3CKD - Sequence, Chains, Asymmetric and Biological Units

• Title: CRYSTAL STRUCTURE OF THE C-TERMINAL DOMAIN OF THE SHIGELLA T EFFECTOR IPAH
• Keywords: E3 UBIQUITIN LIGASE, HELICAL, TYPE III EFFECTOR, STRUCTURAL PSI-2, PROTEIN STRUCTURE INITIATIVE, MIDWEST CENTER FOR STR GENOMICS, MCSG, LIGASE
• Experiment: X-ray diffraction
• Number of Models: 1

Database	ID code	Status	Coordinate files
			Header	Asymmetric unit	Biological unit
PDB	3CKD	released	available	available	Quaternary Structure Server

Asymmetric unit from PDB

Unit	Type	Name	Chain ID	Residues	Atoms	Hetatoms
1	Protein	INVASION PLASMID ANTIGEN, SECRETED BY THE MXI-SPA MACHINERY	A	262	2074	40
2	Protein	INVASION PLASMID ANTIGEN, SECRETED BY THE MXI-SPA MACHINERY	B	244	1930	40
3	Protein	INVASION PLASMID ANTIGEN, SECRETED BY THE MXI-SPA MACHINERY	C	272	2144	40
4	Ligand	INVASION PLASMID ANTIGEN, SECRETED BY THE MXI-SPA MACHINERY	B	1	0	5
5	Ligand	INVASION PLASMID ANTIGEN, SECRETED BY THE MXI-SPA MACHINERY	C	5	0	30
6	Water			24	0	24
total				808	6148	179

Proteins

Unit 1	SER 284 LEU 285 ALA 286 ASP 287 ALA 288 VAL 289 THR 290 ALA 291 TRP 292 PHE 293 PRO 294 GLU 295 ASN 296 LYS 297 GLN 298 SER 302 GLN 303 ILE 304 TRP 305 HIS 306 ALA 307 PHE 308 GLU 309 HIS 310 GLU 311 GLU 312 HIS 313 ALA 314 ASN 315 THR 316 PHE 317 SER 318 ALA 319 PHE 320 LEU 321 ASP 322 ARG 323 LEU 324 SER 325 ASP 326 THR 327 GLY 335 PHE 336 ARG 337 GLU 338 GLN 339 VAL 340 ALA 341 ALA 342 TRP 343 LEU 344 GLU 345 LYS 346 LEU 347 SER 348 ALA 349 SER 350 ALA 351 GLU 352 LEU 353 ARG 354 GLN 355 GLN 356 SER 357 PHE 358 ALA 359 VAL 360 ALA 361 ALA 362 ASP 363 ALA 364 THR 365 GLU 366 SER 367 CYS 368 GLU 369 ASP 370 ARG 371 VAL 372 ALA 373 LEU 374 THR 375 TRP 376 ASN 377 ASN 378 LEU 379 ARG 380 LYS 381 THR 382 LEU 383 LEU 384 VAL 385 HIS 386 GLN 387 ALA 388 SER 389 GLU 390 GLY 391 LEU 392 PHE 393 ASP 394 ASN 395 ASP 396 THR 397 GLY 398 ALA 399 LEU 400 LEU 401 SER 402 LEU 403 GLY 404 ARG 405 GLU 406 MSE 407 PHE 408 ARG 409 LEU 410 GLU 411 ILE 412 LEU 413 GLU 414 ASP 415 ILE 416 ALA 417 ARG 418 ASP 419 LYS 420 VAL 421 ARG 422 THR 423 LEU 424 HIS 425 PHE 426 VAL 427 ASP 428 GLU 429 ILE 430 GLU 431 VAL 432 TYR 433 LEU 434 ALA 435 PHE 436 GLN 437 THR 438 MSE 439 LEU 440 ALA 441 GLU 442 LYS 443 LEU 444 GLN 445 LEU 446 GLY 457 VAL 458 SER 459 GLY 460 VAL 461 THR 462 ALA 463 ASN 464 ASP 465 LEU 466 ARG 467 THR 468 ALA 469 GLU 470 ALA 471 MSE 472 VAL 473 ARG 474 SER 475 ARG 476 GLU 477 GLU 478 ASN 479 GLU 480 PHE 481 THR 482 ASP 483 TRP 484 PHE 485 SER 486 LEU 487 TRP 488 GLY 489 PRO 490 TRP 491 HIS 492 ALA 493 VAL 494 LEU 495 LYS 496 ARG 497 THR 498 GLU 499 ALA 500 ASP 501 ARG 502 TRP 503 ALA 504 GLN 505 ALA 506 GLU 507 GLU 508 GLN 509 LYS 510 TYR 511 GLU 512 MSE 513 LEU 514 GLU 515 ASN 516 GLU 517 TYR 518 SER 519 GLN 520 ARG 521 VAL 522 ALA 523 ASP 524 ARG 525 LEU 526 LYS 527 ALA 528 SER 529 GLY 530 LEU 531 SER 532 GLY 533 ASP 534 ALA 535 ASP 536 ALA 537 GLU 538 ARG 539 GLU 540 ALA 541 GLY 542 ALA 543 GLN 544 VAL 545 MSE 546 ARG 547 GLU 548 THR 549 GLU 550 GLN 551 GLN 552 ILE 553 TYR 554 ARG 555 GLN 556 LEU 557 THR 558 ASP 559 GLU 560 VAL 561 LEU 562 ALA 563 LEU 564 ARG 565
Unit 2	LEU 285 ALA 286 ASP 287 ALA 288 VAL 289 THR 290 ALA 291 TRP 292 PHE 293 PRO 294 GLU 295 ASN 296 LYS 297 GLN 298 SER 299 ASP 300 VAL 301 SER 302 ILE 304 TRP 305 HIS 306 ALA 307 PHE 308 GLU 309 HIS 310 GLU 311 GLU 312 HIS 313 ALA 314 ASN 315 THR 316 PHE 317 SER 318 ALA 319 PHE 320 LEU 321 ASP 322 ARG 323 LEU 324 SER 325 ASP 326 THR 327 VAL 328 GLU 338 GLN 339 VAL 340 ALA 341 ALA 342 TRP 343 LEU 344 GLU 345 LYS 346 LEU 347 SER 348 ALA 349 SER 350 ALA 351 GLU 352 LEU 353 ARG 354 GLN 355 GLN 356 SER 357 PHE 358 ALA 359 VAL 360 ALA 361 ALA 362 ASP 363 VAL 372 ALA 373 LEU 374 THR 375 TRP 376 ASN 377 ASN 378 LEU 379 ARG 380 LYS 381 THR 382 LEU 383 LEU 384 VAL 385 HIS 386 GLN 387 ALA 388 SER 389 GLU 390 GLY 391 LEU 392 PHE 393 ASP 394 ASN 395 ASP 396 THR 397 GLY 398 ALA 399 LEU 400 LEU 401 SER 402 LEU 403 GLY 404 ARG 405 GLU 406 MSE 407 PHE 408 ARG 409 LEU 410 GLU 411 ILE 412 LEU 413 GLU 414 ASP 415 ILE 416 ALA 417 ARG 418 ASP 419 LYS 420 VAL 421 GLU 429 ILE 430 GLU 431 VAL 432 TYR 433 LEU 434 ALA 435 PHE 436 GLN 437 THR 438 MSE 439 LEU 440 ALA 441 GLU 442 LYS 443 LEU 444 GLN 445 LEU 446 SER 447 THR 448 VAL 461 THR 462 ALA 463 ASN 464 ASP 465 LEU 466 ARG 467 THR 468 ALA 469 GLU 470 ALA 471 MSE 472 VAL 473 ARG 474 SER 475 ARG 476 GLU 477 GLU 478 ASN 479 GLU 480 PHE 481 THR 482 ASP 483 TRP 484 PHE 485 SER 486 LEU 487 TRP 488 GLY 489 PRO 490 TRP 491 HIS 492 ALA 493 VAL 494 LEU 495 LYS 496 ARG 497 THR 498 GLU 499 ALA 500 ASP 501 ARG 502 TRP 503 ALA 504 GLN 505 ALA 506 GLU 507 GLU 508 GLN 509 LYS 510 TYR 511 GLU 512 MSE 513 LEU 514 GLU 515 ASN 516 GLU 517 TYR 518 SER 519 GLN 520 ARG 521 VAL 522 ALA 523 ASP 524 ARG 525 LEU 526 LYS 527 ALA 528 SER 529 GLY 530 LEU 531 SER 532 GLY 533 ASP 534 ALA 535 ASP 536 ALA 537 GLU 538 ARG 539 GLU 540 ALA 541 GLY 542 ALA 543 GLN 544 VAL 545 MSE 546 ARG 547 GLU 548 THR 549 GLU 550 GLN 551 GLN 552 ILE 553 TYR 554 ARG 555 GLN 556 LEU 557 THR 558 ASP 559 GLU 560 VAL 561 LEU 562 ALA 563 LEU 564 ARG 565
Unit 3	HIS 283 SER 284 LEU 285 ALA 286 ASP 287 ALA 288 VAL 289 THR 290 ALA 291 TRP 292 PHE 293 PRO 294 GLU 295 ASN 296 LYS 297 GLN 298 SER 299 ASP 300 VAL 301 SER 302 GLN 303 ILE 304 TRP 305 HIS 306 ALA 307 PHE 308 GLU 309 HIS 310 GLU 311 GLU 312 HIS 313 ALA 314 ASN 315 THR 316 PHE 317 SER 318 ALA 319 PHE 320 LEU 321 ASP 322 ARG 323 LEU 324 SER 325 ASP 326 THR 327 VAL 328 SER 329 THR 333 SER 334 GLY 335 PHE 336 ARG 337 GLU 338 GLN 339 VAL 340 ALA 341 ALA 342 TRP 343 LEU 344 GLU 345 LYS 346 LEU 347 SER 348 ALA 349 SER 350 ALA 351 GLU 352 LEU 353 ARG 354 GLN 355 GLN 356 SER 357 PHE 358 ALA 359 VAL 360 ALA 361 ALA 362 ASP 363 ALA 364 THR 365 GLU 366 SER 367 CYS 368 GLU 369 ASP 370 ARG 371 VAL 372 ALA 373 LEU 374 THR 375 TRP 376 ASN 377 ASN 378 LEU 379 ARG 380 LYS 381 THR 382 LEU 383 LEU 384 VAL 385 HIS 386 GLN 387 ALA 388 SER 389 GLU 390 GLY 391 LEU 392 PHE 393 ASP 394 ASN 395 ASP 396 THR 397 GLY 398 ALA 399 LEU 400 LEU 401 SER 402 LEU 403 GLY 404 ARG 405 GLU 406 MSE 407 PHE 408 ARG 409 LEU 410 GLU 411 ILE 412 LEU 413 GLU 414 ASP 415 ILE 416 ALA 417 ARG 418 ASP 419 LYS 420 VAL 421 ARG 422 THR 423 LEU 424 HIS 425 PHE 426 VAL 427 ASP 428 GLU 429 ILE 430 GLU 431 VAL 432 TYR 433 LEU 434 ALA 435 PHE 436 GLN 437 THR 438 MSE 439 LEU 440 ALA 441 GLU 442 LYS 443 LEU 444 GLN 445 LEU 446 SER 447 THR 448 GLY 457 VAL 458 SER 459 GLY 460 VAL 461 THR 462 ALA 463 ASN 464 ASP 465 LEU 466 ARG 467 THR 468 ALA 469 GLU 470 ALA 471 MSE 472 VAL 473 ARG 474 SER 475 ARG 476 GLU 477 GLU 478 ASN 479 GLU 480 PHE 481 THR 482 ASP 483 TRP 484 PHE 485 SER 486 LEU 487 TRP 488 GLY 489 PRO 490 TRP 491 HIS 492 ALA 493 VAL 494 LEU 495 LYS 496 ARG 497 THR 498 GLU 499 ALA 500 ASP 501 ARG 502 TRP 503 ALA 504 GLN 505 ALA 506 GLU 507 GLU 508 GLN 509 LYS 510 TYR 511 GLU 512 MSE 513 LEU 514 GLU 515 ASN 516 GLU 517 TYR 518 SER 519 GLN 520 ARG 521 VAL 522 ALA 523 ASP 524 ARG 525 LEU 526 LYS 527 ALA 528 SER 529 GLY 530 LEU 531 SER 532 GLY 533 ASP 534 ALA 535 ASP 536 ALA 537 GLU 538 ARG 539 GLU 540 ALA 541 GLY 542 ALA 543 GLN 544 VAL 545 MSE 546 ARG 547 GLU 548 THR 549 GLU 550 GLN 551 GLN 552 ILE 553 TYR 554 ARG 555 GLN 556 LEU 557 THR 558 ASP 559 GLU 560 VAL 561 LEU 562 ALA 563 LEU 564 ARG 565

Ligands

Unit 4	SO4 601
Unit 5	SO4 600 GOL 602 GOL 603 GOL 604 PEG 605