2DOU - Sequence, Chains, Asymmetric and Biological Units

• Title: PROBABLE N-SUCCINYLDIAMINOPIMELATE AMINOTRANSFERASE (TTHA034 THERMUS THERMOPHILUS HB8
• Keywords: PLP-DEPENDENT ENZYME, STRUCTURAL GENOMICS, NPPSFA, NATIONAL ON PROTEIN STRUCTURAL AND FUNCTIONAL ANALYSES, RIKEN STRUCT GENOMICS/PROTEOMICS INITIATIVE, RSGI, TRANSFERASE
• Experiment: X-ray diffraction
• Number of Models: 1

Database	ID code	Status	Coordinate files
			Header	Asymmetric unit	Biological unit
PDB	2DOU	released	available	available	Quaternary Structure Server

Asymmetric unit from PDB

Unit	Type	Name	Chain ID	Residues	Atoms	Hetatoms
1	Protein		A	372	2829	0
2	Protein		B	368	2753	0
3	Ligand		A	3	0	25
4	Ligand		B	2	0	10
5	Water			204	0	204
total				949	5582	239

Proteins

Unit 1

VAL 4 PRO 5 GLU 6 PRO 7 SER 8 VAL 9 PHE 10 LEU 11 VAL 12 VAL 13 ASP 14 GLU 15 ALA 16 LYS 17 ARG 18 LYS 19 ALA 20 ARG 21 GLU 22 ARG 23 GLY 24 VAL 25 GLY 26 LEU 27 ILE 28 ASP 29 LEU 30 SER 31 ILE 32 GLY 33 SER 34 THR 35 ASP 36 LEU 37 PRO 38 PRO 39 PRO 40 GLU 41 ALA 42 PRO 43 LEU 44 LYS 45 ALA 46 LEU 47 ALA 48 GLU 49 ALA 50 LEU 51 ASN 52 ASP 53 PRO 54 THR 55 THR 56 TYR 57 GLY 58 TYR 59 CYS 60 LEU 61 LYS 62 SER 63 CYS 64 THR 65 LEU 66 PRO 67 PHE 68 LEU 69 GLU 70 GLU 71 ALA 72 ALA 73 ARG 74 TRP 75 TYR 76 GLU 77 GLY 78 ARG 79 TYR 80 GLY 81 VAL 82 GLY 83 LEU 84 ASP 85 PRO 86 ARG 87 ARG 88 GLU 89 ALA 90 LEU 91 ALA 92 LEU 93 ILE 94 GLY 95 SER 96 GLN 97 GLU 98 GLY 99 LEU 100 ALA 101 HIS 102 LEU 103 LEU 104 LEU 105 ALA 106 LEU 107 THR 108 GLU 109 PRO 110 GLU 111 ASP 112 LEU 113 LEU 114 LEU 115 LEU 116 PRO 117 GLU 118 VAL 119 ALA 120 TYR 121 PRO 122 SER 123 TYR 124 PHE 125 GLY 126 ALA 127 ALA 128 ARG 129 VAL 130 ALA 131 SER 132 LEU 133 ARG 134 THR 135 PHE 136 LEU 137 ILE 138 PRO 139 LEU 140 ARG 141 GLU 142 ASP 143 GLY 144 LEU 145 ALA 146 ASP 147 LEU 148 LYS 149 ALA 150 VAL 151 PRO 152 GLU 153 GLY 154 VAL 155 TRP 156 ARG 157 GLU 158 ALA 159 LYS 160 VAL 161 LEU 162 LEU 163 LEU 164 ASN 165 TYR 166 PRO 167 ASN 168 ASN 169 PRO 170 THR 171 GLY 172 ALA 173 VAL 174 ALA 175 ASP 176 TRP 177 GLY 178 TYR 179 PHE 180 GLU 181 GLU 182 ALA 183 LEU 184 GLY 185 LEU 186 ALA 187 ARG 188 LYS 189 HIS 190 GLY 191 LEU 192 TRP 193 LEU 194 ILE 195 HIS 196 ASP 197 ASN 198 PRO 199 TYR 200 VAL 201 ASP 202 GLN 203 VAL 204 TYR 205 GLU 206 GLY 207 GLU 208 ALA 209 PRO 210 SER 211 PRO 212 LEU 213 ALA 214 LEU 215 PRO 216 GLY 217 ALA 218 LYS 219 GLU 220 ARG 221 VAL 222 VAL 223 GLU 224 LEU 225 PHE 226 SER 227 LEU 228 SER 229 LYS 230 SER 231 TYR 232 ASN 233 LEU 234 ALA 235 GLY 236 PHE 237 ARG 238 LEU 239 GLY 240 PHE 241 ALA 242 LEU 243 GLY 244 SER 245 GLU 246 GLU 247 ALA 248 LEU 249 ALA 250 ARG 251 LEU 252 GLU 253 ARG 254 VAL 255 LYS 256 GLY 257 VAL 258 ILE 259 ASP 260 PHE 261 ASN 262 GLN 263 TYR 264 ALA 265 GLY 266 VAL 267 LEU 268 ARG 269 MET 270 GLY 271 VAL 272 GLU 273 ALA 274 LEU 275 LYS 276 THR 277 PRO 278 LYS 279 GLU 280 VAL 281 VAL 282 ARG 283 GLY 284 TYR 285 ALA 286 ARG 287 VAL 288 TYR 289 ARG 290 GLU 291 ARG 292 ALA 293 LEU 294 GLY 295 MET 296 ALA 297 GLU 298 ALA 299 LEU 300 LYS 301 GLY 302 VAL 303 LEU 304 SER 305 LEU 306 LEU 307 PRO 308 PRO 309 ARG 310 ALA 311 THR 312 MET 313 TYR 314 LEU 315 TRP 316 GLY 317 ARG 318 LEU 319 PRO 320 GLU 321 GLY 322 VAL 323 ASP 324 ASP 325 LEU 326 GLU 327 PHE 328 GLY 329 LEU 330 ARG 331 LEU 332 VAL 333 GLU 334 ARG 335 GLY 336 VAL 337 ALA 338 LEU 339 ALA 340 PRO 341 GLY 342 ARG 343 GLY 344 PHE 345 GLY 346 PRO 347 GLY 348 GLY 349 LYS 350 GLY 351 PHE 352 VAL 353 ARG 354 ILE 355 ALA 356 LEU 357 VAL 358 ARG 359 PRO 360 LEU 361 GLU 362 GLU 363 LEU 364 LEU 365 GLU 366 ALA 367 ALA 368 LYS 369 ARG 370 ILE 371 ARG 372 GLU 373 ALA 374 LEU 375

Unit 2

SER 8 VAL 9 PHE 10 LEU 11 VAL 12 VAL 13 ASP 14 GLU 15 ALA 16 LYS 17 ARG 18 LYS 19 ALA 20 ARG 21 GLU 22 ARG 23 GLY 24 VAL 25 GLY 26 LEU 27 ILE 28 ASP 29 LEU 30 SER 31 ILE 32 GLY 33 SER 34 THR 35 ASP 36 LEU 37 PRO 38 PRO 39 PRO 40 GLU 41 ALA 42 PRO 43 LEU 44 LYS 45 ALA 46 LEU 47 ALA 48 GLU 49 ALA 50 LEU 51 ASN 52 ASP 53 PRO 54 THR 55 THR 56 TYR 57 GLY 58 TYR 59 CYS 60 LEU 61 LYS 62 SER 63 CYS 64 THR 65 LEU 66 PRO 67 PHE 68 LEU 69 GLU 70 GLU 71 ALA 72 ALA 73 ARG 74 TRP 75 TYR 76 GLU 77 GLY 78 ARG 79 TYR 80 GLY 81 VAL 82 GLY 83 LEU 84 ASP 85 PRO 86 ARG 87 ARG 88 GLU 89 ALA 90 LEU 91 ALA 92 LEU 93 ILE 94 GLY 95 SER 96 GLN 97 GLU 98 GLY 99 LEU 100 ALA 101 HIS 102 LEU 103 LEU 104 LEU 105 ALA 106 LEU 107 THR 108 GLU 109 PRO 110 GLU 111 ASP 112 LEU 113 LEU 114 LEU 115 LEU 116 PRO 117 GLU 118 VAL 119 ALA 120 TYR 121 PRO 122 SER 123 TYR 124 PHE 125 GLY 126 ALA 127 ALA 128 ARG 129 VAL 130 ALA 131 SER 132 LEU 133 ARG 134 THR 135 PHE 136 LEU 137 ILE 138 PRO 139 LEU 140 ARG 141 GLU 142 ASP 143 GLY 144 LEU 145 ALA 146 ASP 147 LEU 148 LYS 149 ALA 150 VAL 151 PRO 152 GLU 153 GLY 154 VAL 155 TRP 156 ARG 157 GLU 158 ALA 159 LYS 160 VAL 161 LEU 162 LEU 163 LEU 164 ASN 165 TYR 166 PRO 167 ASN 168 ASN 169 PRO 170 THR 171 GLY 172 ALA 173 VAL 174 ALA 175 ASP 176 TRP 177 GLY 178 TYR 179 PHE 180 GLU 181 GLU 182 ALA 183 LEU 184 GLY 185 LEU 186 ALA 187 ARG 188 LYS 189 HIS 190 GLY 191 LEU 192 TRP 193 LEU 194 ILE 195 HIS 196 ASP 197 ASN 198 PRO 199 TYR 200 VAL 201 ASP 202 GLN 203 VAL 204 TYR 205 GLU 206 GLY 207 GLU 208 ALA 209 PRO 210 SER 211 PRO 212 LEU 213 ALA 214 LEU 215 PRO 216 GLY 217 ALA 218 LYS 219 GLU 220 ARG 221 VAL 222 VAL 223 GLU 224 LEU 225 PHE 226 SER 227 LEU 228 SER 229 LYS 230 SER 231 TYR 232 ASN 233 LEU 234 ALA 235 GLY 236 PHE 237 ARG 238 LEU 239 GLY 240 PHE 241 ALA 242 LEU 243 GLY 244 SER 245 GLU 246 GLU 247 ALA 248 LEU 249 ALA 250 ARG 251 LEU 252 GLU 253 ARG 254 VAL 255 LYS 256 GLY 257 VAL 258 ILE 259 ASP 260 PHE 261 ASN 262 GLN 263 TYR 264 ALA 265 GLY 266 VAL 267 LEU 268 ARG 269 MET 270 GLY 271 VAL 272 GLU 273 ALA 274 LEU 275 LYS 276 THR 277 PRO 278 LYS 279 GLU 280 VAL 281 VAL 282 ARG 283 GLY 284 TYR 285 ALA 286 ARG 287 VAL 288 TYR 289 ARG 290 GLU 291 ARG 292 ALA 293 LEU 294 GLY 295 MET 296 ALA 297 GLU 298 ALA 299 LEU 300 LYS 301 GLY 302 VAL 303 LEU 304 SER 305 LEU 306 LEU 307 PRO 308 PRO 309 ARG 310 ALA 311 THR 312 MET 313 TYR 314 LEU 315 TRP 316 GLY 317 ARG 318 LEU 319 PRO 320 GLU 321 GLY 322 VAL 323 ASP 324 ASP 325 LEU 326 GLU 327 PHE 328 GLY 329 LEU 330 ARG 331 LEU 332 VAL 333 GLU 334 ARG 335 GLY 336 VAL 337 ALA 338 LEU 339 ALA 340 PRO 341 GLY 342 ARG 343 GLY 344 PHE 345 GLY 346 PRO 347 GLY 348 GLY 349 LYS 350 GLY 351 PHE 352 VAL 353 ARG 354 ILE 355 ALA 356 LEU 357 VAL 358 ARG 359 PRO 360 LEU 361 GLU 362 GLU 363 LEU 364 LEU 365 GLU 366 ALA 367 ALA 368 LYS 369 ARG 370 ILE 371 ARG 372 GLU 373 ALA 374 LEU 375

Ligands

Unit 3	EPE 501 SO4 502 SO4 503
Unit 4	SO4 504 SO4 505