3AK4 - Sequence, Chains, Asymmetric and Biological Units

• Title: CRYSTAL STRUCTURE OF NADH-DEPENDENT QUINUCLIDINONE REDUCTASE AGROBACTERIUM TUMEFACIENS
• Keywords: SDR, 3-QUINUCLIDINONE, (R)-3-QUINUCLIDINOL, CHIRAL ALCOHOL, REDUCTASE, OXIDOREDUCTASE
• Experiment: X-ray diffraction
• Number of Models: 1

Database	ID code	Status	Coordinate files
			Header	Asymmetric unit	Biological unit
PDB	3AK4	released	available	available	Quaternary Structure Server

Asymmetric unit from PDB

Unit	Type	Name	Chain ID	Residues	Atoms	Hetatoms
1	Protein	NADH-DEPENDENT QUINUCLIDINONE REDUCTASE	A	258	1899	0
2	Protein	NADH-DEPENDENT QUINUCLIDINONE REDUCTASE	B	258	1899	0
3	Protein	NADH-DEPENDENT QUINUCLIDINONE REDUCTASE	C	258	1899	0
4	Protein	NADH-DEPENDENT QUINUCLIDINONE REDUCTASE	D	258	1899	0
5	Ligand	NADH-DEPENDENT QUINUCLIDINONE REDUCTASE	A	1	0	44
6	Ligand	NADH-DEPENDENT QUINUCLIDINONE REDUCTASE	B	1	0	44
7	Ligand	NADH-DEPENDENT QUINUCLIDINONE REDUCTASE	C	1	0	44
8	Ligand	NADH-DEPENDENT QUINUCLIDINONE REDUCTASE	D	1	0	44
9	Water			820	0	820
total				1856	7596	996

Proteins

Unit 1	GLY 3 ILE 4 PHE 5 ASP 6 LEU 7 SER 8 GLY 9 ARG 10 LYS 11 ALA 12 ILE 13 VAL 14 THR 15 GLY 16 GLY 17 SER 18 LYS 19 GLY 20 ILE 21 GLY 22 ALA 23 ALA 24 ILE 25 ALA 26 ARG 27 ALA 28 LEU 29 ASP 30 LYS 31 ALA 32 GLY 33 ALA 34 THR 35 VAL 36 ALA 37 ILE 38 ALA 39 ASP 40 LEU 41 ASP 42 VAL 43 MET 44 ALA 45 ALA 46 GLN 47 ALA 48 VAL 49 VAL 50 ALA 51 GLY 52 LEU 53 GLU 54 ASN 55 GLY 56 GLY 57 PHE 58 ALA 59 VAL 60 GLU 61 VAL 62 ASP 63 VAL 64 THR 65 LYS 66 ARG 67 ALA 68 SER 69 VAL 70 ASP 71 ALA 72 ALA 73 MET 74 GLN 75 LYS 76 ALA 77 ILE 78 ASP 79 ALA 80 LEU 81 GLY 82 GLY 83 PHE 84 ASP 85 LEU 86 LEU 87 CYS 88 ALA 89 ASN 90 ALA 91 GLY 92 VAL 93 SER 94 THR 95 MET 96 ARG 97 PRO 98 ALA 99 VAL 100 ASP 101 ILE 102 THR 103 ASP 104 GLU 105 GLU 106 TRP 107 ASP 108 PHE 109 ASN 110 PHE 111 ASP 112 VAL 113 ASN 114 ALA 115 ARG 116 GLY 117 VAL 118 PHE 119 LEU 120 ALA 121 ASN 122 GLN 123 ILE 124 ALA 125 CYS 126 ARG 127 HIS 128 PHE 129 LEU 130 ALA 131 SER 132 ASN 133 THR 134 LYS 135 GLY 136 VAL 137 ILE 138 VAL 139 ASN 140 THR 141 ALA 142 SER 143 LEU 144 ALA 145 ALA 146 LYS 147 VAL 148 GLY 149 ALA 150 PRO 151 LEU 152 LEU 153 ALA 154 HIS 155 TYR 156 SER 157 ALA 158 SER 159 LYS 160 PHE 161 ALA 162 VAL 163 PHE 164 GLY 165 TRP 166 THR 167 GLN 168 ALA 169 LEU 170 ALA 171 ARG 172 GLU 173 MET 174 ALA 175 PRO 176 LYS 177 ASN 178 ILE 179 ARG 180 VAL 181 ASN 182 CYS 183 VAL 184 CYS 185 PRO 186 GLY 187 PHE 188 VAL 189 LYS 190 THR 191 ALA 192 MET 193 GLN 194 GLU 195 ARG 196 GLU 197 ILE 198 ILE 199 TRP 200 GLU 201 ALA 202 GLU 203 LEU 204 ARG 205 GLY 206 MET 207 THR 208 PRO 209 GLU 210 ALA 211 VAL 212 ARG 213 ALA 214 GLU 215 TYR 216 VAL 217 SER 218 LEU 219 THR 220 PRO 221 LEU 222 GLY 223 ARG 224 ILE 225 GLU 226 GLU 227 PRO 228 GLU 229 ASP 230 VAL 231 ALA 232 ASP 233 VAL 234 VAL 235 VAL 236 PHE 237 LEU 238 ALA 239 SER 240 ASP 241 ALA 242 ALA 243 ARG 244 PHE 245 MET 246 THR 247 GLY 248 GLN 249 GLY 250 ILE 251 ASN 252 VAL 253 THR 254 GLY 255 GLY 256 VAL 257 ARG 258 MET 259 ASP 260
Unit 2	GLY 3 ILE 4 PHE 5 ASP 6 LEU 7 SER 8 GLY 9 ARG 10 LYS 11 ALA 12 ILE 13 VAL 14 THR 15 GLY 16 GLY 17 SER 18 LYS 19 GLY 20 ILE 21 GLY 22 ALA 23 ALA 24 ILE 25 ALA 26 ARG 27 ALA 28 LEU 29 ASP 30 LYS 31 ALA 32 GLY 33 ALA 34 THR 35 VAL 36 ALA 37 ILE 38 ALA 39 ASP 40 LEU 41 ASP 42 VAL 43 MET 44 ALA 45 ALA 46 GLN 47 ALA 48 VAL 49 VAL 50 ALA 51 GLY 52 LEU 53 GLU 54 ASN 55 GLY 56 GLY 57 PHE 58 ALA 59 VAL 60 GLU 61 VAL 62 ASP 63 VAL 64 THR 65 LYS 66 ARG 67 ALA 68 SER 69 VAL 70 ASP 71 ALA 72 ALA 73 MET 74 GLN 75 LYS 76 ALA 77 ILE 78 ASP 79 ALA 80 LEU 81 GLY 82 GLY 83 PHE 84 ASP 85 LEU 86 LEU 87 CYS 88 ALA 89 ASN 90 ALA 91 GLY 92 VAL 93 SER 94 THR 95 MET 96 ARG 97 PRO 98 ALA 99 VAL 100 ASP 101 ILE 102 THR 103 ASP 104 GLU 105 GLU 106 TRP 107 ASP 108 PHE 109 ASN 110 PHE 111 ASP 112 VAL 113 ASN 114 ALA 115 ARG 116 GLY 117 VAL 118 PHE 119 LEU 120 ALA 121 ASN 122 GLN 123 ILE 124 ALA 125 CYS 126 ARG 127 HIS 128 PHE 129 LEU 130 ALA 131 SER 132 ASN 133 THR 134 LYS 135 GLY 136 VAL 137 ILE 138 VAL 139 ASN 140 THR 141 ALA 142 SER 143 LEU 144 ALA 145 ALA 146 LYS 147 VAL 148 GLY 149 ALA 150 PRO 151 LEU 152 LEU 153 ALA 154 HIS 155 TYR 156 SER 157 ALA 158 SER 159 LYS 160 PHE 161 ALA 162 VAL 163 PHE 164 GLY 165 TRP 166 THR 167 GLN 168 ALA 169 LEU 170 ALA 171 ARG 172 GLU 173 MET 174 ALA 175 PRO 176 LYS 177 ASN 178 ILE 179 ARG 180 VAL 181 ASN 182 CYS 183 VAL 184 CYS 185 PRO 186 GLY 187 PHE 188 VAL 189 LYS 190 THR 191 ALA 192 MET 193 GLN 194 GLU 195 ARG 196 GLU 197 ILE 198 ILE 199 TRP 200 GLU 201 ALA 202 GLU 203 LEU 204 ARG 205 GLY 206 MET 207 THR 208 PRO 209 GLU 210 ALA 211 VAL 212 ARG 213 ALA 214 GLU 215 TYR 216 VAL 217 SER 218 LEU 219 THR 220 PRO 221 LEU 222 GLY 223 ARG 224 ILE 225 GLU 226 GLU 227 PRO 228 GLU 229 ASP 230 VAL 231 ALA 232 ASP 233 VAL 234 VAL 235 VAL 236 PHE 237 LEU 238 ALA 239 SER 240 ASP 241 ALA 242 ALA 243 ARG 244 PHE 245 MET 246 THR 247 GLY 248 GLN 249 GLY 250 ILE 251 ASN 252 VAL 253 THR 254 GLY 255 GLY 256 VAL 257 ARG 258 MET 259 ASP 260
Unit 3	GLY 3 ILE 4 PHE 5 ASP 6 LEU 7 SER 8 GLY 9 ARG 10 LYS 11 ALA 12 ILE 13 VAL 14 THR 15 GLY 16 GLY 17 SER 18 LYS 19 GLY 20 ILE 21 GLY 22 ALA 23 ALA 24 ILE 25 ALA 26 ARG 27 ALA 28 LEU 29 ASP 30 LYS 31 ALA 32 GLY 33 ALA 34 THR 35 VAL 36 ALA 37 ILE 38 ALA 39 ASP 40 LEU 41 ASP 42 VAL 43 MET 44 ALA 45 ALA 46 GLN 47 ALA 48 VAL 49 VAL 50 ALA 51 GLY 52 LEU 53 GLU 54 ASN 55 GLY 56 GLY 57 PHE 58 ALA 59 VAL 60 GLU 61 VAL 62 ASP 63 VAL 64 THR 65 LYS 66 ARG 67 ALA 68 SER 69 VAL 70 ASP 71 ALA 72 ALA 73 MET 74 GLN 75 LYS 76 ALA 77 ILE 78 ASP 79 ALA 80 LEU 81 GLY 82 GLY 83 PHE 84 ASP 85 LEU 86 LEU 87 CYS 88 ALA 89 ASN 90 ALA 91 GLY 92 VAL 93 SER 94 THR 95 MET 96 ARG 97 PRO 98 ALA 99 VAL 100 ASP 101 ILE 102 THR 103 ASP 104 GLU 105 GLU 106 TRP 107 ASP 108 PHE 109 ASN 110 PHE 111 ASP 112 VAL 113 ASN 114 ALA 115 ARG 116 GLY 117 VAL 118 PHE 119 LEU 120 ALA 121 ASN 122 GLN 123 ILE 124 ALA 125 CYS 126 ARG 127 HIS 128 PHE 129 LEU 130 ALA 131 SER 132 ASN 133 THR 134 LYS 135 GLY 136 VAL 137 ILE 138 VAL 139 ASN 140 THR 141 ALA 142 SER 143 LEU 144 ALA 145 ALA 146 LYS 147 VAL 148 GLY 149 ALA 150 PRO 151 LEU 152 LEU 153 ALA 154 HIS 155 TYR 156 SER 157 ALA 158 SER 159 LYS 160 PHE 161 ALA 162 VAL 163 PHE 164 GLY 165 TRP 166 THR 167 GLN 168 ALA 169 LEU 170 ALA 171 ARG 172 GLU 173 MET 174 ALA 175 PRO 176 LYS 177 ASN 178 ILE 179 ARG 180 VAL 181 ASN 182 CYS 183 VAL 184 CYS 185 PRO 186 GLY 187 PHE 188 VAL 189 LYS 190 THR 191 ALA 192 MET 193 GLN 194 GLU 195 ARG 196 GLU 197 ILE 198 ILE 199 TRP 200 GLU 201 ALA 202 GLU 203 LEU 204 ARG 205 GLY 206 MET 207 THR 208 PRO 209 GLU 210 ALA 211 VAL 212 ARG 213 ALA 214 GLU 215 TYR 216 VAL 217 SER 218 LEU 219 THR 220 PRO 221 LEU 222 GLY 223 ARG 224 ILE 225 GLU 226 GLU 227 PRO 228 GLU 229 ASP 230 VAL 231 ALA 232 ASP 233 VAL 234 VAL 235 VAL 236 PHE 237 LEU 238 ALA 239 SER 240 ASP 241 ALA 242 ALA 243 ARG 244 PHE 245 MET 246 THR 247 GLY 248 GLN 249 GLY 250 ILE 251 ASN 252 VAL 253 THR 254 GLY 255 GLY 256 VAL 257 ARG 258 MET 259 ASP 260
Unit 4	GLY 3 ILE 4 PHE 5 ASP 6 LEU 7 SER 8 GLY 9 ARG 10 LYS 11 ALA 12 ILE 13 VAL 14 THR 15 GLY 16 GLY 17 SER 18 LYS 19 GLY 20 ILE 21 GLY 22 ALA 23 ALA 24 ILE 25 ALA 26 ARG 27 ALA 28 LEU 29 ASP 30 LYS 31 ALA 32 GLY 33 ALA 34 THR 35 VAL 36 ALA 37 ILE 38 ALA 39 ASP 40 LEU 41 ASP 42 VAL 43 MET 44 ALA 45 ALA 46 GLN 47 ALA 48 VAL 49 VAL 50 ALA 51 GLY 52 LEU 53 GLU 54 ASN 55 GLY 56 GLY 57 PHE 58 ALA 59 VAL 60 GLU 61 VAL 62 ASP 63 VAL 64 THR 65 LYS 66 ARG 67 ALA 68 SER 69 VAL 70 ASP 71 ALA 72 ALA 73 MET 74 GLN 75 LYS 76 ALA 77 ILE 78 ASP 79 ALA 80 LEU 81 GLY 82 GLY 83 PHE 84 ASP 85 LEU 86 LEU 87 CYS 88 ALA 89 ASN 90 ALA 91 GLY 92 VAL 93 SER 94 THR 95 MET 96 ARG 97 PRO 98 ALA 99 VAL 100 ASP 101 ILE 102 THR 103 ASP 104 GLU 105 GLU 106 TRP 107 ASP 108 PHE 109 ASN 110 PHE 111 ASP 112 VAL 113 ASN 114 ALA 115 ARG 116 GLY 117 VAL 118 PHE 119 LEU 120 ALA 121 ASN 122 GLN 123 ILE 124 ALA 125 CYS 126 ARG 127 HIS 128 PHE 129 LEU 130 ALA 131 SER 132 ASN 133 THR 134 LYS 135 GLY 136 VAL 137 ILE 138 VAL 139 ASN 140 THR 141 ALA 142 SER 143 LEU 144 ALA 145 ALA 146 LYS 147 VAL 148 GLY 149 ALA 150 PRO 151 LEU 152 LEU 153 ALA 154 HIS 155 TYR 156 SER 157 ALA 158 SER 159 LYS 160 PHE 161 ALA 162 VAL 163 PHE 164 GLY 165 TRP 166 THR 167 GLN 168 ALA 169 LEU 170 ALA 171 ARG 172 GLU 173 MET 174 ALA 175 PRO 176 LYS 177 ASN 178 ILE 179 ARG 180 VAL 181 ASN 182 CYS 183 VAL 184 CYS 185 PRO 186 GLY 187 PHE 188 VAL 189 LYS 190 THR 191 ALA 192 MET 193 GLN 194 GLU 195 ARG 196 GLU 197 ILE 198 ILE 199 TRP 200 GLU 201 ALA 202 GLU 203 LEU 204 ARG 205 GLY 206 MET 207 THR 208 PRO 209 GLU 210 ALA 211 VAL 212 ARG 213 ALA 214 GLU 215 TYR 216 VAL 217 SER 218 LEU 219 THR 220 PRO 221 LEU 222 GLY 223 ARG 224 ILE 225 GLU 226 GLU 227 PRO 228 GLU 229 ASP 230 VAL 231 ALA 232 ASP 233 VAL 234 VAL 235 VAL 236 PHE 237 LEU 238 ALA 239 SER 240 ASP 241 ALA 242 ALA 243 ARG 244 PHE 245 MET 246 THR 247 GLY 248 GLN 249 GLY 250 ILE 251 ASN 252 VAL 253 THR 254 GLY 255 GLY 256 VAL 257 ARG 258 MET 259 ASP 260

Ligands

Unit 5	NAD 901
Unit 6	NAD 902
Unit 7	NAD 903
Unit 8	NAD 904