3BFD - Sequence, Chains, Asymmetric and Biological Units

• Title: CRYSTAL STRUCTURE OF THE CLASS A BETA-LACTAMASE SED-G238C MU CITROBACTER SEDLAKII
• Keywords: HYDROLASE, BETA-LACTAMASE, CLASS A, SED-G238C MUTANT
• Experiment: X-ray diffraction
• Number of Models: 1

Database	ID code	Status	Coordinate files
			Header	Asymmetric unit	Biological unit
PDB	3BFD	released	available	available	Quaternary Structure Server

Asymmetric unit from PDB

Unit	Type	Name	Chain ID	Residues	Atoms	Hetatoms
1	Protein	CLASS A BETA-LACTAMASE SED1	A	263	1995	0
2	Protein	CLASS A BETA-LACTAMASE SED1	B	263	1995	0
3	Protein	CLASS A BETA-LACTAMASE SED1	C	263	1995	0
4	Protein	CLASS A BETA-LACTAMASE SED1	D	263	1995	0
5	Ligand	CLASS A BETA-LACTAMASE SED1	A	1	0	5
6	Ligand	CLASS A BETA-LACTAMASE SED1	B	1	0	5
7	Ligand	CLASS A BETA-LACTAMASE SED1	C	1	0	5
8	Ligand	CLASS A BETA-LACTAMASE SED1	D	1	0	5
9	Water			1019	0	1019
total				2075	7980	1039

Proteins

Unit 1	ASP 25 VAL 26 GLN 27 GLN 28 VAL 29 GLN 30 LYS 31 LYS 32 LEU 33 ALA 34 ALA 35 LEU 36 GLU 37 LYS 38 GLN 39 SER 40 GLY 41 GLY 42 ARG 43 LEU 44 GLY 45 VAL 46 ALA 47 LEU 48 ILE 49 ASN 50 THR 51 ALA 52 ASP 53 ASN 54 SER 55 GLN 56 VAL 57 LEU 59 TYR 60 ARG 61 ALA 62 ASP 63 GLU 64 ARG 65 PHE 66 ALA 67 MET 68 CYS 69 SER 70 THR 71 SER 72 LYS 73 VAL 74 MET 75 THR 76 ALA 77 ALA 78 ALA 79 VAL 80 LEU 81 LYS 82 GLN 83 SER 84 GLU 85 THR 86 HIS 87 ASP 88 GLY 89 ILE 90 LEU 91 GLN 92 GLN 93 LYS 94 MET 95 THR 96 ILE 97 LYS 98 LYS 99 ALA 100 ASP 101 LEU 102 THR 103 ASN 104 TRP 105 ASN 106 PRO 107 VAL 108 THR 109 GLU 110 LYS 111 TYR 112 VAL 113 GLY 114 ASN 115 THR 116 MET 117 THR 118 LEU 119 ALA 120 GLU 121 LEU 122 SER 123 ALA 124 ALA 125 THR 126 LEU 127 GLN 128 TYR 129 SER 130 ASP 131 ASN 132 THR 133 ALA 134 MET 135 ASN 136 LYS 137 LEU 138 LEU 139 ALA 140 HIS 141 LEU 142 GLY 143 GLY 144 PRO 145 GLY 146 ASN 147 VAL 148 THR 149 ALA 150 PHE 151 ALA 152 ARG 153 SER 154 ILE 155 GLY 156 ASP 157 THR 158 THR 159 PHE 160 ARG 161 LEU 162 ASP 163 ARG 164 LYS 165 GLU 166 PRO 167 GLU 168 LEU 169 ASN 170 THR 171 ALA 172 ILE 173 PRO 174 GLY 175 ASP 176 GLU 177 ARG 178 ASP 179 THR 180 THR 181 SER 182 PRO 183 LEU 184 ALA 185 MET 186 ALA 187 LYS 188 SER 189 LEU 190 ARG 191 LYS 192 LEU 193 THR 194 LEU 195 GLY 196 ASP 197 ALA 198 LEU 199 ALA 200 GLY 201 PRO 202 GLN 203 ARG 204 ALA 205 GLN 206 LEU 207 VAL 208 ASP 209 TRP 210 LEU 211 LYS 212 GLY 213 ASN 214 THR 215 THR 216 GLY 217 GLY 218 GLN 219 SER 220 ILE 221 ARG 222 ALA 223 GLY 224 LEU 225 PRO 226 ALA 227 HIS 228 TRP 229 VAL 230 VAL 231 GLY 232 ASP 233 LYS 234 THR 235 GLY 236 ALA 237 CYS 238 ASP 240 TYR 241 GLY 242 THR 243 THR 244 ASN 245 ASP 246 ILE 247 ALA 248 VAL 249 ILE 250 TRP 251 PRO 252 GLU 254 ASP 255 ARG 256 ALA 257 PRO 258 LEU 259 VAL 260 LEU 261 VAL 262 THR 263 TYR 264 PHE 265 THR 266 GLN 267 PRO 268 GLN 269 GLN 270 ASP 271 ALA 272 LYS 273 TRP 274 ARG 275 LYS 276 ASP 277 VAL 278 LEU 279 ALA 280 ALA 281 ALA 282 ALA 283 LYS 284 ILE 285 VAL 286 THR 287 GLU 288 GLY 289 LYS 290
Unit 2	ASP 25 VAL 26 GLN 27 GLN 28 VAL 29 GLN 30 LYS 31 LYS 32 LEU 33 ALA 34 ALA 35 LEU 36 GLU 37 LYS 38 GLN 39 SER 40 GLY 41 GLY 42 ARG 43 LEU 44 GLY 45 VAL 46 ALA 47 LEU 48 ILE 49 ASN 50 THR 51 ALA 52 ASP 53 ASN 54 SER 55 GLN 56 VAL 57 LEU 59 TYR 60 ARG 61 ALA 62 ASP 63 GLU 64 ARG 65 PHE 66 ALA 67 MET 68 CYS 69 SER 70 THR 71 SER 72 LYS 73 VAL 74 MET 75 THR 76 ALA 77 ALA 78 ALA 79 VAL 80 LEU 81 LYS 82 GLN 83 SER 84 GLU 85 THR 86 HIS 87 ASP 88 GLY 89 ILE 90 LEU 91 GLN 92 GLN 93 LYS 94 MET 95 THR 96 ILE 97 LYS 98 LYS 99 ALA 100 ASP 101 LEU 102 THR 103 ASN 104 TRP 105 ASN 106 PRO 107 VAL 108 THR 109 GLU 110 LYS 111 TYR 112 VAL 113 GLY 114 ASN 115 THR 116 MET 117 THR 118 LEU 119 ALA 120 GLU 121 LEU 122 SER 123 ALA 124 ALA 125 THR 126 LEU 127 GLN 128 TYR 129 SER 130 ASP 131 ASN 132 THR 133 ALA 134 MET 135 ASN 136 LYS 137 LEU 138 LEU 139 ALA 140 HIS 141 LEU 142 GLY 143 GLY 144 PRO 145 GLY 146 ASN 147 VAL 148 THR 149 ALA 150 PHE 151 ALA 152 ARG 153 SER 154 ILE 155 GLY 156 ASP 157 THR 158 THR 159 PHE 160 ARG 161 LEU 162 ASP 163 ARG 164 LYS 165 GLU 166 PRO 167 GLU 168 LEU 169 ASN 170 THR 171 ALA 172 ILE 173 PRO 174 GLY 175 ASP 176 GLU 177 ARG 178 ASP 179 THR 180 THR 181 SER 182 PRO 183 LEU 184 ALA 185 MET 186 ALA 187 LYS 188 SER 189 LEU 190 ARG 191 LYS 192 LEU 193 THR 194 LEU 195 GLY 196 ASP 197 ALA 198 LEU 199 ALA 200 GLY 201 PRO 202 GLN 203 ARG 204 ALA 205 GLN 206 LEU 207 VAL 208 ASP 209 TRP 210 LEU 211 LYS 212 GLY 213 ASN 214 THR 215 THR 216 GLY 217 GLY 218 GLN 219 SER 220 ILE 221 ARG 222 ALA 223 GLY 224 LEU 225 PRO 226 ALA 227 HIS 228 TRP 229 VAL 230 VAL 231 GLY 232 ASP 233 LYS 234 THR 235 GLY 236 ALA 237 CYS 238 ASP 240 TYR 241 GLY 242 THR 243 THR 244 ASN 245 ASP 246 ILE 247 ALA 248 VAL 249 ILE 250 TRP 251 PRO 252 GLU 254 ASP 255 ARG 256 ALA 257 PRO 258 LEU 259 VAL 260 LEU 261 VAL 262 THR 263 TYR 264 PHE 265 THR 266 GLN 267 PRO 268 GLN 269 GLN 270 ASP 271 ALA 272 LYS 273 TRP 274 ARG 275 LYS 276 ASP 277 VAL 278 LEU 279 ALA 280 ALA 281 ALA 282 ALA 283 LYS 284 ILE 285 VAL 286 THR 287 GLU 288 GLY 289 LYS 290
Unit 3	ASP 25 VAL 26 GLN 27 GLN 28 VAL 29 GLN 30 LYS 31 LYS 32 LEU 33 ALA 34 ALA 35 LEU 36 GLU 37 LYS 38 GLN 39 SER 40 GLY 41 GLY 42 ARG 43 LEU 44 GLY 45 VAL 46 ALA 47 LEU 48 ILE 49 ASN 50 THR 51 ALA 52 ASP 53 ASN 54 SER 55 GLN 56 VAL 57 LEU 59 TYR 60 ARG 61 ALA 62 ASP 63 GLU 64 ARG 65 PHE 66 ALA 67 MET 68 CYS 69 SER 70 THR 71 SER 72 LYS 73 VAL 74 MET 75 THR 76 ALA 77 ALA 78 ALA 79 VAL 80 LEU 81 LYS 82 GLN 83 SER 84 GLU 85 THR 86 HIS 87 ASP 88 GLY 89 ILE 90 LEU 91 GLN 92 GLN 93 LYS 94 MET 95 THR 96 ILE 97 LYS 98 LYS 99 ALA 100 ASP 101 LEU 102 THR 103 ASN 104 TRP 105 ASN 106 PRO 107 VAL 108 THR 109 GLU 110 LYS 111 TYR 112 VAL 113 GLY 114 ASN 115 THR 116 MET 117 THR 118 LEU 119 ALA 120 GLU 121 LEU 122 SER 123 ALA 124 ALA 125 THR 126 LEU 127 GLN 128 TYR 129 SER 130 ASP 131 ASN 132 THR 133 ALA 134 MET 135 ASN 136 LYS 137 LEU 138 LEU 139 ALA 140 HIS 141 LEU 142 GLY 143 GLY 144 PRO 145 GLY 146 ASN 147 VAL 148 THR 149 ALA 150 PHE 151 ALA 152 ARG 153 SER 154 ILE 155 GLY 156 ASP 157 THR 158 THR 159 PHE 160 ARG 161 LEU 162 ASP 163 ARG 164 LYS 165 GLU 166 PRO 167 GLU 168 LEU 169 ASN 170 THR 171 ALA 172 ILE 173 PRO 174 GLY 175 ASP 176 GLU 177 ARG 178 ASP 179 THR 180 THR 181 SER 182 PRO 183 LEU 184 ALA 185 MET 186 ALA 187 LYS 188 SER 189 LEU 190 ARG 191 LYS 192 LEU 193 THR 194 LEU 195 GLY 196 ASP 197 ALA 198 LEU 199 ALA 200 GLY 201 PRO 202 GLN 203 ARG 204 ALA 205 GLN 206 LEU 207 VAL 208 ASP 209 TRP 210 LEU 211 LYS 212 GLY 213 ASN 214 THR 215 THR 216 GLY 217 GLY 218 GLN 219 SER 220 ILE 221 ARG 222 ALA 223 GLY 224 LEU 225 PRO 226 ALA 227 HIS 228 TRP 229 VAL 230 VAL 231 GLY 232 ASP 233 LYS 234 THR 235 GLY 236 ALA 237 CYS 238 ASP 240 TYR 241 GLY 242 THR 243 THR 244 ASN 245 ASP 246 ILE 247 ALA 248 VAL 249 ILE 250 TRP 251 PRO 252 GLU 254 ASP 255 ARG 256 ALA 257 PRO 258 LEU 259 VAL 260 LEU 261 VAL 262 THR 263 TYR 264 PHE 265 THR 266 GLN 267 PRO 268 GLN 269 GLN 270 ASP 271 ALA 272 LYS 273 TRP 274 ARG 275 LYS 276 ASP 277 VAL 278 LEU 279 ALA 280 ALA 281 ALA 282 ALA 283 LYS 284 ILE 285 VAL 286 THR 287 GLU 288 GLY 289 LYS 290
Unit 4	ASP 25 VAL 26 GLN 27 GLN 28 VAL 29 GLN 30 LYS 31 LYS 32 LEU 33 ALA 34 ALA 35 LEU 36 GLU 37 LYS 38 GLN 39 SER 40 GLY 41 GLY 42 ARG 43 LEU 44 GLY 45 VAL 46 ALA 47 LEU 48 ILE 49 ASN 50 THR 51 ALA 52 ASP 53 ASN 54 SER 55 GLN 56 VAL 57 LEU 59 TYR 60 ARG 61 ALA 62 ASP 63 GLU 64 ARG 65 PHE 66 ALA 67 MET 68 CYS 69 SER 70 THR 71 SER 72 LYS 73 VAL 74 MET 75 THR 76 ALA 77 ALA 78 ALA 79 VAL 80 LEU 81 LYS 82 GLN 83 SER 84 GLU 85 THR 86 HIS 87 ASP 88 GLY 89 ILE 90 LEU 91 GLN 92 GLN 93 LYS 94 MET 95 THR 96 ILE 97 LYS 98 LYS 99 ALA 100 ASP 101 LEU 102 THR 103 ASN 104 TRP 105 ASN 106 PRO 107 VAL 108 THR 109 GLU 110 LYS 111 TYR 112 VAL 113 GLY 114 ASN 115 THR 116 MET 117 THR 118 LEU 119 ALA 120 GLU 121 LEU 122 SER 123 ALA 124 ALA 125 THR 126 LEU 127 GLN 128 TYR 129 SER 130 ASP 131 ASN 132 THR 133 ALA 134 MET 135 ASN 136 LYS 137 LEU 138 LEU 139 ALA 140 HIS 141 LEU 142 GLY 143 GLY 144 PRO 145 GLY 146 ASN 147 VAL 148 THR 149 ALA 150 PHE 151 ALA 152 ARG 153 SER 154 ILE 155 GLY 156 ASP 157 THR 158 THR 159 PHE 160 ARG 161 LEU 162 ASP 163 ARG 164 LYS 165 GLU 166 PRO 167 GLU 168 LEU 169 ASN 170 THR 171 ALA 172 ILE 173 PRO 174 GLY 175 ASP 176 GLU 177 ARG 178 ASP 179 THR 180 THR 181 SER 182 PRO 183 LEU 184 ALA 185 MET 186 ALA 187 LYS 188 SER 189 LEU 190 ARG 191 LYS 192 LEU 193 THR 194 LEU 195 GLY 196 ASP 197 ALA 198 LEU 199 ALA 200 GLY 201 PRO 202 GLN 203 ARG 204 ALA 205 GLN 206 LEU 207 VAL 208 ASP 209 TRP 210 LEU 211 LYS 212 GLY 213 ASN 214 THR 215 THR 216 GLY 217 GLY 218 GLN 219 SER 220 ILE 221 ARG 222 ALA 223 GLY 224 LEU 225 PRO 226 ALA 227 HIS 228 TRP 229 VAL 230 VAL 231 GLY 232 ASP 233 LYS 234 THR 235 GLY 236 ALA 237 CYS 238 ASP 240 TYR 241 GLY 242 THR 243 THR 244 ASN 245 ASP 246 ILE 247 ALA 248 VAL 249 ILE 250 TRP 251 PRO 252 GLU 254 ASP 255 ARG 256 ALA 257 PRO 258 LEU 259 VAL 260 LEU 261 VAL 262 THR 263 TYR 264 PHE 265 THR 266 GLN 267 PRO 268 GLN 269 GLN 270 ASP 271 ALA 272 LYS 273 TRP 274 ARG 275 LYS 276 ASP 277 VAL 278 LEU 279 ALA 280 ALA 281 ALA 282 ALA 283 LYS 284 ILE 285 VAL 286 THR 287 GLU 288 GLY 289 LYS 290

Ligands

Unit 5	CAC 1
Unit 6	CAC 2
Unit 7	CAC 3
Unit 8	CAC 4