2GAI - Sequence, Chains, Asymmetric and Biological Units

• Title: STRUCTURE OF FULL LENGTH TOPOISOMERASE I FROM THERMOTOGA MAR TRICLINIC CRYSTAL FORM
• Keywords: TOPOISOMERASE, ZINC RIBBON, ISOMERASE
• Experiment: X-ray diffraction
• Number of Models: 1

Database	ID code	Status	Coordinate files
			Header	Asymmetric unit	Biological unit
PDB	2GAI	released	available	available	Quaternary Structure Server

Asymmetric unit from PDB

Unit	Type	Name	Chain ID	Residues	Atoms	Hetatoms
1	Protein	DNA TOPOISOMERASE I	A	581	4714	0
2	Protein	DNA TOPOISOMERASE I	B	581	4714	0
3	Water			1054	0	1054
total				2216	9428	1054

Proteins

Unit 1

LYS 7 TYR 8 ILE 9 VAL 10 VAL 11 GLU 12 SER 13 PRO 14 ALA 15 LYS 16 ALA 17 LYS 18 THR 19 ILE 20 LYS 21 SER 22 ILE 23 LEU 24 GLY 25 ASN 26 GLU 27 TYR 28 GLU 29 VAL 30 PHE 31 ALA 32 SER 33 MET 34 GLY 35 HIS 36 ILE 37 ILE 38 ASP 39 LEU 40 PRO 41 LYS 42 SER 43 LYS 44 PHE 45 GLY 46 VAL 47 ASP 48 LEU 49 GLU 50 LYS 51 ASP 52 PHE 53 GLU 54 PRO 55 GLU 56 PHE 57 ALA 58 VAL 59 ILE 60 LYS 61 GLY 62 LYS 63 GLU 64 LYS 65 VAL 66 VAL 67 GLU 68 LYS 69 LEU 70 LYS 71 ASP 72 LEU 73 ALA 74 LYS 75 LYS 76 GLY 77 GLU 78 LEU 79 LEU 80 ILE 81 ALA 82 SER 83 ASP 84 MET 85 ASP 86 ARG 87 GLU 88 GLY 89 GLU 90 ALA 91 ILE 92 ALA 93 TRP 94 HIS 95 ILE 96 ALA 97 ARG 98 VAL 99 THR 100 ASN 101 THR 102 LEU 103 GLY 104 ARG 105 LYS 106 ASN 107 ARG 108 ILE 109 VAL 110 PHE 111 SER 112 GLU 113 ILE 114 THR 115 PRO 116 ARG 117 VAL 118 ILE 119 ARG 120 GLU 121 ALA 122 VAL 123 LYS 124 ASN 125 PRO 126 ARG 127 GLU 128 ILE 129 ASP 130 MET 131 LYS 132 LYS 133 VAL 134 ARG 135 ALA 136 GLN 137 LEU 138 ALA 139 ARG 140 ARG 141 ILE 142 LEU 143 ASP 144 ARG 145 ILE 146 VAL 147 GLY 148 TYR 149 SER 150 LEU 151 SER 152 PRO 153 VAL 154 LEU 155 TRP 156 ARG 157 ASN 158 PHE 159 LYS 160 SER 161 ASN 162 LEU 163 SER 164 ALA 165 GLY 166 ARG 167 VAL 168 GLN 169 SER 170 ALA 171 THR 172 LEU 173 LYS 174 LEU 175 VAL 176 CYS 177 ASP 178 ARG 179 GLU 180 ARG 181 GLU 182 ILE 183 LEU 184 ARG 185 PHE 186 VAL 187 PRO 188 LYS 189 LYS 190 TYR 191 HIS 192 ARG 193 ILE 194 THR 195 VAL 196 ASN 197 PHE 198 ASP 199 GLY 200 LEU 201 THR 202 ALA 203 GLU 204 ILE 205 ASP 206 VAL 207 LYS 208 GLU 209 LYS 210 LYS 211 PHE 212 PHE 213 ASP 214 ALA 215 GLU 216 THR 217 LEU 218 LYS 219 GLU 220 ILE 221 GLN 222 SER 223 ILE 224 ASP 225 GLU 226 LEU 227 VAL 228 VAL 229 GLU 230 GLU 231 LYS 232 LYS 233 VAL 234 SER 235 VAL 236 LYS 237 LYS 238 PHE 239 ALA 240 PRO 241 PRO 242 GLU 243 PRO 244 PHE 245 LYS 246 THR 247 SER 248 THR 249 LEU 250 GLN 251 GLN 252 GLU 253 ALA 254 TYR 255 SER 256 LYS 257 LEU 258 GLY 259 PHE 260 SER 261 VAL 262 SER 263 LYS 264 THR 265 MET 266 MET 267 ILE 268 ALA 269 GLN 270 GLN 271 LEU 272 TYR 273 GLU 274 GLY 275 VAL 276 GLU 277 THR 278 LYS 279 ASP 280 GLY 281 HIS 282 ILE 283 ALA 284 PHE 285 ILE 286 THR 287 TYR 288 MET 289 ARG 290 THR 291 ASP 292 SER 293 THR 294 ARG 295 VAL 296 SER 297 ASP 298 TYR 299 ALA 300 LYS 301 GLU 302 GLU 303 ALA 304 ARG 305 ASN 306 LEU 307 ILE 308 THR 309 GLU 310 VAL 311 PHE 312 GLY 313 GLU 314 GLU 315 TYR 316 VAL 317 GLY 318 ALA 333 HIS 334 GLU 335 ALA 336 ILE 337 ARG 338 PRO 339 THR 340 ASN 341 VAL 342 PHE 343 MET 344 THR 345 PRO 346 GLU 347 GLU 348 ALA 349 GLY 350 LYS 351 TYR 352 LEU 353 ASN 354 SER 355 ASP 356 GLN 357 LYS 358 LYS 359 LEU 360 TYR 361 GLU 362 LEU 363 ILE 364 TRP 365 LYS 366 ARG 367 PHE 368 LEU 369 ALA 370 SER 371 GLN 372 MET 373 LYS 374 PRO 375 SER 376 GLN 377 TYR 378 GLU 379 GLU 380 THR 381 ARG 382 PHE 383 VAL 384 LEU 385 ARG 386 THR 387 LYS 388 ASP 389 GLY 390 LYS 391 TYR 392 ARG 393 PHE 394 LYS 395 GLY 396 THR 397 VAL 398 LEU 399 LYS 400 LYS 401 ILE 402 PHE 403 ASP 404 GLY 405 TYR 406 GLU 407 LYS 408 VAL 409 TRP 410 LYS 411 THR 412 GLU 413 ARG 414 ASN 415 THR 416 GLY 417 GLU 418 PHE 419 PRO 420 PHE 421 GLU 422 GLU 423 GLY 424 GLU 425 SER 426 VAL 427 LYS 428 PRO 429 VAL 430 VAL 431 VAL 432 LYS 433 ILE 434 GLU 435 GLU 436 GLN 437 GLU 438 THR 439 LYS 440 PRO 441 LYS 442 PRO 443 ARG 444 TYR 445 THR 446 GLU 447 GLY 448 SER 449 LEU 450 VAL 451 LYS 452 GLU 453 MET 454 GLU 455 ARG 456 LEU 457 GLY 458 ILE 459 GLY 460 ARG 461 PRO 462 SER 463 THR 464 TYR 465 ALA 466 SER 467 THR 468 ILE 469 LYS 470 LEU 471 LEU 472 LEU 473 ASN 474 ARG 475 GLY 476 TYR 477 ILE 478 LYS 479 LYS 480 ILE 481 ARG 482 GLY 483 TYR 484 LEU 485 TYR 486 PRO 487 THR 488 ILE 489 VAL 490 GLY 491 SER 492 VAL 493 VAL 494 MET 495 ASP 496 TYR 497 LEU 498 GLU 499 LYS 500 LYS 501 TYR 502 SER 503 ASP 504 VAL 505 VAL 506 SER 507 VAL 508 SER 509 PHE 510 THR 511 ALA 512 GLU 513 MET 514 GLU 515 LYS 516 ASP 517 LEU 518 ASP 519 GLU 520 VAL 521 GLU 522 GLN 523 GLY 524 LYS 525 LYS 526 THR 527 ASP 528 LYS 529 ILE 530 VAL 531 LEU 532 ARG 533 GLU 534 PHE 535 TYR 536 GLU 537 SER 538 PHE 539 SER 540 SER 541 VAL 542 PHE 543 ASP 544 ARG 545 ASN 546 ASP 547 ARG 548 ILE 549 VAL 550 VAL 551 ASP 552 PHE 553 PRO 554 THR 555 ASN 556 GLN 557 LYS 558 CYS 559 SER 560 CYS 561 GLY 562 LYS 563 GLU 564 MET 565 ARG 566 LEU 567 SER 568 PHE 569 GLY 570 LYS 571 TYR 572 GLY 573 PHE 574 TYR 575 LEU 576 LYS 577 CYS 578 GLU 579 CYS 580 GLY 581 LYS 582 THR 583 ARG 584 SER 585 VAL 586 LYS 587 ASN 588 ASP 589 GLU 590 ILE 591 ALA 592 VAL 593 ILE 594 ASP 595 ASP 596 GLY 597 LYS 598 ILE 599 PHE 600 LEU 601

Unit 2

LYS 7 TYR 8 ILE 9 VAL 10 VAL 11 GLU 12 SER 13 PRO 14 ALA 15 LYS 16 ALA 17 LYS 18 THR 19 ILE 20 LYS 21 SER 22 ILE 23 LEU 24 GLY 25 ASN 26 GLU 27 TYR 28 GLU 29 VAL 30 PHE 31 ALA 32 SER 33 MET 34 GLY 35 HIS 36 ILE 37 ILE 38 ASP 39 LEU 40 PRO 41 LYS 42 SER 43 LYS 44 PHE 45 GLY 46 VAL 47 ASP 48 LEU 49 GLU 50 LYS 51 ASP 52 PHE 53 GLU 54 PRO 55 GLU 56 PHE 57 ALA 58 VAL 59 ILE 60 LYS 61 GLY 62 LYS 63 GLU 64 LYS 65 VAL 66 VAL 67 GLU 68 LYS 69 LEU 70 LYS 71 ASP 72 LEU 73 ALA 74 LYS 75 LYS 76 GLY 77 GLU 78 LEU 79 LEU 80 ILE 81 ALA 82 SER 83 ASP 84 MET 85 ASP 86 ARG 87 GLU 88 GLY 89 GLU 90 ALA 91 ILE 92 ALA 93 TRP 94 HIS 95 ILE 96 ALA 97 ARG 98 VAL 99 THR 100 ASN 101 THR 102 LEU 103 GLY 104 ARG 105 LYS 106 ASN 107 ARG 108 ILE 109 VAL 110 PHE 111 SER 112 GLU 113 ILE 114 THR 115 PRO 116 ARG 117 VAL 118 ILE 119 ARG 120 GLU 121 ALA 122 VAL 123 LYS 124 ASN 125 PRO 126 ARG 127 GLU 128 ILE 129 ASP 130 MET 131 LYS 132 LYS 133 VAL 134 ARG 135 ALA 136 GLN 137 LEU 138 ALA 139 ARG 140 ARG 141 ILE 142 LEU 143 ASP 144 ARG 145 ILE 146 VAL 147 GLY 148 TYR 149 SER 150 LEU 151 SER 152 PRO 153 VAL 154 LEU 155 TRP 156 ARG 157 ASN 158 PHE 159 LYS 160 SER 161 ASN 162 LEU 163 SER 164 ALA 165 GLY 166 ARG 167 VAL 168 GLN 169 SER 170 ALA 171 THR 172 LEU 173 LYS 174 LEU 175 VAL 176 CYS 177 ASP 178 ARG 179 GLU 180 ARG 181 GLU 182 ILE 183 LEU 184 ARG 185 PHE 186 VAL 187 PRO 188 LYS 189 LYS 190 TYR 191 HIS 192 ARG 193 ILE 194 THR 195 VAL 196 ASN 197 PHE 198 ASP 199 GLY 200 LEU 201 THR 202 ALA 203 GLU 204 ILE 205 ASP 206 VAL 207 LYS 208 GLU 209 LYS 210 LYS 211 PHE 212 PHE 213 ASP 214 ALA 215 GLU 216 THR 217 LEU 218 LYS 219 GLU 220 ILE 221 GLN 222 SER 223 ILE 224 ASP 225 GLU 226 LEU 227 VAL 228 VAL 229 GLU 230 GLU 231 LYS 232 LYS 233 VAL 234 SER 235 VAL 236 LYS 237 LYS 238 PHE 239 ALA 240 PRO 241 PRO 242 GLU 243 PRO 244 PHE 245 LYS 246 THR 247 SER 248 THR 249 LEU 250 GLN 251 GLN 252 GLU 253 ALA 254 TYR 255 SER 256 LYS 257 LEU 258 GLY 259 PHE 260 SER 261 VAL 262 SER 263 LYS 264 THR 265 MET 266 MET 267 ILE 268 ALA 269 GLN 270 GLN 271 LEU 272 TYR 273 GLU 274 GLY 275 VAL 276 GLU 277 THR 278 LYS 279 ASP 280 GLY 281 HIS 282 ILE 283 ALA 284 PHE 285 ILE 286 THR 287 TYR 288 MET 289 ARG 290 THR 291 ASP 292 SER 293 THR 294 ARG 295 VAL 296 SER 297 ASP 298 TYR 299 ALA 300 LYS 301 GLU 302 GLU 303 ALA 304 ARG 305 ASN 306 LEU 307 ILE 308 THR 309 GLU 310 VAL 311 PHE 312 GLY 313 GLU 314 GLU 315 TYR 316 VAL 317 GLY 318 ALA 333 HIS 334 GLU 335 ALA 336 ILE 337 ARG 338 PRO 339 THR 340 ASN 341 VAL 342 PHE 343 MET 344 THR 345 PRO 346 GLU 347 GLU 348 ALA 349 GLY 350 LYS 351 TYR 352 LEU 353 ASN 354 SER 355 ASP 356 GLN 357 LYS 358 LYS 359 LEU 360 TYR 361 GLU 362 LEU 363 ILE 364 TRP 365 LYS 366 ARG 367 PHE 368 LEU 369 ALA 370 SER 371 GLN 372 MET 373 LYS 374 PRO 375 SER 376 GLN 377 TYR 378 GLU 379 GLU 380 THR 381 ARG 382 PHE 383 VAL 384 LEU 385 ARG 386 THR 387 LYS 388 ASP 389 GLY 390 LYS 391 TYR 392 ARG 393 PHE 394 LYS 395 GLY 396 THR 397 VAL 398 LEU 399 LYS 400 LYS 401 ILE 402 PHE 403 ASP 404 GLY 405 TYR 406 GLU 407 LYS 408 VAL 409 TRP 410 LYS 411 THR 412 GLU 413 ARG 414 ASN 415 THR 416 GLY 417 GLU 418 PHE 419 PRO 420 PHE 421 GLU 422 GLU 423 GLY 424 GLU 425 SER 426 VAL 427 LYS 428 PRO 429 VAL 430 VAL 431 VAL 432 LYS 433 ILE 434 GLU 435 GLU 436 GLN 437 GLU 438 THR 439 LYS 440 PRO 441 LYS 442 PRO 443 ARG 444 TYR 445 THR 446 GLU 447 GLY 448 SER 449 LEU 450 VAL 451 LYS 452 GLU 453 MET 454 GLU 455 ARG 456 LEU 457 GLY 458 ILE 459 GLY 460 ARG 461 PRO 462 SER 463 THR 464 TYR 465 ALA 466 SER 467 THR 468 ILE 469 LYS 470 LEU 471 LEU 472 LEU 473 ASN 474 ARG 475 GLY 476 TYR 477 ILE 478 LYS 479 LYS 480 ILE 481 ARG 482 GLY 483 TYR 484 LEU 485 TYR 486 PRO 487 THR 488 ILE 489 VAL 490 GLY 491 SER 492 VAL 493 VAL 494 MET 495 ASP 496 TYR 497 LEU 498 GLU 499 LYS 500 LYS 501 TYR 502 SER 503 ASP 504 VAL 505 VAL 506 SER 507 VAL 508 SER 509 PHE 510 THR 511 ALA 512 GLU 513 MET 514 GLU 515 LYS 516 ASP 517 LEU 518 ASP 519 GLU 520 VAL 521 GLU 522 GLN 523 GLY 524 LYS 525 LYS 526 THR 527 ASP 528 LYS 529 ILE 530 VAL 531 LEU 532 ARG 533 GLU 534 PHE 535 TYR 536 GLU 537 SER 538 PHE 539 SER 540 SER 541 VAL 542 PHE 543 ASP 544 ARG 545 ASN 546 ASP 547 ARG 548 ILE 549 VAL 550 VAL 551 ASP 552 PHE 553 PRO 554 THR 555 ASN 556 GLN 557 LYS 558 CYS 559 SER 560 CYS 561 GLY 562 LYS 563 GLU 564 MET 565 ARG 566 LEU 567 SER 568 PHE 569 GLY 570 LYS 571 TYR 572 GLY 573 PHE 574 TYR 575 LEU 576 LYS 577 CYS 578 GLU 579 CYS 580 GLY 581 LYS 582 THR 583 ARG 584 SER 585 VAL 586 LYS 587 ASN 588 ASP 589 GLU 590 ILE 591 ALA 592 VAL 593 ILE 594 ASP 595 ASP 596 GLY 597 LYS 598 ILE 599 PHE 600 LEU 601