1JPN - Sequence, Chains, Asymmetric and Biological Units

• Title: GMPPNP COMPLEX OF SRP GTPASE NG DOMAIN
• Keywords: FFH, SRP, GMPPNP, SIGNAL RECOGNITION PARTICLE, SRP54, NG DOMAIN, SIGNALING PROTEIN
• Experiment: X-ray diffraction
• Number of Models: 1

Database	ID code	Status	Coordinate files
			Header	Asymmetric unit	Biological unit
PDB	1JPN	released	available	available	Quaternary Structure Server

Asymmetric unit from PDB

Unit	Type	Name	Chain ID	Residues	Atoms	Hetatoms
1	Protein	SIGNAL RECOGNITION PARTICLE PROTEIN	B	295	2270	0
2	Protein	SIGNAL RECOGNITION PARTICLE PROTEIN	A	296	2278	0
3	Ligand	SIGNAL RECOGNITION PARTICLE PROTEIN	B	4	0	41
4	Ligand	SIGNAL RECOGNITION PARTICLE PROTEIN	A	4	0	41
5	Water			431	0	431
total				1030	4548	513

Proteins

Unit 1

MET 1 PHE 2 GLN 3 GLN 4 LEU 5 SER 6 ALA 7 ARG 8 LEU 9 GLN 10 GLU 11 ALA 12 ILE 13 GLY 14 ARG 15 LEU 16 ARG 17 GLY 18 ARG 19 GLY 20 ARG 21 ILE 22 THR 23 GLU 24 GLU 25 ASP 26 LEU 27 LYS 28 ALA 29 THR 30 LEU 31 ARG 32 GLU 33 ILE 34 ARG 35 ARG 36 ALA 37 LEU 38 MET 39 ASP 40 ALA 41 ASP 42 VAL 43 ASN 44 LEU 45 GLU 46 VAL 47 ALA 48 ARG 49 ASP 50 PHE 51 VAL 52 GLU 53 ARG 54 VAL 55 ARG 56 GLU 57 GLU 58 ALA 59 LEU 60 GLY 61 LYS 62 GLN 63 VAL 64 LEU 65 GLU 66 SER 67 LEU 68 THR 69 PRO 70 ALA 71 GLU 72 VAL 73 ILE 74 LEU 75 ALA 76 THR 77 VAL 78 TYR 79 GLU 80 ALA 81 LEU 82 LYS 83 GLU 84 ALA 85 LEU 86 GLY 87 GLY 88 GLU 89 ALA 90 ARG 91 LEU 92 PRO 93 VAL 94 LEU 95 LYS 96 ASP 97 ARG 98 ASN 99 LEU 100 TRP 101 PHE 102 LEU 103 VAL 104 GLY 105 LEU 106 GLN 107 GLY 108 SER 109 GLY 110 LYS 111 THR 112 THR 113 THR 114 ALA 115 ALA 116 LYS 117 LEU 118 ALA 119 LEU 120 TYR 121 TYR 122 LYS 123 GLY 124 LYS 125 GLY 126 ARG 127 ARG 128 PRO 129 LEU 130 LEU 131 VAL 132 ALA 133 ALA 134 ASP 135 THR 136 GLN 137 ARG 138 PRO 139 ALA 140 ALA 141 ARG 142 GLU 143 GLN 144 LEU 145 ARG 146 LEU 147 LEU 148 GLY 149 GLU 150 LYS 151 VAL 152 GLY 153 VAL 154 PRO 155 VAL 156 LEU 157 GLU 158 VAL 159 MET 160 ASP 161 GLY 162 GLU 163 SER 164 PRO 165 GLU 166 SER 167 ILE 168 ARG 169 ARG 170 ARG 171 VAL 172 GLU 173 GLU 174 LYS 175 ALA 176 ARG 177 LEU 178 GLU 179 ALA 180 ARG 181 ASP 182 LEU 183 ILE 184 LEU 185 VAL 186 ASP 187 THR 188 ALA 189 GLY 190 ARG 191 LEU 192 GLN 193 ILE 194 ASP 195 GLU 196 PRO 197 LEU 198 MET 199 GLY 200 GLU 201 LEU 202 ALA 203 ARG 204 LEU 205 LYS 206 GLU 207 VAL 208 LEU 209 GLY 210 PRO 211 ASP 212 GLU 213 VAL 214 LEU 215 LEU 216 VAL 217 LEU 218 ASP 219 ALA 220 MET 221 THR 222 GLY 223 GLN 224 GLU 225 ALA 226 LEU 227 SER 228 VAL 229 ALA 230 ARG 231 ALA 232 PHE 233 ASP 234 GLU 235 LYS 236 VAL 237 GLY 238 VAL 239 THR 240 GLY 241 LEU 242 VAL 243 LEU 244 THR 245 LYS 246 LEU 247 ASP 248 GLY 249 ASP 250 ALA 251 ARG 252 GLY 253 GLY 254 ALA 255 ALA 256 LEU 257 SER 258 ALA 259 ARG 260 HIS 261 VAL 262 THR 263 GLY 264 LYS 265 PRO 266 ILE 267 TYR 268 PHE 269 ALA 270 GLY 271 VAL 272 SER 273 GLU 274 LYS 275 PRO 276 GLU 277 GLY 278 LEU 279 GLU 280 PRO 281 PHE 282 TYR 283 PRO 284 GLU 285 ARG 286 LEU 287 ALA 288 GLY 289 ARG 290 ILE 291 LEU 292 GLY 293 MET 294 GLY 295

Unit 2

MET 1 PHE 2 GLN 3 GLN 4 LEU 5 SER 6 ALA 7 ARG 8 LEU 9 GLN 10 GLU 11 ALA 12 ILE 13 GLY 14 ARG 15 LEU 16 ARG 17 GLY 18 ARG 19 GLY 20 ARG 21 ILE 22 THR 23 GLU 24 GLU 25 ASP 26 LEU 27 LYS 28 ALA 29 THR 30 LEU 31 ARG 32 GLU 33 ILE 34 ARG 35 ARG 36 ALA 37 LEU 38 MET 39 ASP 40 ALA 41 ASP 42 VAL 43 ASN 44 LEU 45 GLU 46 VAL 47 ALA 48 ARG 49 ASP 50 PHE 51 VAL 52 GLU 53 ARG 54 VAL 55 ARG 56 GLU 57 GLU 58 ALA 59 LEU 60 GLY 61 LYS 62 GLN 63 VAL 64 LEU 65 GLU 66 SER 67 LEU 68 THR 69 PRO 70 ALA 71 GLU 72 VAL 73 ILE 74 LEU 75 ALA 76 THR 77 VAL 78 TYR 79 GLU 80 ALA 81 LEU 82 LYS 83 GLU 84 ALA 85 LEU 86 GLY 87 GLY 88 GLU 89 ALA 90 ARG 91 LEU 92 PRO 93 VAL 94 LEU 95 LYS 96 ASP 97 ARG 98 ASN 99 LEU 100 TRP 101 PHE 102 LEU 103 VAL 104 GLY 105 LEU 106 GLN 107 GLY 108 SER 109 GLY 110 LYS 111 THR 112 THR 113 THR 114 ALA 115 ALA 116 LYS 117 LEU 118 ALA 119 LEU 120 TYR 121 TYR 122 LYS 123 GLY 124 LYS 125 GLY 126 ARG 127 ARG 128 PRO 129 LEU 130 LEU 131 VAL 132 ALA 133 ALA 134 ASP 135 THR 136 GLN 137 ARG 138 PRO 139 ALA 140 ALA 141 ARG 142 GLU 143 GLN 144 LEU 145 ARG 146 LEU 147 LEU 148 GLY 149 GLU 150 LYS 151 VAL 152 GLY 153 VAL 154 PRO 155 VAL 156 LEU 157 GLU 158 VAL 159 MET 160 ASP 161 GLY 162 GLU 163 SER 164 PRO 165 GLU 166 SER 167 ILE 168 ARG 169 ARG 170 ARG 171 VAL 172 GLU 173 GLU 174 LYS 175 ALA 176 ARG 177 LEU 178 GLU 179 ALA 180 ARG 181 ASP 182 LEU 183 ILE 184 LEU 185 VAL 186 ASP 187 THR 188 ALA 189 GLY 190 ARG 191 LEU 192 GLN 193 ILE 194 ASP 195 GLU 196 PRO 197 LEU 198 MET 199 GLY 200 GLU 201 LEU 202 ALA 203 ARG 204 LEU 205 LYS 206 GLU 207 VAL 208 LEU 209 GLY 210 PRO 211 ASP 212 GLU 213 VAL 214 LEU 215 LEU 216 VAL 217 LEU 218 ASP 219 ALA 220 MET 221 THR 222 GLY 223 GLN 224 GLU 225 ALA 226 LEU 227 SER 228 VAL 229 ALA 230 ARG 231 ALA 232 PHE 233 ASP 234 GLU 235 LYS 236 VAL 237 GLY 238 VAL 239 THR 240 GLY 241 LEU 242 VAL 243 LEU 244 THR 245 LYS 246 LEU 247 ASP 248 GLY 249 ASP 250 ALA 251 ARG 252 GLY 253 GLY 254 ALA 255 ALA 256 LEU 257 SER 258 ALA 259 ARG 260 HIS 261 VAL 262 THR 263 GLY 264 LYS 265 PRO 266 ILE 267 TYR 268 PHE 269 ALA 270 GLY 271 VAL 272 SER 273 GLU 274 LYS 275 PRO 276 GLU 277 GLY 278 LEU 279 GLU 280 PRO 281 PHE 282 TYR 283 PRO 284 GLU 285 ARG 286 LEU 287 ALA 288 GLY 289 ARG 290 ILE 291 LEU 292 GLY 293 MET 294 GLY 295 ASP 296

Ligands

Unit 3	CA 900 GNP 910 ACY 950 ACY 951
Unit 4	CA 901 GNP 911 ACY 952 ACY 953