 1 TYR 2 THR 3 LEU 4 ASN 5 TRP 6 GLN 7 PRO 8 PRO 9 TYR 10 ASP 11 TRP 12 SER 13 TRP 14 MET 15 LEU 16 GLY 17 PHE 18 LEU 19 ALA 20 ALA 21 ARG 22 ALA 23 VAL 24 SER 25 SER 26 VAL 27 GLU 28 THR 29 VAL 30 ALA 31 ASP 32 SER 33 TYR 34 TYR 35 ALA 36 ARG 37 SER 38 LEU 39 ALA 40 VAL 41 GLY 42 GLU 43 TYR 44 ARG 45 GLY 46 VAL 47 VAL 48 THR 49 ALA 50 ILE 51 PRO 52 ASP 53 ILE 54 ALA 55 ARG 56 HIS 57 THR 58 LEU 59 HIS 60 ILE 61 ASN 62 LEU 63 SER 64 ALA 65 GLY 66 LEU 67 GLU 68 PRO 69 VAL 70 ALA 71 ALA 72 GLU 73 CYS 74 LEU 75 ALA 76 LYS 77 MET 78 SER 79 ARG 80 LEU 81 PHE 82 ASP 83 LEU 84 GLN 85 CYS 86 ASN 87 PRO 88 GLN 89 ILE 90 VAL 91 ASN 92 GLY 93 ALA 94 LEU 95 GLY 96 ARG 97 LEU 98 GLY 99 ALA 100 ALA 101 ARG 102 PRO 103 GLY 104 LEU 105 ARG 106 LEU 107 PRO 108 GLY 109 CYS 110 VAL 111 ASP 112 ALA 113 PHE 114 GLU 115 GLN 116 GLY 117 VAL 118 ARG 119 ALA 120 ILE 121 LEU 122 GLY 123 GLN 124 LEU 125 VAL 126 SER 127 VAL 128 ALA 129 MET 130 ALA 131 ALA 132 LYS 133 LEU 134 THR 135 ALA 136 ARG 137 VAL 138 ALA 139 GLN 140 LEU 141 TYR 142 GLY 143 GLU 144 ARG 145 LEU 146 ASP 147 ASP 148 PHE 149 PRO 150 GLU 151 TYR 152 ILE 153 CYS 154 PHE 155 PRO 156 THR 157 PRO 158 GLN 159 ARG 160 LEU 161 ALA 162 ALA 163 ALA 164 ASP 165 PRO 166 GLN 167 ALA 168 LEU 169 LYS 170 ALA 171 LEU 172 GLY 173 MET 174 PRO 175 LEU 176 LYS 177 ARG 178 ALA 179 GLU 180 ALA 181 LEU 182 ILE 183 HIS 184 LEU 185 ALA 186 ASN 187 ALA 188 ALA 189 LEU 190 GLU 191 GLY 192 THR 193 LEU 194 PRO 195 MET 196 THR 197 ILE 198 PRO 199 GLY 200 ASP 201 VAL 202 GLU 203 GLN 204 ALA 205 MET 206 LYS 207 THR 208 LEU 209 GLN 210 THR 211 PHE 212 PRO 213 GLY 214 ILE 215 GLY 216 ARG 217 TRP 218 THR 219 ALA 220 ASN 221 TYR 222 PHE 223 ALA 224 LEU 225 ARG 226 GLY 227 TRP 228 GLN 229 ALA 230 LYS 231 ASP 232 VAL 233 PHE 234 LEU 235 PRO 236 ASP 237 ASP 238 TYR 239 LEU 240 ILE 241 LYS 242 GLN 243 ARG 244 PHE 245 PRO 246 GLY 247 MET 248 THR 249 PRO 250 ALA 251 GLN 252 ILE 253 ARG 254 ARG 255 TYR 256 ALA 257 GLU 258 ARG 259 TRP 260 LYS 261 PRO 262 TRP 263 ARG 264 SER 265 TYR 266 ALA 267 LEU 268 LEU 269 HIS 270 ILE 271 TRP 272 TYR 273 THR 274 GLU 275 GLY 276 TRP 277 GLN 278 PRO 279 ASP 280 GLU 281 ALA 282
Unit 4	MET 1 TYR 2 THR 3 LEU 4 ASN 5 TRP 6 GLN 7 PRO 8 PRO 9 TYR 10 ASP 11 TRP 12 SER 13 TRP 14 MET 15 LEU 16 GLY 17 PHE 18 LEU 19 ALA 20 ALA 21 ARG 22 ALA 23 VAL 24 SER 25 SER 26 VAL 27 GLU 28 THR 29 VAL 30 ALA 31 ASP 32 SER 33 TYR 34 TYR 35 ALA 36 ARG 37 SER 38 LEU 39 ALA 40 VAL 41 GLY 42 GLU 43 TYR 44 ARG 45 GLY 46 VAL 47 VAL 48 THR 49 ALA 50 ILE 51 PRO 52 ASP 53 ILE 54 ALA 55 ARG 56 HIS 57 THR 58 LEU 59 HIS 60 ILE 61 ASN 62 LEU 63 SER 64 ALA 65 GLY 66 LEU 67 GLU 68 PRO 69 VAL 70 ALA 71 ALA 72 GLU 73 CYS 74 LEU 75 ALA 76 LYS 77 MET 78 SER 79 ARG 80 LEU 81 PHE 82 ASP 83 LEU 84 GLN 85 CYS 86 ASN 87 PRO 88 GLN 89 ILE 90 VAL 91 ASN 92 GLY 93 ALA 94 LEU 95 GLY 96 ARG 97 LEU 98 GLY 99 ALA 100 ALA 101 ARG 102 PRO 103 GLY 104 LEU 105 ARG 106 LEU 107 PRO 108 GLY 109 CYS 110 VAL 111 ASP 112 ALA 113 PHE 114 GLU 115 GLN 116 GLY 117 VAL 118 ARG 119 ALA 120 ILE 121 LEU 122 GLY 123 GLN 124 LEU 125 VAL 126 SER 127 VAL 128 ALA 129 MET 130 ALA 131 ALA 132 LYS 133 LEU 134 THR 135 ALA 136 ARG 137 VAL 138 ALA 139 GLN 140 LEU 141 TYR 142 GLY 143 GLU 144 ARG 145 LEU 146 ASP 147 ASP 148 PHE 149 PRO 150 GLU 151 TYR 152 ILE 153 CYS 154 PHE 155 PRO 156 THR 157 PRO 158 GLN 159 ARG 160 LEU 161 ALA 162 ALA 163 ALA 164 ASP 165 PRO 166 GLN 167 ALA 168 LEU 169 LYS 170 ALA 171 LEU 172 GLY 173 MET 174 PRO 175 LEU 176 LYS 177 ARG 178 ALA 179 GLU 180 ALA 181 LEU 182 ILE 183 HIS 184 LEU 185 ALA 186 ASN 187 ALA 188 ALA 189 LEU 190 GLU 191 GLY 192 THR 193 LEU 194 PRO 195 MET 196 THR 197 ILE 198 PRO 199 GLY 200 ASP 201 VAL 202 GLU 203 GLN 204 ALA 205 MET 206 LYS 207 THR 208 LEU 209 GLN 210 THR 211 PHE 212 PRO 213 GLY 214 ILE 215 GLY 216 ARG 217 TRP 218 THR 219 ALA 220 ASN 221 TYR 222 PHE 223 ALA 224 LEU 225 ARG 226 GLY 227 TRP 228 GLN 229 ALA 230 LYS 231 ASP 232 VAL 233 PHE 234 LEU 235 PRO 236 ASP 237 ASP 238 TYR 239 LEU 240 ILE 241 LYS 242 GLN 243 ARG 244 PHE 245 PRO 246 GLY 247 MET 248 THR 249 PRO 250 ALA 251 GLN 252 ILE 253 ARG 254 ARG 255 TYR 256 ALA 257 GLU 258 ARG 259 TRP 260 LYS 261 PRO 262 TRP 263 ARG 264 SER 265 TYR 266 ALA 267 LEU 268 LEU 269 HIS 270 ILE 271 TRP 272 TYR 273 THR 274 GLU 275 GLY 276 TRP 277 GLN 278 PRO 279 ASP 280 GLU 281 ALA 282

Other macromolecules

Unit 5	DG 1 DA 2 DC 3 DA 4 DT 5 8OG 6 DA 7 DG 8 DT 9 DG 10 DC 11 DC 12
Unit 6	DG 14 DG 15 DC 16 DA 17 DC 18 DT 19 DC 20 DA 21 DT 22 DG 23 DT 24 DC 25
Unit 7	DG 1 DA 2 DC 3 DA 4 DT 5 8OG 6 DA 7 DG 8 DT 9 DG 10 DC 11 DC 12
Unit 8	DG 14 DG 15 DC 16 DA 17 DC 18 DT 19 DC 20 DA 21 DT 22 DG 23 DT 24 DC 25