1VE5 - Sequence, Chains, Asymmetric and Biological Units

• Title: CRYSTAL STRUCTURE OF T.TH. HB8 THREONINE DEAMINASE
• Keywords: THREONINE DEAMINASE CATABOLIC, RIKEN STRUCTURAL GENOMICS/PRO INITIATIVE, RSGI, STRUCTURAL GENOMICS, LYASE
• Experiment: X-ray diffraction
• Number of Models: 1

Database	ID code	Status	Coordinate files
			Header	Asymmetric unit	Biological unit
PDB	1VE5	released	available	available	Quaternary Structure Server

Asymmetric unit from PDB

Unit	Type	Name	Chain ID	Residues	Atoms	Hetatoms
1	Protein	THREONINE DEAMINASE	A	308	2279	0
2	Protein	THREONINE DEAMINASE	B	297	2190	0
3	Protein	THREONINE DEAMINASE	C	274	2024	0
4	Protein	THREONINE DEAMINASE	D	280	2069	0
5	Ligand	THREONINE DEAMINASE	A	2	0	16
6	Ligand	THREONINE DEAMINASE	B	2	0	16
7	Ligand	THREONINE DEAMINASE	C	2	0	16
8	Ligand	THREONINE DEAMINASE	D	2	0	16
9	Water			256	0	256
total				1423	8562	320

Proteins

Unit 1	PRO 2 SER 3 LEU 4 GLN 5 ASP 6 LEU 7 TYR 8 ALA 9 ALA 10 PHE 11 ARG 12 ARG 13 ILE 14 ALA 15 PRO 16 TYR 17 THR 18 HIS 19 ARG 20 THR 21 PRO 22 LEU 23 LEU 24 THR 25 SER 26 ARG 27 LEU 28 LEU 29 ASP 30 GLY 31 LEU 32 LEU 33 GLY 34 LYS 35 ARG 36 LEU 37 LEU 38 LEU 39 LYS 40 ALA 41 GLU 42 HIS 43 LEU 44 GLN 45 LYS 46 THR 47 GLY 48 SER 49 PHE 50 LYS 51 ALA 52 ARG 53 GLY 54 ALA 55 LEU 56 SER 57 LYS 58 ALA 59 LEU 60 ALA 61 LEU 62 GLU 63 ASN 64 PRO 65 LYS 66 GLY 67 LEU 68 LEU 69 ALA 70 VAL 71 SER 72 SER 73 GLY 74 ASN 75 HIS 76 ALA 77 GLN 78 GLY 79 VAL 80 ALA 81 TYR 82 ALA 83 ALA 84 GLN 85 VAL 86 LEU 87 GLY 88 VAL 89 LYS 90 ALA 91 LEU 92 VAL 93 VAL 94 MET 95 PRO 96 GLU 97 ASP 98 PRO 101 TYR 102 LYS 103 LYS 104 ALA 105 CYS 106 ALA 107 ARG 108 ALA 109 TYR 110 GLY 111 ALA 112 GLU 113 VAL 114 VAL 115 ASP 116 ARG 117 GLY 118 VAL 119 THR 120 ALA 121 LYS 122 ASN 123 ARG 124 GLU 125 GLU 126 VAL 127 ALA 128 ARG 129 ALA 130 LEU 131 GLN 132 GLU 133 GLU 134 THR 135 GLY 136 TYR 137 ALA 138 LEU 139 ILE 140 HIS 141 PRO 142 PHE 143 ASP 144 ASP 145 PRO 146 LEU 147 VAL 148 ILE 149 ALA 150 GLY 151 GLN 152 GLY 153 THR 154 ALA 155 GLY 156 LEU 157 GLU 158 LEU 159 LEU 160 ALA 161 GLN 162 ALA 163 GLY 164 ARG 165 MET 166 GLY 167 VAL 168 PHE 169 PRO 170 GLY 171 ALA 172 VAL 173 LEU 174 ALA 175 PRO 176 VAL 177 GLY 178 GLY 179 GLY 180 GLY 181 LEU 182 LEU 183 ALA 184 GLY 185 LEU 186 ALA 187 THR 188 ALA 189 VAL 190 LYS 191 ALA 192 LEU 193 SER 194 PRO 195 THR 196 THR 197 LEU 198 VAL 199 LEU 200 GLY 201 VAL 202 GLU 203 PRO 204 GLU 205 ALA 206 ALA 207 ASP 208 ASP 209 ALA 210 LYS 211 ARG 212 SER 213 LEU 214 GLU 215 ALA 216 GLY 217 ARG 218 ILE 219 LEU 220 ARG 221 LEU 222 GLU 223 ALA 224 PRO 225 PRO 226 ARG 227 THR 228 ARG 229 ALA 230 ASP 231 GLY 232 VAL 233 ARG 234 THR 235 LEU 236 SER 237 LEU 238 GLY 239 GLU 240 ARG 241 THR 242 PHE 243 PRO 244 ILE 245 LEU 246 ARG 247 GLU 248 ARG 249 VAL 250 ASP 251 GLY 252 ILE 253 LEU 254 THR 255 VAL 256 SER 257 GLU 258 GLU 259 ALA 260 LEU 261 LEU 262 GLU 263 ALA 264 GLU 265 ARG 266 LEU 267 LEU 268 PHE 269 THR 270 ARG 271 THR 272 LYS 273 GLN 274 VAL 275 VAL 276 GLU 277 PRO 278 THR 279 GLY 280 ALA 281 LEU 282 PRO 283 LEU 284 ALA 285 ALA 286 VAL 287 LEU 288 GLU 289 HIS 290 GLY 291 ALA 292 ARG 293 LEU 294 PRO 295 GLN 296 THR 297 LEU 298 ALA 299 LEU 300 LEU 301 LEU 302 SER 303 GLY 304 GLY 305 ASN 306 ARG 307 ASP 308 PHE 309 SER 310 PRO 311
Unit 2	PRO 2 SER 3 LEU 4 GLN 5 ASP 6 LEU 7 TYR 8 ALA 9 ALA 10 PHE 11 ARG 12 ARG 13 ILE 14 ALA 15 PRO 16 TYR 17 THR 18 HIS 19 ARG 20 THR 21 PRO 22 LEU 23 LEU 24 THR 25 SER 26 ARG 27 LEU 28 LEU 29 ASP 30 GLY 31 LEU 32 LEU 33 GLY 34 LYS 35 ARG 36 LEU 37 LEU 38 LEU 39 LYS 40 ALA 41 GLU 42 HIS 43 LEU 44 GLN 45 LYS 46 THR 47 GLY 48 SER 49 PHE 50 LYS 51 ALA 52 ARG 53 GLY 54 ALA 55 LEU 56 SER 57 LYS 58 ALA 59 LEU 60 ALA 61 LEU 62 GLU 63 ASN 64 PRO 65 LYS 66 GLY 67 LEU 68 LEU 69 ALA 70 VAL 71 SER 72 SER 73 GLY 74 ASN 75 HIS 76 ALA 77 GLN 78 GLY 79 VAL 80 ALA 81 TYR 82 ALA 83 ALA 84 GLN 85 VAL 86 LEU 87 GLY 88 VAL 89 LYS 90 ALA 91 LEU 92 VAL 93 VAL 94 MET 95 PRO 96 LYS 103 LYS 104 ALA 105 CYS 106 ALA 107 ARG 108 ALA 109 TYR 110 GLY 111 ALA 112 GLU 113 VAL 114 VAL 115 ASN 123 ARG 124 GLU 125 GLU 126 VAL 127 ALA 128 ARG 129 ALA 130 LEU 131 GLN 132 GLU 133 GLU 134 THR 135 GLY 136 TYR 137 ALA 138 LEU 139 ILE 140 HIS 141 PRO 142 PHE 143 ASP 144 ASP 145 PRO 146 LEU 147 VAL 148 ILE 149 ALA 150 GLY 151 GLN 152 GLY 153 THR 154 ALA 155 GLY 156 LEU 157 GLU 158 LEU 159 LEU 160 ALA 161 GLN 162 ALA 163 GLY 164 ARG 165 MET 166 GLY 167 VAL 168 PHE 169 PRO 170 GLY 171 ALA 172 VAL 173 LEU 174 ALA 175 PRO 176 VAL 177 GLY 178 GLY 179 GLY 180 GLY 181 LEU 182 LEU 183 ALA 184 GLY 185 LEU 186 ALA 187 THR 188 ALA 189 VAL 190 LYS 191 ALA 192 LEU 193 SER 194 PRO 195 THR 196 THR 197 LEU 198 VAL 199 LEU 200 GLY 201 VAL 202 GLU 203 PRO 204 GLU 205 ALA 206 ALA 207 ASP 208 ASP 209 ALA 210 LYS 211 ARG 212 SER 213 LEU 214 GLU 215 ALA 216 GLY 217 ARG 218 ILE 219 LEU 220 ARG 221 LEU 222 GLU 223 ALA 224 PRO 225 PRO 226 ARG 227 THR 228 ARG 229 ALA 230 ASP 231 GLY 232 VAL 233 ARG 234 THR 235 LEU 236 SER 237 LEU 238 GLY 239 GLU 240 ARG 241 THR 242 PHE 243 PRO 244 ILE 245 LEU 246 ARG 247 GLU 248 ARG 249 VAL 250 ASP 251 GLY 252 ILE 253 LEU 254 THR 255 VAL 256 SER 257 GLU 258 GLU 259 ALA 260 LEU 261 LEU 262 GLU 263 ALA 264 GLU 265 ARG 266 LEU 267 LEU 268 PHE 269 THR 270 ARG 271 THR 272 LYS 273 GLN 274 VAL 275 VAL 276 GLU 277 PRO 278 THR 279 GLY 280 ALA 281 LEU 282 PRO 283 LEU 284 ALA 285 ALA 286 VAL 287 LEU 288 GLU 289 HIS 290 GLY 291 ALA 292 ARG 293 LEU 294 PRO 295 GLN 296 THR 297 LEU 298 ALA 299 LEU 300 LEU 301 LEU 302 SER 303 GLY 304 GLY 305 ASN 306 ARG 307 ASP 308 PHE 309 SER 310 PRO 311
Unit 3	PRO 2 SER 3 LEU 4 GLN 5 ASP 6 LEU 7 TYR 8 ALA 9 ALA 10 PHE 11 ARG 12 ARG 13 ILE 14 ALA 15 PRO 16 TYR 17 THR 18 HIS 19 ARG 20 THR 21 PRO 22 LEU 23 LEU 24 THR 25 SER 26 ARG 27 LEU 28 LEU 29 ASP 30 GLY 31 LEU 32 LEU 33 GLY 34 LYS 35 ARG 36 LEU 37 LEU 38 LEU 39 LYS 40 ALA 41 GLU 42 HIS 43 LEU 44 GLN 45 LYS 46 THR 47 GLY 48 SER 49 PHE 50 LYS 51 ALA 52 ARG 53 GLY 54 ALA 55 LEU 56 SER 57 LYS 58 ALA 59 LEU 60 ALA 61 LEU 62 GLU 63 ASN 64 PRO 65 LYS 66 GLY 67 LEU 68 LEU 69 ALA 70 VAL 71 SER 72 SER 73 GLY 74 ASN 75 HIS 76 ALA 77 GLN 78 GLY 79 VAL 80 ALA 81 TYR 82 ALA 83 ALA 84 GLN 85 VAL 86 LEU 87 GLY 88 VAL 89 LYS 90 ALA 91 LEU 92 VAL 93 ALA 130 LEU 131 GLN 132 GLU 133 GLU 134 THR 135 GLY 136 TYR 137 ALA 138 LEU 139 ILE 140 HIS 141 PRO 142 PHE 143 ASP 144 ASP 145 PRO 146 LEU 147 VAL 148 ILE 149 ALA 150 GLY 151 GLN 152 GLY 153 THR 154 ALA 155 GLY 156 LEU 157 GLU 158 LEU 159 LEU 160 ALA 161 GLN 162 ALA 163 GLY 164 ARG 165 MET 166 GLY 167 VAL 168 PHE 169 PRO 170 GLY 171 ALA 172 VAL 173 LEU 174 ALA 175 PRO 176 VAL 177 GLY 178 GLY 179 GLY 180 GLY 181 LEU 182 LEU 183 ALA 184 GLY 185 LEU 186 ALA 187 THR 188 ALA 189 VAL 190 LYS 191 ALA 192 LEU 193 SER 194 PRO 195 THR 196 THR 197 LEU 198 VAL 199 LEU 200 GLY 201 VAL 202 GLU 203 PRO 204 GLU 205 ALA 206 ALA 207 ASP 208 ASP 209 ALA 210 LYS 211 ARG 212 SER 213 LEU 214 GLU 215 ALA 216 GLY 217 ARG 218 ILE 219 LEU 220 ARG 221 LEU 222 GLU 223 ALA 224 PRO 225 PRO 226 ARG 227 THR 228 ARG 229 ALA 230 ASP 231 GLY 232 VAL 233 ARG 234 THR 235 LEU 236 SER 237 LEU 238 GLY 239 GLU 240 ARG 241 THR 242 PHE 243 PRO 244 ILE 245 LEU 246 ARG 247 GLU 248 ARG 249 VAL 250 ASP 251 GLY 252 ILE 253 LEU 254 THR 255 VAL 256 SER 257 GLU 258 GLU 259 ALA 260 LEU 261 LEU 262 GLU 263 ALA 264 GLU 265 ARG 266 LEU 267 LEU 268 PHE 269 THR 270 ARG 271 THR 272 LYS 273 GLN 274 VAL 275 VAL 276 GLU 277 PRO 278 THR 279 GLY 280 ALA 281 LEU 282 PRO 283 LEU 284 ALA 285 ALA 286 VAL 287 LEU 288 GLU 289 HIS 290 GLY 291 ALA 292 ARG 293 LEU 294 PRO 295 GLN 296 THR 297 LEU 298 ALA 299 LEU 300 LEU 301 LEU 302 SER 303 GLY 304 GLY 305 ASN 306 ARG 307 ASP 308 PHE 309 SER 310 PRO 311
Unit 4	PRO 2 SER 3 LEU 4 GLN 5 ASP 6 LEU 7 TYR 8 ALA 9 ALA 10 PHE 11 ARG 12 ARG 13 ILE 14 ALA 15 PRO 16 TYR 17 THR 18 HIS 19 ARG 20 THR 21 PRO 22 LEU 23 LEU 24 THR 25 SER 26 ARG 27 LEU 28 LEU 29 ASP 30 GLY 31 LEU 32 LEU 33 GLY 34 LYS 35 ARG 36 LEU 37 LEU 38 LEU 39 LYS 40 ALA 41 GLU 42 HIS 43 LEU 44 GLN 45 LYS 46 THR 47 GLY 48 SER 49 PHE 50 LYS 51 ALA 52 ARG 53 GLY 54 ALA 55 LEU 56 SER 57 LYS 58 ALA 59 LEU 60 ALA 61 LEU 62 GLU 63 ASN 64 PRO 65 LYS 66 GLY 67 LEU 68 LEU 69 ALA 70 VAL 71 SER 72 SER 73 GLY 74 ASN 75 HIS 76 ALA 77 GLN 78 GLY 79 VAL 80 ALA 81 TYR 82 ALA 83 ALA 84 GLN 85 VAL 86 LEU 87 GLY 88 VAL 89 LYS 90 ALA 91 LEU 92 VAL 93 VAL 94 MET 95 PRO 96 VAL 127 ALA 128 ARG 129 ALA 130 LEU 131 GLN 132 GLU 133 GLU 134 THR 135 GLY 136 TYR 137 ALA 138 LEU 139 ILE 140 HIS 141 PRO 142 PHE 143 ASP 144 ASP 145 PRO 146 LEU 147 VAL 148 ILE 149 ALA 150 GLY 151 GLN 152 GLY 153 THR 154 ALA 155 GLY 156 LEU 157 GLU 158 LEU 159 LEU 160 ALA 161 GLN 162 ALA 163 GLY 164 ARG 165 MET 166 GLY 167 VAL 168 PHE 169 PRO 170 GLY 171 ALA 172 VAL 173 LEU 174 ALA 175 PRO 176 VAL 177 GLY 178 GLY 179 GLY 180 GLY 181 LEU 182 LEU 183 ALA 184 GLY 185 LEU 186 ALA 187 THR 188 ALA 189 VAL 190 LYS 191 ALA 192 LEU 193 SER 194 PRO 195 THR 196 THR 197 LEU 198 VAL 199 LEU 200 GLY 201 VAL 202 GLU 203 PRO 204 GLU 205 ALA 206 ALA 207 ASP 208 ASP 209 ALA 210 LYS 211 ARG 212 SER 213 LEU 214 GLU 215 ALA 216 GLY 217 ARG 218 ILE 219 LEU 220 ARG 221 LEU 222 GLU 223 ALA 224 PRO 225 PRO 226 ARG 227 THR 228 ARG 229 ALA 230 ASP 231 GLY 232 VAL 233 ARG 234 THR 235 LEU 236 SER 237 LEU 238 GLY 239 GLU 240 ARG 241 THR 242 PHE 243 PRO 244 ILE 245 LEU 246 ARG 247 GLU 248 ARG 249 VAL 250 ASP 251 GLY 252 ILE 253 LEU 254 THR 255 VAL 256 SER 257 GLU 258 GLU 259 ALA 260 LEU 261 LEU 262 GLU 263 ALA 264 GLU 265 ARG 266 LEU 267 LEU 268 PHE 269 THR 270 ARG 271 THR 272 LYS 273 GLN 274 VAL 275 VAL 276 GLU 277 PRO 278 THR 279 GLY 280 ALA 281 LEU 282 PRO 283 LEU 284 ALA 285 ALA 286 VAL 287 LEU 288 GLU 289 HIS 290 GLY 291 ALA 292 ARG 293 LEU 294 PRO 295 GLN 296 THR 297 LEU 298 ALA 299 LEU 300 LEU 301 LEU 302 SER 303 GLY 304 GLY 305 ASN 306 ARG 307 ASP 308 PHE 309 SER 310 PRO 311

Ligands

Unit 5	PLP 413 CA 2001
Unit 6	PLP 913 CA 2003
Unit 7	PLP 1413 CA 2004
Unit 8	PLP 1913 CA 2002