1ODI - Sequence, Chains, Asymmetric and Biological Units

• Title: PURINE NUCLEOSIDE PHOSPHORYLASE FROM THERMUS THERMOPHILUS
• Keywords: TRANSFERASE, NUCLEOSIDE PHOSPHORYLASE, ALPHA-BETA PROTEIN, A RIKEN STRUCTURAL GENOMICS/PROTEOMICS INITIATIVE, RSGI, STRU GENOMICS
• Experiment: X-ray diffraction
• Number of Models: 1

Database	ID code	Status	Coordinate files
			Header	Asymmetric unit	Biological unit
PDB	1ODI	released	available	available	Quaternary Structure Server

Asymmetric unit from PDB

Unit	Type	Name	Chain ID	Residues	Atoms	Hetatoms
1	Protein	PURINE NUCLEOSIDE PHOSPHORYLASE	A	234	1786	0
2	Protein	PURINE NUCLEOSIDE PHOSPHORYLASE	B	234	1786	0
3	Protein	PURINE NUCLEOSIDE PHOSPHORYLASE	C	234	1786	0
4	Protein	PURINE NUCLEOSIDE PHOSPHORYLASE	D	234	1786	0
5	Protein	PURINE NUCLEOSIDE PHOSPHORYLASE	E	234	1786	0
6	Protein	PURINE NUCLEOSIDE PHOSPHORYLASE	F	234	1786	0
7	Ligand	PURINE NUCLEOSIDE PHOSPHORYLASE	A	2	0	24
8	Ligand	PURINE NUCLEOSIDE PHOSPHORYLASE	B	2	0	24
9	Ligand	PURINE NUCLEOSIDE PHOSPHORYLASE	C	3	0	29
10	Ligand	PURINE NUCLEOSIDE PHOSPHORYLASE	D	2	0	24
11	Ligand	PURINE NUCLEOSIDE PHOSPHORYLASE	E	2	0	24
12	Ligand	PURINE NUCLEOSIDE PHOSPHORYLASE	F	3	0	29
13	Water			391	0	391
total				1809	10716	545

Proteins

Unit 1	SER 2 PRO 3 ILE 4 HIS 5 VAL 6 ARG 7 ALA 8 HIS 9 PRO 10 GLY 11 ASP 12 VAL 13 ALA 14 GLU 15 ARG 16 VAL 17 LEU 18 LEU 19 PRO 20 GLY 21 ASP 22 PRO 23 GLY 24 ARG 25 ALA 26 GLU 27 TRP 28 ILE 29 ALA 30 LYS 31 THR 32 PHE 33 LEU 34 GLN 35 ASN 36 PRO 37 ARG 38 ARG 39 TYR 40 ASN 41 ASP 42 HIS 43 ARG 44 GLY 45 LEU 46 TRP 47 GLY 48 TYR 49 THR 50 GLY 51 LEU 52 TYR 53 LYS 54 GLY 55 VAL 56 PRO 57 VAL 58 SER 59 VAL 60 GLN 61 THR 62 THR 63 GLY 64 MET 65 GLY 66 THR 67 PRO 68 SER 69 ALA 70 ALA 71 ILE 72 VAL 73 VAL 74 GLU 75 GLU 76 LEU 77 VAL 78 ARG 79 LEU 80 GLY 81 ALA 82 ARG 83 VAL 84 LEU 85 VAL 86 ARG 87 VAL 88 GLY 89 THR 90 ALA 91 GLY 92 ALA 93 ALA 94 SER 95 SER 96 ASP 97 LEU 98 ALA 99 PRO 100 GLY 101 GLU 102 LEU 103 ILE 104 VAL 105 ALA 106 GLN 107 GLY 108 ALA 109 VAL 110 PRO 111 LEU 112 ASP 113 GLY 114 THR 115 THR 116 ARG 117 GLN 118 TYR 119 LEU 120 GLU 121 GLY 122 ARG 123 PRO 124 TYR 125 ALA 126 PRO 127 VAL 128 PRO 129 ASP 130 PRO 131 GLU 132 VAL 133 PHE 134 ARG 135 ALA 136 LEU 137 TRP 138 ARG 139 ARG 140 ALA 141 GLU 142 ALA 143 LEU 144 GLY 145 TYR 146 PRO 147 HIS 148 ARG 149 VAL 150 GLY 151 LEU 152 VAL 153 ALA 154 SER 155 GLU 156 ASP 157 ALA 158 PHE 159 TYR 160 ALA 161 THR 162 THR 163 PRO 164 GLU 165 GLU 166 ALA 167 ARG 168 ALA 169 TRP 170 ALA 171 ARG 172 TYR 173 GLY 174 VAL 175 LEU 176 ALA 177 PHE 178 GLU 179 MET 180 GLU 181 ALA 182 SER 183 ALA 184 LEU 185 PHE 186 LEU 187 LEU 188 GLY 189 ARG 190 MET 191 ARG 192 GLY 193 VAL 194 ARG 195 THR 196 GLY 197 ALA 198 ILE 199 LEU 200 ALA 201 VAL 202 SER 203 ASN 204 ARG 205 ILE 206 GLY 207 ASP 208 PRO 209 GLU 210 LEU 211 ALA 212 PRO 213 PRO 214 GLU 215 VAL 216 LEU 217 GLN 218 GLU 219 GLY 220 VAL 221 ARG 222 ARG 223 MET 224 VAL 225 GLU 226 VAL 227 ALA 228 LEU 229 GLU 230 ALA 231 VAL 232 LEU 233 GLU 234 VAL 235
Unit 2	SER 2 PRO 3 ILE 4 HIS 5 VAL 6 ARG 7 ALA 8 HIS 9 PRO 10 GLY 11 ASP 12 VAL 13 ALA 14 GLU 15 ARG 16 VAL 17 LEU 18 LEU 19 PRO 20 GLY 21 ASP 22 PRO 23 GLY 24 ARG 25 ALA 26 GLU 27 TRP 28 ILE 29 ALA 30 LYS 31 THR 32 PHE 33 LEU 34 GLN 35 ASN 36 PRO 37 ARG 38 ARG 39 TYR 40 ASN 41 ASP 42 HIS 43 ARG 44 GLY 45 LEU 46 TRP 47 GLY 48 TYR 49 THR 50 GLY 51 LEU 52 TYR 53 LYS 54 GLY 55 VAL 56 PRO 57 VAL 58 SER 59 VAL 60 GLN 61 THR 62 THR 63 GLY 64 MET 65 GLY 66 THR 67 PRO 68 SER 69 ALA 70 ALA 71 ILE 72 VAL 73 VAL 74 GLU 75 GLU 76 LEU 77 VAL 78 ARG 79 LEU 80 GLY 81 ALA 82 ARG 83 VAL 84 LEU 85 VAL 86 ARG 87 VAL 88 GLY 89 THR 90 ALA 91 GLY 92 ALA 93 ALA 94 SER 95 SER 96 ASP 97 LEU 98 ALA 99 PRO 100 GLY 101 GLU 102 LEU 103 ILE 104 VAL 105 ALA 106 GLN 107 GLY 108 ALA 109 VAL 110 PRO 111 LEU 112 ASP 113 GLY 114 THR 115 THR 116 ARG 117 GLN 118 TYR 119 LEU 120 GLU 121 GLY 122 ARG 123 PRO 124 TYR 125 ALA 126 PRO 127 VAL 128 PRO 129 ASP 130 PRO 131 GLU 132 VAL 133 PHE 134 ARG 135 ALA 136 LEU 137 TRP 138 ARG 139 ARG 140 ALA 141 GLU 142 ALA 143 LEU 144 GLY 145 TYR 146 PRO 147 HIS 148 ARG 149 VAL 150 GLY 151 LEU 152 VAL 153 ALA 154 SER 155 GLU 156 ASP 157 ALA 158 PHE 159 TYR 160 ALA 161 THR 162 THR 163 PRO 164 GLU 165 GLU 166 ALA 167 ARG 168 ALA 169 TRP 170 ALA 171 ARG 172 TYR 173 GLY 174 VAL 175 LEU 176 ALA 177 PHE 178 GLU 179 MET 180 GLU 181 ALA 182 SER 183 ALA 184 LEU 185 PHE 186 LEU 187 LEU 188 GLY 189 ARG 190 MET 191 ARG 192 GLY 193 VAL 194 ARG 195 THR 196 GLY 197 ALA 198 ILE 199 LEU 200 ALA 201 VAL 202 SER 203 ASN 204 ARG 205 ILE 206 GLY 207 ASP 208 PRO 209 GLU 210 LEU 211 ALA 212 PRO 213 PRO 214 GLU 215 VAL 216 LEU 217 GLN 218 GLU 219 GLY 220 VAL 221 ARG 222 ARG 223 MET 224 VAL 225 GLU 226 VAL 227 ALA 228 LEU 229 GLU 230 ALA 231 VAL 232 LEU 233 GLU 234 VAL 235
Unit 3	SER 2 PRO 3 ILE 4 HIS 5 VAL 6 ARG 7 ALA 8 HIS 9 PRO 10 GLY 11 ASP 12 VAL 13 ALA 14 GLU 15 ARG 16 VAL 17 LEU 18 LEU 19 PRO 20 GLY 21 ASP 22 PRO 23 GLY 24 ARG 25 ALA 26 GLU 27 TRP 28 ILE 29 ALA 30 LYS 31 THR 32 PHE 33 LEU 34 GLN 35 ASN 36 PRO 37 ARG 38 ARG 39 TYR 40 ASN 41 ASP 42 HIS 43 ARG 44 GLY 45 LEU 46 TRP 47 GLY 48 TYR 49 THR 50 GLY 51 LEU 52 TYR 53 LYS 54 GLY 55 VAL 56 PRO 57 VAL 58 SER 59 VAL 60 GLN 61 THR 62 THR 63 GLY 64 MET 65 GLY 66 THR 67 PRO 68 SER 69 ALA 70 ALA 71 ILE 72 VAL 73 VAL 74 GLU 75 GLU 76 LEU 77 VAL 78 ARG 79 LEU 80 GLY 81 ALA 82 ARG 83 VAL 84 LEU 85 VAL 86 ARG 87 VAL 88 GLY 89 THR 90 ALA 91 GLY 92 ALA 93 ALA 94 SER 95 SER 96 ASP 97 LEU 98 ALA 99 PRO 100 GLY 101 GLU 102 LEU 103 ILE 104 VAL 105 ALA 106 GLN 107 GLY 108 ALA 109 VAL 110 PRO 111 LEU 112 ASP 113 GLY 114 THR 115 THR 116 ARG 117 GLN 118 TYR 119 LEU 120 GLU 121 GLY 122 ARG 123 PRO 124 TYR 125 ALA 126 PRO 127 VAL 128 PRO 129 ASP 130 PRO 131 GLU 132 VAL 133 PHE 134 ARG 135 ALA 136 LEU 137 TRP 138 ARG 139 ARG 140 ALA 141 GLU 142 ALA 143 LEU 144 GLY 145 TYR 146 PRO 147 HIS 148 ARG 149 VAL 150 GLY 151 LEU 152 VAL 153 ALA 154 SER 155 GLU 156 ASP 157 ALA 158 PHE 159 TYR 160 ALA 161 THR 162 THR 163 PRO 164 GLU 165 GLU 166 ALA 167 ARG 168 ALA 169 TRP 170 ALA 171 ARG 172 TYR 173 GLY 174 VAL 175 LEU 176 ALA 177 PHE 178 GLU 179 MET 180 GLU 181 ALA 182 SER 183 ALA 184 LEU 185 PHE 186 LEU 187 LEU 188 GLY 189 ARG 190 MET 191 ARG 192 GLY 193 VAL 194 ARG 195 THR 196 GLY 197 ALA 198 ILE 199 LEU 200 ALA 201 VAL 202 SER 203 ASN 204 ARG 205 ILE 206 GLY 207 ASP 208 PRO 209 GLU 210 LEU 211 ALA 212 PRO 213 PRO 214 GLU 215 VAL 216 LEU 217 GLN 218 GLU 219 GLY 220 VAL 221 ARG 222 ARG 223 MET 224 VAL 225 GLU 226 VAL 227 ALA 228 LEU 229 GLU 230 ALA 231 VAL 232 LEU 233 GLU 234 VAL 235
Unit 4	SER 2 PRO 3 ILE 4 HIS 5 VAL 6 ARG 7 ALA 8 HIS 9 PRO 10 GLY 11 ASP 12 VAL 13 ALA 14 GLU 15 ARG 16 VAL 17 LEU 18 LEU 19 PRO 20 GLY 21 ASP 22 PRO 23 GLY 24 ARG 25 ALA 26 GLU 27 TRP 28 ILE 29 ALA 30 LYS 31 THR 32 PHE 33 LEU 34 GLN 35 ASN 36 PRO 37 ARG 38 ARG 39 TYR 40 ASN 41 ASP 42 HIS 43 ARG 44 GLY 45 LEU 46 TRP 47 GLY 48 TYR 49 THR 50 GLY 51 LEU 52 TYR 53 LYS 54 GLY 55 VAL 56 PRO 57 VAL 58 SER 59 VAL 60 GLN 61 THR 62 THR 63 GLY 64 MET 65 GLY 66 THR 67 PRO 68 SER 69 ALA 70 ALA 71 ILE 72 VAL 73 VAL 74 GLU 75 GLU 76 LEU 77 VAL 78 ARG 79 LEU 80 GLY 81 ALA 82 ARG 83 VAL 84 LEU 85 VAL 86 ARG 87 VAL 88 GLY 89 THR 90 ALA 91 GLY 92 ALA 93 ALA 94 SER 95 SER 96 ASP 97 LEU 98 ALA 99 PRO 100 GLY 101 GLU 102 LEU 103 ILE 104 VAL 105 ALA 106 GLN 107 GLY 108 ALA 109 VAL 110 PRO 111 LEU 112 ASP 113 GLY 114 THR 115 THR 116 ARG 117 GLN 118 TYR 119 LEU 120 GLU 121 GLY 122 ARG 123 PRO 124 TYR 125 ALA 126 PRO 127 VAL 128 PRO 129 ASP 130 PRO 131 GLU 132 VAL 133 PHE 134 ARG 135 ALA 136 LEU 137 TRP 138 ARG 139 ARG 140 ALA 141 GLU 142 ALA 143 LEU 144 GLY 145 TYR 146 PRO 147 HIS 148 ARG 149 VAL 150 GLY 151 LEU 152 VAL 153 ALA 154 SER 155 GLU 156 ASP 157 ALA 158 PHE 159 TYR 160 ALA 161 THR 162 THR 163 PRO 164 GLU 165 GLU 166 ALA 167 ARG 168 ALA 169 TRP 170 ALA 171 ARG 172 TYR 173 GLY 174 VAL 175 LEU 176 ALA 177 PHE 178 GLU 179 MET 180 GLU 181 ALA 182 SER 183 ALA 184 LEU 185 PHE 186 LEU 187 LEU 188 GLY 189 ARG 190 MET 191 ARG 192 GLY 193 VAL 194 ARG 195 THR 196 GLY 197 ALA 198 ILE 199 LEU 200 ALA 201 VAL 202 SER 203 ASN 204 ARG 205 ILE 206 GLY 207 ASP 208 PRO 209 GLU 210 LEU 211 ALA 212 PRO 213 PRO 214 GLU 215 VAL 216 LEU 217 GLN 218 GLU 219 GLY 220 VAL 221 ARG 222 ARG 223 MET 224 VAL 225 GLU 226 VAL 227 ALA 228 LEU 229 GLU 230 ALA 231 VAL 232 LEU 233 GLU 234 VAL 235
Unit 5	SER 2 PRO 3 ILE 4 HIS 5 VAL 6 ARG 7 ALA 8 HIS 9 PRO 10 GLY 11 ASP 12 VAL 13 ALA 14 GLU 15 ARG 16 VAL 17 LEU 18 LEU 19 PRO 20 GLY 21 ASP 22 PRO 23 GLY 24 ARG 25 ALA 26 GLU 27 TRP 28 ILE 29 ALA 30 LYS 31 THR 32 PHE 33 LEU 34 GLN 35 ASN 36 PRO 37 ARG 38 ARG 39 TYR 40 ASN 41 ASP 42 HIS 43 ARG 44 GLY 45 LEU 46 TRP 47 GLY 48 TYR 49 THR 50 GLY 51 LEU 52 TYR 53 LYS 54 GLY 55 VAL 56 PRO 57 VAL 58 SER 59 VAL 60 GLN 61 THR 62 THR 63 GLY 64 MET 65 GLY 66 THR 67 PRO 68 SER 69 ALA 70 ALA 71 ILE 72 VAL 73 VAL 74 GLU 75 GLU 76 LEU 77 VAL 78 ARG 79 LEU 80 GLY 81 ALA 82 ARG 83 VAL 84 LEU 85 VAL 86 ARG 87 VAL 88 GLY 89 THR 90 ALA 91 GLY 92 ALA 93 ALA 94 SER 95 SER 96 ASP 97 LEU 98 ALA 99 PRO 100 GLY 101 GLU 102 LEU 103 ILE 104 VAL 105 ALA 106 GLN 107 GLY 108 ALA 109 VAL 110 PRO 111 LEU 112 ASP 113 GLY 114 THR 115 THR 116 ARG 117 GLN 118 TYR 119 LEU 120 GLU 121 GLY 122 ARG 123 PRO 124 TYR 125 ALA 126 PRO 127 VAL 128 PRO 129 ASP 130 PRO 131 GLU 132 VAL 133 PHE 134 ARG 135 ALA 136 LEU 137 TRP 138 ARG 139 ARG 140 ALA 141 GLU 142 ALA 143 LEU 144 GLY 145 TYR 146 PRO 147 HIS 148 ARG 149 VAL 150 GLY 151 LEU 152 VAL 153 ALA 154 SER 155 GLU 156 ASP 157 ALA 158 PHE 159 TYR 160 ALA 161 THR 162 THR 163 PRO 164 GLU 165 GLU 166 ALA 167 ARG 168 ALA 169 TRP 170 ALA 171 ARG 172 TYR 173 GLY 174 VAL 175 LEU 176 ALA 177 PHE 178 GLU 179 MET 180 GLU 181 ALA 182 SER 183 ALA 184 LEU 185 PHE 186 LEU 187 LEU 188 GLY 189 ARG 190 MET 191 ARG 192 GLY 193 VAL 194 ARG 195 THR 196 GLY 197 ALA 198 ILE 199 LEU 200 ALA 201 VAL 202 SER 203 ASN 204 ARG 205 ILE 206 GLY 207 ASP 208 PRO 209 GLU 210 LEU 211 ALA 212 PRO 213 PRO 214 GLU 215 VAL 216 LEU 217 GLN 218 GLU 219 GLY 220 VAL 221 ARG 222 ARG 223 MET 224 VAL 225 GLU 226 VAL 227 ALA 228 LEU 229 GLU 230 ALA 231 VAL 232 LEU 233 GLU 234 VAL 235
Unit 6	SER 2 PRO 3 ILE 4 HIS 5 VAL 6 ARG 7 ALA 8 HIS 9 PRO 10 GLY 11 ASP 12 VAL 13 ALA 14 GLU 15 ARG 16 VAL 17 LEU 18 LEU 19 PRO 20 GLY 21 ASP 22 PRO 23 GLY 24 ARG 25 ALA 26 GLU 27 TRP 28 ILE 29 ALA 30 LYS 31 THR 32 PHE 33 LEU 34 GLN 35 ASN 36 PRO 37 ARG 38 ARG 39 TYR 40 ASN 41 ASP 42 HIS 43 ARG 44 GLY 45 LEU 46 TRP 47 GLY 48 TYR 49 THR 50 GLY 51 LEU 52 TYR 53 LYS 54 GLY 55 VAL 56 PRO 57 VAL 58 SER 59 VAL 60 GLN 61 THR 62 THR 63 GLY 64 MET 65 GLY 66 THR 67 PRO 68 SER 69 ALA 70 ALA 71 ILE 72 VAL 73 VAL 74 GLU 75 GLU 76 LEU 77 VAL 78 ARG 79 LEU 80 GLY 81 ALA 82 ARG 83 VAL 84 LEU 85 VAL 86 ARG 87 VAL 88 GLY 89 THR 90 ALA 91 GLY 92 ALA 93 ALA 94 SER 95 SER 96 ASP 97 LEU 98 ALA 99 PRO 100 GLY 101 GLU 102 LEU 103 ILE 104 VAL 105 ALA 106 GLN 107 GLY 108 ALA 109 VAL 110 PRO 111 LEU 112 ASP 113 GLY 114 THR 115 THR 116 ARG 117 GLN 118 TYR 119 LEU 120 GLU 121 GLY 122 ARG 123 PRO 124 TYR 125 ALA 126 PRO 127 VAL 128 PRO 129 ASP 130 PRO 131 GLU 132 VAL 133 PHE 134 ARG 135 ALA 136 LEU 137 TRP 138 ARG 139 ARG 140 ALA 141 GLU 142 ALA 143 LEU 144 GLY 145 TYR 146 PRO 147 HIS 148 ARG 149 VAL 150 GLY 151 LEU 152 VAL 153 ALA 154 SER 155 GLU 156 ASP 157 ALA 158 PHE 159 TYR 160 ALA 161 THR 162 THR 163 PRO 164 GLU 165 GLU 166 ALA 167 ARG 168 ALA 169 TRP 170 ALA 171 ARG 172 TYR 173 GLY 174 VAL 175 LEU 176 ALA 177 PHE 178 GLU 179 MET 180 GLU 181 ALA 182 SER 183 ALA 184 LEU 185 PHE 186 LEU 187 LEU 188 GLY 189 ARG 190 MET 191 ARG 192 GLY 193 VAL 194 ARG 195 THR 196 GLY 197 ALA 198 ILE 199 LEU 200 ALA 201 VAL 202 SER 203 ASN 204 ARG 205 ILE 206 GLY 207 ASP 208 PRO 209 GLU 210 LEU 211 ALA 212 PRO 213 PRO 214 GLU 215 VAL 216 LEU 217 GLN 218 GLU 219 GLY 220 VAL 221 ARG 222 ARG 223 MET 224 VAL 225 GLU 226 VAL 227 ALA 228 LEU 229 GLU 230 ALA 231 VAL 232 LEU 233 GLU 234 VAL 235

Ligands

Unit 7	SO4 1236 ADN 1237
Unit 8	SO4 1236 ADN 1237
Unit 9	SO4 1236 SO4 1237 ADN 1238
Unit 10	SO4 1236 ADN 1237
Unit 11	SO4 1236 ADN 1237
Unit 12	SO4 1236 SO4 1237 ADN 1238