1JJC - Sequence, Chains, Asymmetric and Biological Units

• Title: CRYSTAL STRUCTURE AT 2.6A RESOLUTION OF PHENYLALANYL-TRNA SY COMPLEXED WITH PHENYLALANYL-ADENYLATE IN THE PRESENCE OF MA
• Keywords: HETERODIMER, PHENYLALANYL-TRNA, THERMUS THERMOPHILUS, LIGASE
• Experiment: X-ray diffraction
• Number of Models: 1

Database	ID code	Status	Coordinate files
			Header	Asymmetric unit	Biological unit
PDB	1JJC	released	available	available	Quaternary Structure Server

Asymmetric unit from PDB

Unit	Type	Name	Chain ID	Residues	Atoms	Hetatoms
1	Protein	PHENYLALANYL-TRNA SYNTHETASE ALPHA CHAIN	A	266	2123	0
2	Protein	PHENYLALANYL-TRNA SYNTHETASE BETA CHAIN	B	785	6127	0
3	Ligand	PHENYLALANYL-TRNA SYNTHETASE ALPHA CHAIN	A	1	0	34
4	Ligand	PHENYLALANYL-TRNA SYNTHETASE BETA CHAIN	B	2	0	6
5	Water			289	0	289
total				1343	8250	329

Proteins

Unit 1

ARG 85 VAL 86 ASP 87 VAL 88 SER 89 LEU 90 PRO 91 GLY 92 ALA 93 SER 94 LEU 95 PHE 96 SER 97 GLY 98 GLY 99 LEU 100 HIS 101 PRO 102 ILE 103 THR 104 LEU 105 MET 106 GLU 107 ARG 108 GLU 109 LEU 110 VAL 111 GLU 112 ILE 113 PHE 114 ARG 115 ALA 116 LEU 117 GLY 118 TYR 119 GLN 120 ALA 121 VAL 122 GLU 123 GLY 124 PRO 125 GLU 126 VAL 127 GLU 128 SER 129 GLU 130 PHE 131 PHE 132 ASN 133 PHE 134 ASP 135 ALA 136 LEU 137 ASN 138 ILE 139 PRO 140 GLU 141 HIS 142 HIS 143 PRO 144 ALA 145 ARG 146 ASP 147 MET 148 TRP 149 ASP 150 THR 151 PHE 152 TRP 153 LEU 154 THR 155 GLY 156 GLU 157 GLY 158 PHE 159 ARG 160 LEU 161 GLU 162 GLY 163 PRO 164 LEU 165 GLY 166 GLU 167 GLU 168 VAL 169 GLU 170 GLY 171 ARG 172 LEU 173 LEU 174 LEU 175 ARG 176 THR 177 HIS 178 THR 179 SER 180 PRO 181 MET 182 GLN 183 VAL 184 ARG 185 TYR 186 MET 187 VAL 188 ALA 189 HIS 190 THR 191 PRO 192 PRO 193 PHE 194 ARG 195 ILE 196 VAL 197 VAL 198 PRO 199 GLY 200 ARG 201 VAL 202 PHE 203 ARG 204 PHE 205 GLU 206 GLN 207 THR 208 ASP 209 ALA 210 THR 211 HIS 212 GLU 213 ALA 214 VAL 215 PHE 216 HIS 217 GLN 218 LEU 219 GLU 220 GLY 221 LEU 222 VAL 223 VAL 224 GLY 225 GLU 226 GLY 227 ILE 228 ALA 229 MET 230 ALA 231 HIS 232 LEU 233 LYS 234 GLY 235 ALA 236 ILE 237 TYR 238 GLU 239 LEU 240 ALA 241 GLN 242 ALA 243 LEU 244 PHE 245 GLY 246 PRO 247 ASP 248 SER 249 LYS 250 VAL 251 ARG 252 PHE 253 GLN 254 PRO 255 VAL 256 TYR 257 PHE 258 PRO 259 PHE 260 VAL 261 GLU 262 PRO 263 GLY 264 ALA 265 GLN 266 PHE 267 ALA 268 VAL 269 TRP 270 TRP 271 PRO 272 GLU 273 GLY 274 GLY 275 LYS 276 TRP 277 LEU 278 GLU 279 LEU 280 GLY 281 GLY 282 ALA 283 GLY 284 MET 285 VAL 286 HIS 287 PRO 288 LYS 289 VAL 290 PHE 291 GLN 292 ALA 293 VAL 294 ASP 295 ALA 296 TYR 297 ARG 298 GLU 299 ARG 300 LEU 301 GLY 302 LEU 303 PRO 304 PRO 305 ALA 306 TYR 307 ARG 308 GLY 309 VAL 310 THR 311 GLY 312 PHE 313 ALA 314 PHE 315 GLY 316 LEU 317 GLY 318 VAL 319 GLU 320 ARG 321 LEU 322 ALA 323 MET 324 LEU 325 ARG 326 TYR 327 GLY 328 ILE 329 PRO 330 ASP 331 ILE 332 ARG 333 TYR 334 PHE 335 PHE 336 GLY 337 GLY 338 ARG 339 LEU 340 LYS 341 PHE 342 LEU 343 GLU 344 GLN 345 PHE 346 LYS 347 GLY 348 VAL 349 LEU 350

Unit 2

MET 1 ARG 2 VAL 3 PRO 4 PHE 5 SER 6 TRP 7 LEU 8 LYS 9 ALA 10 TYR 11 VAL 12 PRO 13 GLU 14 LEU 15 GLU 16 SER 17 PRO 18 GLU 19 VAL 20 LEU 21 GLU 22 GLU 23 ARG 24 LEU 25 ALA 26 GLY 27 LEU 28 GLY 29 PHE 30 GLU 31 THR 32 ASP 33 ARG 34 ILE 35 GLU 36 ARG 37 VAL 38 PHE 39 PRO 40 ILE 41 PRO 42 ARG 43 GLY 44 VAL 45 VAL 46 PHE 47 ALA 48 ARG 49 VAL 50 LEU 51 GLU 52 ALA 53 HIS 54 PRO 55 ILE 56 PRO 57 GLY 58 THR 59 ARG 60 LEU 61 LYS 62 ARG 63 LEU 64 VAL 65 LEU 66 ASP 67 ALA 68 GLY 69 ARG 70 THR 71 VAL 72 GLU 73 VAL 74 VAL 75 SER 76 GLY 77 ALA 78 GLU 79 ASN 80 ALA 81 ARG 82 LYS 83 GLY 84 ILE 85 GLY 86 VAL 87 ALA 88 LEU 89 ALA 90 LEU 91 PRO 92 GLY 93 THR 94 GLU 95 LEU 96 PRO 97 GLY 98 LEU 99 GLY 100 GLN 101 LYS 102 VAL 103 GLY 104 GLU 105 ARG 106 VAL 107 ILE 108 GLN 109 GLY 110 VAL 111 ARG 112 SER 113 PHE 114 GLY 115 MET 116 ALA 117 LEU 118 SER 119 PRO 120 ARG 121 GLU 122 LEU 123 GLY 124 VAL 125 GLY 126 GLU 127 TYR 128 GLY 129 GLY 130 GLY 131 LEU 132 LEU 133 GLU 134 PHE 135 PRO 136 GLU 137 ASP 138 ALA 139 LEU 140 PRO 141 PRO 142 GLY 143 THR 144 PRO 145 LEU 146 SER 147 GLU 148 ALA 149 TRP 150 PRO 151 GLU 152 GLU 153 VAL 154 VAL 155 LEU 156 ASP 157 LEU 158 GLU 159 VAL 160 THR 161 PRO 162 ASN 163 ARG 164 PRO 165 ASP 166 ALA 167 LEU 168 GLY 169 LEU 170 LEU 171 GLY 172 LEU 173 ALA 174 ARG 175 ASP 176 LEU 177 HIS 178 ALA 179 LEU 180 GLY 181 TYR 182 ALA 183 LEU 184 VAL 185 GLU 186 PRO 187 GLU 188 ALA 189 ALA 190 LEU 191 LYS 192 ALA 193 GLU 194 ALA 195 LEU 196 PRO 197 LEU 198 PRO 199 PHE 200 ALA 201 LEU 202 LYS 203 VAL 204 GLU 205 ASP 206 PRO 207 GLU 208 GLY 209 ALA 210 PRO 211 HIS 212 PHE 213 THR 214 LEU 215 GLY 216 TYR 217 ALA 218 PHE 219 GLY 220 LEU 221 ARG 222 VAL 223 ALA 224 PRO 225 SER 226 PRO 227 LEU 228 TRP 229 MET 230 GLN 231 ARG 232 ALA 233 LEU 234 PHE 235 ALA 236 ALA 237 GLY 238 MET 239 ARG 240 PRO 241 ILE 242 ASN 243 ASN 244 VAL 245 VAL 246 ASP 247 VAL 248 THR 249 ASN 250 TYR 251 VAL 252 MET 253 LEU 254 GLU 255 ARG 256 ALA 257 GLN 258 PRO 259 MET 260 HIS 261 ALA 262 PHE 263 ASP 264 LEU 265 ARG 266 PHE 267 VAL 268 GLY 269 GLU 270 GLY 271 ILE 272 ALA 273 VAL 274 ARG 275 ARG 276 ALA 277 ARG 278 GLU 279 GLY 280 GLU 281 ARG 282 LEU 283 LYS 284 THR 285 LEU 286 ASP 287 GLY 288 VAL 289 GLU 290 ARG 291 THR 292 LEU 293 HIS 294 PRO 295 GLU 296 ASP 297 LEU 298 VAL 299 ILE 300 ALA 301 GLY 302 TRP 303 ARG 304 GLY 305 GLU 306 GLU 307 SER 308 PHE 309 PRO 310 LEU 311 GLY 312 LEU 313 ALA 314 GLY 315 VAL 316 MET 317 GLY 318 GLY 319 ALA 320 GLU 321 SER 322 GLU 323 VAL 324 ARG 325 GLU 326 ASP 327 THR 328 GLU 329 ALA 330 ILE 331 ALA 332 LEU 333 GLU 334 VAL 335 ALA 336 CYS 337 PHE 338 ASP 339 PRO 340 VAL 341 SER 342 ILE 343 ARG 344 LYS 345 THR 346 ALA 347 ARG 348 ARG 349 HIS 350 GLY 351 LEU 352 ARG 353 THR 354 GLU 355 ALA 356 SER 357 HIS 358 ARG 359 PHE 360 GLU 361 ARG 362 GLY 363 VAL 364 ASP 365 PRO 366 LEU 367 GLY 368 GLN 369 VAL 370 PRO 371 ALA 372 GLN 373 ARG 374 ARG 375 ALA 376 LEU 377 SER 378 LEU 379 LEU 380 GLN 381 ALA 382 LEU 383 ALA 384 GLY 385 ALA 386 ARG 387 VAL 388 ALA 389 GLU 390 ALA 391 LEU 392 LEU 393 GLU 394 ALA 395 GLY 396 SER 397 PRO 398 LYS 399 PRO 400 PRO 401 GLU 402 ALA 403 ILE 404 PRO 405 PHE 406 ARG 407 PRO 408 GLU 409 TYR 410 ALA 411 ASN 412 ARG 413 LEU 414 LEU 415 GLY 416 THR 417 SER 418 TYR 419 PRO 420 GLU 421 ALA 422 GLU 423 GLN 424 ILE 425 ALA 426 ILE 427 LEU 428 LYS 429 ARG 430 LEU 431 GLY 432 CYS 433 ARG 434 VAL 435 GLU 436 GLY 437 GLU 438 GLY 439 PRO 440 THR 441 TYR 442 ARG 443 VAL 444 THR 445 PRO 446 PRO 447 SER 448 HIS 449 ARG 450 LEU 451 ASP 452 LEU 453 ARG 454 LEU 455 GLU 456 GLU 457 ASP 458 LEU 459 VAL 460 GLU 461 GLU 462 VAL 463 ALA 464 ARG 465 ILE 466 GLN 467 GLY 468 TYR 469 GLU 470 THR 471 ILE 472 PRO 473 LEU 474 ALA 475 LEU 476 PRO 477 ALA 478 PHE 479 PHE 480 PRO 481 ALA 482 PRO 483 ASP 484 ASN 485 ARG 486 GLY 487 VAL 488 GLU 489 ALA 490 PRO 491 TYR 492 ARG 493 LYS 494 GLU 495 GLN 496 ARG 497 LEU 498 ARG 499 GLU 500 VAL 501 LEU 502 SER 503 GLY 504 LEU 505 GLY 506 PHE 507 GLN 508 GLU 509 VAL 510 TYR 511 THR 512 TYR 513 SER 514 PHE 515 MET 516 ASP 517 PRO 518 GLU 519 ASP 520 ALA 521 ARG 522 ARG 523 PHE 524 ARG 525 LEU 526 ASP 527 PRO 528 PRO 529 ARG 530 LEU 531 LEU 532 LEU 533 LEU 534 ASN 535 PRO 536 LEU 537 ALA 538 PRO 539 GLU 540 LYS 541 ALA 542 ALA 543 LEU 544 ARG 545 THR 546 HIS 547 LEU 548 PHE 549 PRO 550 GLY 551 LEU 552 VAL 553 ARG 554 VAL 555 LEU 556 LYS 557 GLU 558 ASN 559 LEU 560 ASP 561 LEU 562 ASP 563 ARG 564 PRO 565 GLU 566 ARG 567 ALA 568 LEU 569 LEU 570 PHE 571 GLU 572 VAL 573 GLY 574 ARG 575 VAL 576 PHE 577 ARG 578 GLU 579 ARG 580 GLU 581 GLU 582 THR 583 HIS 584 LEU 585 ALA 586 GLY 587 LEU 588 LEU 589 PHE 590 GLY 591 GLU 592 GLY 593 VAL 594 GLY 595 LEU 596 PRO 597 TRP 598 ALA 599 LYS 600 GLU 601 ARG 602 LEU 603 SER 604 GLY 605 TYR 606 PHE 607 LEU 608 LEU 609 LYS 610 GLY 611 TYR 612 LEU 613 GLU 614 ALA 615 LEU 616 PHE 617 ALA 618 ARG 619 LEU 620 GLY 621 LEU 622 ALA 623 PHE 624 ARG 625 VAL 626 GLU 627 ALA 628 GLN 629 ALA 630 PHE 631 PRO 632 PHE 633 LEU 634 HIS 635 PRO 636 GLY 637 VAL 638 SER 639 GLY 640 ARG 641 VAL 642 LEU 643 VAL 644 GLU 645 GLY 646 GLU 647 GLU 648 VAL 649 GLY 650 PHE 651 LEU 652 GLY 653 ALA 654 LEU 655 HIS 656 PRO 657 GLU 658 ILE 659 ALA 660 GLN 661 GLU 662 LEU 663 GLU 664 LEU 665 PRO 666 PRO 667 VAL 668 HIS 669 LEU 670 PHE 671 GLU 672 LEU 673 ARG 674 LEU 675 PRO 676 LEU 677 PRO 678 ASP 679 LYS 680 PRO 681 LEU 682 ALA 683 PHE 684 GLN 685 ASP 686 PRO 687 SER 688 ARG 689 HIS 690 PRO 691 ALA 692 ALA 693 PHE 694 ARG 695 ASP 696 LEU 697 ALA 698 VAL 699 VAL 700 VAL 701 PRO 702 ALA 703 PRO 704 THR 705 PRO 706 TYR 707 GLY 708 GLU 709 VAL 710 GLU 711 ALA 712 LEU 713 VAL 714 ARG 715 GLU 716 ALA 717 ALA 718 GLY 719 PRO 720 TYR 721 LEU 722 GLU 723 SER 724 LEU 725 ALA 726 LEU 727 PHE 728 ASP 729 LEU 730 TYR 731 GLN 732 GLY 733 PRO 734 PRO 735 LEU 736 PRO 737 GLU 738 GLY 739 HIS 740 LYS 741 SER 742 LEU 743 ALA 744 PHE 745 HIS 746 LEU 747 ARG 748 PHE 749 ARG 750 HIS 751 PRO 752 LYS 753 ARG 754 THR 755 LEU 756 ARG 757 ASP 758 GLU 759 GLU 760 VAL 761 GLU 762 GLU 763 ALA 764 VAL 765 SER 766 ARG 767 VAL 768 ALA 769 GLU 770 ALA 771 LEU 772 ARG 773 ALA 774 ARG 775 GLY 776 PHE 777 GLY 778 LEU 779 ARG 780 GLY 781 LEU 782 ASP 783 THR 784 PRO 785

Ligands

Unit 3	FA5 999
Unit 4	MN 901 SO4 902