1YBE - Sequence, Chains, Asymmetric and Biological Units

• Title: CRYSTAL STRUCTURE OF A NICOTINATE PHOSPHORIBOSYLTRANSFERASE
• Keywords: STRUCTURAL GENOMICS, PROTEIN STRUCTURE INITIATIVE, NYSGXRC, PSI, NEW YORK SGX RESEARCH CENTER FOR STRUCTURAL GENOMICS, TRANSFERASE
• Experiment: X-ray diffraction
• Number of Models: 1

Database	ID code	Status	Coordinate files
			Header	Asymmetric unit	Biological unit
PDB	1YBE	released	available	available	Quaternary Structure Server

Asymmetric unit from PDB

Unit	Type	Name	Chain ID	Residues	Atoms	Hetatoms
1	Protein	NICOTINATE PHOSPHORIBOSYLTRANSFERASE	A	416	3293	0
2	Protein	NICOTINATE PHOSPHORIBOSYLTRANSFERASE	B	416	3293	0
3	Water			324	0	324
total				1156	6586	324

Proteins

Unit 1

MET 8 THR 9 LYS 10 THR 11 ASP 12 ILE 13 ALA 14 THR 15 ARG 16 TRP 22 LYS 23 LEU 24 ASP 25 PRO 26 ILE 27 VAL 28 ARG 29 SER 30 LEU 31 ILE 32 ASP 33 THR 34 ASP 35 PHE 36 TYR 37 LYS 38 LEU 39 LEU 40 MET 41 LEU 42 GLN 43 MET 44 ILE 45 TRP 46 LYS 47 LEU 48 TYR 49 PRO 50 GLU 51 VAL 52 ASP 53 ALA 54 THR 55 PHE 56 SER 57 LEU 58 ILE 59 ASN 60 ARG 61 THR 62 LYS 63 THR 64 VAL 65 ARG 66 LEU 67 ALA 68 GLU 69 GLU 70 ILE 71 ASP 72 GLU 73 MET 74 GLU 75 LEU 76 ARG 77 GLU 78 GLN 79 LEU 80 ASP 81 HIS 82 ALA 83 ARG 84 THR 85 LEU 86 ARG 87 LEU 88 SER 89 LYS 90 LYS 91 GLU 92 ASN 93 ILE 94 TRP 95 LEU 96 ALA 97 GLY 98 ASN 99 THR 100 PHE 101 TYR 102 GLY 103 ARG 104 SER 105 GLN 106 ILE 107 PHE 108 GLU 109 PRO 110 GLU 111 PHE 112 LEU 113 SER 114 TRP 115 LEU 116 SER 117 SER 118 TYR 119 GLN 120 LEU 121 PRO 122 GLU 123 TYR 124 GLU 125 LEU 126 PHE 127 LYS 128 ARG 129 ASP 130 GLY 131 GLN 132 TYR 133 GLU 134 LEU 135 ASN 136 PHE 137 HIS 138 GLY 139 ARG 140 TRP 141 MET 142 ASP 143 THR 144 THR 145 LEU 146 TRP 147 GLU 148 ILE 149 PRO 150 ALA 151 LEU 152 SER 153 ILE 154 ILE 155 ASN 156 GLU 157 LEU 158 ARG 159 SER 160 ARG 161 SER 162 ALA 163 MET 164 ARG 165 SER 166 LEU 167 GLY 168 TYR 169 PHE 170 THR 171 LEU 172 ASP 173 VAL 174 LEU 175 TYR 176 ALA 177 ARG 178 ALA 179 LYS 180 ALA 181 LYS 182 MET 183 TRP 184 GLU 185 LYS 186 VAL 187 GLU 188 ARG 189 LEU 190 ARG 191 GLU 192 LEU 193 PRO 194 GLY 195 LEU 196 ARG 197 ILE 198 SER 199 ASP 200 PHE 201 GLY 202 THR 203 ARG 204 ARG 205 ARG 206 HIS 207 SER 208 PHE 209 LEU 210 TRP 211 GLN 212 ARG 213 TRP 214 CYS 215 VAL 216 GLU 217 ALA 218 LEU 219 LYS 220 GLU 221 GLY 222 ILE 223 GLY 224 PRO 225 ALA 226 PHE 227 THR 228 GLY 229 THR 230 SER 231 ASN 232 VAL 233 LEU 234 LEU 235 ALA 236 MET 237 ASP 238 SER 239 ASP 240 LEU 241 GLU 242 ALA 243 VAL 244 GLY 245 THR 246 ASN 247 ALA 248 HIS 249 GLU 250 LEU 251 PRO 252 MET 253 VAL 254 VAL 255 ALA 256 ALA 257 LEU 258 ALA 259 GLN 260 THR 261 ASN 262 GLU 263 GLU 264 LEU 265 ALA 266 ALA 267 ALA 268 PRO 269 TYR 270 GLN 271 VAL 272 LEU 273 LYS 274 ASP 275 TRP 276 ASN 277 ARG 278 LEU 279 TYR 280 GLY 281 GLY 282 ASN 283 LEU 284 LEU 285 ILE 286 VAL 287 LEU 288 PRO 289 ASP 290 ALA 291 PHE 292 GLY 293 THR 294 ALA 295 ALA 296 PHE 297 LEU 298 ARG 299 ASN 300 ALA 301 PRO 302 GLU 303 TRP 304 VAL 305 ALA 306 ASP 307 TRP 308 THR 309 GLY 310 PHE 311 ARG 312 PRO 313 ASP 314 SER 315 ALA 316 PRO 317 PRO 318 ILE 319 GLU 320 GLY 321 GLY 322 GLU 323 LYS 324 ILE 325 ILE 326 GLU 327 TRP 328 TRP 329 ARG 330 LYS 331 MET 332 GLY 333 ARG 334 ASP 335 PRO 336 ARG 337 THR 338 LYS 339 MET 340 LEU 341 ILE 342 PHE 343 SER 344 ASP 345 GLY 346 LEU 347 ASP 348 VAL 349 ASP 350 ALA 351 ILE 352 VAL 353 ASP 354 THR 355 TYR 356 ARG 357 HIS 358 PHE 359 GLU 360 GLY 361 ARG 362 VAL 363 ARG 364 MET 365 SER 366 PHE 367 GLY 368 TRP 369 GLY 370 THR 371 ASN 372 LEU 373 THR 374 ASN 375 ASP 376 PHE 377 ALA 378 GLY 379 CYS 380 ALA 381 PRO 382 LEU 388 LYS 389 PRO 390 ILE 391 SER 392 ILE 393 VAL 394 CYS 395 LYS 396 VAL 397 SER 398 ASP 399 ALA 400 ASN 401 GLY 402 ARG 403 PRO 404 ALA 405 VAL 406 LYS 407 LEU 408 SER 409 ASP 410 ASN 411 PRO 412 GLN 413 LYS 414 ALA 415 THR 416 GLY 417 ASP 418 PRO 419 ALA 420 GLU 421 VAL 422 GLU 423 ARG 424 TYR 425 LEU 426 LYS 427 PHE 428 PHE 429 GLY 430 GLU 431 GLU 432 ASP 433

Unit 2

MET 8 THR 9 LYS 10 THR 11 ASP 12 ILE 13 ALA 14 THR 15 ARG 16 TRP 22 LYS 23 LEU 24 ASP 25 PRO 26 ILE 27 VAL 28 ARG 29 SER 30 LEU 31 ILE 32 ASP 33 THR 34 ASP 35 PHE 36 TYR 37 LYS 38 LEU 39 LEU 40 MET 41 LEU 42 GLN 43 MET 44 ILE 45 TRP 46 LYS 47 LEU 48 TYR 49 PRO 50 GLU 51 VAL 52 ASP 53 ALA 54 THR 55 PHE 56 SER 57 LEU 58 ILE 59 ASN 60 ARG 61 THR 62 LYS 63 THR 64 VAL 65 ARG 66 LEU 67 ALA 68 GLU 69 GLU 70 ILE 71 ASP 72 GLU 73 MET 74 GLU 75 LEU 76 ARG 77 GLU 78 GLN 79 LEU 80 ASP 81 HIS 82 ALA 83 ARG 84 THR 85 LEU 86 ARG 87 LEU 88 SER 89 LYS 90 LYS 91 GLU 92 ASN 93 ILE 94 TRP 95 LEU 96 ALA 97 GLY 98 ASN 99 THR 100 PHE 101 TYR 102 GLY 103 ARG 104 SER 105 GLN 106 ILE 107 PHE 108 GLU 109 PRO 110 GLU 111 PHE 112 LEU 113 SER 114 TRP 115 LEU 116 SER 117 SER 118 TYR 119 GLN 120 LEU 121 PRO 122 GLU 123 TYR 124 GLU 125 LEU 126 PHE 127 LYS 128 ARG 129 ASP 130 GLY 131 GLN 132 TYR 133 GLU 134 LEU 135 ASN 136 PHE 137 HIS 138 GLY 139 ARG 140 TRP 141 MET 142 ASP 143 THR 144 THR 145 LEU 146 TRP 147 GLU 148 ILE 149 PRO 150 ALA 151 LEU 152 SER 153 ILE 154 ILE 155 ASN 156 GLU 157 LEU 158 ARG 159 SER 160 ARG 161 SER 162 ALA 163 MET 164 ARG 165 SER 166 LEU 167 GLY 168 TYR 169 PHE 170 THR 171 LEU 172 ASP 173 VAL 174 LEU 175 TYR 176 ALA 177 ARG 178 ALA 179 LYS 180 ALA 181 LYS 182 MET 183 TRP 184 GLU 185 LYS 186 VAL 187 GLU 188 ARG 189 LEU 190 ARG 191 GLU 192 LEU 193 PRO 194 GLY 195 LEU 196 ARG 197 ILE 198 SER 199 ASP 200 PHE 201 GLY 202 THR 203 ARG 204 ARG 205 ARG 206 HIS 207 SER 208 PHE 209 LEU 210 TRP 211 GLN 212 ARG 213 TRP 214 CYS 215 VAL 216 GLU 217 ALA 218 LEU 219 LYS 220 GLU 221 GLY 222 ILE 223 GLY 224 PRO 225 ALA 226 PHE 227 THR 228 GLY 229 THR 230 SER 231 ASN 232 VAL 233 LEU 234 LEU 235 ALA 236 MET 237 ASP 238 SER 239 ASP 240 LEU 241 GLU 242 ALA 243 VAL 244 GLY 245 THR 246 ASN 247 ALA 248 HIS 249 GLU 250 LEU 251 PRO 252 MET 253 VAL 254 VAL 255 ALA 256 ALA 257 LEU 258 ALA 259 GLN 260 THR 261 ASN 262 GLU 263 GLU 264 LEU 265 ALA 266 ALA 267 ALA 268 PRO 269 TYR 270 GLN 271 VAL 272 LEU 273 LYS 274 ASP 275 TRP 276 ASN 277 ARG 278 LEU 279 TYR 280 GLY 281 GLY 282 ASN 283 LEU 284 LEU 285 ILE 286 VAL 287 LEU 288 PRO 289 ASP 290 ALA 291 PHE 292 GLY 293 THR 294 ALA 295 ALA 296 PHE 297 LEU 298 ARG 299 ASN 300 ALA 301 PRO 302 GLU 303 TRP 304 VAL 305 ALA 306 ASP 307 TRP 308 THR 309 GLY 310 PHE 311 ARG 312 PRO 313 ASP 314 SER 315 ALA 316 PRO 317 PRO 318 ILE 319 GLU 320 GLY 321 GLY 322 GLU 323 LYS 324 ILE 325 ILE 326 GLU 327 TRP 328 TRP 329 ARG 330 LYS 331 MET 332 GLY 333 ARG 334 ASP 335 PRO 336 ARG 337 THR 338 LYS 339 MET 340 LEU 341 ILE 342 PHE 343 SER 344 ASP 345 GLY 346 LEU 347 ASP 348 VAL 349 ASP 350 ALA 351 ILE 352 VAL 353 ASP 354 THR 355 TYR 356 ARG 357 HIS 358 PHE 359 GLU 360 GLY 361 ARG 362 VAL 363 ARG 364 MET 365 SER 366 PHE 367 GLY 368 TRP 369 GLY 370 THR 371 ASN 372 LEU 373 THR 374 ASN 375 ASP 376 PHE 377 ALA 378 GLY 379 CYS 380 ALA 381 PRO 382 LEU 388 LYS 389 PRO 390 ILE 391 SER 392 ILE 393 VAL 394 CYS 395 LYS 396 VAL 397 SER 398 ASP 399 ALA 400 ASN 401 GLY 402 ARG 403 PRO 404 ALA 405 VAL 406 LYS 407 LEU 408 SER 409 ASP 410 ASN 411 PRO 412 GLN 413 LYS 414 ALA 415 THR 416 GLY 417 ASP 418 PRO 419 ALA 420 GLU 421 VAL 422 GLU 423 ARG 424 TYR 425 LEU 426 LYS 427 PHE 428 PHE 429 GLY 430 GLU 431 GLU 432 ASP 433