2QTK - Sequence, Chains, Asymmetric and Biological Units

• Title: CRYSTAL STRUCTURE OF THE OUTER MEMBRANE PROTEIN OPDK FROM PSEUDOMONAS AERUGINOSA
• Keywords: OUTER MEMBRANE PROTEIN, BETA BARREL, VANILLATE TRANSPORT, PORIN
• Experiment: X-ray diffraction
• Number of Models: 1

Database	ID code	Status	Coordinate files
			Header	Asymmetric unit	Biological unit
PDB	2QTK	released	available	available	Quaternary Structure Server

Asymmetric unit from PDB

Unit	Type	Name	Chain ID	Residues	Atoms	Hetatoms
1	Protein	PROBABLE PORIN	A	371	2907	0
2	Protein	PROBABLE PORIN	B	368	2888	0
3	Ligand	PROBABLE PORIN	B	1	0	20
4	Ligand	PROBABLE PORIN	A	1	0	13
5	Ligand	PROBABLE PORIN	B	1	0	13
6	Ligand	PROBABLE PORIN	A	11	0	135
7	Ligand	PROBABLE PORIN	B	8	0	92
total				761	5795	273

Proteins

Unit 1

GLY 4 PHE 5 LEU 6 GLU 7 ASP 8 ALA 9 LYS 10 THR 11 ASP 12 LEU 13 VAL 14 LEU 15 ARG 16 ASN 17 TYR 18 TYR 19 PHE 20 ASN 21 ARG 22 ASP 23 PHE 24 LYS 31 SER 32 LEU 33 VAL 34 ASP 35 GLU 36 TRP 37 ALA 38 GLN 39 GLY 40 PHE 41 ILE 42 LEU 43 LYS 44 PHE 45 SER 46 SER 47 GLY 48 TYR 49 THR 50 PRO 51 GLY 52 THR 53 VAL 54 GLY 55 VAL 56 GLY 57 LEU 58 ASP 59 ALA 60 ILE 61 GLY 62 LEU 63 PHE 64 GLY 65 VAL 66 LYS 67 LEU 68 ASN 69 ASN 76 SER 77 GLU 78 LEU 79 LEU 80 PRO 81 LEU 82 HIS 83 ALA 88 ALA 89 ASP 90 ASN 91 TYR 92 GLY 93 ARG 94 VAL 95 GLY 96 VAL 97 ALA 98 ALA 99 LYS 100 LEU 101 ARG 102 VAL 103 SER 104 ALA 105 SER 106 GLU 107 LEU 108 LYS 109 ILE 110 GLY 111 GLU 112 MET 113 LEU 114 PRO 115 ASP 116 ILE 117 PRO 118 LEU 119 LEU 120 ARG 121 TYR 122 ASP 123 ASP 124 GLY 125 ARG 126 LEU 127 LEU 128 PRO 129 GLN 130 THR 131 PHE 132 ARG 133 GLY 134 PHE 135 ALA 136 VAL 137 VAL 138 SER 139 ARG 140 GLU 141 LEU 142 PRO 143 GLY 144 LEU 145 ALA 146 LEU 147 GLN 148 ALA 149 GLY 150 ARG 151 PHE 152 ASP 153 ALA 154 VAL 155 SER 156 LEU 157 ARG 158 ASN 159 SER 160 ALA 161 ASP 162 MET 163 GLN 164 ASP 165 LEU 166 SER 167 ALA 168 TRP 169 SER 170 ALA 171 PRO 172 THR 173 GLN 174 LYS 175 SER 176 ASP 177 GLY 178 PHE 179 ASN 180 TYR 181 ALA 182 GLY 183 ALA 184 GLU 185 TYR 186 ARG 187 PHE 188 ASN 189 ARG 190 GLU 191 ARG 192 THR 193 GLN 194 LEU 195 GLY 196 LEU 197 TRP 198 HIS 199 GLY 200 GLN 201 LEU 202 GLU 203 ASP 204 VAL 205 TYR 206 ARG 207 GLN 208 SER 209 TYR 210 ALA 211 ASN 212 LEU 213 LEU 214 HIS 215 LYS 216 GLN 217 ARG 218 VAL 219 GLY 220 ASP 221 TRP 222 THR 223 LEU 224 GLY 225 ALA 226 ASN 227 LEU 228 GLY 229 LEU 230 PHE 231 VAL 232 ASP 233 ARG 234 ASP 235 ASP 236 GLY 237 ALA 238 ALA 239 ARG 240 ALA 241 GLY 242 GLU 243 ILE 244 ASP 245 SER 246 HIS 247 THR 248 VAL 249 TYR 250 GLY 251 LEU 252 PHE 253 SER 254 ALA 255 GLY 256 ILE 257 GLY 258 LEU 259 HIS 260 THR 261 PHE 262 TYR 263 LEU 264 GLY 265 LEU 266 GLN 267 LYS 268 VAL 269 GLY 270 GLY 271 ASP 272 SER 273 GLY 274 TRP 275 GLN 276 SER 277 VAL 278 TYR 279 GLY 280 SER 281 SER 282 GLY 283 ARG 284 SER 285 MET 286 GLY 287 ASN 288 ASP 289 MET 290 PHE 291 ASN 292 GLY 293 ASN 294 PHE 295 THR 296 ASN 297 ALA 298 ASP 299 GLU 300 ARG 301 SER 302 TRP 303 GLN 304 VAL 305 ARG 306 TYR 307 ASP 308 TYR 309 ASP 310 PHE 311 VAL 312 GLY 313 LEU 314 GLY 315 TRP 316 PRO 317 GLY 318 LEU 319 ILE 320 GLY 321 MET 322 VAL 323 ARG 324 TYR 325 GLY 326 HIS 327 GLY 328 SER 329 ASN 330 ALA 331 THR 332 THR 333 LYS 334 ALA 335 GLY 336 SER 337 GLY 338 GLY 339 LYS 340 GLU 341 TRP 342 GLU 343 ARG 344 ASP 345 VAL 346 GLU 347 LEU 348 GLY 349 TYR 350 THR 351 VAL 352 GLN 353 SER 354 GLY 355 PRO 356 LEU 357 ALA 358 ARG 359 LEU 360 ASN 361 VAL 362 ARG 363 LEU 364 ASN 365 HIS 366 ALA 367 SER 368 ASN 369 ARG 370 ARG 371 SER 372 PHE 373 ASN 374 SER 375 ASP 376 PHE 377 ASP 378 GLN 379 THR 380 ARG 381 LEU 382 VAL 383 VAL 384 SER 385 TYR 386 PRO 387 LEU 388 SER 389 TRP 390

Unit 2

PHE 5 LEU 6 GLU 7 ASP 8 ALA 9 LYS 10 THR 11 ASP 12 LEU 13 VAL 14 LEU 15 ARG 16 ASN 17 TYR 18 TYR 19 PHE 20 ASN 21 ARG 22 ASP 23 PHE 24 LEU 33 VAL 34 ASP 35 GLU 36 TRP 37 ALA 38 GLN 39 GLY 40 PHE 41 ILE 42 LEU 43 LYS 44 PHE 45 SER 46 SER 47 GLY 48 TYR 49 THR 50 PRO 51 GLY 52 THR 53 VAL 54 GLY 55 VAL 56 GLY 57 LEU 58 ASP 59 ALA 60 ILE 61 GLY 62 LEU 63 PHE 64 GLY 65 VAL 66 LYS 67 LEU 68 ASN 69 ASN 76 SER 77 GLU 78 LEU 79 LEU 80 PRO 81 LEU 82 HIS 83 ALA 88 ALA 89 ASP 90 ASN 91 TYR 92 GLY 93 ARG 94 VAL 95 GLY 96 VAL 97 ALA 98 ALA 99 LYS 100 LEU 101 ARG 102 VAL 103 SER 104 ALA 105 SER 106 GLU 107 LEU 108 LYS 109 ILE 110 GLY 111 GLU 112 MET 113 LEU 114 PRO 115 ASP 116 ILE 117 PRO 118 LEU 119 LEU 120 ARG 121 TYR 122 ASP 123 ASP 124 GLY 125 ARG 126 LEU 127 LEU 128 PRO 129 GLN 130 THR 131 PHE 132 ARG 133 GLY 134 PHE 135 ALA 136 VAL 137 VAL 138 SER 139 ARG 140 GLU 141 LEU 142 PRO 143 GLY 144 LEU 145 ALA 146 LEU 147 GLN 148 ALA 149 GLY 150 ARG 151 PHE 152 ASP 153 ALA 154 VAL 155 SER 156 LEU 157 ARG 158 ASN 159 SER 160 ALA 161 ASP 162 MET 163 GLN 164 ASP 165 LEU 166 SER 167 ALA 168 TRP 169 SER 170 ALA 171 PRO 172 THR 173 GLN 174 LYS 175 SER 176 ASP 177 GLY 178 PHE 179 ASN 180 TYR 181 ALA 182 GLY 183 ALA 184 GLU 185 TYR 186 ARG 187 PHE 188 ASN 189 ARG 190 GLU 191 ARG 192 THR 193 GLN 194 LEU 195 GLY 196 LEU 197 TRP 198 HIS 199 GLY 200 GLN 201 LEU 202 GLU 203 ASP 204 VAL 205 TYR 206 ARG 207 GLN 208 SER 209 TYR 210 ALA 211 ASN 212 LEU 213 LEU 214 HIS 215 LYS 216 GLN 217 ARG 218 VAL 219 GLY 220 ASP 221 TRP 222 THR 223 LEU 224 GLY 225 ALA 226 ASN 227 LEU 228 GLY 229 LEU 230 PHE 231 VAL 232 ASP 233 ARG 234 ASP 235 ASP 236 GLY 237 ALA 238 ALA 239 ARG 240 ALA 241 GLY 242 GLU 243 ILE 244 ASP 245 SER 246 HIS 247 THR 248 VAL 249 TYR 250 GLY 251 LEU 252 PHE 253 SER 254 ALA 255 GLY 256 ILE 257 GLY 258 LEU 259 HIS 260 THR 261 PHE 262 TYR 263 LEU 264 GLY 265 LEU 266 GLN 267 LYS 268 VAL 269 GLY 270 GLY 271 ASP 272 SER 273 GLY 274 TRP 275 GLN 276 SER 277 VAL 278 TYR 279 GLY 280 SER 281 SER 282 GLY 283 ARG 284 SER 285 MET 286 GLY 287 ASN 288 ASP 289 MET 290 PHE 291 ASN 292 GLY 293 ASN 294 PHE 295 THR 296 ASN 297 ALA 298 ASP 299 GLU 300 ARG 301 SER 302 TRP 303 GLN 304 VAL 305 ARG 306 TYR 307 ASP 308 TYR 309 ASP 310 PHE 311 VAL 312 GLY 313 LEU 314 GLY 315 TRP 316 PRO 317 GLY 318 LEU 319 ILE 320 GLY 321 MET 322 VAL 323 ARG 324 TYR 325 GLY 326 HIS 327 GLY 328 SER 329 ASN 330 ALA 331 THR 332 THR 333 LYS 334 ALA 335 GLY 336 SER 337 GLY 338 GLY 339 LYS 340 GLU 341 TRP 342 GLU 343 ARG 344 ASP 345 VAL 346 GLU 347 LEU 348 GLY 349 TYR 350 THR 351 VAL 352 GLN 353 SER 354 GLY 355 PRO 356 LEU 357 ALA 358 ARG 359 LEU 360 ASN 361 VAL 362 ARG 363 LEU 364 ASN 365 HIS 366 ALA 367 SER 368 ASN 369 ARG 370 ARG 371 SER 372 PHE 373 ASN 374 SER 375 ASP 376 PHE 377 ASP 378 GLN 379 THR 380 ARG 381 LEU 382 VAL 383 VAL 384 SER 385 TYR 386 PRO 387 LEU 388 SER 389 TRP 390

Ligands

Unit 3	C8E 391
Unit 4	C8E 391
Unit 5	C8E 392
Unit 6	C8E 392 C8E 393 C8E 394 C8E 395 C8E 396 C8E 397 C8E 398 C8E 399 C8E 400 C8E 401 C8E 402
Unit 7	C8E 393 C8E 394 C8E 395 C8E 396 C8E 397 C8E 398 C8E 399 C8E 400