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Sequence, Chains, Asymmetric and Biological Units

Title STRUCTURAL ADAPTATION AND CONSERVATION IN QUADRUPLEX-DRUG RECOGNITION
Keywords QUADRUPLEX, DNA, PROPELLER, INTRAMOLECULAR, HUMAN TELOMERE PARALLEL STRANDED, LIGAND, COMPLEX
Experiment X-ray diffraction
Number of Models  1


   Database       ID code    StatusCoordinate files
        Header     Asymmetric unit     Biological unit  

PDB   3CDM     released     available     available     Quaternary Structure Server  


Asymmetric unit from PDB
 Unit     Type     Name   Chain ID   Residues   Atoms   Hetatoms 
1  Other macromolecule   DNA (5'- D(*DT*DAP*DGP*DGP*DGP*DTP*DTP*DAP*DGP*DGP*DGP*DTP*DTP*DAP*D GP*DGP*DGP*DTP*DTP*DAP*DGP*DGP*DG)-3')  A 22 465 0
2  Other macromolecule   DNA (5'- D(*DT*DAP*DGP*DGP*DGP*DTP*DTP*DAP*DGP*DGP*DGP*DTP*DTP*DAP*D GP*DGP*DGP*DTP*DTP*DAP*DGP*DGP*DG)-3')  B 23 485 0
3  Ligand   DNA (5'- D(*DT*DAP*DGP*DGP*DGP*DTP*DTP*DAP*DGP*DGP*DGP*DTP*DTP*DAP*D GP*DGP*DGP*DTP*DTP*DAP*DGP*DGP*DG)-3')  A 4 0 86
4  Ligand   DNA (5'- D(*DT*DAP*DGP*DGP*DGP*DTP*DTP*DAP*DGP*DGP*DGP*DTP*DTP*DAP*D GP*DGP*DGP*DTP*DTP*DAP*DGP*DGP*DG)-3')  B 6 0 170
5 Water     158 0 158
total       213 950 414

Other macromolecules
Unit 1 DA2 DG3 DG4 DG5 DT6 DT7 DA8 DG9 DG10 DG11 DT12 DT13 DA14 DG15 DG16 DG17 DT18 DT19 DA20 DG21 DG22 DG23
Unit 2 DT1 DA2 DG3 DG4 DG5 DT6 DT7 DA8 DG9 DG10 DG11 DT12 DT13 DA14 DG15 DG16 DG17 DT18 DT19 DA20 DG21 DG22 DG23

Ligands
Unit 3 K24 K25 NII26 NII27
Unit 4 K24 K25 NII26 NII27 NII28 NII29

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Perl script:    PDBscan.pl  (15 Sep 2016)
Author:    Peter Slickers  (slickers@leibniz-fli.de),  IMB Jena,  Germany