1VR5 - Sequence, Chains, Asymmetric and Biological Units

• Title: CRYSTAL STRUCTURE OF OLIGOPEPTIDE ABC TRANSPORTER, PERIPLASM OLIGOPEPTIDE-BINDING (TM1223) FROM THERMOTOGA MARITIMA AT 1 RESOLUTION
• Keywords: TM1223, OLIGOPEPTIDE ABC TRANSPORTER, PERIPLASMIC OLIGOPEPTI BINDING, STRUCTURAL GENOMICS, JOINT CENTER FOR STRUCTURAL G JCSG, PROTEIN STRUCTURE INITIATIVE, PSI, PROTEIN TRANSPORT
• Experiment: X-ray diffraction
• Number of Models: 1

Database	ID code	Status	Coordinate files
			Header	Asymmetric unit	Biological unit
PDB	1VR5	released	available	available	Quaternary Structure Server

Asymmetric unit from PDB

Unit	Type	Name	Chain ID	Residues	Atoms	Hetatoms
1	Protein	OLIGOPEPTIDE ABC TRANSPORTER, PERIPLASMIC OLIGOPE BINDING PROTEIN	A	536	4271	72
2	Protein	OLIGOPEPTIDE ABC TRANSPORTER, PERIPLASMIC OLIGOPE BINDING PROTEIN	B	536	4277	72
3	Ligand	OLIGOPEPTIDE ABC TRANSPORTER, PERIPLASMIC OLIGOPE BINDING PROTEIN	A	24	0	99
4	Ligand	OLIGOPEPTIDE ABC TRANSPORTER, PERIPLASMIC OLIGOPE BINDING PROTEIN	B	17	0	62
5	Water			1098	0	1098
total				2211	8548	1403

Proteins

Unit 1

HIS 0 GLU 23 ARG 24 ASN 25 LYS 26 THR 27 LEU 28 TYR 29 TRP 30 GLY 31 GLY 32 ALA 33 LEU 34 TRP 35 SER 36 PRO 37 PRO 38 SER 39 ASN 40 TRP 41 ASN 42 PRO 43 PHE 44 THR 45 PRO 46 TRP 47 ASN 48 ALA 49 VAL 50 ALA 51 GLY 52 THR 53 ILE 54 GLY 55 LEU 56 VAL 57 TYR 58 GLU 59 PRO 60 LEU 61 PHE 62 LEU 63 TYR 64 ASP 65 PRO 66 LEU 67 ASN 68 ASP 69 LYS 70 PHE 71 GLU 72 PRO 73 TRP 74 LEU 75 ALA 76 GLU 77 LYS 78 GLY 79 GLU 80 TRP 81 VAL 82 SER 83 ASN 84 ASN 85 GLU 86 TYR 87 VAL 88 LEU 89 THR 90 LEU 91 ARG 92 LYS 93 GLY 94 LEU 95 ARG 96 TRP 97 GLN 98 ASP 99 GLY 100 VAL 101 PRO 102 LEU 103 THR 104 ALA 105 ASP 106 ASP 107 VAL 108 VAL 109 PHE 110 THR 111 PHE 112 GLU 113 ILE 114 ALA 115 LYS 116 LYS 117 TYR 118 THR 119 GLY 120 ILE 121 SER 122 TYR 123 SER 124 PRO 125 VAL 126 TRP 127 ASN 128 TRP 129 LEU 130 GLY 131 ARG 132 ILE 133 GLU 134 ARG 135 VAL 136 ASP 137 GLU 138 ARG 139 THR 140 LEU 141 LYS 142 PHE 143 VAL 144 PHE 145 SER 146 ASP 147 PRO 148 ARG 149 TYR 150 GLN 151 GLU 152 TRP 153 LYS 154 GLN 155 MSE 156 LEU 157 ILE 158 ASN 159 THR 160 PRO 161 ILE 162 VAL 163 PRO 164 LYS 165 HIS 166 ILE 167 TRP 168 GLU 169 ASN 170 LYS 171 THR 172 GLU 173 GLU 174 GLU 175 VAL 176 LEU 177 GLN 178 ALA 179 ALA 180 ASN 181 GLU 182 ASN 183 PRO 184 VAL 185 GLY 186 SER 187 GLY 188 PRO 189 TYR 190 TYR 191 VAL 192 GLU 193 SER 194 TRP 195 ALA 196 ASP 197 ASP 198 ARG 199 CYS 200 VAL 201 PHE 202 LYS 203 LYS 204 ASN 205 GLY 206 ASN 207 TRP 208 TRP 209 GLY 210 ILE 211 ARG 212 GLU 213 LEU 214 GLY 215 TYR 216 ASP 217 PRO 218 LYS 219 PRO 220 GLU 221 ARG 222 ILE 223 VAL 224 GLU 225 LEU 226 ARG 227 VAL 228 LEU 229 SER 230 ASN 231 ASN 232 VAL 233 ALA 234 VAL 235 GLY 236 MSE 237 LEU 238 MSE 239 LYS 240 GLY 241 GLU 242 LEU 243 ASP 244 TRP 245 SER 246 ASN 247 PHE 248 PHE 249 LEU 250 PRO 251 GLY 252 VAL 253 PRO 254 VAL 255 LEU 256 LYS 257 LYS 258 ALA 259 TYR 260 GLY 261 ILE 262 VAL 263 THR 264 TRP 265 TYR 266 GLU 267 ASN 268 ALA 269 PRO 270 TYR 271 MSE 272 LEU 273 PRO 274 ALA 275 ASN 276 THR 277 ALA 278 GLY 279 ILE 280 TYR 281 ILE 282 ASN 283 VAL 284 ASN 285 LYS 286 TYR 287 PRO 288 LEU 289 SER 290 ILE 291 PRO 292 GLU 293 PHE 294 ARG 295 ARG 296 ALA 297 MSE 298 ALA 299 TYR 300 ALA 301 ILE 302 ASN 303 PRO 304 GLU 305 LYS 306 ILE 307 VAL 308 THR 309 ARG 310 ALA 311 TYR 312 GLU 313 ASN 314 MSE 315 VAL 316 THR 317 ALA 318 ALA 319 ASN 320 PRO 321 ALA 322 GLY 323 ILE 324 LEU 325 PRO 326 LEU 327 PRO 328 GLY 329 TYR 330 MSE 331 LYS 332 TYR 333 TYR 334 PRO 335 LYS 336 GLU 337 VAL 338 VAL 339 ASP 340 LYS 341 TYR 342 GLY 343 PHE 344 LYS 345 TYR 346 ASP 347 PRO 348 GLU 349 MSE 350 ALA 351 LYS 352 LYS 353 ILE 354 LEU 355 ASP 356 GLU 357 LEU 358 GLY 359 PHE 360 LYS 361 ASP 362 VAL 363 ASN 364 LYS 365 ASP 366 GLY 367 PHE 368 ARG 369 GLU 370 ASP 371 PRO 372 ASN 373 GLY 374 LYS 375 PRO 376 PHE 377 LYS 378 LEU 379 THR 380 ILE 381 GLU 382 CYS 383 PRO 384 TYR 385 GLY 386 TRP 387 THR 388 ASP 389 TRP 390 MSE 391 VAL 392 SER 393 ILE 394 GLN 395 SER 396 ILE 397 ALA 398 GLU 399 ASP 400 LEU 401 VAL 402 LYS 403 VAL 404 GLY 405 ILE 406 ASN 407 VAL 408 GLU 409 PRO 410 LYS 411 TYR 412 PRO 413 ASP 414 TYR 415 SER 416 LYS 417 TYR 418 ALA 419 ASP 420 ASP 421 LEU 422 TYR 423 GLY 424 GLY 425 LYS 426 PHE 427 ASP 428 LEU 429 ILE 430 LEU 431 ASN 432 ASN 433 PHE 434 THR 435 THR 436 GLY 437 VAL 438 SER 439 ALA 440 THR 441 ILE 442 TRP 443 SER 444 TYR 445 PHE 446 ASN 447 GLY 448 VAL 449 PHE 450 TYR 451 PRO 452 ASP 453 ALA 454 VAL 455 GLU 456 SER 457 GLU 458 TYR 459 SER 460 TYR 461 SER 462 GLY 463 ASN 464 PHE 465 GLY 466 LYS 467 TYR 468 ALA 469 ASN 470 PRO 471 GLU 472 VAL 473 GLU 474 THR 475 LEU 476 LEU 477 ASP 478 GLU 479 LEU 480 ASN 481 ARG 482 SER 483 ASN 484 ASP 485 ASP 486 ALA 487 LYS 488 ILE 489 LYS 490 GLU 491 VAL 492 VAL 493 ALA 494 LYS 495 LEU 496 SER 497 GLU 498 ILE 499 LEU 500 LEU 501 LYS 502 ASP 503 LEU 504 PRO 505 PHE 506 ILE 507 PRO 508 LEU 509 TRP 510 TYR 511 ASN 512 GLY 513 ALA 514 TRP 515 PHE 516 GLN 517 ALA 518 SER 519 GLU 520 ALA 521 VAL 522 TRP 523 THR 524 ASN 525 TRP 526 PRO 527 THR 528 GLU 529 LYS 530 ASN 531 PRO 532 TYR 533 ALA 534 VAL 535 PRO 536 ILE 537 GLY 538 TRP 539 ASN 540 GLY 541 TRP 542 TRP 543 GLN 544 LEU 545 THR 546 GLY 547 ILE 548 LYS 549 THR 550 LEU 551 PHE 552 GLY 553 ILE 554 GLU 555 ALA 556 LYS 557

Unit 2

HIS 0 GLU 23 ARG 24 ASN 25 LYS 26 THR 27 LEU 28 TYR 29 TRP 30 GLY 31 GLY 32 ALA 33 LEU 34 TRP 35 SER 36 PRO 37 PRO 38 SER 39 ASN 40 TRP 41 ASN 42 PRO 43 PHE 44 THR 45 PRO 46 TRP 47 ASN 48 ALA 49 VAL 50 ALA 51 GLY 52 THR 53 ILE 54 GLY 55 LEU 56 VAL 57 TYR 58 GLU 59 PRO 60 LEU 61 PHE 62 LEU 63 TYR 64 ASP 65 PRO 66 LEU 67 ASN 68 ASP 69 LYS 70 PHE 71 GLU 72 PRO 73 TRP 74 LEU 75 ALA 76 GLU 77 LYS 78 GLY 79 GLU 80 TRP 81 VAL 82 SER 83 ASN 84 ASN 85 GLU 86 TYR 87 VAL 88 LEU 89 THR 90 LEU 91 ARG 92 LYS 93 GLY 94 LEU 95 ARG 96 TRP 97 GLN 98 ASP 99 GLY 100 VAL 101 PRO 102 LEU 103 THR 104 ALA 105 ASP 106 ASP 107 VAL 108 VAL 109 PHE 110 THR 111 PHE 112 GLU 113 ILE 114 ALA 115 LYS 116 LYS 117 TYR 118 THR 119 GLY 120 ILE 121 SER 122 TYR 123 SER 124 PRO 125 VAL 126 TRP 127 ASN 128 TRP 129 LEU 130 GLY 131 ARG 132 ILE 133 GLU 134 ARG 135 VAL 136 ASP 137 GLU 138 ARG 139 THR 140 LEU 141 LYS 142 PHE 143 VAL 144 PHE 145 SER 146 ASP 147 PRO 148 ARG 149 TYR 150 GLN 151 GLU 152 TRP 153 LYS 154 GLN 155 MSE 156 LEU 157 ILE 158 ASN 159 THR 160 PRO 161 ILE 162 VAL 163 PRO 164 LYS 165 HIS 166 ILE 167 TRP 168 GLU 169 ASN 170 LYS 171 THR 172 GLU 173 GLU 174 GLU 175 VAL 176 LEU 177 GLN 178 ALA 179 ALA 180 ASN 181 GLU 182 ASN 183 PRO 184 VAL 185 GLY 186 SER 187 GLY 188 PRO 189 TYR 190 TYR 191 VAL 192 GLU 193 SER 194 TRP 195 ALA 196 ASP 197 ASP 198 ARG 199 CYS 200 VAL 201 PHE 202 LYS 203 LYS 204 ASN 205 GLY 206 ASN 207 TRP 208 TRP 209 GLY 210 ILE 211 ARG 212 GLU 213 LEU 214 GLY 215 TYR 216 ASP 217 PRO 218 LYS 219 PRO 220 GLU 221 ARG 222 ILE 223 VAL 224 GLU 225 LEU 226 ARG 227 VAL 228 LEU 229 SER 230 ASN 231 ASN 232 VAL 233 ALA 234 VAL 235 GLY 236 MSE 237 LEU 238 MSE 239 LYS 240 GLY 241 GLU 242 LEU 243 ASP 244 TRP 245 SER 246 ASN 247 PHE 248 PHE 249 LEU 250 PRO 251 GLY 252 VAL 253 PRO 254 VAL 255 LEU 256 LYS 257 LYS 258 ALA 259 TYR 260 GLY 261 ILE 262 VAL 263 THR 264 TRP 265 TYR 266 GLU 267 ASN 268 ALA 269 PRO 270 TYR 271 MSE 272 LEU 273 PRO 274 ALA 275 ASN 276 THR 277 ALA 278 GLY 279 ILE 280 TYR 281 ILE 282 ASN 283 VAL 284 ASN 285 LYS 286 TYR 287 PRO 288 LEU 289 SER 290 ILE 291 PRO 292 GLU 293 PHE 294 ARG 295 ARG 296 ALA 297 MSE 298 ALA 299 TYR 300 ALA 301 ILE 302 ASN 303 PRO 304 GLU 305 LYS 306 ILE 307 VAL 308 THR 309 ARG 310 ALA 311 TYR 312 GLU 313 ASN 314 MSE 315 VAL 316 THR 317 ALA 318 ALA 319 ASN 320 PRO 321 ALA 322 GLY 323 ILE 324 LEU 325 PRO 326 LEU 327 PRO 328 GLY 329 TYR 330 MSE 331 LYS 332 TYR 333 TYR 334 PRO 335 LYS 336 GLU 337 VAL 338 VAL 339 ASP 340 LYS 341 TYR 342 GLY 343 PHE 344 LYS 345 TYR 346 ASP 347 PRO 348 GLU 349 MSE 350 ALA 351 LYS 352 LYS 353 ILE 354 LEU 355 ASP 356 GLU 357 LEU 358 GLY 359 PHE 360 LYS 361 ASP 362 VAL 363 ASN 364 LYS 365 ASP 366 GLY 367 PHE 368 ARG 369 GLU 370 ASP 371 PRO 372 ASN 373 GLY 374 LYS 375 PRO 376 PHE 377 LYS 378 LEU 379 THR 380 ILE 381 GLU 382 CYS 383 PRO 384 TYR 385 GLY 386 TRP 387 THR 388 ASP 389 TRP 390 MSE 391 VAL 392 SER 393 ILE 394 GLN 395 SER 396 ILE 397 ALA 398 GLU 399 ASP 400 LEU 401 VAL 402 LYS 403 VAL 404 GLY 405 ILE 406 ASN 407 VAL 408 GLU 409 PRO 410 LYS 411 TYR 412 PRO 413 ASP 414 TYR 415 SER 416 LYS 417 TYR 418 ALA 419 ASP 420 ASP 421 LEU 422 TYR 423 GLY 424 GLY 425 LYS 426 PHE 427 ASP 428 LEU 429 ILE 430 LEU 431 ASN 432 ASN 433 PHE 434 THR 435 THR 436 GLY 437 VAL 438 SER 439 ALA 440 THR 441 ILE 442 TRP 443 SER 444 TYR 445 PHE 446 ASN 447 GLY 448 VAL 449 PHE 450 TYR 451 PRO 452 ASP 453 ALA 454 VAL 455 GLU 456 SER 457 GLU 458 TYR 459 SER 460 TYR 461 SER 462 GLY 463 ASN 464 PHE 465 GLY 466 LYS 467 TYR 468 ALA 469 ASN 470 PRO 471 GLU 472 VAL 473 GLU 474 THR 475 LEU 476 LEU 477 ASP 478 GLU 479 LEU 480 ASN 481 ARG 482 SER 483 ASN 484 ASP 485 ASP 486 ALA 487 LYS 488 ILE 489 LYS 490 GLU 491 VAL 492 VAL 493 ALA 494 LYS 495 LEU 496 SER 497 GLU 498 ILE 499 LEU 500 LEU 501 LYS 502 ASP 503 LEU 504 PRO 505 PHE 506 ILE 507 PRO 508 LEU 509 TRP 510 TYR 511 ASN 512 GLY 513 ALA 514 TRP 515 PHE 516 GLN 517 ALA 518 SER 519 GLU 520 ALA 521 VAL 522 TRP 523 THR 524 ASN 525 TRP 526 PRO 527 THR 528 GLU 529 LYS 530 ASN 531 PRO 532 TYR 533 ALA 534 VAL 535 PRO 536 ILE 537 GLY 538 TRP 539 ASN 540 GLY 541 TRP 542 TRP 543 GLN 544 LEU 545 THR 546 GLY 547 ILE 548 LYS 549 THR 550 LEU 551 PHE 552 GLY 553 ILE 554 GLU 555 ALA 556 LYS 557

Ligands

Unit 3	NA 1 CL 3 EPE 5 ACT 6 ACT 7 ACT 9 EDO 12 EDO 13 EDO 14 EDO 15 EDO 16 EDO 19 EDO 558 EDO 559 EDO 560 EDO 561 EDO 562 EDO 563 EDO 564 EDO 565 EDO 566 EDO 567 FMT 568 FMT 569
Unit 4	NA 2 CL 4 ACT 8 EDO 10 EDO 11 EDO 17 EDO 18 EDO 20 EDO 21 EDO 22 EDO 558 EDO 559 EDO 560 EDO 561 EDO 562 EDO 563 EDO 564