1VGO - Sequence, Chains, Asymmetric and Biological Units

• Title: CRYSTAL STRUCTURE OF ARCHAERHODOPSIN-2
• Keywords: RETINAL-BINDING PROTEIN, PROTON TRANSPORT
• Experiment: X-ray diffraction
• Number of Models: 1

Database	ID code	Status	Coordinate files
			Header	Asymmetric unit	Biological unit
PDB	1VGO	released	available	available	Quaternary Structure Server

Asymmetric unit from PDB

Unit	Type	Name	Chain ID	Residues	Atoms	Hetatoms
1	Protein	ARCHAERHODOPSIN 2	A	233	1802	0
2	Protein	ARCHAERHODOPSIN 2	B	235	1818	0
3	Ligand	ARCHAERHODOPSIN 2	A	11	0	214
4	Ligand	ARCHAERHODOPSIN 2	B	6	0	93
5	Water			29	0	29
total				514	3620	336

Proteins

Unit 1

ASP 5 LEU 6 LEU 7 ASN 8 ASP 9 GLY 10 ARG 11 PRO 12 GLU 13 THR 14 LEU 15 TRP 16 LEU 17 GLY 18 ILE 19 GLY 20 THR 21 LEU 22 LEU 23 MET 24 LEU 25 ILE 26 GLY 27 THR 28 PHE 29 TYR 30 PHE 31 ILE 32 ALA 33 ARG 34 GLY 35 TRP 36 GLY 37 VAL 38 THR 39 ASP 40 LYS 41 GLU 42 ALA 43 ARG 44 GLU 45 TYR 46 TYR 47 ALA 48 ILE 49 THR 50 ILE 51 LEU 52 VAL 53 PRO 54 GLY 55 ILE 56 ALA 57 SER 58 ALA 59 ALA 60 TYR 61 LEU 62 ALA 63 MET 64 PHE 65 PHE 66 GLY 67 ILE 68 GLY 69 VAL 70 THR 71 GLU 72 VAL 73 GLU 74 LEU 75 ALA 76 SER 77 GLY 78 THR 79 VAL 80 LEU 81 ASP 82 ILE 83 TYR 84 TYR 85 ALA 86 ARG 87 TYR 88 ALA 89 ASP 90 TRP 91 LEU 92 PHE 93 THR 94 THR 95 PRO 96 LEU 97 LEU 98 LEU 99 LEU 100 ASP 101 LEU 102 ALA 103 LEU 104 LEU 105 ALA 106 LYS 107 VAL 108 ASP 109 ARG 110 VAL 111 THR 112 ILE 113 GLY 114 THR 115 LEU 116 ILE 117 GLY 118 VAL 119 ASP 120 ALA 121 LEU 122 MET 123 ILE 124 VAL 125 THR 126 GLY 127 LEU 128 ILE 129 GLY 130 ALA 131 LEU 132 SER 133 LYS 134 THR 135 PRO 136 LEU 137 ALA 138 ARG 139 TYR 140 THR 141 TRP 142 TRP 143 LEU 144 PHE 145 SER 146 THR 147 ILE 148 ALA 149 PHE 150 LEU 151 PHE 152 VAL 153 LEU 154 TYR 155 TYR 156 LEU 157 LEU 158 THR 159 SER 160 LEU 161 ARG 162 SER 163 ALA 164 ALA 165 ALA 166 LYS 167 ARG 168 SER 169 GLU 170 GLU 171 VAL 172 ARG 173 SER 174 THR 175 PHE 176 ASN 177 THR 178 LEU 179 THR 180 ALA 181 LEU 182 VAL 183 ALA 184 VAL 185 LEU 186 TRP 187 THR 188 ALA 189 TYR 190 PRO 191 ILE 192 LEU 193 TRP 194 ILE 195 VAL 196 GLY 197 THR 198 GLU 199 GLY 200 ALA 201 GLY 202 VAL 203 VAL 204 GLY 205 LEU 206 GLY 207 ILE 208 GLU 209 THR 210 LEU 211 ALA 212 PHE 213 MET 214 VAL 215 LEU 216 ASP 217 VAL 218 THR 219 ALA 220 LYS 221 VAL 222 GLY 223 PHE 224 GLY 225 PHE 226 VAL 227 LEU 228 LEU 229 ARG 230 SER 231 ARG 232 ALA 233 ILE 234 LEU 235 GLY 236 GLU 237

Unit 2

ASP 5 LEU 6 LEU 7 ASN 8 ASP 9 GLY 10 ARG 11 PRO 12 GLU 13 THR 14 LEU 15 TRP 16 LEU 17 GLY 18 ILE 19 GLY 20 THR 21 LEU 22 LEU 23 MET 24 LEU 25 ILE 26 GLY 27 THR 28 PHE 29 TYR 30 PHE 31 ILE 32 ALA 33 ARG 34 GLY 35 TRP 36 GLY 37 VAL 38 THR 39 ASP 40 LYS 41 GLU 42 ALA 43 ARG 44 GLU 45 TYR 46 TYR 47 ALA 48 ILE 49 THR 50 ILE 51 LEU 52 VAL 53 PRO 54 GLY 55 ILE 56 ALA 57 SER 58 ALA 59 ALA 60 TYR 61 LEU 62 ALA 63 MET 64 PHE 65 PHE 66 GLY 67 ILE 68 GLY 69 VAL 70 THR 71 GLU 72 VAL 73 GLU 74 LEU 75 ALA 76 SER 77 GLY 78 THR 79 VAL 80 LEU 81 ASP 82 ILE 83 TYR 84 TYR 85 ALA 86 ARG 87 TYR 88 ALA 89 ASP 90 TRP 91 LEU 92 PHE 93 THR 94 THR 95 PRO 96 LEU 97 LEU 98 LEU 99 LEU 100 ASP 101 LEU 102 ALA 103 LEU 104 LEU 105 ALA 106 LYS 107 VAL 108 ASP 109 ARG 110 VAL 111 THR 112 ILE 113 GLY 114 THR 115 LEU 116 ILE 117 GLY 118 VAL 119 ASP 120 ALA 121 LEU 122 MET 123 ILE 124 VAL 125 THR 126 GLY 127 LEU 128 ILE 129 GLY 130 ALA 131 LEU 132 SER 133 LYS 134 THR 135 PRO 136 LEU 137 ALA 138 ARG 139 TYR 140 THR 141 TRP 142 TRP 143 LEU 144 PHE 145 SER 146 THR 147 ILE 148 ALA 149 PHE 150 LEU 151 PHE 152 VAL 153 LEU 154 TYR 155 TYR 156 LEU 157 LEU 158 THR 159 SER 160 LEU 161 ARG 162 SER 163 ALA 164 ALA 165 ALA 166 LYS 167 ARG 168 SER 169 GLU 170 GLU 171 VAL 172 ARG 173 SER 174 THR 175 PHE 176 ASN 177 THR 178 LEU 179 THR 180 ALA 181 LEU 182 VAL 183 ALA 184 VAL 185 LEU 186 TRP 187 THR 188 ALA 189 TYR 190 PRO 191 ILE 192 LEU 193 TRP 194 ILE 195 VAL 196 GLY 197 THR 198 GLU 199 GLY 200 ALA 201 GLY 202 VAL 203 VAL 204 GLY 205 LEU 206 GLY 207 ILE 208 GLU 209 THR 210 LEU 211 ALA 212 PHE 213 MET 214 VAL 215 LEU 216 ASP 217 VAL 218 THR 219 ALA 220 LYS 221 VAL 222 GLY 223 PHE 224 GLY 225 PHE 226 VAL 227 LEU 228 LEU 229 ARG 230 SER 231 ARG 232 ALA 233 ILE 234 LEU 235 GLY 236 GLU 237 THR 238 GLU 239

Ligands

Unit 3	RET 260 BNG 301 BNG 302 BNG 303 BNG 304 BNG 305 BNG 306 BNG 307 BNG 308 BNG 309 SO4 400
Unit 4	RET 261 BNG 310 BNG 311 BNG 312 SO4 401 SO4 402