1V6S - Sequence, Chains, Asymmetric and Biological Units

• Title: CRYSTAL STRUCTURE OF PHOSPHOGLYCERATE KINASE FROM THERMUS TH HB8
• Keywords: PHOSPHOGLYCERATE KINASE, THERMUS THERMOPHILUS, RIKEN STRUCTU GENOMICS/PROTEOMICS INITIATIVE, RSGI, STRUCTURAL GENOMICS, TRANSFERASE
• Experiment: X-ray diffraction
• Number of Models: 1

Database	ID code	Status	Coordinate files
			Header	Asymmetric unit	Biological unit
PDB	1V6S	released	available	available	Quaternary Structure Server

Asymmetric unit from PDB

Unit	Type	Name	Chain ID	Residues	Atoms	Hetatoms
1	Protein	PHOSPHOGLYCERATE KINASE	A	390	2949	0
2	Protein	PHOSPHOGLYCERATE KINASE	B	390	2949	0
3	Ligand	PHOSPHOGLYCERATE KINASE	A	3	0	13
4	Ligand	PHOSPHOGLYCERATE KINASE	B	4	0	14
5	Water			734	0	734
total				1521	5898	761

Proteins

Unit 1

MET 1 ARG 2 THR 3 LEU 4 LEU 5 ASP 6 LEU 7 ASP 8 PRO 9 LYS 10 GLY 11 LYS 12 ARG 13 VAL 14 LEU 15 VAL 16 ARG 17 VAL 18 ASP 19 TYR 20 ASN 21 VAL 22 PRO 23 VAL 24 GLN 25 ASP 26 GLY 27 LYS 28 VAL 29 GLN 30 ASP 31 GLU 32 THR 33 ARG 34 ILE 35 LEU 36 GLU 37 SER 38 LEU 39 PRO 40 THR 41 LEU 42 ARG 43 HIS 44 LEU 45 LEU 46 ALA 47 GLY 48 GLY 49 ALA 50 SER 51 LEU 52 VAL 53 LEU 54 LEU 55 SER 56 HIS 57 LEU 58 GLY 59 ARG 60 PRO 61 LYS 62 GLY 63 PRO 64 ASP 65 PRO 66 LYS 67 TYR 68 SER 69 LEU 70 ALA 71 PRO 72 VAL 73 GLY 74 GLU 75 ALA 76 LEU 77 ARG 78 ALA 79 HIS 80 LEU 81 PRO 82 GLU 83 ALA 84 ARG 85 PHE 86 ALA 87 PRO 88 PHE 89 PRO 90 PRO 91 GLY 92 SER 93 GLU 94 GLU 95 ALA 96 ARG 97 ARG 98 GLU 99 ALA 100 GLU 101 ALA 102 LEU 103 ARG 104 PRO 105 GLY 106 GLU 107 VAL 108 LEU 109 LEU 110 LEU 111 GLU 112 ASN 113 VAL 114 ARG 115 PHE 116 GLU 117 PRO 118 GLY 119 GLU 120 GLU 121 LYS 122 ASN 123 ASP 124 PRO 125 GLU 126 LEU 127 SER 128 ALA 129 ARG 130 TYR 131 ALA 132 ARG 133 LEU 134 GLY 135 GLU 136 ALA 137 PHE 138 VAL 139 LEU 140 ASP 141 ALA 142 PHE 143 GLY 144 SER 145 ALA 146 HIS 147 ARG 148 ALA 149 HIS 150 ALA 151 SER 152 VAL 153 VAL 154 GLY 155 VAL 156 ALA 157 ARG 158 LEU 159 LEU 160 PRO 161 ALA 162 TYR 163 ALA 164 GLY 165 PHE 166 LEU 167 MET 168 GLU 169 LYS 170 GLU 171 VAL 172 ARG 173 ALA 174 LEU 175 SER 176 ARG 177 LEU 178 LEU 179 LYS 180 ASP 181 PRO 182 GLU 183 ARG 184 PRO 185 TYR 186 ALA 187 VAL 188 VAL 189 LEU 190 GLY 191 GLY 192 ALA 193 LYS 194 VAL 195 SER 196 ASP 197 LYS 198 ILE 199 GLY 200 VAL 201 ILE 202 GLU 203 SER 204 LEU 205 LEU 206 PRO 207 ARG 208 ILE 209 ASP 210 ARG 211 LEU 212 LEU 213 ILE 214 GLY 215 GLY 216 ALA 217 MET 218 ALA 219 PHE 220 THR 221 PHE 222 LEU 223 LYS 224 ALA 225 LEU 226 GLY 227 GLY 228 GLU 229 VAL 230 GLY 231 ARG 232 SER 233 LEU 234 VAL 235 GLU 236 GLU 237 ASP 238 ARG 239 LEU 240 ASP 241 LEU 242 ALA 243 LYS 244 ASP 245 LEU 246 LEU 247 GLY 248 ARG 249 ALA 250 GLU 251 ALA 252 LEU 253 GLY 254 VAL 255 ARG 256 VAL 257 TYR 258 LEU 259 PRO 260 GLU 261 ASP 262 VAL 263 VAL 264 ALA 265 ALA 266 GLU 267 ARG 268 ILE 269 GLU 270 ALA 271 GLY 272 VAL 273 GLU 274 THR 275 ARG 276 VAL 277 PHE 278 PRO 279 ALA 280 ARG 281 ALA 282 ILE 283 PRO 284 VAL 285 PRO 286 TYR 287 MET 288 GLY 289 LEU 290 ASP 291 ILE 292 GLY 293 PRO 294 LYS 295 THR 296 ARG 297 GLU 298 ALA 299 PHE 300 ALA 301 ARG 302 ALA 303 LEU 304 GLU 305 GLY 306 ALA 307 ARG 308 THR 309 VAL 310 PHE 311 TRP 312 ASN 313 GLY 314 PRO 315 MET 316 GLY 317 VAL 318 PHE 319 GLU 320 VAL 321 PRO 322 PRO 323 PHE 324 ASP 325 GLU 326 GLY 327 THR 328 LEU 329 ALA 330 VAL 331 GLY 332 GLN 333 ALA 334 ILE 335 ALA 336 ALA 337 LEU 338 GLU 339 GLY 340 ALA 341 PHE 342 THR 343 VAL 344 VAL 345 GLY 346 GLY 347 GLY 348 ASP 349 SER 350 VAL 351 ALA 352 ALA 353 VAL 354 ASN 355 ARG 356 LEU 357 GLY 358 LEU 359 LYS 360 GLU 361 ARG 362 PHE 363 GLY 364 HIS 365 VAL 366 SER 367 THR 368 GLY 369 GLY 370 GLY 371 ALA 372 SER 373 LEU 374 GLU 375 PHE 376 LEU 377 GLU 378 LYS 379 GLY 380 THR 381 LEU 382 PRO 383 GLY 384 LEU 385 GLU 386 VAL 387 LEU 388 GLU 389 GLY 390

Unit 2

MET 1 ARG 2 THR 3 LEU 4 LEU 5 ASP 6 LEU 7 ASP 8 PRO 9 LYS 10 GLY 11 LYS 12 ARG 13 VAL 14 LEU 15 VAL 16 ARG 17 VAL 18 ASP 19 TYR 20 ASN 21 VAL 22 PRO 23 VAL 24 GLN 25 ASP 26 GLY 27 LYS 28 VAL 29 GLN 30 ASP 31 GLU 32 THR 33 ARG 34 ILE 35 LEU 36 GLU 37 SER 38 LEU 39 PRO 40 THR 41 LEU 42 ARG 43 HIS 44 LEU 45 LEU 46 ALA 47 GLY 48 GLY 49 ALA 50 SER 51 LEU 52 VAL 53 LEU 54 LEU 55 SER 56 HIS 57 LEU 58 GLY 59 ARG 60 PRO 61 LYS 62 GLY 63 PRO 64 ASP 65 PRO 66 LYS 67 TYR 68 SER 69 LEU 70 ALA 71 PRO 72 VAL 73 GLY 74 GLU 75 ALA 76 LEU 77 ARG 78 ALA 79 HIS 80 LEU 81 PRO 82 GLU 83 ALA 84 ARG 85 PHE 86 ALA 87 PRO 88 PHE 89 PRO 90 PRO 91 GLY 92 SER 93 GLU 94 GLU 95 ALA 96 ARG 97 ARG 98 GLU 99 ALA 100 GLU 101 ALA 102 LEU 103 ARG 104 PRO 105 GLY 106 GLU 107 VAL 108 LEU 109 LEU 110 LEU 111 GLU 112 ASN 113 VAL 114 ARG 115 PHE 116 GLU 117 PRO 118 GLY 119 GLU 120 GLU 121 LYS 122 ASN 123 ASP 124 PRO 125 GLU 126 LEU 127 SER 128 ALA 129 ARG 130 TYR 131 ALA 132 ARG 133 LEU 134 GLY 135 GLU 136 ALA 137 PHE 138 VAL 139 LEU 140 ASP 141 ALA 142 PHE 143 GLY 144 SER 145 ALA 146 HIS 147 ARG 148 ALA 149 HIS 150 ALA 151 SER 152 VAL 153 VAL 154 GLY 155 VAL 156 ALA 157 ARG 158 LEU 159 LEU 160 PRO 161 ALA 162 TYR 163 ALA 164 GLY 165 PHE 166 LEU 167 MET 168 GLU 169 LYS 170 GLU 171 VAL 172 ARG 173 ALA 174 LEU 175 SER 176 ARG 177 LEU 178 LEU 179 LYS 180 ASP 181 PRO 182 GLU 183 ARG 184 PRO 185 TYR 186 ALA 187 VAL 188 VAL 189 LEU 190 GLY 191 GLY 192 ALA 193 LYS 194 VAL 195 SER 196 ASP 197 LYS 198 ILE 199 GLY 200 VAL 201 ILE 202 GLU 203 SER 204 LEU 205 LEU 206 PRO 207 ARG 208 ILE 209 ASP 210 ARG 211 LEU 212 LEU 213 ILE 214 GLY 215 GLY 216 ALA 217 MET 218 ALA 219 PHE 220 THR 221 PHE 222 LEU 223 LYS 224 ALA 225 LEU 226 GLY 227 GLY 228 GLU 229 VAL 230 GLY 231 ARG 232 SER 233 LEU 234 VAL 235 GLU 236 GLU 237 ASP 238 ARG 239 LEU 240 ASP 241 LEU 242 ALA 243 LYS 244 ASP 245 LEU 246 LEU 247 GLY 248 ARG 249 ALA 250 GLU 251 ALA 252 LEU 253 GLY 254 VAL 255 ARG 256 VAL 257 TYR 258 LEU 259 PRO 260 GLU 261 ASP 262 VAL 263 VAL 264 ALA 265 ALA 266 GLU 267 ARG 268 ILE 269 GLU 270 ALA 271 GLY 272 VAL 273 GLU 274 THR 275 ARG 276 VAL 277 PHE 278 PRO 279 ALA 280 ARG 281 ALA 282 ILE 283 PRO 284 VAL 285 PRO 286 TYR 287 MET 288 GLY 289 LEU 290 ASP 291 ILE 292 GLY 293 PRO 294 LYS 295 THR 296 ARG 297 GLU 298 ALA 299 PHE 300 ALA 301 ARG 302 ALA 303 LEU 304 GLU 305 GLY 306 ALA 307 ARG 308 THR 309 VAL 310 PHE 311 TRP 312 ASN 313 GLY 314 PRO 315 MET 316 GLY 317 VAL 318 PHE 319 GLU 320 VAL 321 PRO 322 PRO 323 PHE 324 ASP 325 GLU 326 GLY 327 THR 328 LEU 329 ALA 330 VAL 331 GLY 332 GLN 333 ALA 334 ILE 335 ALA 336 ALA 337 LEU 338 GLU 339 GLY 340 ALA 341 PHE 342 THR 343 VAL 344 VAL 345 GLY 346 GLY 347 GLY 348 ASP 349 SER 350 VAL 351 ALA 352 ALA 353 VAL 354 ASN 355 ARG 356 LEU 357 GLY 358 LEU 359 LYS 360 GLU 361 ARG 362 PHE 363 GLY 364 HIS 365 VAL 366 SER 367 THR 368 GLY 369 GLY 370 GLY 371 ALA 372 SER 373 LEU 374 GLU 375 PHE 376 LEU 377 GLU 378 LYS 379 GLY 380 THR 381 LEU 382 PRO 383 GLY 384 LEU 385 GLU 386 VAL 387 LEU 388 GLU 389 GLY 390

Ligands

Unit 3	GOL 1401 GOL 1402 NA 1405
Unit 4	GOL 1403 GOL 1404 NA 1406 NA 1407