2ZII - Sequence, Chains, Asymmetric and Biological Units

• Title: CRYSTAL STRUCTURE OF YEAST VPS74-N-TERM TRUNCATION VARIANT
• Keywords: BETA HAIRPIN, VPS, GOLGI LOCALIZATION, VPS74, TETRAMER, GOLG APPARATUS, PHOSPHOPROTEIN, PROTEIN TRANSPORT, TRANSPORT
• Experiment: X-ray diffraction
• Number of Models: 1

Database	ID code	Status	Coordinate files
			Header	Asymmetric unit	Biological unit
PDB	2ZII	released	available	available	Quaternary Structure Server

Asymmetric unit from PDB

Unit	Type	Name	Chain ID	Residues	Atoms	Hetatoms
1	Protein	VACUOLAR PROTEIN SORTING-ASSOCIATED PROTEIN 74	A	281	2149	0
2	Protein	VACUOLAR PROTEIN SORTING-ASSOCIATED PROTEIN 74	B	281	2126	0
3	Protein	VACUOLAR PROTEIN SORTING-ASSOCIATED PROTEIN 74	C	279	2125	0
4	Protein	VACUOLAR PROTEIN SORTING-ASSOCIATED PROTEIN 74	D	283	2188	0
5	Water			2	0	2
total				1126	8588	2

Proteins

Unit 1	ASN 63 ILE 64 PRO 65 THR 66 LEU 67 THR 68 LEU 69 MET 70 GLU 71 GLU 72 VAL 73 LEU 74 LEU 75 MET 76 GLY 77 LEU 78 ARG 79 ASP 80 ARG 81 GLU 82 GLY 83 TYR 84 LEU 85 SER 86 PHE 87 TRP 88 ASN 89 ASP 90 SER 91 ILE 92 SER 93 TYR 94 ALA 95 LEU 96 ARG 97 GLY 98 CYS 99 ILE 100 ILE 101 ILE 102 GLU 103 LEU 104 ALA 105 LEU 106 ARG 107 GLY 108 LYS 109 ILE 110 ARG 111 ILE 112 LEU 113 ASP 114 ASP 115 SER 116 ALA 117 ARG 118 LYS 119 ARG 120 PHE 121 ASP 122 LEU 123 SER 124 GLU 125 ARG 126 LEU 127 ILE 128 GLU 129 VAL 130 ILE 131 ASP 132 SER 133 SER 134 LYS 135 THR 136 GLY 137 GLU 138 VAL 139 LEU 140 LEU 141 ASP 142 GLU 143 THR 144 LEU 145 GLN 146 LEU 147 MET 148 LYS 149 ASN 150 ASP 151 GLU 152 PRO 153 LEU 154 SER 155 ILE 156 SER 157 ASN 158 TRP 159 ILE 160 ASP 161 LEU 162 LEU 163 SER 164 GLY 165 GLU 166 THR 167 TRP 168 ASN 169 LEU 170 LEU 171 LYS 172 ILE 173 ASN 174 TYR 175 GLN 176 LEU 177 LYS 178 GLN 179 VAL 180 ARG 181 GLU 182 ARG 183 LEU 184 ALA 185 LYS 186 GLY 187 LEU 188 VAL 189 ASP 190 LYS 191 GLY 192 VAL 193 LEU 194 ARG 195 THR 196 GLU 197 MET 198 LYS 199 ASN 200 PHE 201 PHE 202 LEU 203 PHE 204 ASP 205 MET 206 ALA 207 THR 208 HIS 209 PRO 210 ILE 211 ALA 212 ASP 213 ALA 214 SER 215 CYS 216 LYS 217 GLU 218 ALA 219 ILE 220 LYS 221 ARG 222 ARG 223 VAL 224 LEU 225 SER 226 VAL 227 LEU 228 VAL 229 SER 230 ARG 231 ASN 232 MET 233 GLU 234 LEU 235 SER 236 TYR 237 ASN 238 GLU 239 TYR 240 PHE 241 PRO 242 GLU 243 THR 244 THR 245 SER 246 PHE 247 LYS 248 ILE 249 ILE 250 ARG 251 THR 252 LEU 253 ALA 254 LEU 255 ILE 256 CYS 257 GLY 258 SER 259 TYR 260 GLY 261 ALA 262 ASN 263 VAL 264 LEU 265 GLU 266 ASN 267 VAL 268 LEU 269 THR 270 THR 271 LEU 272 GLU 273 TYR 274 GLU 275 LYS 276 ARG 277 ASP 278 LYS 279 ALA 280 ILE 281 SER 282 ARG 283 ALA 284 GLU 285 GLU 286 ILE 287 MET 288 ALA 289 GLN 290 PHE 291 SER 292 GLN 293 TYR 294 PRO 295 PHE 296 ASP 297 LEU 298 GLU 299 LYS 300 GLU 301 THR 302 GLU 303 LEU 304 GLY 305 VAL 306 SER 307 VAL 308 ASN 309 LEU 310 ASN 311 LYS 312 GLU 313 VAL 314 LYS 315 GLU 316 GLU 317 ILE 318 GLU 319 ASN 320 ASN 321 PRO 322 GLY 323 HIS 324 ASP 325 LEU 326 GLN 327 LEU 328 GLU 329 VAL 330 ILE 331 ALA 332 GLY 333 VAL 334 PHE 335 GLU 336 VAL 337 PHE 338 SER 339 ARG 340 MET 341 ASP 342 MET 343
Unit 2	ILE 62 ASN 63 ILE 64 PRO 65 THR 66 LEU 67 THR 68 LEU 69 MET 70 GLU 71 GLU 72 VAL 73 LEU 74 LEU 75 MET 76 GLY 77 LEU 78 ARG 79 ASP 80 ARG 81 GLU 82 GLY 83 TYR 84 LEU 85 SER 86 PHE 87 TRP 88 ASN 89 ASP 90 SER 91 ILE 92 SER 93 TYR 94 ALA 95 LEU 96 ARG 97 GLY 98 CYS 99 ILE 100 ILE 101 ILE 102 GLU 103 LEU 104 ALA 105 LEU 106 ARG 107 GLY 108 LYS 109 ILE 110 ARG 111 ILE 112 LEU 113 ASP 114 ASP 115 SER 116 ALA 117 ARG 118 LYS 119 ARG 120 PHE 121 ASP 122 LEU 123 SER 124 GLU 125 ARG 126 LEU 127 ILE 128 GLU 129 VAL 130 ILE 131 ASP 132 SER 133 SER 134 LYS 135 THR 136 GLY 137 GLU 138 VAL 139 LEU 140 LEU 141 ASP 142 GLU 143 THR 144 LEU 145 GLN 146 LEU 147 MET 148 LYS 149 ASN 150 ASP 151 GLU 152 PRO 153 LEU 154 SER 155 ILE 156 SER 157 ASN 158 TRP 159 ILE 160 ASP 161 LEU 162 LEU 163 SER 164 GLY 165 GLU 166 THR 167 TRP 168 ASN 169 LEU 170 LEU 171 LYS 172 ILE 173 ASN 174 TYR 175 GLN 176 LEU 177 LYS 178 GLN 179 VAL 180 ARG 181 GLU 182 ARG 183 LEU 184 ALA 185 LYS 186 GLY 187 LEU 188 VAL 189 ASP 190 LYS 191 GLY 192 VAL 193 LEU 194 ARG 195 THR 196 GLU 197 MET 198 LYS 199 ASN 200 PHE 201 PHE 202 LEU 203 PHE 204 ASP 205 MET 206 ALA 207 THR 208 HIS 209 PRO 210 ILE 211 ALA 212 ASP 213 ALA 214 SER 215 CYS 216 LYS 217 GLU 218 ALA 219 ILE 220 LYS 221 ARG 222 ARG 223 VAL 224 LEU 225 SER 226 VAL 227 LEU 228 VAL 229 SER 230 ARG 231 ASN 232 MET 233 GLU 234 LEU 235 SER 236 TYR 237 ASN 238 GLU 239 TYR 240 PHE 241 PRO 242 GLU 243 THR 244 THR 245 SER 246 PHE 247 LYS 248 ILE 249 ILE 250 ARG 251 THR 252 LEU 253 ALA 254 LEU 255 ILE 256 CYS 257 GLY 258 SER 259 TYR 260 GLY 261 ALA 262 ASN 263 VAL 264 LEU 265 GLU 266 ASN 267 VAL 268 LEU 269 THR 270 THR 271 LEU 272 GLU 273 TYR 274 GLU 275 LYS 276 ARG 277 ASP 278 LYS 279 ALA 280 ILE 281 SER 282 ARG 283 ALA 284 GLU 285 GLU 286 ILE 287 MET 288 ALA 289 GLN 290 PHE 291 SER 292 GLN 293 TYR 294 PRO 295 PHE 296 ASP 297 LEU 298 GLU 299 LYS 300 GLU 301 THR 302 GLU 303 LEU 304 GLY 305 VAL 306 SER 307 VAL 308 ASN 309 LEU 310 ASN 311 LYS 312 GLU 313 VAL 314 LYS 315 GLU 316 GLU 317 ILE 318 GLU 319 ASN 320 ASN 321 PRO 322 GLY 323 HIS 324 ASP 325 LEU 326 GLN 327 LEU 328 GLU 329 VAL 330 ILE 331 ALA 332 GLY 333 VAL 334 PHE 335 GLU 336 VAL 337 PHE 338 SER 339 ARG 340 MET 341 ASP 342
Unit 3	ASN 63 ILE 64 PRO 65 THR 66 LEU 67 THR 68 LEU 69 MET 70 GLU 71 GLU 72 VAL 73 LEU 74 LEU 75 MET 76 GLY 77 LEU 78 ARG 79 ASP 80 ARG 81 GLU 82 GLY 83 TYR 84 LEU 85 SER 86 PHE 87 TRP 88 ASN 89 ASP 90 SER 91 ILE 92 SER 93 TYR 94 ALA 95 LEU 96 ARG 97 GLY 98 CYS 99 ILE 100 ILE 101 ILE 102 GLU 103 LEU 104 ALA 105 LEU 106 ARG 107 GLY 108 LYS 109 ILE 110 ARG 111 ILE 112 LEU 113 ASP 114 ASP 115 SER 116 ALA 117 ARG 118 LYS 119 ARG 120 PHE 121 ASP 122 LEU 123 SER 124 GLU 125 ARG 126 LEU 127 ILE 128 GLU 129 VAL 130 ILE 131 ASP 132 SER 133 SER 134 LYS 135 THR 136 GLY 137 GLU 138 VAL 139 LEU 140 LEU 141 ASP 142 GLU 143 THR 144 LEU 145 GLN 146 LEU 147 MET 148 LYS 149 ASN 150 ASP 151 GLU 152 PRO 153 LEU 154 SER 155 ILE 156 SER 157 ASN 158 TRP 159 ILE 160 ASP 161 LEU 162 LEU 163 SER 164 GLY 165 GLU 166 THR 167 TRP 168 ASN 169 LEU 170 LEU 171 LYS 172 ILE 173 ASN 174 TYR 175 GLN 176 LEU 177 LYS 178 GLN 179 VAL 180 ARG 181 GLU 182 ARG 183 LEU 184 ALA 185 LYS 186 GLY 187 LEU 188 VAL 189 ASP 190 LYS 191 GLY 192 VAL 193 LEU 194 ARG 195 THR 196 GLU 197 MET 198 LYS 199 ASN 200 PHE 201 PHE 202 LEU 203 PHE 204 ASP 205 MET 206 ALA 207 THR 208 HIS 209 PRO 210 ILE 211 ALA 212 ASP 213 ALA 214 SER 215 CYS 216 LYS 217 GLU 218 ALA 219 ILE 220 LYS 221 ARG 222 ARG 223 VAL 224 LEU 225 SER 226 VAL 227 LEU 228 VAL 229 SER 230 ARG 231 ASN 232 MET 233 GLU 234 LEU 235 SER 236 TYR 237 ASN 238 GLU 239 TYR 240 PHE 241 PRO 242 GLU 243 THR 244 THR 245 SER 246 PHE 247 LYS 248 ILE 249 ILE 250 ARG 251 THR 252 LEU 253 ALA 254 LEU 255 ILE 256 CYS 257 GLY 258 SER 259 TYR 260 GLY 261 ALA 262 ASN 263 VAL 264 LEU 265 GLU 266 ASN 267 VAL 268 LEU 269 THR 270 THR 271 LEU 272 GLU 273 TYR 274 GLU 275 LYS 276 ARG 277 ASP 278 LYS 279 ALA 280 ILE 281 SER 282 ARG 283 ALA 284 GLU 285 GLU 286 ILE 287 MET 288 ALA 289 GLN 290 PHE 291 SER 292 GLN 293 TYR 294 PRO 295 PHE 296 ASP 297 LEU 298 GLU 299 LYS 300 GLU 301 THR 302 GLU 303 LEU 304 GLY 305 VAL 306 SER 307 VAL 308 ASN 309 LEU 310 ASN 311 LYS 312 GLU 313 VAL 314 LYS 315 GLU 316 GLU 317 ILE 318 GLU 319 ASN 320 ASN 321 PRO 322 GLY 323 HIS 324 ASP 325 LEU 326 GLN 327 LEU 328 GLU 329 VAL 330 ILE 331 ALA 332 GLY 333 VAL 334 PHE 335 GLU 336 VAL 337 PHE 338 SER 339 ARG 340 MET 341
Unit 4	ILE 62 ASN 63 ILE 64 PRO 65 THR 66 LEU 67 THR 68 LEU 69 MET 70 GLU 71 GLU 72 VAL 73 LEU 74 LEU 75 MET 76 GLY 77 LEU 78 ARG 79 ASP 80 ARG 81 GLU 82 GLY 83 TYR 84 LEU 85 SER 86 PHE 87 TRP 88 ASN 89 ASP 90 SER 91 ILE 92 SER 93 TYR 94 ALA 95 LEU 96 ARG 97 GLY 98 CYS 99 ILE 100 ILE 101 ILE 102 GLU 103 LEU 104 ALA 105 LEU 106 ARG 107 GLY 108 LYS 109 ILE 110 ARG 111 ILE 112 LEU 113 ASP 114 ASP 115 SER 116 ALA 117 ARG 118 LYS 119 ARG 120 PHE 121 ASP 122 LEU 123 SER 124 GLU 125 ARG 126 LEU 127 ILE 128 GLU 129 VAL 130 ILE 131 ASP 132 SER 133 SER 134 LYS 135 THR 136 GLY 137 GLU 138 VAL 139 LEU 140 LEU 141 ASP 142 GLU 143 THR 144 LEU 145 GLN 146 LEU 147 MET 148 LYS 149 ASN 150 ASP 151 GLU 152 PRO 153 LEU 154 SER 155 ILE 156 SER 157 ASN 158 TRP 159 ILE 160 ASP 161 LEU 162 LEU 163 SER 164 GLY 165 GLU 166 THR 167 TRP 168 ASN 169 LEU 170 LEU 171 LYS 172 ILE 173 ASN 174 TYR 175 GLN 176 LEU 177 LYS 178 GLN 179 VAL 180 ARG 181 GLU 182 ARG 183 LEU 184 ALA 185 LYS 186 GLY 187 LEU 188 VAL 189 ASP 190 LYS 191 GLY 192 VAL 193 LEU 194 ARG 195 THR 196 GLU 197 MET 198 LYS 199 ASN 200 PHE 201 PHE 202 LEU 203 PHE 204 ASP 205 MET 206 ALA 207 THR 208 HIS 209 PRO 210 ILE 211 ALA 212 ASP 213 ALA 214 SER 215 CYS 216 LYS 217 GLU 218 ALA 219 ILE 220 LYS 221 ARG 222 ARG 223 VAL 224 LEU 225 SER 226 VAL 227 LEU 228 VAL 229 SER 230 ARG 231 ASN 232 MET 233 GLU 234 LEU 235 SER 236 TYR 237 ASN 238 GLU 239 TYR 240 PHE 241 PRO 242 GLU 243 THR 244 THR 245 SER 246 PHE 247 LYS 248 ILE 249 ILE 250 ARG 251 THR 252 LEU 253 ALA 254 LEU 255 ILE 256 CYS 257 GLY 258 SER 259 TYR 260 GLY 261 ALA 262 ASN 263 VAL 264 LEU 265 GLU 266 ASN 267 VAL 268 LEU 269 THR 270 THR 271 LEU 272 GLU 273 TYR 274 GLU 275 LYS 276 ARG 277 ASP 278 LYS 279 ALA 280 ILE 281 SER 282 ARG 283 ALA 284 GLU 285 GLU 286 ILE 287 MET 288 ALA 289 GLN 290 PHE 291 SER 292 GLN 293 TYR 294 PRO 295 PHE 296 ASP 297 LEU 298 GLU 299 LYS 300 GLU 301 THR 302 GLU 303 LEU 304 GLY 305 VAL 306 SER 307 VAL 308 ASN 309 LEU 310 ASN 311 LYS 312 GLU 313 VAL 314 LYS 315 GLU 316 GLU 317 ILE 318 GLU 319 ASN 320 ASN 321 PRO 322 GLY 323 HIS 324 ASP 325 LEU 326 GLN 327 LEU 328 GLU 329 VAL 330 ILE 331 ALA 332 GLY 333 VAL 334 PHE 335 GLU 336 VAL 337 PHE 338 SER 339 ARG 340 MET 341 ASP 342 MET 343 LEU 344