1M22 - Sequence, Chains, Asymmetric and Biological Units

• Title: X-RAY STRUCTURE OF NATIVE PEPTIDE AMIDASE FROM STENOTROPHOMO MALTOPHILIA AT 1.4 A
• Keywords: ELEVEN-STRANDED BETA SHEET, COVERED DOUBLE LAYERS OF ALPHA H TOP AND BOTTOM, HYDROLASE
• Experiment: X-ray diffraction
• Number of Models: 1

Database	ID code	Status	Coordinate files
			Header	Asymmetric unit	Biological unit
PDB	1M22	released	available	available	Quaternary Structure Server

Asymmetric unit from PDB

Unit	Type	Name	Chain ID	Residues	Atoms	Hetatoms
1	Protein	PEPTIDE AMIDASE	A	487	3649	0
2	Protein	PEPTIDE AMIDASE	B	487	3649	0
3	Ligand	PEPTIDE AMIDASE	A	1	0	15
4	Ligand	PEPTIDE AMIDASE	B	1	0	15
5	Water			1149	0	1149
total				2125	7298	1179

Proteins

Unit 1

PRO 42 PHE 43 PRO 44 TYR 45 ALA 46 GLU 47 THR 48 ASP 49 VAL 50 ALA 51 ASP 52 LEU 53 GLN 54 ALA 55 ARG 56 MET 57 THR 58 ALA 59 GLY 60 GLU 61 LEU 62 ASP 63 SER 64 THR 65 THR 66 LEU 67 THR 68 GLN 69 ALA 70 TYR 71 LEU 72 GLN 73 ARG 74 ILE 75 ALA 76 ALA 77 LEU 78 ASP 79 ARG 80 THR 81 GLY 82 PRO 83 ARG 84 LEU 85 ARG 86 ALA 87 VAL 88 ILE 89 GLU 90 LEU 91 ASN 92 PRO 93 ASP 94 ALA 95 LEU 96 LYS 97 GLU 98 ALA 99 ALA 100 GLU 101 ARG 102 ASP 103 ARG 104 GLU 105 ARG 106 ARG 107 ASP 108 GLY 109 ARG 110 LEU 111 ARG 112 GLY 113 PRO 114 LEU 115 HIS 116 GLY 117 ILE 118 PRO 119 LEU 120 LEU 121 LEU 122 LYS 123 ASP 124 ASN 125 ILE 126 ASN 127 ALA 128 ALA 129 PRO 130 MET 131 ALA 132 THR 133 SER 134 ALA 135 GLY 136 SER 137 LEU 138 ALA 139 LEU 140 GLN 141 GLY 142 PHE 143 ARG 144 PRO 145 ASP 146 ASP 147 ALA 148 TYR 149 LEU 150 VAL 151 ARG 152 ARG 153 LEU 154 ARG 155 ASP 156 ALA 157 GLY 158 ALA 159 VAL 160 VAL 161 LEU 162 GLY 163 LYS 164 THR 165 ASN 166 LEU 167 SER 168 GLU 169 TRP 170 ALA 171 ASN 172 PHE 173 ARG 174 GLY 175 ASN 176 ASP 177 SER 178 ILE 179 SER 180 GLY 181 TRP 182 SER 183 ALA 184 ARG 185 GLY 186 GLY 187 GLN 188 THR 189 ARG 190 ASN 191 PRO 192 TYR 193 ARG 194 ILE 195 SER 196 HIS 197 SER 198 PRO 199 CYS 200 GLY 201 SER 202 SER 203 SER 204 GLY 205 SER 206 ALA 207 VAL 208 ALA 209 VAL 210 ALA 211 ALA 212 ASN 213 LEU 214 ALA 215 SER 216 VAL 217 ALA 218 ILE 219 GLY 220 THR 221 GLU 222 THR 223 ASP 224 GLY 225 SER 226 ILE 227 VAL 228 CYS 229 PRO 230 ALA 231 ALA 232 ILE 233 ASN 234 GLY 235 VAL 236 VAL 237 GLY 238 LEU 239 LYS 240 PRO 241 THR 242 VAL 243 GLY 244 LEU 245 VAL 246 SER 247 ARG 248 ASP 249 GLY 250 ILE 251 ILE 252 PRO 253 ILE 254 SER 255 PHE 256 SER 257 GLN 258 ASP 259 THR 260 ALA 261 GLY 262 PRO 263 MET 264 ALA 265 ARG 266 SER 267 VAL 268 ALA 269 ASP 270 ALA 271 ALA 272 ALA 273 VAL 274 LEU 275 THR 276 ALA 277 ILE 278 ALA 279 GLY 280 ARG 281 ASP 282 ASP 283 ALA 284 ASP 285 PRO 286 ALA 287 THR 288 ALA 289 THR 290 MET 291 PRO 292 GLY 293 ARG 294 ALA 295 VAL 296 TYR 297 ASP 298 TYR 299 THR 300 ALA 301 ARG 302 LEU 303 ASP 304 PRO 305 GLN 306 GLY 307 LEU 308 ARG 309 GLY 310 LYS 311 ARG 312 ILE 313 GLY 314 LEU 315 LEU 316 GLN 317 THR 318 PRO 319 LEU 320 LEU 321 LYS 322 TYR 323 ARG 324 GLY 325 MET 326 PRO 327 PRO 328 LEU 329 ILE 330 GLU 331 GLN 332 ALA 333 ALA 334 THR 335 GLU 336 LEU 337 ARG 338 ARG 339 ALA 340 GLY 341 ALA 342 VAL 343 VAL 344 VAL 345 PRO 346 VAL 347 GLU 348 LEU 349 PRO 350 ASN 351 GLN 352 GLY 353 ALA 354 TRP 355 ALA 356 GLU 357 ALA 358 GLU 359 ARG 360 THR 361 LEU 362 LEU 363 LEU 364 TYR 365 GLU 366 PHE 367 LYS 368 ALA 369 GLY 370 LEU 371 GLU 372 ARG 373 TYR 374 PHE 375 ASN 376 THR 377 HIS 378 ARG 379 ALA 380 PRO 381 LEU 382 ARG 383 SER 384 LEU 385 ALA 386 ASP 387 LEU 388 ILE 389 ALA 390 PHE 391 ASN 392 GLN 393 ALA 394 HIS 395 SER 396 LYS 397 GLN 398 GLU 399 LEU 400 GLY 401 LEU 402 PHE 403 GLY 404 GLN 405 GLU 406 LEU 407 LEU 408 VAL 409 GLU 410 ALA 411 ASP 412 ALA 413 THR 414 ALA 415 GLY 416 LEU 417 ALA 418 ASP 419 PRO 420 ALA 421 TYR 422 ILE 423 ARG 424 ALA 425 ARG 426 SER 427 ASP 428 ALA 429 ARG 430 ARG 431 LEU 432 ALA 433 GLY 434 PRO 435 GLU 436 GLY 437 ILE 438 ASP 439 ALA 440 ALA 441 LEU 442 ALA 443 ALA 444 HIS 445 GLN 446 LEU 447 ASP 448 ALA 449 LEU 450 VAL 451 ALA 452 PRO 453 THR 454 THR 455 GLY 456 VAL 457 ALA 458 TRP 459 PRO 460 ILE 461 ARG 462 SER 463 ASP 467 PHE 468 PRO 469 GLY 470 GLU 471 SER 472 TYR 473 SER 474 ALA 475 ALA 476 ALA 477 VAL 478 ALA 479 GLY 480 TYR 481 PRO 482 SER 483 LEU 484 THR 485 VAL 486 PRO 487 MET 488 GLY 489 GLN 490 ILE 491 ASP 492 GLY 493 LEU 494 PRO 495 VAL 496 GLY 497 LEU 498 LEU 499 PHE 500 MET 501 GLY 502 THR 503 ALA 504 TRP 505 SER 506 GLU 507 PRO 508 LYS 509 LEU 510 ILE 511 GLU 512 MET 513 ALA 514 TYR 515 ALA 516 TYR 517 GLU 518 GLN 519 ARG 520 THR 521 ARG 522 ALA 523 ARG 524 ARG 525 PRO 526 PRO 527 HIS 528 PHE 529 ASP 530 THR 531

Unit 2

PRO 42 PHE 43 PRO 44 TYR 45 ALA 46 GLU 47 THR 48 ASP 49 VAL 50 ALA 51 ASP 52 LEU 53 GLN 54 ALA 55 ARG 56 MET 57 THR 58 ALA 59 GLY 60 GLU 61 LEU 62 ASP 63 SER 64 THR 65 THR 66 LEU 67 THR 68 GLN 69 ALA 70 TYR 71 LEU 72 GLN 73 ARG 74 ILE 75 ALA 76 ALA 77 LEU 78 ASP 79 ARG 80 THR 81 GLY 82 PRO 83 ARG 84 LEU 85 ARG 86 ALA 87 VAL 88 ILE 89 GLU 90 LEU 91 ASN 92 PRO 93 ASP 94 ALA 95 LEU 96 LYS 97 GLU 98 ALA 99 ALA 100 GLU 101 ARG 102 ASP 103 ARG 104 GLU 105 ARG 106 ARG 107 ASP 108 GLY 109 ARG 110 LEU 111 ARG 112 GLY 113 PRO 114 LEU 115 HIS 116 GLY 117 ILE 118 PRO 119 LEU 120 LEU 121 LEU 122 LYS 123 ASP 124 ASN 125 ILE 126 ASN 127 ALA 128 ALA 129 PRO 130 MET 131 ALA 132 THR 133 SER 134 ALA 135 GLY 136 SER 137 LEU 138 ALA 139 LEU 140 GLN 141 GLY 142 PHE 143 ARG 144 PRO 145 ASP 146 ASP 147 ALA 148 TYR 149 LEU 150 VAL 151 ARG 152 ARG 153 LEU 154 ARG 155 ASP 156 ALA 157 GLY 158 ALA 159 VAL 160 VAL 161 LEU 162 GLY 163 LYS 164 THR 165 ASN 166 LEU 167 SER 168 GLU 169 TRP 170 ALA 171 ASN 172 PHE 173 ARG 174 GLY 175 ASN 176 ASP 177 SER 178 ILE 179 SER 180 GLY 181 TRP 182 SER 183 ALA 184 ARG 185 GLY 186 GLY 187 GLN 188 THR 189 ARG 190 ASN 191 PRO 192 TYR 193 ARG 194 ILE 195 SER 196 HIS 197 SER 198 PRO 199 CYS 200 GLY 201 SER 202 SER 203 SER 204 GLY 205 SER 206 ALA 207 VAL 208 ALA 209 VAL 210 ALA 211 ALA 212 ASN 213 LEU 214 ALA 215 SER 216 VAL 217 ALA 218 ILE 219 GLY 220 THR 221 GLU 222 THR 223 ASP 224 GLY 225 SER 226 ILE 227 VAL 228 CYS 229 PRO 230 ALA 231 ALA 232 ILE 233 ASN 234 GLY 235 VAL 236 VAL 237 GLY 238 LEU 239 LYS 240 PRO 241 THR 242 VAL 243 GLY 244 LEU 245 VAL 246 SER 247 ARG 248 ASP 249 GLY 250 ILE 251 ILE 252 PRO 253 ILE 254 SER 255 PHE 256 SER 257 GLN 258 ASP 259 THR 260 ALA 261 GLY 262 PRO 263 MET 264 ALA 265 ARG 266 SER 267 VAL 268 ALA 269 ASP 270 ALA 271 ALA 272 ALA 273 VAL 274 LEU 275 THR 276 ALA 277 ILE 278 ALA 279 GLY 280 ARG 281 ASP 282 ASP 283 ALA 284 ASP 285 PRO 286 ALA 287 THR 288 ALA 289 THR 290 MET 291 PRO 292 GLY 293 ARG 294 ALA 295 VAL 296 TYR 297 ASP 298 TYR 299 THR 300 ALA 301 ARG 302 LEU 303 ASP 304 PRO 305 GLN 306 GLY 307 LEU 308 ARG 309 GLY 310 LYS 311 ARG 312 ILE 313 GLY 314 LEU 315 LEU 316 GLN 317 THR 318 PRO 319 LEU 320 LEU 321 LYS 322 TYR 323 ARG 324 GLY 325 MET 326 PRO 327 PRO 328 LEU 329 ILE 330 GLU 331 GLN 332 ALA 333 ALA 334 THR 335 GLU 336 LEU 337 ARG 338 ARG 339 ALA 340 GLY 341 ALA 342 VAL 343 VAL 344 VAL 345 PRO 346 VAL 347 GLU 348 LEU 349 PRO 350 ASN 351 GLN 352 GLY 353 ALA 354 TRP 355 ALA 356 GLU 357 ALA 358 GLU 359 ARG 360 THR 361 LEU 362 LEU 363 LEU 364 TYR 365 GLU 366 PHE 367 LYS 368 ALA 369 GLY 370 LEU 371 GLU 372 ARG 373 TYR 374 PHE 375 ASN 376 THR 377 HIS 378 ARG 379 ALA 380 PRO 381 LEU 382 ARG 383 SER 384 LEU 385 ALA 386 ASP 387 LEU 388 ILE 389 ALA 390 PHE 391 ASN 392 GLN 393 ALA 394 HIS 395 SER 396 LYS 397 GLN 398 GLU 399 LEU 400 GLY 401 LEU 402 PHE 403 GLY 404 GLN 405 GLU 406 LEU 407 LEU 408 VAL 409 GLU 410 ALA 411 ASP 412 ALA 413 THR 414 ALA 415 GLY 416 LEU 417 ALA 418 ASP 419 PRO 420 ALA 421 TYR 422 ILE 423 ARG 424 ALA 425 ARG 426 SER 427 ASP 428 ALA 429 ARG 430 ARG 431 LEU 432 ALA 433 GLY 434 PRO 435 GLU 436 GLY 437 ILE 438 ASP 439 ALA 440 ALA 441 LEU 442 ALA 443 ALA 444 HIS 445 GLN 446 LEU 447 ASP 448 ALA 449 LEU 450 VAL 451 ALA 452 PRO 453 THR 454 THR 455 GLY 456 VAL 457 ALA 458 TRP 459 PRO 460 ILE 461 ARG 462 SER 463 ASP 467 PHE 468 PRO 469 GLY 470 GLU 471 SER 472 TYR 473 SER 474 ALA 475 ALA 476 ALA 477 VAL 478 ALA 479 GLY 480 TYR 481 PRO 482 SER 483 LEU 484 THR 485 VAL 486 PRO 487 MET 488 GLY 489 GLN 490 ILE 491 ASP 492 GLY 493 LEU 494 PRO 495 VAL 496 GLY 497 LEU 498 LEU 499 PHE 500 MET 501 GLY 502 THR 503 ALA 504 TRP 505 SER 506 GLU 507 PRO 508 LYS 509 LEU 510 ILE 511 GLU 512 MET 513 ALA 514 TYR 515 ALA 516 TYR 517 GLU 518 GLN 519 ARG 520 THR 521 ARG 522 ALA 523 ARG 524 ARG 525 PRO 526 PRO 527 HIS 528 PHE 529 ASP 530 THR 531

Ligands

Unit 3	EPE 2001
Unit 4	EPE 3001