2YRI - Sequence, Chains, Asymmetric and Biological Units

• Title: CRYSTAL STRUCTURE OF ALANINE-PYRUVATE AMINOTRANSFERASE WITH METHYLSERINE
• Keywords: AMINOTRANSFERASE, STRUCTURAL GENOMICS, NPPSFA, NATIONAL PROJ PROTEIN STRUCTURAL AND FUNCTIONAL ANALYSES, RIKEN STRUCTURA GENOMICS/PROTEOMICS INITIATIVE, RSGI, TRANSFERASE
• Experiment: X-ray diffraction
• Number of Models: 1

Database	ID code	Status	Coordinate files
			Header	Asymmetric unit	Biological unit
PDB	2YRI	released	available	available	Quaternary Structure Server

Asymmetric unit from PDB

Unit	Type	Name	Chain ID	Residues	Atoms	Hetatoms
1	Protein	AMINOTRANSFERASE, CLASS V	A	352	2573	0
2	Protein	AMINOTRANSFERASE, CLASS V	B	352	2581	0
3	Ligand	AMINOTRANSFERASE, CLASS V	A	1	0	23
4	Ligand	AMINOTRANSFERASE, CLASS V	B	1	0	16
5	Water			811	0	811
total				1517	5154	850

Proteins

Unit 1

MET 1 LEU 2 LEU 3 LEU 4 THR 5 PRO 6 GLY 7 PRO 8 THR 9 PRO 10 ILE 11 PRO 12 GLU 13 ARG 14 VAL 15 GLN 16 LYS 17 ALA 18 LEU 19 LEU 20 ARG 21 PRO 22 MET 23 ARG 24 GLY 25 HIS 26 LEU 27 ASP 28 PRO 29 GLU 30 VAL 31 LEU 32 ARG 33 VAL 34 ASN 35 ARG 36 ALA 37 ILE 38 GLN 39 GLU 40 ARG 41 LEU 42 ALA 43 ALA 44 LEU 45 PHE 46 ASP 47 PRO 48 GLY 49 GLU 50 GLY 51 ALA 52 LEU 53 VAL 54 ALA 55 ALA 56 LEU 57 ALA 58 GLY 59 SER 60 GLY 61 SER 62 LEU 63 GLY 64 MET 65 GLU 66 ALA 67 GLY 68 LEU 69 ALA 70 ASN 71 LEU 72 ASP 73 ARG 74 GLY 75 PRO 76 VAL 77 LEU 78 VAL 79 LEU 80 VAL 81 ASN 82 GLY 83 ALA 84 PHE 85 SER 86 GLN 87 ARG 88 VAL 89 ALA 90 GLU 91 MET 92 ALA 93 ALA 94 LEU 95 HIS 96 GLY 97 LEU 98 ASP 99 PRO 100 GLU 101 VAL 102 LEU 103 ASP 104 PHE 105 PRO 106 PRO 107 GLY 108 GLU 109 PRO 110 VAL 111 ASP 112 PRO 113 GLU 114 ALA 115 VAL 116 ALA 117 ARG 118 ALA 119 LEU 120 LYS 121 ARG 122 ARG 123 ARG 124 TYR 125 ARG 126 MET 127 VAL 128 ALA 129 LEU 130 VAL 131 HIS 132 GLY 133 GLU 134 THR 135 SER 136 THR 137 GLY 138 VAL 139 LEU 140 ASN 141 PRO 142 ALA 143 GLU 144 ALA 145 ILE 146 GLY 147 ALA 148 LEU 149 ALA 150 LYS 151 GLU 152 ALA 153 GLY 154 ALA 155 LEU 156 PHE 157 PHE 158 LEU 159 ASP 160 ALA 161 VAL 162 THR 163 THR 164 LEU 165 GLY 166 MET 167 LEU 168 PRO 169 PHE 170 SER 171 MET 172 ARG 173 ALA 174 MET 175 GLY 176 VAL 177 ASP 178 TYR 179 ALA 180 PHE 181 THR 182 GLY 183 SER 184 GLN 185 LYS 186 CYS 187 LEU 188 SER 189 ALA 190 PRO 191 PRO 192 GLY 193 LEU 194 ALA 195 PRO 196 ILE 197 ALA 198 ALA 199 SER 200 LEU 201 GLU 202 ALA 203 ARG 204 LYS 205 ALA 206 PHE 207 THR 208 GLY 209 LYS 210 ARG 211 GLY 212 TRP 213 TYR 214 LEU 215 ASP 216 LEU 217 ALA 218 ARG 219 VAL 220 ALA 221 GLU 222 HIS 223 TRP 224 GLU 225 ARG 226 GLY 227 GLY 228 TYR 229 HIS 230 HIS 231 THR 232 THR 233 PRO 234 VAL 235 LEU 236 LEU 237 HIS 238 TYR 239 ALA 240 LEU 241 LEU 242 GLU 243 ALA 244 LEU 245 ASP 246 LEU 247 VAL 248 LEU 249 GLU 250 GLU 251 GLY 252 VAL 253 ALA 254 ALA 255 ARG 256 GLU 257 ARG 258 ARG 259 ALA 260 ARG 261 GLU 262 VAL 263 TYR 264 ALA 265 TRP 266 VAL 267 LEU 268 GLU 269 GLU 270 LEU 271 LYS 272 ALA 273 ARG 274 GLY 275 PHE 276 ARG 277 PRO 278 TYR 279 PRO 280 LYS 281 ALA 282 SER 283 PRO 284 LEU 285 PRO 286 THR 287 VAL 288 LEU 289 VAL 290 VAL 291 ARG 292 PRO 293 PRO 294 GLU 295 GLY 296 VAL 297 ASP 298 ALA 299 ASP 300 ARG 301 LEU 302 VAL 303 ARG 304 ALA 305 LEU 306 TYR 307 ALA 308 GLU 309 GLY 310 VAL 311 ALA 312 VAL 313 ALA 314 GLY 315 GLY 316 ILE 317 GLY 318 PRO 319 THR 320 ARG 321 GLY 322 GLN 323 VAL 324 LEU 325 ARG 326 LEU 327 GLY 328 LEU 329 MET 330 GLY 331 GLU 332 GLY 333 ALA 334 ARG 335 ARG 336 GLU 337 ALA 338 TYR 339 GLN 340 ALA 341 PHE 342 LEU 343 LYS 344 ALA 345 LEU 346 ASP 347 ARG 348 ALA 349 LEU 350 ALA 351 LEU 352

Unit 2

MET 1 LEU 2 LEU 3 LEU 4 THR 5 PRO 6 GLY 7 PRO 8 THR 9 PRO 10 ILE 11 PRO 12 GLU 13 ARG 14 VAL 15 GLN 16 LYS 17 ALA 18 LEU 19 LEU 20 ARG 21 PRO 22 MET 23 ARG 24 GLY 25 HIS 26 LEU 27 ASP 28 PRO 29 GLU 30 VAL 31 LEU 32 ARG 33 VAL 34 ASN 35 ARG 36 ALA 37 ILE 38 GLN 39 GLU 40 ARG 41 LEU 42 ALA 43 ALA 44 LEU 45 PHE 46 ASP 47 PRO 48 GLY 49 GLU 50 GLY 51 ALA 52 LEU 53 VAL 54 ALA 55 ALA 56 LEU 57 ALA 58 GLY 59 SER 60 GLY 61 SER 62 LEU 63 GLY 64 MET 65 GLU 66 ALA 67 GLY 68 LEU 69 ALA 70 ASN 71 LEU 72 ASP 73 ARG 74 GLY 75 PRO 76 VAL 77 LEU 78 VAL 79 LEU 80 VAL 81 ASN 82 GLY 83 ALA 84 PHE 85 SER 86 GLN 87 ARG 88 VAL 89 ALA 90 GLU 91 MET 92 ALA 93 ALA 94 LEU 95 HIS 96 GLY 97 LEU 98 ASP 99 PRO 100 GLU 101 VAL 102 LEU 103 ASP 104 PHE 105 PRO 106 PRO 107 GLY 108 GLU 109 PRO 110 VAL 111 ASP 112 PRO 113 GLU 114 ALA 115 VAL 116 ALA 117 ARG 118 ALA 119 LEU 120 LYS 121 ARG 122 ARG 123 ARG 124 TYR 125 ARG 126 MET 127 VAL 128 ALA 129 LEU 130 VAL 131 HIS 132 GLY 133 GLU 134 THR 135 SER 136 THR 137 GLY 138 VAL 139 LEU 140 ASN 141 PRO 142 ALA 143 GLU 144 ALA 145 ILE 146 GLY 147 ALA 148 LEU 149 ALA 150 LYS 151 GLU 152 ALA 153 GLY 154 ALA 155 LEU 156 PHE 157 PHE 158 LEU 159 ASP 160 ALA 161 VAL 162 THR 163 THR 164 LEU 165 GLY 166 MET 167 LEU 168 PRO 169 PHE 170 SER 171 MET 172 ARG 173 ALA 174 MET 175 GLY 176 VAL 177 ASP 178 TYR 179 ALA 180 PHE 181 THR 182 GLY 183 SER 184 GLN 185 LYS 186 CYS 187 LEU 188 SER 189 ALA 190 PRO 191 PRO 192 GLY 193 LEU 194 ALA 195 PRO 196 ILE 197 ALA 198 ALA 199 SER 200 LEU 201 GLU 202 ALA 203 ARG 204 LYS 205 ALA 206 PHE 207 THR 208 GLY 209 LYS 210 ARG 211 GLY 212 TRP 213 TYR 214 LEU 215 ASP 216 LEU 217 ALA 218 ARG 219 VAL 220 ALA 221 GLU 222 HIS 223 TRP 224 GLU 225 ARG 226 GLY 227 GLY 228 TYR 229 HIS 230 HIS 231 THR 232 THR 233 PRO 234 VAL 235 LEU 236 LEU 237 HIS 238 TYR 239 ALA 240 LEU 241 LEU 242 GLU 243 ALA 244 LEU 245 ASP 246 LEU 247 VAL 248 LEU 249 GLU 250 GLU 251 GLY 252 VAL 253 ALA 254 ALA 255 ARG 256 GLU 257 ARG 258 ARG 259 ALA 260 ARG 261 GLU 262 VAL 263 TYR 264 ALA 265 TRP 266 VAL 267 LEU 268 GLU 269 GLU 270 LEU 271 LYS 272 ALA 273 ARG 274 GLY 275 PHE 276 ARG 277 PRO 278 TYR 279 PRO 280 LYS 281 ALA 282 SER 283 PRO 284 LEU 285 PRO 286 THR 287 VAL 288 LEU 289 VAL 290 VAL 291 ARG 292 PRO 293 PRO 294 GLU 295 GLY 296 VAL 297 ASP 298 ALA 299 ASP 300 ARG 301 LEU 302 VAL 303 ARG 304 ALA 305 LEU 306 TYR 307 ALA 308 GLU 309 GLY 310 VAL 311 ALA 312 VAL 313 ALA 314 GLY 315 GLY 316 ILE 317 GLY 318 PRO 319 THR 320 ARG 321 GLY 322 GLN 323 VAL 324 LEU 325 ARG 326 LEU 327 GLY 328 LEU 329 MET 330 GLY 331 GLU 332 GLY 333 ALA 334 ARG 335 ARG 336 GLU 337 ALA 338 TYR 339 GLN 340 ALA 341 PHE 342 LEU 343 LYS 344 ALA 345 LEU 346 ASP 347 ARG 348 ALA 349 LEU 350 ALA 351 LEU 352

Ligands

Unit 3	MMM 500
Unit 4	PMP 501