1SB7 - Sequence, Chains, Asymmetric and Biological Units

• Title: CRYSTAL STRUCTURE OF THE E.COLI PSEUDOURIDINE SYNTHASE TRUD
• Keywords: PSEUDOURIDINE SYNTHASE, LYASE
• Experiment: X-ray diffraction
• Number of Models: 1

Database	ID code	Status	Coordinate files
			Header	Asymmetric unit	Biological unit
PDB	1SB7	released	available	available	Quaternary Structure Server

Asymmetric unit from PDB

Unit	Type	Name	Chain ID	Residues	Atoms	Hetatoms
1	Protein	TRNA PSEUDOURIDINE SYNTHASE D	A	342	2635	32
2	Protein	TRNA PSEUDOURIDINE SYNTHASE D	B	344	2639	32
3	Ligand	TRNA PSEUDOURIDINE SYNTHASE D	A	2	0	12
4	Ligand	TRNA PSEUDOURIDINE SYNTHASE D	B	5	0	29
5	Water			258	0	258
total				951	5274	363

Proteins

Unit 1

HIS 0 MSE 1 ILE 2 GLU 3 PHE 4 ASP 5 ASN 6 LEU 7 THR 8 TYR 9 LEU 10 HIS 11 GLY 12 LYS 13 PRO 14 GLN 15 GLY 16 THR 17 GLY 18 LEU 19 LEU 20 LYS 21 ALA 22 ASN 23 PRO 24 GLU 25 ASP 26 PHE 27 VAL 28 VAL 29 VAL 30 GLU 31 ASP 32 LEU 33 GLY 34 PHE 35 GLU 36 PRO 37 ASP 38 GLY 39 GLU 40 GLY 41 GLU 42 HIS 43 ILE 44 LEU 45 VAL 46 ARG 47 ILE 48 LEU 49 LYS 50 ASN 51 GLY 52 CYS 53 ASN 54 THR 55 ARG 56 PHE 57 VAL 58 ALA 59 ASP 60 ALA 61 LEU 62 ALA 63 LYS 64 PHE 65 LEU 66 LYS 67 ILE 68 HIS 69 ALA 70 ARG 71 GLU 72 VAL 73 SER 74 PHE 75 ALA 76 GLY 77 GLN 78 LYS 79 ASP 80 LYS 81 HIS 82 ALA 83 VAL 84 THR 85 GLU 86 GLN 87 TRP 88 LEU 89 CYS 90 ALA 91 ARG 92 VAL 93 PRO 94 GLY 95 LYS 96 GLU 97 MSE 98 PRO 99 ASP 100 LEU 101 SER 102 ALA 103 PHE 104 GLN 105 LEU 106 GLU 107 GLY 108 CYS 109 GLN 110 VAL 111 LEU 112 GLU 113 TYR 114 ALA 115 ARG 116 HIS 117 LYS 118 ARG 119 LYS 120 LEU 121 ARG 122 LEU 123 GLY 124 ALA 125 LEU 126 LYS 127 GLY 128 ASN 129 ALA 130 PHE 131 THR 132 LEU 133 VAL 134 LEU 135 ARG 136 GLU 137 VAL 138 SER 139 ASN 140 ARG 141 ASP 142 ASP 143 VAL 144 GLU 145 GLN 146 ARG 147 LEU 148 ILE 149 ASP 150 ILE 151 CYS 152 VAL 153 LYS 154 GLY 155 VAL 156 PRO 157 ASN 158 TYR 159 PHE 160 GLY 161 ALA 162 GLN 163 ARG 164 PHE 165 GLY 166 ILE 167 GLY 168 GLY 169 SER 170 ASN 171 LEU 172 GLN 173 GLY 174 ALA 175 GLN 176 ARG 177 TRP 178 ALA 179 GLN 180 THR 181 ASN 182 THR 183 PRO 184 VAL 185 ARG 186 ASP 187 ARG 188 ASN 189 LYS 190 ARG 191 SER 192 PHE 193 TRP 194 LEU 195 SER 196 ALA 197 ALA 198 ARG 199 SER 200 ALA 201 LEU 202 PHE 203 ASN 204 GLN 205 ILE 206 VAL 207 ALA 208 GLU 209 ARG 210 LEU 211 LYS 212 LYS 213 ALA 214 ASP 215 VAL 216 ASN 217 GLN 218 VAL 219 VAL 220 ASP 221 GLY 222 ASP 223 ALA 224 LEU 225 GLN 226 LEU 227 ALA 228 GLY 229 ARG 230 GLY 231 SER 232 TRP 233 PHE 234 VAL 235 ALA 236 THR 237 THR 238 GLU 239 GLU 240 LEU 241 ALA 242 GLU 243 LEU 244 GLN 245 ARG 246 ARG 247 VAL 248 ASN 249 ASP 250 LYS 251 GLU 252 LEU 253 MSE 254 ILE 255 THR 256 ALA 257 ALA 258 LEU 259 PRO 260 GLY 261 SER 262 GLY 263 GLU 264 TRP 265 GLY 266 THR 267 GLN 268 ARG 269 GLU 270 ALA 271 LEU 272 ALA 273 PHE 274 GLU 275 GLN 276 ALA 277 ALA 278 VAL 279 ALA 280 ALA 281 GLU 282 THR 283 GLU 284 LEU 285 GLN 286 ALA 287 LEU 288 LEU 289 VAL 290 ARG 291 GLU 292 LYS 293 VAL 294 GLU 295 ALA 296 ALA 297 ARG 298 ARG 299 ALA 300 MSE 301 LEU 302 LEU 303 TYR 304 PRO 305 GLN 306 GLN 307 LEU 308 SER 309 TRP 310 ASN 311 TRP 312 TRP 313 ASP 314 ASP 315 VAL 316 THR 317 VAL 318 GLU 319 ILE 320 ARG 321 PHE 322 TRP 323 LEU 324 PRO 325 ALA 326 GLY 327 SER 328 PHE 329 ALA 330 THR 331 SER 332 VAL 333 VAL 334 ARG 335 GLU 336 LEU 337 ILE 338 ASN 339 THR 340 THR 341

Unit 2

PRO -4 ARG -3 GLY -2 SER -1 MSE 1 ILE 2 GLU 3 PHE 4 ASP 5 ASN 6 LEU 7 THR 8 TYR 9 LEU 10 HIS 11 GLY 12 LYS 13 PRO 14 GLN 15 GLY 16 THR 17 GLY 18 LEU 19 LEU 20 LYS 21 ALA 22 ASN 23 PRO 24 GLU 25 ASP 26 PHE 27 VAL 28 VAL 29 VAL 30 GLU 31 ASP 32 LEU 33 GLY 34 PHE 35 GLU 36 PRO 37 ASP 38 GLY 39 GLU 40 GLY 41 GLU 42 HIS 43 ILE 44 LEU 45 VAL 46 ARG 47 ILE 48 LEU 49 LYS 50 ASN 51 GLY 52 CYS 53 ASN 54 THR 55 ARG 56 PHE 57 VAL 58 ALA 59 ASP 60 ALA 61 LEU 62 ALA 63 LYS 64 PHE 65 LEU 66 LYS 67 ILE 68 HIS 69 ALA 70 ARG 71 GLU 72 VAL 73 SER 74 PHE 75 ALA 76 GLY 77 GLN 78 LYS 79 ASP 80 LYS 81 HIS 82 ALA 83 VAL 84 THR 85 GLU 86 GLN 87 TRP 88 LEU 89 CYS 90 ALA 91 ARG 92 VAL 93 PRO 94 GLY 95 LYS 96 GLU 97 MSE 98 PRO 99 ASP 100 LEU 101 SER 102 ALA 103 PHE 104 GLN 105 LEU 106 GLU 107 GLY 108 CYS 109 GLN 110 VAL 111 LEU 112 GLU 113 TYR 114 ALA 115 ARG 116 HIS 117 LYS 118 ARG 119 LYS 120 LEU 121 ARG 122 LEU 123 GLY 124 ALA 125 LEU 126 LYS 127 GLY 128 ASN 129 ALA 130 PHE 131 THR 132 LEU 133 VAL 134 LEU 135 ARG 136 GLU 137 VAL 138 SER 139 ASN 140 ARG 141 ASP 142 ASP 143 VAL 144 GLU 145 GLN 146 ARG 147 LEU 148 ILE 149 ASP 150 ILE 151 CYS 152 VAL 153 LYS 154 GLY 155 VAL 156 PRO 157 ASN 158 TYR 159 PHE 160 GLY 161 ALA 162 GLN 163 ARG 164 PHE 165 GLY 166 ILE 167 GLY 168 GLY 169 SER 170 ASN 171 LEU 172 GLN 173 GLY 174 ALA 175 GLN 176 ARG 177 TRP 178 ALA 179 GLN 180 THR 181 ASN 182 THR 183 PRO 184 VAL 185 ARG 186 ASP 187 ARG 188 ASN 189 LYS 190 ARG 191 SER 192 PHE 193 TRP 194 LEU 195 SER 196 ALA 197 ALA 198 ARG 199 SER 200 ALA 201 LEU 202 PHE 203 ASN 204 GLN 205 ILE 206 VAL 207 ALA 208 GLU 209 ARG 210 LEU 211 LYS 212 LYS 213 ALA 214 ASP 215 VAL 216 ASN 217 GLN 218 VAL 219 VAL 220 ASP 221 GLY 222 ASP 223 ALA 224 LEU 225 GLN 226 LEU 227 ALA 228 GLY 229 ARG 230 GLY 231 SER 232 TRP 233 PHE 234 VAL 235 ALA 236 THR 237 THR 238 GLU 239 GLU 240 LEU 241 ALA 242 GLU 243 LEU 244 GLN 245 ARG 246 ARG 247 VAL 248 ASN 249 ASP 250 LYS 251 GLU 252 LEU 253 MSE 254 ILE 255 THR 256 ALA 257 ALA 258 LEU 259 PRO 260 GLY 261 SER 262 GLY 263 GLU 264 TRP 265 GLY 266 THR 267 GLN 268 ARG 269 GLU 270 ALA 271 LEU 272 ALA 273 PHE 274 GLU 275 GLN 276 ALA 277 ALA 278 VAL 279 ALA 280 ALA 281 GLU 282 THR 283 GLU 284 LEU 285 GLN 286 ALA 287 LEU 288 LEU 289 VAL 290 ARG 291 GLU 292 LYS 293 VAL 294 GLU 295 ALA 296 ALA 297 ARG 298 ARG 299 ALA 300 MSE 301 LEU 302 LEU 303 TYR 304 PRO 305 GLN 306 GLN 307 LEU 308 SER 309 TRP 310 ASN 311 TRP 312 TRP 313 ASP 314 ASP 315 VAL 316 THR 317 VAL 318 GLU 319 ILE 320 ARG 321 PHE 322 TRP 323 LEU 324 PRO 325 ALA 326 GLY 327 SER 328 PHE 329 ALA 330 THR 331 SER 332 VAL 333 VAL 334 ARG 335 GLU 336 LEU 337 ILE 338 ASN 339 THR 340

Ligands

Unit 3	GOL 1202 GOL 1203
Unit 4	GOL 1201 GOL 1204 GOL 1205 GOL 1206 PO4 1301