2PFY - Sequence, Chains, Asymmetric and Biological Units

• Title: CRYSTAL STRUCTURE OF DCTP7, A BORDETELLA PERTUSSIS EXTRACYTOPLASMIC SOLUTE RECEPTOR BINDING PYROGLUTAMIC ACID
• Keywords: EXTRACYTOPLASMIC SOLUTE RECEPTOR, TRIPARTITE ATP INDEPENDENT PERIPLASMIC TRANSPORT, PYROGLUTAMIC ACID, LIGAND BINDING, TRANSPORT PROTEIN
• Experiment: X-ray diffraction
• Number of Models: 1

Database	ID code	Status	Coordinate files
			Header	Asymmetric unit	Biological unit
PDB	2PFY	released	available	available	Quaternary Structure Server

Asymmetric unit from PDB

Unit	Type	Name	Chain ID	Residues	Atoms	Hetatoms
1	Protein	PUTATIVE EXPORTED PROTEIN	A	301	2260	48
2	Protein	PUTATIVE EXPORTED PROTEIN	B	301	2260	48
3	Protein	PUTATIVE EXPORTED PROTEIN	C	301	2260	48
4	Protein	PUTATIVE EXPORTED PROTEIN	D	301	2260	48
5	Ligand	PUTATIVE EXPORTED PROTEIN	A	1	0	9
6	Ligand	PUTATIVE EXPORTED PROTEIN	B	1	0	9
7	Ligand	PUTATIVE EXPORTED PROTEIN	C	1	0	9
8	Ligand	PUTATIVE EXPORTED PROTEIN	D	1	0	9
9	Water			741	0	741
total				1949	9040	969

Proteins

Unit 1	ALA 1 THR 2 SER 3 TRP 4 THR 5 MSE 6 THR 7 ALA 8 GLU 9 GLN 10 PRO 11 ASP 12 ALA 13 ASN 14 TYR 15 LEU 16 THR 17 GLN 18 ASN 19 ALA 20 ARG 21 GLN 22 PHE 23 ALA 24 ASP 25 GLU 26 VAL 27 LYS 28 ALA 29 ALA 30 THR 31 ALA 32 GLY 33 ALA 34 LEU 35 GLU 36 ILE 37 LYS 38 VAL 39 GLN 40 SER 41 ASN 42 SER 43 THR 44 LEU 45 LEU 46 LYS 47 ARG 48 PRO 49 GLU 50 VAL 51 LYS 52 ARG 53 GLY 54 VAL 55 GLN 56 GLN 57 GLY 58 VAL 59 VAL 60 GLN 61 ILE 62 GLY 63 GLU 64 VAL 65 LEU 66 VAL 67 SER 68 ALA 69 LEU 70 GLY 71 ASN 72 GLU 73 ASP 74 PRO 75 LEU 76 PHE 77 GLU 78 ILE 79 ASP 80 SER 81 VAL 82 PRO 83 PHE 84 LEU 85 ALA 86 SER 87 SER 88 PHE 89 ASN 90 GLU 91 SER 92 GLU 93 LYS 94 LEU 95 TRP 96 LYS 97 ALA 98 THR 99 ARG 100 PRO 101 LEU 102 LEU 103 ALA 104 GLN 105 ARG 106 LEU 107 ASP 108 LYS 109 GLN 110 GLY 111 ILE 112 VAL 113 LEU 114 VAL 115 TYR 116 GLY 117 SER 118 PRO 119 TRP 120 PRO 121 PRO 122 GLN 123 GLY 124 ILE 125 TYR 126 THR 127 LYS 128 LYS 129 PRO 130 VAL 131 ALA 132 ALA 133 LEU 134 ALA 135 ASP 136 LEU 137 LYS 138 GLY 139 THR 140 ARG 141 PHE 142 ARG 143 ALA 144 TYR 145 SER 146 ALA 147 SER 148 THR 149 SER 150 HIS 151 MSE 152 ALA 153 ALA 154 LEU 155 MSE 156 GLY 157 ALA 158 VAL 159 PRO 160 THR 161 THR 162 VAL 163 GLN 164 THR 165 PRO 166 GLU 167 VAL 168 PRO 169 GLN 170 ALA 171 PHE 172 SER 173 THR 174 GLY 175 VAL 176 ILE 177 ASP 178 ALA 179 MSE 180 LEU 181 THR 182 SER 183 PRO 184 ALA 185 THR 186 GLY 187 VAL 188 ASP 189 SER 190 GLN 191 ALA 192 TRP 193 ASP 194 TYR 195 VAL 196 LYS 197 TYR 198 TYR 199 TYR 200 ASP 201 ALA 202 GLN 203 ALA 204 PHE 205 ILE 206 PRO 207 GLN 208 SER 209 PHE 210 VAL 211 ILE 212 ALA 213 ASN 214 LYS 215 ARG 216 ALA 217 PHE 218 GLN 219 ARG 220 LEU 221 PRO 222 ALA 223 GLU 224 VAL 225 ARG 226 GLN 227 ALA 228 VAL 229 LEU 230 ASP 231 ALA 232 GLY 233 ALA 234 LYS 235 ALA 236 GLU 237 ILE 238 ARG 239 GLY 240 TRP 241 GLN 242 THR 243 ALA 244 ARG 245 ALA 246 LYS 247 THR 248 ARG 249 GLU 250 LEU 251 THR 252 ASP 253 THR 254 LEU 255 ALA 256 ARG 257 ASN 258 GLY 259 MSE 260 SER 261 VAL 262 GLU 263 PRO 264 LEU 265 PRO 266 PRO 267 GLN 268 LEU 269 ALA 270 LYS 271 GLU 272 LEU 273 GLN 274 ALA 275 ILE 276 GLY 277 ALA 278 THR 279 MSE 280 VAL 281 SER 282 ASP 283 TRP 284 SER 285 LYS 286 LYS 287 ALA 288 GLY 289 ALA 290 ASP 291 GLY 292 GLN 293 GLN 294 LEU 295 LEU 296 ASP 297 ALA 298 TYR 299 ARG 300 LYS 301
Unit 2	ALA 1 THR 2 SER 3 TRP 4 THR 5 MSE 6 THR 7 ALA 8 GLU 9 GLN 10 PRO 11 ASP 12 ALA 13 ASN 14 TYR 15 LEU 16 THR 17 GLN 18 ASN 19 ALA 20 ARG 21 GLN 22 PHE 23 ALA 24 ASP 25 GLU 26 VAL 27 LYS 28 ALA 29 ALA 30 THR 31 ALA 32 GLY 33 ALA 34 LEU 35 GLU 36 ILE 37 LYS 38 VAL 39 GLN 40 SER 41 ASN 42 SER 43 THR 44 LEU 45 LEU 46 LYS 47 ARG 48 PRO 49 GLU 50 VAL 51 LYS 52 ARG 53 GLY 54 VAL 55 GLN 56 GLN 57 GLY 58 VAL 59 VAL 60 GLN 61 ILE 62 GLY 63 GLU 64 VAL 65 LEU 66 VAL 67 SER 68 ALA 69 LEU 70 GLY 71 ASN 72 GLU 73 ASP 74 PRO 75 LEU 76 PHE 77 GLU 78 ILE 79 ASP 80 SER 81 VAL 82 PRO 83 PHE 84 LEU 85 ALA 86 SER 87 SER 88 PHE 89 ASN 90 GLU 91 SER 92 GLU 93 LYS 94 LEU 95 TRP 96 LYS 97 ALA 98 THR 99 ARG 100 PRO 101 LEU 102 LEU 103 ALA 104 GLN 105 ARG 106 LEU 107 ASP 108 LYS 109 GLN 110 GLY 111 ILE 112 VAL 113 LEU 114 VAL 115 TYR 116 GLY 117 SER 118 PRO 119 TRP 120 PRO 121 PRO 122 GLN 123 GLY 124 ILE 125 TYR 126 THR 127 LYS 128 LYS 129 PRO 130 VAL 131 ALA 132 ALA 133 LEU 134 ALA 135 ASP 136 LEU 137 LYS 138 GLY 139 THR 140 ARG 141 PHE 142 ARG 143 ALA 144 TYR 145 SER 146 ALA 147 SER 148 THR 149 SER 150 HIS 151 MSE 152 ALA 153 ALA 154 LEU 155 MSE 156 GLY 157 ALA 158 VAL 159 PRO 160 THR 161 THR 162 VAL 163 GLN 164 THR 165 PRO 166 GLU 167 VAL 168 PRO 169 GLN 170 ALA 171 PHE 172 SER 173 THR 174 GLY 175 VAL 176 ILE 177 ASP 178 ALA 179 MSE 180 LEU 181 THR 182 SER 183 PRO 184 ALA 185 THR 186 GLY 187 VAL 188 ASP 189 SER 190 GLN 191 ALA 192 TRP 193 ASP 194 TYR 195 VAL 196 LYS 197 TYR 198 TYR 199 TYR 200 ASP 201 ALA 202 GLN 203 ALA 204 PHE 205 ILE 206 PRO 207 GLN 208 SER 209 PHE 210 VAL 211 ILE 212 ALA 213 ASN 214 LYS 215 ARG 216 ALA 217 PHE 218 GLN 219 ARG 220 LEU 221 PRO 222 ALA 223 GLU 224 VAL 225 ARG 226 GLN 227 ALA 228 VAL 229 LEU 230 ASP 231 ALA 232 GLY 233 ALA 234 LYS 235 ALA 236 GLU 237 ILE 238 ARG 239 GLY 240 TRP 241 GLN 242 THR 243 ALA 244 ARG 245 ALA 246 LYS 247 THR 248 ARG 249 GLU 250 LEU 251 THR 252 ASP 253 THR 254 LEU 255 ALA 256 ARG 257 ASN 258 GLY 259 MSE 260 SER 261 VAL 262 GLU 263 PRO 264 LEU 265 PRO 266 PRO 267 GLN 268 LEU 269 ALA 270 LYS 271 GLU 272 LEU 273 GLN 274 ALA 275 ILE 276 GLY 277 ALA 278 THR 279 MSE 280 VAL 281 SER 282 ASP 283 TRP 284 SER 285 LYS 286 LYS 287 ALA 288 GLY 289 ALA 290 ASP 291 GLY 292 GLN 293 GLN 294 LEU 295 LEU 296 ASP 297 ALA 298 TYR 299 ARG 300 LYS 301
Unit 3	ALA 1 THR 2 SER 3 TRP 4 THR 5 MSE 6 THR 7 ALA 8 GLU 9 GLN 10 PRO 11 ASP 12 ALA 13 ASN 14 TYR 15 LEU 16 THR 17 GLN 18 ASN 19 ALA 20 ARG 21 GLN 22 PHE 23 ALA 24 ASP 25 GLU 26 VAL 27 LYS 28 ALA 29 ALA 30 THR 31 ALA 32 GLY 33 ALA 34 LEU 35 GLU 36 ILE 37 LYS 38 VAL 39 GLN 40 SER 41 ASN 42 SER 43 THR 44 LEU 45 LEU 46 LYS 47 ARG 48 PRO 49 GLU 50 VAL 51 LYS 52 ARG 53 GLY 54 VAL 55 GLN 56 GLN 57 GLY 58 VAL 59 VAL 60 GLN 61 ILE 62 GLY 63 GLU 64 VAL 65 LEU 66 VAL 67 SER 68 ALA 69 LEU 70 GLY 71 ASN 72 GLU 73 ASP 74 PRO 75 LEU 76 PHE 77 GLU 78 ILE 79 ASP 80 SER 81 VAL 82 PRO 83 PHE 84 LEU 85 ALA 86 SER 87 SER 88 PHE 89 ASN 90 GLU 91 SER 92 GLU 93 LYS 94 LEU 95 TRP 96 LYS 97 ALA 98 THR 99 ARG 100 PRO 101 LEU 102 LEU 103 ALA 104 GLN 105 ARG 106 LEU 107 ASP 108 LYS 109 GLN 110 GLY 111 ILE 112 VAL 113 LEU 114 VAL 115 TYR 116 GLY 117 SER 118 PRO 119 TRP 120 PRO 121 PRO 122 GLN 123 GLY 124 ILE 125 TYR 126 THR 127 LYS 128 LYS 129 PRO 130 VAL 131 ALA 132 ALA 133 LEU 134 ALA 135 ASP 136 LEU 137 LYS 138 GLY 139 THR 140 ARG 141 PHE 142 ARG 143 ALA 144 TYR 145 SER 146 ALA 147 SER 148 THR 149 SER 150 HIS 151 MSE 152 ALA 153 ALA 154 LEU 155 MSE 156 GLY 157 ALA 158 VAL 159 PRO 160 THR 161 THR 162 VAL 163 GLN 164 THR 165 PRO 166 GLU 167 VAL 168 PRO 169 GLN 170 ALA 171 PHE 172 SER 173 THR 174 GLY 175 VAL 176 ILE 177 ASP 178 ALA 179 MSE 180 LEU 181 THR 182 SER 183 PRO 184 ALA 185 THR 186 GLY 187 VAL 188 ASP 189 SER 190 GLN 191 ALA 192 TRP 193 ASP 194 TYR 195 VAL 196 LYS 197 TYR 198 TYR 199 TYR 200 ASP 201 ALA 202 GLN 203 ALA 204 PHE 205 ILE 206 PRO 207 GLN 208 SER 209 PHE 210 VAL 211 ILE 212 ALA 213 ASN 214 LYS 215 ARG 216 ALA 217 PHE 218 GLN 219 ARG 220 LEU 221 PRO 222 ALA 223 GLU 224 VAL 225 ARG 226 GLN 227 ALA 228 VAL 229 LEU 230 ASP 231 ALA 232 GLY 233 ALA 234 LYS 235 ALA 236 GLU 237 ILE 238 ARG 239 GLY 240 TRP 241 GLN 242 THR 243 ALA 244 ARG 245 ALA 246 LYS 247 THR 248 ARG 249 GLU 250 LEU 251 THR 252 ASP 253 THR 254 LEU 255 ALA 256 ARG 257 ASN 258 GLY 259 MSE 260 SER 261 VAL 262 GLU 263 PRO 264 LEU 265 PRO 266 PRO 267 GLN 268 LEU 269 ALA 270 LYS 271 GLU 272 LEU 273 GLN 274 ALA 275 ILE 276 GLY 277 ALA 278 THR 279 MSE 280 VAL 281 SER 282 ASP 283 TRP 284 SER 285 LYS 286 LYS 287 ALA 288 GLY 289 ALA 290 ASP 291 GLY 292 GLN 293 GLN 294 LEU 295 LEU 296 ASP 297 ALA 298 TYR 299 ARG 300 LYS 301
Unit 4	ALA 1 THR 2 SER 3 TRP 4 THR 5 MSE 6 THR 7 ALA 8 GLU 9 GLN 10 PRO 11 ASP 12 ALA 13 ASN 14 TYR 15 LEU 16 THR 17 GLN 18 ASN 19 ALA 20 ARG 21 GLN 22 PHE 23 ALA 24 ASP 25 GLU 26 VAL 27 LYS 28 ALA 29 ALA 30 THR 31 ALA 32 GLY 33 ALA 34 LEU 35 GLU 36 ILE 37 LYS 38 VAL 39 GLN 40 SER 41 ASN 42 SER 43 THR 44 LEU 45 LEU 46 LYS 47 ARG 48 PRO 49 GLU 50 VAL 51 LYS 52 ARG 53 GLY 54 VAL 55 GLN 56 GLN 57 GLY 58 VAL 59 VAL 60 GLN 61 ILE 62 GLY 63 GLU 64 VAL 65 LEU 66 VAL 67 SER 68 ALA 69 LEU 70 GLY 71 ASN 72 GLU 73 ASP 74 PRO 75 LEU 76 PHE 77 GLU 78 ILE 79 ASP 80 SER 81 VAL 82 PRO 83 PHE 84 LEU 85 ALA 86 SER 87 SER 88 PHE 89 ASN 90 GLU 91 SER 92 GLU 93 LYS 94 LEU 95 TRP 96 LYS 97 ALA 98 THR 99 ARG 100 PRO 101 LEU 102 LEU 103 ALA 104 GLN 105 ARG 106 LEU 107 ASP 108 LYS 109 GLN 110 GLY 111 ILE 112 VAL 113 LEU 114 VAL 115 TYR 116 GLY 117 SER 118 PRO 119 TRP 120 PRO 121 PRO 122 GLN 123 GLY 124 ILE 125 TYR 126 THR 127 LYS 128 LYS 129 PRO 130 VAL 131 ALA 132 ALA 133 LEU 134 ALA 135 ASP 136 LEU 137 LYS 138 GLY 139 THR 140 ARG 141 PHE 142 ARG 143 ALA 144 TYR 145 SER 146 ALA 147 SER 148 THR 149 SER 150 HIS 151 MSE 152 ALA 153 ALA 154 LEU 155 MSE 156 GLY 157 ALA 158 VAL 159 PRO 160 THR 161 THR 162 VAL 163 GLN 164 THR 165 PRO 166 GLU 167 VAL 168 PRO 169 GLN 170 ALA 171 PHE 172 SER 173 THR 174 GLY 175 VAL 176 ILE 177 ASP 178 ALA 179 MSE 180 LEU 181 THR 182 SER 183 PRO 184 ALA 185 THR 186 GLY 187 VAL 188 ASP 189 SER 190 GLN 191 ALA 192 TRP 193 ASP 194 TYR 195 VAL 196 LYS 197 TYR 198 TYR 199 TYR 200 ASP 201 ALA 202 GLN 203 ALA 204 PHE 205 ILE 206 PRO 207 GLN 208 SER 209 PHE 210 VAL 211 ILE 212 ALA 213 ASN 214 LYS 215 ARG 216 ALA 217 PHE 218 GLN 219 ARG 220 LEU 221 PRO 222 ALA 223 GLU 224 VAL 225 ARG 226 GLN 227 ALA 228 VAL 229 LEU 230 ASP 231 ALA 232 GLY 233 ALA 234 LYS 235 ALA 236 GLU 237 ILE 238 ARG 239 GLY 240 TRP 241 GLN 242 THR 243 ALA 244 ARG 245 ALA 246 LYS 247 THR 248 ARG 249 GLU 250 LEU 251 THR 252 ASP 253 THR 254 LEU 255 ALA 256 ARG 257 ASN 258 GLY 259 MSE 260 SER 261 VAL 262 GLU 263 PRO 264 LEU 265 PRO 266 PRO 267 GLN 268 LEU 269 ALA 270 LYS 271 GLU 272 LEU 273 GLN 274 ALA 275 ILE 276 GLY 277 ALA 278 THR 279 MSE 280 VAL 281 SER 282 ASP 283 TRP 284 SER 285 LYS 286 LYS 287 ALA 288 GLY 289 ALA 290 ASP 291 GLY 292 GLN 293 GLN 294 LEU 295 LEU 296 ASP 297 ALA 298 TYR 299 ARG 300 LYS 301

Ligands

Unit 5	PCA 302
Unit 6	PCA 302
Unit 7	PCA 302
Unit 8	PCA 302