3B4T - Sequence, Chains, Asymmetric and Biological Units

• Title: CRYSTAL STRUCTURE OF MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS RNASE PH, TH MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS STRUCTURAL GENOMICS CONSORTIUM T RV1340
• Keywords: RNASE, TRNA NUCLEOTIDYLTRANSFERASE, RIBONUCLEASE, RPHA, STRU GENOMICS, TBSGC, MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS STRUCTURAL GENO CONSORTIUM, TRNA PROCESSING, TB STRUCTURAL GENOMICS CONSORT PROTEIN STRUCTURE INITIATIVE, TRANSFERASE
• Experiment: X-ray diffraction
• Number of Models: 1

Database	ID code	Status	Coordinate files
			Header	Asymmetric unit	Biological unit
PDB	3B4T	released	available	available	Quaternary Structure Server

Asymmetric unit from PDB

Unit	Type	Name	Chain ID	Residues	Atoms	Hetatoms
1	Protein	RIBONUCLEASE PH	A	243	1787	0
2	Protein	RIBONUCLEASE PH	B	239	1765	0
3	Protein	RIBONUCLEASE PH	C	241	1790	0
4	Protein	RIBONUCLEASE PH	D	239	1765	0
5	Protein	RIBONUCLEASE PH	E	240	1771	0
6	Protein	RIBONUCLEASE PH	F	240	1771	0
7	Ligand	RIBONUCLEASE PH	A	2	0	10
8	Ligand	RIBONUCLEASE PH	B	1	0	5
9	Ligand	RIBONUCLEASE PH	C	2	0	10
10	Ligand	RIBONUCLEASE PH	D	2	0	10
11	Ligand	RIBONUCLEASE PH	E	1	0	5
12	Ligand	RIBONUCLEASE PH	F	2	0	10
13	Water			1107	0	1107
total				2559	10649	1157

Proteins

Unit 1	SER 1 LYS 2 ARG 3 GLU 4 ASP 5 GLY 6 ARG 7 LEU 8 ASP 9 HIS 10 GLU 11 LEU 12 ARG 13 PRO 14 VAL 15 ILE 16 ILE 17 THR 18 ARG 19 GLY 20 PHE 21 THR 22 GLU 23 ASN 24 PRO 25 ALA 26 GLY 27 SER 28 VAL 29 LEU 30 ILE 31 GLU 32 PHE 33 GLY 34 HIS 35 THR 36 LYS 37 VAL 38 LEU 39 CYS 40 THR 41 ALA 42 SER 43 VAL 44 THR 45 GLU 46 GLY 47 VAL 48 PRO 49 ALA 54 THR 55 GLY 56 LEU 57 GLY 58 TRP 59 LEU 60 THR 61 ALA 62 GLU 63 TYR 64 ALA 65 MET 66 LEU 67 PRO 68 SER 69 ALA 70 THR 71 HIS 72 SER 73 ARG 74 SER 75 ASP 76 ARG 77 GLU 78 SER 79 VAL 80 ARG 81 GLY 82 ARG 83 LEU 84 SER 85 GLY 86 ARG 87 THR 88 GLN 89 GLU 90 ILE 91 SER 92 ARG 93 LEU 94 ILE 95 GLY 96 ARG 97 SER 98 LEU 99 ARG 100 ALA 101 CYS 102 ILE 103 ASP 104 LEU 105 ALA 106 ALA 107 LEU 108 GLY 109 GLU 110 ASN 111 THR 112 ILE 113 ALA 114 ILE 115 ASP 116 CYS 117 ASP 118 VAL 119 LEU 120 GLN 121 ALA 122 ASP 123 GLY 124 GLY 125 THR 126 ARG 127 THR 128 ALA 129 ALA 130 ILE 131 THR 132 GLY 133 ALA 134 TYR 135 VAL 136 ALA 137 LEU 138 ALA 139 ASP 140 ALA 141 VAL 142 THR 143 TYR 144 LEU 145 SER 146 ALA 147 ALA 148 GLY 149 LYS 150 LEU 151 SER 152 ASP 153 PRO 154 ARG 155 PRO 156 LEU 157 SER 158 CYS 159 ALA 160 ILE 161 ALA 162 ALA 163 VAL 164 SER 165 VAL 166 GLY 167 VAL 168 VAL 169 ASP 170 GLY 171 ARG 172 ILE 173 ARG 174 VAL 175 ASP 176 LEU 177 PRO 178 TYR 179 GLU 180 GLU 181 ASP 182 SER 183 ARG 184 ALA 185 GLU 186 VAL 187 ASP 188 MET 189 ASN 190 VAL 191 VAL 192 ALA 193 THR 194 ASP 195 THR 196 GLY 197 THR 198 LEU 199 VAL 200 GLU 201 ILE 202 GLN 203 GLY 204 THR 205 GLY 206 GLU 207 GLY 208 ALA 209 THR 210 PHE 211 ALA 212 ARG 213 SER 214 THR 215 LEU 216 ASP 217 LYS 218 LEU 219 LEU 220 ASP 221 MET 222 ALA 223 LEU 224 GLY 225 ALA 226 CYS 227 ASP 228 THR 229 LEU 230 PHE 231 ALA 232 ALA 233 GLN 234 ARG 235 ASP 236 ALA 237 LEU 238 ALA 239 LEU 240 PRO 241 TYR 242 PRO 243 GLY 244 VAL 245 LEU 246 PRO 247
Unit 2	LYS 2 ARG 3 GLU 4 ASP 5 GLY 6 ARG 7 LEU 8 ASP 9 HIS 10 GLU 11 LEU 12 ARG 13 PRO 14 VAL 15 ILE 16 ILE 17 THR 18 ARG 19 GLY 20 PHE 21 THR 22 GLU 23 ASN 24 PRO 25 ALA 26 GLY 27 SER 28 VAL 29 LEU 30 ILE 31 GLU 32 PHE 33 GLY 34 HIS 35 THR 36 LYS 37 VAL 38 LEU 39 CYS 40 THR 41 ALA 42 SER 43 VAL 44 THR 45 GLU 46 GLY 47 VAL 48 PRO 49 LEU 57 GLY 58 TRP 59 LEU 60 THR 61 ALA 62 GLU 63 TYR 64 ALA 65 MET 66 LEU 67 PRO 68 SER 69 ALA 70 THR 71 HIS 72 SER 73 ARG 74 SER 75 ASP 76 ARG 77 GLU 78 SER 79 VAL 80 ARG 81 GLY 82 ARG 83 LEU 84 SER 85 GLY 86 ARG 87 THR 88 GLN 89 GLU 90 ILE 91 SER 92 ARG 93 LEU 94 ILE 95 GLY 96 ARG 97 SER 98 LEU 99 ARG 100 ALA 101 CYS 102 ILE 103 ASP 104 LEU 105 ALA 106 ALA 107 LEU 108 GLY 109 GLU 110 ASN 111 THR 112 ILE 113 ALA 114 ILE 115 ASP 116 CYS 117 ASP 118 VAL 119 LEU 120 GLN 121 ALA 122 ASP 123 GLY 124 GLY 125 THR 126 ARG 127 THR 128 ALA 129 ALA 130 ILE 131 THR 132 GLY 133 ALA 134 TYR 135 VAL 136 ALA 137 LEU 138 ALA 139 ASP 140 ALA 141 VAL 142 THR 143 TYR 144 LEU 145 SER 146 ALA 147 ALA 148 GLY 149 LYS 150 LEU 151 SER 152 ASP 153 PRO 154 ARG 155 PRO 156 LEU 157 SER 158 CYS 159 ALA 160 ILE 161 ALA 162 ALA 163 VAL 164 SER 165 VAL 166 GLY 167 VAL 168 VAL 169 ASP 170 GLY 171 ARG 172 ILE 173 ARG 174 VAL 175 ASP 176 LEU 177 PRO 178 TYR 179 GLU 180 GLU 181 ASP 182 SER 183 ARG 184 ALA 185 GLU 186 VAL 187 ASP 188 MET 189 ASN 190 VAL 191 VAL 192 ALA 193 THR 194 ASP 195 THR 196 GLY 197 THR 198 LEU 199 VAL 200 GLU 201 ILE 202 GLN 203 GLY 204 THR 205 GLY 206 GLU 207 GLY 208 ALA 209 THR 210 PHE 211 ALA 212 ARG 213 SER 214 THR 215 LEU 216 ASP 217 LYS 218 LEU 219 LEU 220 ASP 221 MET 222 ALA 223 LEU 224 GLY 225 ALA 226 CYS 227 ASP 228 THR 229 LEU 230 PHE 231 ALA 232 ALA 233 GLN 234 ARG 235 ASP 236 ALA 237 LEU 238 ALA 239 LEU 240 PRO 241 TYR 242 PRO 243 GLY 244 VAL 245 LEU 246 PRO 247
Unit 3	LYS 2 ARG 3 GLU 4 ASP 5 GLY 6 ARG 7 LEU 8 ASP 9 HIS 10 GLU 11 LEU 12 ARG 13 PRO 14 VAL 15 ILE 16 ILE 17 THR 18 ARG 19 GLY 20 PHE 21 THR 22 GLU 23 ASN 24 PRO 25 ALA 26 GLY 27 SER 28 VAL 29 LEU 30 ILE 31 GLU 32 PHE 33 GLY 34 HIS 35 THR 36 LYS 37 VAL 38 LEU 39 CYS 40 THR 41 ALA 42 SER 43 VAL 44 THR 45 GLU 46 GLY 47 VAL 48 PRO 49 ARG 50 TRP 51 LEU 57 GLY 58 TRP 59 LEU 60 THR 61 ALA 62 GLU 63 TYR 64 ALA 65 MET 66 LEU 67 PRO 68 SER 69 ALA 70 THR 71 HIS 72 SER 73 ARG 74 SER 75 ASP 76 ARG 77 GLU 78 SER 79 VAL 80 ARG 81 GLY 82 ARG 83 LEU 84 SER 85 GLY 86 ARG 87 THR 88 GLN 89 GLU 90 ILE 91 SER 92 ARG 93 LEU 94 ILE 95 GLY 96 ARG 97 SER 98 LEU 99 ARG 100 ALA 101 CYS 102 ILE 103 ASP 104 LEU 105 ALA 106 ALA 107 LEU 108 GLY 109 GLU 110 ASN 111 THR 112 ILE 113 ALA 114 ILE 115 ASP 116 CYS 117 ASP 118 VAL 119 LEU 120 GLN 121 ALA 122 ASP 123 GLY 124 GLY 125 THR 126 ARG 127 THR 128 ALA 129 ALA 130 ILE 131 THR 132 GLY 133 ALA 134 TYR 135 VAL 136 ALA 137 LEU 138 ALA 139 ASP 140 ALA 141 VAL 142 THR 143 TYR 144 LEU 145 SER 146 ALA 147 ALA 148 GLY 149 LYS 150 LEU 151 SER 152 ASP 153 PRO 154 ARG 155 PRO 156 LEU 157 SER 158 CYS 159 ALA 160 ILE 161 ALA 162 ALA 163 VAL 164 SER 165 VAL 166 GLY 167 VAL 168 VAL 169 ASP 170 GLY 171 ARG 172 ILE 173 ARG 174 VAL 175 ASP 176 LEU 177 PRO 178 TYR 179 GLU 180 GLU 181 ASP 182 SER 183 ARG 184 ALA 185 GLU 186 VAL 187 ASP 188 MET 189 ASN 190 VAL 191 VAL 192 ALA 193 THR 194 ASP 195 THR 196 GLY 197 THR 198 LEU 199 VAL 200 GLU 201 ILE 202 GLN 203 GLY 204 THR 205 GLY 206 GLU 207 GLY 208 ALA 209 THR 210 PHE 211 ALA 212 ARG 213 SER 214 THR 215 LEU 216 ASP 217 LYS 218 LEU 219 LEU 220 ASP 221 MET 222 ALA 223 LEU 224 GLY 225 ALA 226 CYS 227 ASP 228 THR 229 LEU 230 PHE 231 ALA 232 ALA 233 GLN 234 ARG 235 ASP 236 ALA 237 LEU 238 ALA 239 LEU 240 PRO 241 TYR 242 PRO 243 GLY 244 VAL 245 LEU 246 PRO 247
Unit 4	LYS 2 ARG 3 GLU 4 ASP 5 GLY 6 ARG 7 LEU 8 ASP 9 HIS 10 GLU 11 LEU 12 ARG 13 PRO 14 VAL 15 ILE 16 ILE 17 THR 18 ARG 19 GLY 20 PHE 21 THR 22 GLU 23 ASN 24 PRO 25 ALA 26 GLY 27 SER 28 VAL 29 LEU 30 ILE 31 GLU 32 PHE 33 GLY 34 HIS 35 THR 36 LYS 37 VAL 38 LEU 39 CYS 40 THR 41 ALA 42 SER 43 VAL 44 THR 45 GLU 46 GLY 47 VAL 48 PRO 49 LEU 57 GLY 58 TRP 59 LEU 60 THR 61 ALA 62 GLU 63 TYR 64 ALA 65 MET 66 LEU 67 PRO 68 SER 69 ALA 70 THR 71 HIS 72 SER 73 ARG 74 SER 75 ASP 76 ARG 77 GLU 78 SER 79 VAL 80 ARG 81 GLY 82 ARG 83 LEU 84 SER 85 GLY 86 ARG 87 THR 88 GLN 89 GLU 90 ILE 91 SER 92 ARG 93 LEU 94 ILE 95 GLY 96 ARG 97 SER 98 LEU 99 ARG 100 ALA 101 CYS 102 ILE 103 ASP 104 LEU 105 ALA 106 ALA 107 LEU 108 GLY 109 GLU 110 ASN 111 THR 112 ILE 113 ALA 114 ILE 115 ASP 116 CYS 117 ASP 118 VAL 119 LEU 120 GLN 121 ALA 122 ASP 123 GLY 124 GLY 125 THR 126 ARG 127 THR 128 ALA 129 ALA 130 ILE 131 THR 132 GLY 133 ALA 134 TYR 135 VAL 136 ALA 137 LEU 138 ALA 139 ASP 140 ALA 141 VAL 142 THR 143 TYR 144 LEU 145 SER 146 ALA 147 ALA 148 GLY 149 LYS 150 LEU 151 SER 152 ASP 153 PRO 154 ARG 155 PRO 156 LEU 157 SER 158 CYS 159 ALA 160 ILE 161 ALA 162 ALA 163 VAL 164 SER 165 VAL 166 GLY 167 VAL 168 VAL 169 ASP 170 GLY 171 ARG 172 ILE 173 ARG 174 VAL 175 ASP 176 LEU 177 PRO 178 TYR 179 GLU 180 GLU 181 ASP 182 SER 183 ARG 184 ALA 185 GLU 186 VAL 187 ASP 188 MET 189 ASN 190 VAL 191 VAL 192 ALA 193 THR 194 ASP 195 THR 196 GLY 197 THR 198 LEU 199 VAL 200 GLU 201 ILE 202 GLN 203 GLY 204 THR 205 GLY 206 GLU 207 GLY 208 ALA 209 THR 210 PHE 211 ALA 212 ARG 213 SER 214 THR 215 LEU 216 ASP 217 LYS 218 LEU 219 LEU 220 ASP 221 MET 222 ALA 223 LEU 224 GLY 225 ALA 226 CYS 227 ASP 228 THR 229 LEU 230 PHE 231 ALA 232 ALA 233 GLN 234 ARG 235 ASP 236 ALA 237 LEU 238 ALA 239 LEU 240 PRO 241 TYR 242 PRO 243 GLY 244 VAL 245 LEU 246 PRO 247
Unit 5	SER 1 LYS 2 ARG 3 GLU 4 ASP 5 GLY 6 ARG 7 LEU 8 ASP 9 HIS 10 GLU 11 LEU 12 ARG 13 PRO 14 VAL 15 ILE 16 ILE 17 THR 18 ARG 19 GLY 20 PHE 21 THR 22 GLU 23 ASN 24 PRO 25 ALA 26 GLY 27 SER 28 VAL 29 LEU 30 ILE 31 GLU 32 PHE 33 GLY 34 HIS 35 THR 36 LYS 37 VAL 38 LEU 39 CYS 40 THR 41 ALA 42 SER 43 VAL 44 THR 45 GLU 46 GLY 47 VAL 48 PRO 49 LEU 57 GLY 58 TRP 59 LEU 60 THR 61 ALA 62 GLU 63 TYR 64 ALA 65 MET 66 LEU 67 PRO 68 SER 69 ALA 70 THR 71 HIS 72 SER 73 ARG 74 SER 75 ASP 76 ARG 77 GLU 78 SER 79 VAL 80 ARG 81 GLY 82 ARG 83 LEU 84 SER 85 GLY 86 ARG 87 THR 88 GLN 89 GLU 90 ILE 91 SER 92 ARG 93 LEU 94 ILE 95 GLY 96 ARG 97 SER 98 LEU 99 ARG 100 ALA 101 CYS 102 ILE 103 ASP 104 LEU 105 ALA 106 ALA 107 LEU 108 GLY 109 GLU 110 ASN 111 THR 112 ILE 113 ALA 114 ILE 115 ASP 116 CYS 117 ASP 118 VAL 119 LEU 120 GLN 121 ALA 122 ASP 123 GLY 124 GLY 125 THR 126 ARG 127 THR 128 ALA 129 ALA 130 ILE 131 THR 132 GLY 133 ALA 134 TYR 135 VAL 136 ALA 137 LEU 138 ALA 139 ASP 140 ALA 141 VAL 142 THR 143 TYR 144 LEU 145 SER 146 ALA 147 ALA 148 GLY 149 LYS 150 LEU 151 SER 152 ASP 153 PRO 154 ARG 155 PRO 156 LEU 157 SER 158 CYS 159 ALA 160 ILE 161 ALA 162 ALA 163 VAL 164 SER 165 VAL 166 GLY 167 VAL 168 VAL 169 ASP 170 GLY 171 ARG 172 ILE 173 ARG 174 VAL 175 ASP 176 LEU 177 PRO 178 TYR 179 GLU 180 GLU 181 ASP 182 SER 183 ARG 184 ALA 185 GLU 186 VAL 187 ASP 188 MET 189 ASN 190 VAL 191 VAL 192 ALA 193 THR 194 ASP 195 THR 196 GLY 197 THR 198 LEU 199 VAL 200 GLU 201 ILE 202 GLN 203 GLY 204 THR 205 GLY 206 GLU 207 GLY 208 ALA 209 THR 210 PHE 211 ALA 212 ARG 213 SER 214 THR 215 LEU 216 ASP 217 LYS 218 LEU 219 LEU 220 ASP 221 MET 222 ALA 223 LEU 224 GLY 225 ALA 226 CYS 227 ASP 228 THR 229 LEU 230 PHE 231 ALA 232 ALA 233 GLN 234 ARG 235 ASP 236 ALA 237 LEU 238 ALA 239 LEU 240 PRO 241 TYR 242 PRO 243 GLY 244 VAL 245 LEU 246 PRO 247
Unit 6	SER 1 LYS 2 ARG 3 GLU 4 ASP 5 GLY 6 ARG 7 LEU 8 ASP 9 HIS 10 GLU 11 LEU 12 ARG 13 PRO 14 VAL 15 ILE 16 ILE 17 THR 18 ARG 19 GLY 20 PHE 21 THR 22 GLU 23 ASN 24 PRO 25 ALA 26 GLY 27 SER 28 VAL 29 LEU 30 ILE 31 GLU 32 PHE 33 GLY 34 HIS 35 THR 36 LYS 37 VAL 38 LEU 39 CYS 40 THR 41 ALA 42 SER 43 VAL 44 THR 45 GLU 46 GLY 47 VAL 48 PRO 49 LEU 57 GLY 58 TRP 59 LEU 60 THR 61 ALA 62 GLU 63 TYR 64 ALA 65 MET 66 LEU 67 PRO 68 SER 69 ALA 70 THR 71 HIS 72 SER 73 ARG 74 SER 75 ASP 76 ARG 77 GLU 78 SER 79 VAL 80 ARG 81 GLY 82 ARG 83 LEU 84 SER 85 GLY 86 ARG 87 THR 88 GLN 89 GLU 90 ILE 91 SER 92 ARG 93 LEU 94 ILE 95 GLY 96 ARG 97 SER 98 LEU 99 ARG 100 ALA 101 CYS 102 ILE 103 ASP 104 LEU 105 ALA 106 ALA 107 LEU 108 GLY 109 GLU 110 ASN 111 THR 112 ILE 113 ALA 114 ILE 115 ASP 116 CYS 117 ASP 118 VAL 119 LEU 120 GLN 121 ALA 122 ASP 123 GLY 124 GLY 125 THR 126 ARG 127 THR 128 ALA 129 ALA 130 ILE 131 THR 132 GLY 133 ALA 134 TYR 135 VAL 136 ALA 137 LEU 138 ALA 139 ASP 140 ALA 141 VAL 142 THR 143 TYR 144 LEU 145 SER 146 ALA 147 ALA 148 GLY 149 LYS 150 LEU 151 SER 152 ASP 153 PRO 154 ARG 155 PRO 156 LEU 157 SER 158 CYS 159 ALA 160 ILE 161 ALA 162 ALA 163 VAL 164 SER 165 VAL 166 GLY 167 VAL 168 VAL 169 ASP 170 GLY 171 ARG 172 ILE 173 ARG 174 VAL 175 ASP 176 LEU 177 PRO 178 TYR 179 GLU 180 GLU 181 ASP 182 SER 183 ARG 184 ALA 185 GLU 186 VAL 187 ASP 188 MET 189 ASN 190 VAL 191 VAL 192 ALA 193 THR 194 ASP 195 THR 196 GLY 197 THR 198 LEU 199 VAL 200 GLU 201 ILE 202 GLN 203 GLY 204 THR 205 GLY 206 GLU 207 GLY 208 ALA 209 THR 210 PHE 211 ALA 212 ARG 213 SER 214 THR 215 LEU 216 ASP 217 LYS 218 LEU 219 LEU 220 ASP 221 MET 222 ALA 223 LEU 224 GLY 225 ALA 226 CYS 227 ASP 228 THR 229 LEU 230 PHE 231 ALA 232 ALA 233 GLN 234 ARG 235 ASP 236 ALA 237 LEU 238 ALA 239 LEU 240 PRO 241 TYR 242 PRO 243 GLY 244 VAL 245 LEU 246 PRO 247

Ligands

Unit 7	PO4 259 PO4 260
Unit 8	PO4 259
Unit 9	PO4 259 PO4 260
Unit 10	PO4 259 PO4 260
Unit 11	PO4 259
Unit 12	PO4 259 PO4 260