1WYD - Sequence, Chains, Asymmetric and Biological Units

• Title: CRYSTAL STRUCTURE OF ASPARTYL-TRNA SYNTHETASE FROM SULFOLOBU
• Keywords: ASPARTYL-TRNA SYNTHETASE, ARCHAEA, SULFOLOBUS TOKODAII, LIGA
• Experiment: X-ray diffraction
• Number of Models: 1

Database	ID code	Status	Coordinate files
			Header	Asymmetric unit	Biological unit
PDB	1WYD	released	available	available	Quaternary Structure Server

Asymmetric unit from PDB

Unit	Type	Name	Chain ID	Residues	Atoms	Hetatoms
1	Protein	HYPOTHETICAL ASPARTYL-TRNA SYNTHETASE	A	428	3386	0
2	Protein	HYPOTHETICAL ASPARTYL-TRNA SYNTHETASE	B	429	3395	0
3	Ligand	HYPOTHETICAL ASPARTYL-TRNA SYNTHETASE	A	3	0	18
4	Ligand	HYPOTHETICAL ASPARTYL-TRNA SYNTHETASE	B	3	0	18
5	Water			276	0	276
total				1139	6781	312

Proteins

Unit 1

MET 1 TYR 2 ARG 3 SER 4 HIS 5 PHE 6 ILE 7 ALA 8 ASP 9 VAL 10 THR 11 PRO 12 GLU 13 TYR 14 ASP 15 GLY 16 LYS 17 GLU 18 VAL 19 ILE 20 TRP 21 ALA 22 GLY 23 TRP 24 VAL 25 HIS 26 LEU 27 LEU 28 ARG 29 ASP 30 LEU 31 GLY 32 GLY 33 LYS 34 LYS 35 PHE 36 ILE 37 ILE 38 LEU 39 ARG 40 ASP 41 LYS 42 THR 43 GLY 44 LEU 45 GLY 46 GLN 47 VAL 48 VAL 49 VAL 50 ASP 51 LYS 52 ASN 53 SER 54 SER 55 ALA 56 PHE 57 GLY 58 ILE 59 SER 60 GLN 61 GLU 62 LEU 63 THR 64 GLN 65 GLU 66 SER 67 VAL 68 ILE 69 GLN 70 VAL 71 ARG 72 GLY 73 ILE 74 VAL 75 LYS 76 ALA 77 ASP 78 LYS 79 ARG 80 ALA 81 PRO 82 ARG 83 GLY 84 ILE 85 GLU 86 LEU 87 HIS 88 ALA 89 GLU 90 GLU 91 ILE 92 THR 93 LEU 94 LEU 95 SER 96 LYS 97 ALA 98 LYS 99 ALA 100 PRO 101 LEU 102 PRO 103 LEU 104 ASP 105 VAL 106 SER 107 GLY 108 LYS 109 VAL 110 LYS 111 ALA 112 ASP 113 ILE 114 ASP 115 THR 116 ARG 117 LEU 118 ARG 119 GLU 120 ARG 121 VAL 122 LEU 123 ASP 124 LEU 125 ARG 126 ARG 127 GLN 128 GLU 129 MET 130 GLN 131 ALA 132 VAL 133 ILE 134 LYS 135 ILE 136 GLN 137 SER 138 LEU 139 ALA 140 LEU 141 LYS 142 ALA 143 PHE 144 ARG 145 GLU 146 THR 147 LEU 148 TYR 149 LYS 150 GLU 151 GLY 152 PHE 153 ILE 154 GLU 155 ILE 156 PHE 157 THR 158 PRO 159 LYS 160 ILE 161 ILE 162 ALA 163 SER 164 ALA 165 THR 166 GLU 167 GLY 168 GLY 169 ALA 170 GLN 171 LEU 172 PHE 173 PRO 174 VAL 175 ILE 176 TYR 177 PHE 178 GLY 179 LYS 180 GLU 181 ALA 182 PHE 183 LEU 184 ALA 185 GLN 186 SER 187 PRO 188 GLN 189 LEU 190 TYR 191 LYS 192 GLU 193 LEU 194 MET 195 ALA 196 GLY 197 VAL 198 VAL 199 GLU 200 ARG 201 VAL 202 PHE 203 GLU 204 VAL 205 ALA 206 PRO 207 ALA 208 TRP 209 ARG 210 ALA 211 GLU 212 GLU 213 SER 214 ASP 215 THR 216 PRO 217 PHE 218 HIS 219 LEU 220 ALA 221 GLU 222 PHE 223 ILE 224 SER 225 MET 226 ASP 227 VAL 228 GLU 229 MET 230 ALA 231 PHE 232 ALA 233 ASP 234 TYR 235 ASN 236 ASP 237 VAL 238 MET 239 GLN 240 LEU 241 LEU 242 GLU 243 LYS 244 ILE 245 LEU 246 HIS 247 ASN 248 ILE 249 VAL 250 LYS 251 THR 252 ILE 253 LYS 254 GLU 255 GLU 256 GLY 257 LYS 258 GLU 259 GLU 260 LEU 261 LYS 262 ILE 263 LEU 264 ASN 265 TYR 266 GLU 267 PRO 268 PRO 269 GLU 270 VAL 271 LYS 272 ILE 273 PRO 274 ILE 275 LYS 276 ARG 277 LEU 278 LYS 279 TYR 280 THR 281 GLU 282 ALA 283 ILE 284 GLU 285 ILE 286 LEU 287 ARG 288 SER 289 LYS 290 GLY 291 TYR 292 ASN 293 ILE 294 LYS 295 PHE 296 GLY 297 ASP 298 ASP 299 ILE 300 GLY 301 THR 302 PRO 303 GLU 304 LEU 305 ARG 306 ILE 307 LEU 308 ASN 309 GLU 310 GLU 311 LEU 312 LYS 313 GLU 314 ASP 315 LEU 316 TYR 317 PHE 318 ILE 319 VAL 320 ASP 321 TRP 322 PRO 323 SER 324 ASP 325 ALA 326 ARG 327 PRO 328 PHE 329 TYR 330 THR 331 LYS 332 SER 333 LYS 334 SER 335 GLU 336 PRO 338 GLU 339 LEU 340 SER 341 GLU 342 SER 343 PHE 344 ASP 345 LEU 346 ILE 347 TYR 348 LYS 349 PHE 350 LEU 351 GLU 352 ILE 353 VAL 354 SER 355 GLY 356 SER 357 THR 358 ARG 359 ASN 360 HIS 361 LYS 362 ARG 363 GLU 364 VAL 365 LEU 366 GLU 367 GLU 368 ALA 369 LEU 370 LYS 371 LYS 372 LYS 373 GLY 374 LEU 375 LYS 376 PRO 377 GLU 378 SER 379 PHE 380 GLU 381 PHE 382 PHE 383 LEU 384 LYS 385 TRP 386 PHE 387 ASP 388 TYR 389 GLY 390 MET 391 PRO 392 PRO 393 HIS 394 ALA 395 GLY 396 PHE 397 GLY 398 MET 399 GLY 400 LEU 401 ALA 402 ARG 403 LEU 404 MET 405 VAL 406 MET 407 LEU 408 THR 409 GLY 410 ILE 411 GLN 412 SER 413 VAL 414 LYS 415 GLU 416 ILE 417 VAL 418 PRO 419 PHE 420 PRO 421 ARG 422 ASP 423 LYS 424 LYS 425 ARG 426 LEU 427 THR 428 PRO 429

Unit 2

MET 1 TYR 2 ARG 3 SER 4 HIS 5 PHE 6 ILE 7 ALA 8 ASP 9 VAL 10 THR 11 PRO 12 GLU 13 TYR 14 ASP 15 GLY 16 LYS 17 GLU 18 VAL 19 ILE 20 TRP 21 ALA 22 GLY 23 TRP 24 VAL 25 HIS 26 LEU 27 LEU 28 ARG 29 ASP 30 LEU 31 GLY 32 GLY 33 LYS 34 LYS 35 PHE 36 ILE 37 ILE 38 LEU 39 ARG 40 ASP 41 LYS 42 THR 43 GLY 44 LEU 45 GLY 46 GLN 47 VAL 48 VAL 49 VAL 50 ASP 51 LYS 52 ASN 53 SER 54 SER 55 ALA 56 PHE 57 GLY 58 ILE 59 SER 60 GLN 61 GLU 62 LEU 63 THR 64 GLN 65 GLU 66 SER 67 VAL 68 ILE 69 GLN 70 VAL 71 ARG 72 GLY 73 ILE 74 VAL 75 LYS 76 ALA 77 ASP 78 LYS 79 ARG 80 ALA 81 PRO 82 ARG 83 GLY 84 ILE 85 GLU 86 LEU 87 HIS 88 ALA 89 GLU 90 GLU 91 ILE 92 THR 93 LEU 94 LEU 95 SER 96 LYS 97 ALA 98 LYS 99 ALA 100 PRO 101 LEU 102 PRO 103 LEU 104 ASP 105 VAL 106 SER 107 GLY 108 LYS 109 VAL 110 LYS 111 ALA 112 ASP 113 ILE 114 ASP 115 THR 116 ARG 117 LEU 118 ARG 119 GLU 120 ARG 121 VAL 122 LEU 123 ASP 124 LEU 125 ARG 126 ARG 127 GLN 128 GLU 129 MET 130 GLN 131 ALA 132 VAL 133 ILE 134 LYS 135 ILE 136 GLN 137 SER 138 LEU 139 ALA 140 LEU 141 LYS 142 ALA 143 PHE 144 ARG 145 GLU 146 THR 147 LEU 148 TYR 149 LYS 150 GLU 151 GLY 152 PHE 153 ILE 154 GLU 155 ILE 156 PHE 157 THR 158 PRO 159 LYS 160 ILE 161 ILE 162 ALA 163 SER 164 ALA 165 THR 166 GLU 167 GLY 168 GLY 169 ALA 170 GLN 171 LEU 172 PHE 173 PRO 174 VAL 175 ILE 176 TYR 177 PHE 178 GLY 179 LYS 180 GLU 181 ALA 182 PHE 183 LEU 184 ALA 185 GLN 186 SER 187 PRO 188 GLN 189 LEU 190 TYR 191 LYS 192 GLU 193 LEU 194 MET 195 ALA 196 GLY 197 VAL 198 VAL 199 GLU 200 ARG 201 VAL 202 PHE 203 GLU 204 VAL 205 ALA 206 PRO 207 ALA 208 TRP 209 ARG 210 ALA 211 GLU 212 GLU 213 SER 214 ASP 215 THR 216 PRO 217 PHE 218 HIS 219 LEU 220 ALA 221 GLU 222 PHE 223 ILE 224 SER 225 MET 226 ASP 227 VAL 228 GLU 229 MET 230 ALA 231 PHE 232 ALA 233 ASP 234 TYR 235 ASN 236 ASP 237 VAL 238 MET 239 GLN 240 LEU 241 LEU 242 GLU 243 LYS 244 ILE 245 LEU 246 HIS 247 ASN 248 ILE 249 VAL 250 LYS 251 THR 252 ILE 253 LYS 254 GLU 255 GLU 256 GLY 257 LYS 258 GLU 259 GLU 260 LEU 261 LYS 262 ILE 263 LEU 264 ASN 265 TYR 266 GLU 267 PRO 268 PRO 269 GLU 270 VAL 271 LYS 272 ILE 273 PRO 274 ILE 275 LYS 276 ARG 277 LEU 278 LYS 279 TYR 280 THR 281 GLU 282 ALA 283 ILE 284 GLU 285 ILE 286 LEU 287 ARG 288 SER 289 LYS 290 GLY 291 TYR 292 ASN 293 ILE 294 LYS 295 PHE 296 GLY 297 ASP 298 ASP 299 ILE 300 GLY 301 THR 302 PRO 303 GLU 304 LEU 305 ARG 306 ILE 307 LEU 308 ASN 309 GLU 310 GLU 311 LEU 312 LYS 313 GLU 314 ASP 315 LEU 316 TYR 317 PHE 318 ILE 319 VAL 320 ASP 321 TRP 322 PRO 323 SER 324 ASP 325 ALA 326 ARG 327 PRO 328 PHE 329 TYR 330 THR 331 LYS 332 SER 333 LYS 334 SER 335 GLU 336 ASN 337 PRO 338 GLU 339 LEU 340 SER 341 GLU 342 SER 343 PHE 344 ASP 345 LEU 346 ILE 347 TYR 348 LYS 349 PHE 350 LEU 351 GLU 352 ILE 353 VAL 354 SER 355 GLY 356 SER 357 THR 358 ARG 359 ASN 360 HIS 361 LYS 362 ARG 363 GLU 364 VAL 365 LEU 366 GLU 367 GLU 368 ALA 369 LEU 370 LYS 371 LYS 372 LYS 373 GLY 374 LEU 375 LYS 376 PRO 377 GLU 378 SER 379 PHE 380 GLU 381 PHE 382 PHE 383 LEU 384 LYS 385 TRP 386 PHE 387 ASP 388 TYR 389 GLY 390 MET 391 PRO 392 PRO 393 HIS 394 ALA 395 GLY 396 PHE 397 GLY 398 MET 399 GLY 400 LEU 401 ALA 402 ARG 403 LEU 404 MET 405 VAL 406 MET 407 LEU 408 THR 409 GLY 410 ILE 411 GLN 412 SER 413 VAL 414 LYS 415 GLU 416 ILE 417 VAL 418 PRO 419 PHE 420 PRO 421 ARG 422 ASP 423 LYS 424 LYS 425 ARG 426 LEU 427 THR 428 PRO 429

Ligands

Unit 3	CL 431 SO4 1001 EPE 1003
Unit 4	CL 430 SO4 1002 EPE 1004