1ZEM - Sequence, Chains, Asymmetric and Biological Units

• Title: CRYSTAL STRUCTURE OF NAD+-BOUND XYLITOL DEHYDROGENASE
• Keywords: ROSSMANN FOLD, DINUCLEOTIDE-BINDING DOMAIN, OXIDOREDUCTASE
• Experiment: X-ray diffraction
• Number of Models: 1

Database	ID code	Status	Coordinate files
			Header	Asymmetric unit	Biological unit
PDB	1ZEM	released	available	available	Quaternary Structure Server

Asymmetric unit from PDB

Unit	Type	Name	Chain ID	Residues	Atoms	Hetatoms
1	Protein	XYLITOL DEHYDROGENASE	A	260	1939	0
2	Protein	XYLITOL DEHYDROGENASE	B	260	1939	0
3	Protein	XYLITOL DEHYDROGENASE	C	260	1939	0
4	Protein	XYLITOL DEHYDROGENASE	D	260	1939	0
5	Protein	XYLITOL DEHYDROGENASE	E	260	1939	0
6	Protein	XYLITOL DEHYDROGENASE	F	260	1939	0
7	Protein	XYLITOL DEHYDROGENASE	G	260	1939	0
8	Protein	XYLITOL DEHYDROGENASE	H	260	1939	0
9	Ligand	XYLITOL DEHYDROGENASE	A	1	0	44
10	Ligand	XYLITOL DEHYDROGENASE	B	1	0	44
11	Ligand	XYLITOL DEHYDROGENASE	C	3	0	46
12	Ligand	XYLITOL DEHYDROGENASE	D	2	0	45
13	Ligand	XYLITOL DEHYDROGENASE	E	2	0	45
14	Ligand	XYLITOL DEHYDROGENASE	F	2	0	45
15	Ligand	XYLITOL DEHYDROGENASE	G	1	0	44
16	Ligand	XYLITOL DEHYDROGENASE	H	1	0	44
17	Water			1648	0	1648
total				3741	15512	2005

Proteins

Unit 1	LYS 3 LYS 4 PHE 5 ASN 6 GLY 7 LYS 8 VAL 9 CYS 10 LEU 11 VAL 12 THR 13 GLY 14 ALA 15 GLY 16 GLY 17 ASN 18 ILE 19 GLY 20 LEU 21 ALA 22 THR 23 ALA 24 LEU 25 ARG 26 LEU 27 ALA 28 GLU 29 GLU 30 GLY 31 THR 32 ALA 33 ILE 34 ALA 35 LEU 36 LEU 37 ASP 38 MET 39 ASN 40 ARG 41 GLU 42 ALA 43 LEU 44 GLU 45 LYS 46 ALA 47 GLU 48 ALA 49 SER 50 VAL 51 ARG 52 GLU 53 LYS 54 GLY 55 VAL 56 GLU 57 ALA 58 ARG 59 SER 60 TYR 61 VAL 62 CYS 63 ASP 64 VAL 65 THR 66 SER 67 GLU 68 GLU 69 ALA 70 VAL 71 ILE 72 GLY 73 THR 74 VAL 75 ASP 76 SER 77 VAL 78 VAL 79 ARG 80 ASP 81 PHE 82 GLY 83 LYS 84 ILE 85 ASP 86 PHE 87 LEU 88 PHE 89 ASN 90 ASN 91 ALA 92 GLY 93 TYR 94 GLN 95 GLY 96 ALA 97 PHE 98 ALA 99 PRO 100 VAL 101 GLN 102 ASP 103 TYR 104 PRO 105 SER 106 ASP 107 ASP 108 PHE 109 ALA 110 ARG 111 VAL 112 LEU 113 THR 114 ILE 115 ASN 116 VAL 117 THR 118 GLY 119 ALA 120 PHE 121 HIS 122 VAL 123 LEU 124 LYS 125 ALA 126 VAL 127 SER 128 ARG 129 GLN 130 MET 131 ILE 132 THR 133 GLN 134 ASN 135 TYR 136 GLY 137 ARG 138 ILE 139 VAL 140 ASN 141 THR 142 ALA 143 SER 144 MET 145 ALA 146 GLY 147 VAL 148 LYS 149 GLY 150 PRO 151 PRO 152 ASN 153 MET 154 ALA 155 ALA 156 TYR 157 GLY 158 THR 159 SER 160 LYS 161 GLY 162 ALA 163 ILE 164 ILE 165 ALA 166 LEU 167 THR 168 GLU 169 THR 170 ALA 171 ALA 172 LEU 173 ASP 174 LEU 175 ALA 176 PRO 177 TYR 178 ASN 179 ILE 180 ARG 181 VAL 182 ASN 183 ALA 184 ILE 185 SER 186 PRO 187 GLY 188 TYR 189 MET 190 GLY 191 PRO 192 GLY 193 PHE 194 MET 195 TRP 196 GLU 197 ARG 198 GLN 199 VAL 200 GLU 201 LEU 202 GLN 203 ALA 204 LYS 205 VAL 206 GLY 207 SER 208 GLN 209 TYR 210 PHE 211 SER 212 THR 213 ASP 214 PRO 215 LYS 216 VAL 217 VAL 218 ALA 219 GLN 220 GLN 221 MET 222 ILE 223 GLY 224 SER 225 VAL 226 PRO 227 MET 228 ARG 229 ARG 230 TYR 231 GLY 232 ASP 233 ILE 234 ASN 235 GLU 236 ILE 237 PRO 238 GLY 239 VAL 240 VAL 241 ALA 242 PHE 243 LEU 244 LEU 245 GLY 246 ASP 247 ASP 248 SER 249 SER 250 PHE 251 MET 252 THR 253 GLY 254 VAL 255 ASN 256 LEU 257 PRO 258 ILE 259 ALA 260 GLY 261 GLY 262
Unit 2	LYS 3 LYS 4 PHE 5 ASN 6 GLY 7 LYS 8 VAL 9 CYS 10 LEU 11 VAL 12 THR 13 GLY 14 ALA 15 GLY 16 GLY 17 ASN 18 ILE 19 GLY 20 LEU 21 ALA 22 THR 23 ALA 24 LEU 25 ARG 26 LEU 27 ALA 28 GLU 29 GLU 30 GLY 31 THR 32 ALA 33 ILE 34 ALA 35 LEU 36 LEU 37 ASP 38 MET 39 ASN 40 ARG 41 GLU 42 ALA 43 LEU 44 GLU 45 LYS 46 ALA 47 GLU 48 ALA 49 SER 50 VAL 51 ARG 52 GLU 53 LYS 54 GLY 55 VAL 56 GLU 57 ALA 58 ARG 59 SER 60 TYR 61 VAL 62 CYS 63 ASP 64 VAL 65 THR 66 SER 67 GLU 68 GLU 69 ALA 70 VAL 71 ILE 72 GLY 73 THR 74 VAL 75 ASP 76 SER 77 VAL 78 VAL 79 ARG 80 ASP 81 PHE 82 GLY 83 LYS 84 ILE 85 ASP 86 PHE 87 LEU 88 PHE 89 ASN 90 ASN 91 ALA 92 GLY 93 TYR 94 GLN 95 GLY 96 ALA 97 PHE 98 ALA 99 PRO 100 VAL 101 GLN 102 ASP 103 TYR 104 PRO 105 SER 106 ASP 107 ASP 108 PHE 109 ALA 110 ARG 111 VAL 112 LEU 113 THR 114 ILE 115 ASN 116 VAL 117 THR 118 GLY 119 ALA 120 PHE 121 HIS 122 VAL 123 LEU 124 LYS 125 ALA 126 VAL 127 SER 128 ARG 129 GLN 130 MET 131 ILE 132 THR 133 GLN 134 ASN 135 TYR 136 GLY 137 ARG 138 ILE 139 VAL 140 ASN 141 THR 142 ALA 143 SER 144 MET 145 ALA 146 GLY 147 VAL 148 LYS 149 GLY 150 PRO 151 PRO 152 ASN 153 MET 154 ALA 155 ALA 156 TYR 157 GLY 158 THR 159 SER 160 LYS 161 GLY 162 ALA 163 ILE 164 ILE 165 ALA 166 LEU 167 THR 168 GLU 169 THR 170 ALA 171 ALA 172 LEU 173 ASP 174 LEU 175 ALA 176 PRO 177 TYR 178 ASN 179 ILE 180 ARG 181 VAL 182 ASN 183 ALA 184 ILE 185 SER 186 PRO 187 GLY 188 TYR 189 MET 190 GLY 191 PRO 192 GLY 193 PHE 194 MET 195 TRP 196 GLU 197 ARG 198 GLN 199 VAL 200 GLU 201 LEU 202 GLN 203 ALA 204 LYS 205 VAL 206 GLY 207 SER 208 GLN 209 TYR 210 PHE 211 SER 212 THR 213 ASP 214 PRO 215 LYS 216 VAL 217 VAL 218 ALA 219 GLN 220 GLN 221 MET 222 ILE 223 GLY 224 SER 225 VAL 226 PRO 227 MET 228 ARG 229 ARG 230 TYR 231 GLY 232 ASP 233 ILE 234 ASN 235 GLU 236 ILE 237 PRO 238 GLY 239 VAL 240 VAL 241 ALA 242 PHE 243 LEU 244 LEU 245 GLY 246 ASP 247 ASP 248 SER 249 SER 250 PHE 251 MET 252 THR 253 GLY 254 VAL 255 ASN 256 LEU 257 PRO 258 ILE 259 ALA 260 GLY 261 GLY 262
Unit 3	LYS 3 LYS 4 PHE 5 ASN 6 GLY 7 LYS 8 VAL 9 CYS 10 LEU 11 VAL 12 THR 13 GLY 14 ALA 15 GLY 16 GLY 17 ASN 18 ILE 19 GLY 20 LEU 21 ALA 22 THR 23 ALA 24 LEU 25 ARG 26 LEU 27 ALA 28 GLU 29 GLU 30 GLY 31 THR 32 ALA 33 ILE 34 ALA 35 LEU 36 LEU 37 ASP 38 MET 39 ASN 40 ARG 41 GLU 42 ALA 43 LEU 44 GLU 45 LYS 46 ALA 47 GLU 48 ALA 49 SER 50 VAL 51 ARG 52 GLU 53 LYS 54 GLY 55 VAL 56 GLU 57 ALA 58 ARG 59 SER 60 TYR 61 VAL 62 CYS 63 ASP 64 VAL 65 THR 66 SER 67 GLU 68 GLU 69 ALA 70 VAL 71 ILE 72 GLY 73 THR 74 VAL 75 ASP 76 SER 77 VAL 78 VAL 79 ARG 80 ASP 81 PHE 82 GLY 83 LYS 84 ILE 85 ASP 86 PHE 87 LEU 88 PHE 89 ASN 90 ASN 91 ALA 92 GLY 93 TYR 94 GLN 95 GLY 96 ALA 97 PHE 98 ALA 99 PRO 100 VAL 101 GLN 102 ASP 103 TYR 104 PRO 105 SER 106 ASP 107 ASP 108 PHE 109 ALA 110 ARG 111 VAL 112 LEU 113 THR 114 ILE 115 ASN 116 VAL 117 THR 118 GLY 119 ALA 120 PHE 121 HIS 122 VAL 123 LEU 124 LYS 125 ALA 126 VAL 127 SER 128 ARG 129 GLN 130 MET 131 ILE 132 THR 133 GLN 134 ASN 135 TYR 136 GLY 137 ARG 138 ILE 139 VAL 140 ASN 141 THR 142 ALA 143 SER 144 MET 145 ALA 146 GLY 147 VAL 148 LYS 149 GLY 150 PRO 151 PRO 152 ASN 153 MET 154 ALA 155 ALA 156 TYR 157 GLY 158 THR 159 SER 160 LYS 161 GLY 162 ALA 163 ILE 164 ILE 165 ALA 166 LEU 167 THR 168 GLU 169 THR 170 ALA 171 ALA 172 LEU 173 ASP 174 LEU 175 ALA 176 PRO 177 TYR 178 ASN 179 ILE 180 ARG 181 VAL 182 ASN 183 ALA 184 ILE 185 SER 186 PRO 187 GLY 188 TYR 189 MET 190 GLY 191 PRO 192 GLY 193 PHE 194 MET 195 TRP 196 GLU 197 ARG 198 GLN 199 VAL 200 GLU 201 LEU 202 GLN 203 ALA 204 LYS 205 VAL 206 GLY 207 SER 208 GLN 209 TYR 210 PHE 211 SER 212 THR 213 ASP 214 PRO 215 LYS 216 VAL 217 VAL 218 ALA 219 GLN 220 GLN 221 MET 222 ILE 223 GLY 224 SER 225 VAL 226 PRO 227 MET 228 ARG 229 ARG 230 TYR 231 GLY 232 ASP 233 ILE 234 ASN 235 GLU 236 ILE 237 PRO 238 GLY 239 VAL 240 VAL 241 ALA 242 PHE 243 LEU 244 LEU 245 GLY 246 ASP 247 ASP 248 SER 249 SER 250 PHE 251 MET 252 THR 253 GLY 254 VAL 255 ASN 256 LEU 257 PRO 258 ILE 259 ALA 260 GLY 261 GLY 262
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Ligands

Unit 9	NAD 2263
Unit 10	NAD 3263
Unit 11	MG 3265 MG 3268 NAD 4263
Unit 12	MG 3264 NAD 5263
Unit 13	MG 3266 NAD 6263
Unit 14	MG 3267 NAD 7263
Unit 15	NAD 8263
Unit 16	NAD 9263