1J8F - Sequence, Chains, Asymmetric and Biological Units

• Title: HUMAN SIRT2 HISTONE DEACETYLASE
• Keywords: SIRT2, GENE REGULATION, TRANSFERASE
• Experiment: X-ray diffraction
• Number of Models: 1

Database	ID code	Status	Coordinate files
			Header	Asymmetric unit	Biological unit
PDB	1J8F	released	available	available	Quaternary Structure Server

Asymmetric unit from PDB

Unit	Type	Name	Chain ID	Residues	Atoms	Hetatoms
1	Protein	SIRTUIN 2, ISOFORM 1	A	312	3006	0
2	Protein	SIRTUIN 2, ISOFORM 1	B	312	3007	0
3	Protein	SIRTUIN 2, ISOFORM 1	C	303	2905	0
4	Ligand	SIRTUIN 2, ISOFORM 1	A	1	0	1
5	Ligand	SIRTUIN 2, ISOFORM 1	B	1	0	1
6	Ligand	SIRTUIN 2, ISOFORM 1	C	1	0	1
7	Water			866	0	2598
total				1796	8918	2601

Proteins

Unit 1	GLY 34 GLU 35 ALA 36 ASP 37 MET 38 ASP 39 PHE 40 LEU 41 ARG 42 ASN 43 LEU 44 PHE 45 ARG 57 LEU 58 LEU 59 ASP 60 GLU 61 LEU 62 THR 63 LEU 64 GLU 65 GLY 66 VAL 67 ALA 68 ARG 69 TYR 70 MET 71 GLN 72 SER 73 GLU 74 ARG 75 CYS 76 ARG 77 ARG 78 VAL 79 ILE 80 CYS 81 LEU 82 VAL 83 GLY 84 ALA 85 GLY 86 ILE 87 SER 88 THR 89 SER 90 ALA 91 GLY 92 ILE 93 PRO 94 ASP 95 PHE 96 ARG 97 SER 98 PRO 99 SER 100 THR 101 GLY 102 LEU 103 TYR 104 ASP 105 ASN 106 LEU 107 GLU 108 LYS 109 TYR 110 HIS 111 LEU 112 PRO 113 TYR 114 PRO 115 GLU 116 ALA 117 ILE 118 PHE 119 GLU 120 ILE 121 SER 122 TYR 123 PHE 124 LYS 125 LYS 126 HIS 127 PRO 128 GLU 129 PRO 130 PHE 131 PHE 132 ALA 133 LEU 134 ALA 135 LYS 136 GLU 137 LEU 138 TYR 139 PRO 140 GLY 141 GLN 142 PHE 143 LYS 144 PRO 145 THR 146 ILE 147 CYS 148 HIS 149 TYR 150 PHE 151 MET 152 ARG 153 LEU 154 LEU 155 LYS 156 ASP 157 LYS 158 GLY 159 LEU 160 LEU 161 LEU 162 ARG 163 CYS 164 TYR 165 THR 166 GLN 167 ASN 168 ILE 169 ASP 170 THR 171 LEU 172 GLU 173 ARG 174 ILE 175 ALA 176 GLY 177 LEU 178 GLU 179 GLN 180 GLU 181 ASP 182 LEU 183 VAL 184 GLU 185 ALA 186 HIS 187 GLY 188 THR 189 PHE 190 TYR 191 THR 192 SER 193 HIS 194 CYS 195 VAL 196 SER 197 ALA 198 SER 199 CYS 200 ARG 201 HIS 202 GLU 203 TYR 204 PRO 205 LEU 206 SER 207 TRP 208 MET 209 LYS 210 GLU 211 LYS 212 ILE 213 PHE 214 SER 215 GLU 216 VAL 217 THR 218 PRO 219 LYS 220 CYS 221 GLU 222 ASP 223 CYS 224 GLN 225 SER 226 LEU 227 VAL 228 LYS 229 PRO 230 ASP 231 ILE 232 VAL 233 PHE 234 PHE 235 GLY 236 GLU 237 SER 238 LEU 239 PRO 240 ALA 241 ARG 242 PHE 243 PHE 244 SER 245 CYS 246 MET 247 GLN 248 SER 249 ASP 250 PHE 251 LEU 252 LYS 253 VAL 254 ASP 255 LEU 256 LEU 257 LEU 258 VAL 259 MET 260 GLY 261 THR 262 SER 263 LEU 264 GLN 265 VAL 266 GLN 267 PRO 268 PHE 269 ALA 270 SER 271 LEU 272 ILE 273 SER 274 LYS 275 ALA 276 PRO 277 LEU 278 SER 279 THR 280 PRO 281 ARG 282 LEU 283 LEU 284 ILE 285 ASN 286 LYS 287 GLU 288 LYS 289 ALA 290 GLY 291 GLN 292 SER 293 ASP 294 PRO 295 PHE 296 LEU 297 GLY 298 MET 299 ILE 300 MET 301 GLY 302 LEU 303 GLY 304 GLY 305 GLY 306 MET 307 ASP 308 PHE 309 ASP 310 SER 311 LYS 312 LYS 313 ALA 314 TYR 315 ARG 316 ASP 317 VAL 318 ALA 319 TRP 320 LEU 321 GLY 322 GLU 323 CYS 324 ASP 325 GLN 326 GLY 327 CYS 328 LEU 329 ALA 330 LEU 331 ALA 332 GLU 333 LEU 334 LEU 335 GLY 336 TRP 337 LYS 338 LYS 339 GLU 340 LEU 341 GLU 342 ASP 343 LEU 344 VAL 345 ARG 346 ARG 347 GLU 348 HIS 349 ALA 350 SER 351 ILE 352 ASP 353 ALA 354 GLN 355 SER 356
Unit 2	GLY 34 GLU 35 ALA 36 ASP 37 MET 38 ASP 39 PHE 40 LEU 41 ARG 42 ASN 43 LEU 44 PHE 45 ARG 57 LEU 58 LEU 59 ASP 60 GLU 61 LEU 62 THR 63 LEU 64 GLU 65 GLY 66 VAL 67 ALA 68 ARG 69 TYR 70 MET 71 GLN 72 SER 73 GLU 74 ARG 75 CYS 76 ARG 77 ARG 78 VAL 79 ILE 80 CYS 81 LEU 82 VAL 83 GLY 84 ALA 85 GLY 86 ILE 87 SER 88 THR 89 SER 90 ALA 91 GLY 92 ILE 93 PRO 94 ASP 95 PHE 96 ARG 97 SER 98 PRO 99 SER 100 THR 101 GLY 102 LEU 103 TYR 104 ASP 105 ASN 106 LEU 107 GLU 108 LYS 109 TYR 110 HIS 111 LEU 112 PRO 113 TYR 114 PRO 115 GLU 116 ALA 117 ILE 118 PHE 119 GLU 120 ILE 121 SER 122 TYR 123 PHE 124 LYS 125 LYS 126 HIS 127 PRO 128 GLU 129 PRO 130 PHE 131 PHE 132 ALA 133 LEU 134 ALA 135 LYS 136 GLU 137 LEU 138 TYR 139 PRO 140 GLY 141 GLN 142 PHE 143 LYS 144 PRO 145 THR 146 ILE 147 CYS 148 HIS 149 TYR 150 PHE 151 MET 152 ARG 153 LEU 154 LEU 155 LYS 156 ASP 157 LYS 158 GLY 159 LEU 160 LEU 161 LEU 162 ARG 163 CYS 164 TYR 165 THR 166 GLN 167 ASN 168 ILE 169 ASP 170 THR 171 LEU 172 GLU 173 ARG 174 ILE 175 ALA 176 GLY 177 LEU 178 GLU 179 GLN 180 GLU 181 ASP 182 LEU 183 VAL 184 GLU 185 ALA 186 HIS 187 GLY 188 THR 189 PHE 190 TYR 191 THR 192 SER 193 HIS 194 CYS 195 VAL 196 SER 197 ALA 198 SER 199 CYS 200 ARG 201 HIS 202 GLU 203 TYR 204 PRO 205 LEU 206 SER 207 TRP 208 MET 209 LYS 210 GLU 211 LYS 212 ILE 213 PHE 214 SER 215 GLU 216 VAL 217 THR 218 PRO 219 LYS 220 CYS 221 GLU 222 ASP 223 CYS 224 GLN 225 SER 226 LEU 227 VAL 228 LYS 229 PRO 230 ASP 231 ILE 232 VAL 233 PHE 234 PHE 235 GLY 236 GLU 237 SER 238 LEU 239 PRO 240 ALA 241 ARG 242 PHE 243 PHE 244 SER 245 CYS 246 MET 247 GLN 248 SER 249 ASP 250 PHE 251 LEU 252 LYS 253 VAL 254 ASP 255 LEU 256 LEU 257 LEU 258 VAL 259 MET 260 GLY 261 THR 262 SER 263 LEU 264 GLN 265 VAL 266 GLN 267 PRO 268 PHE 269 ALA 270 SER 271 LEU 272 ILE 273 SER 274 LYS 275 ALA 276 PRO 277 LEU 278 SER 279 THR 280 PRO 281 ARG 282 LEU 283 LEU 284 ILE 285 ASN 286 LYS 287 GLU 288 LYS 289 ALA 290 GLY 291 GLN 292 SER 293 ASP 294 PRO 295 PHE 296 LEU 297 GLY 298 MET 299 ILE 300 MET 301 GLY 302 LEU 303 GLY 304 GLY 305 GLY 306 MET 307 ASP 308 PHE 309 ASP 310 SER 311 LYS 312 LYS 313 ALA 314 TYR 315 ARG 316 ASP 317 VAL 318 ALA 319 TRP 320 LEU 321 GLY 322 GLU 323 CYS 324 ASP 325 GLN 326 GLY 327 CYS 328 LEU 329 ALA 330 LEU 331 ALA 332 GLU 333 LEU 334 LEU 335 GLY 336 TRP 337 LYS 338 LYS 339 GLU 340 LEU 341 GLU 342 ASP 343 LEU 344 VAL 345 ARG 346 ARG 347 GLU 348 HIS 349 ALA 350 SER 351 ILE 352 ASP 353 ALA 354 GLN 355 SER 356
Unit 3	GLN 54 LYS 55 GLU 56 ARG 57 LEU 58 LEU 59 ASP 60 GLU 61 LEU 62 THR 63 LEU 64 GLU 65 GLY 66 VAL 67 ALA 68 ARG 69 TYR 70 MET 71 GLN 72 SER 73 GLU 74 ARG 75 CYS 76 ARG 77 ARG 78 VAL 79 ILE 80 CYS 81 LEU 82 VAL 83 GLY 84 ALA 85 GLY 86 ILE 87 SER 88 THR 89 SER 90 ALA 91 GLY 92 ILE 93 PRO 94 ASP 95 PHE 96 ARG 97 SER 98 PRO 99 SER 100 THR 101 GLY 102 LEU 103 TYR 104 ASP 105 ASN 106 LEU 107 GLU 108 LYS 109 TYR 110 HIS 111 LEU 112 PRO 113 TYR 114 PRO 115 GLU 116 ALA 117 ILE 118 PHE 119 GLU 120 ILE 121 SER 122 TYR 123 PHE 124 LYS 125 LYS 126 HIS 127 PRO 128 GLU 129 PRO 130 PHE 131 PHE 132 ALA 133 LEU 134 ALA 135 LYS 136 GLU 137 LEU 138 TYR 139 PRO 140 GLY 141 GLN 142 PHE 143 LYS 144 PRO 145 THR 146 ILE 147 CYS 148 HIS 149 TYR 150 PHE 151 MET 152 ARG 153 LEU 154 LEU 155 LYS 156 ASP 157 LYS 158 GLY 159 LEU 160 LEU 161 LEU 162 ARG 163 CYS 164 TYR 165 THR 166 GLN 167 ASN 168 ILE 169 ASP 170 THR 171 LEU 172 GLU 173 ARG 174 ILE 175 ALA 176 GLY 177 LEU 178 GLU 179 GLN 180 GLU 181 ASP 182 LEU 183 VAL 184 GLU 185 ALA 186 HIS 187 GLY 188 THR 189 PHE 190 TYR 191 THR 192 SER 193 HIS 194 CYS 195 VAL 196 SER 197 ALA 198 SER 199 CYS 200 ARG 201 HIS 202 GLU 203 TYR 204 PRO 205 LEU 206 SER 207 TRP 208 MET 209 LYS 210 GLU 211 LYS 212 ILE 213 PHE 214 SER 215 GLU 216 VAL 217 THR 218 PRO 219 LYS 220 CYS 221 GLU 222 ASP 223 CYS 224 GLN 225 SER 226 LEU 227 VAL 228 LYS 229 PRO 230 ASP 231 ILE 232 VAL 233 PHE 234 PHE 235 GLY 236 GLU 237 SER 238 LEU 239 PRO 240 ALA 241 ARG 242 PHE 243 PHE 244 SER 245 CYS 246 MET 247 GLN 248 SER 249 ASP 250 PHE 251 LEU 252 LYS 253 VAL 254 ASP 255 LEU 256 LEU 257 LEU 258 VAL 259 MET 260 GLY 261 THR 262 SER 263 LEU 264 GLN 265 VAL 266 GLN 267 PRO 268 PHE 269 ALA 270 SER 271 LEU 272 ILE 273 SER 274 LYS 275 ALA 276 PRO 277 LEU 278 SER 279 THR 280 PRO 281 ARG 282 LEU 283 LEU 284 ILE 285 ASN 286 LYS 287 GLU 288 LYS 289 ALA 290 GLY 291 GLN 292 SER 293 ASP 294 PRO 295 PHE 296 LEU 297 GLY 298 MET 299 ILE 300 MET 301 GLY 302 LEU 303 GLY 304 GLY 305 GLY 306 MET 307 ASP 308 PHE 309 ASP 310 SER 311 LYS 312 LYS 313 ALA 314 TYR 315 ARG 316 ASP 317 VAL 318 ALA 319 TRP 320 LEU 321 GLY 322 GLU 323 CYS 324 ASP 325 GLN 326 GLY 327 CYS 328 LEU 329 ALA 330 LEU 331 ALA 332 GLU 333 LEU 334 LEU 335 GLY 336 TRP 337 LYS 338 LYS 339 GLU 340 LEU 341 GLU 342 ASP 343 LEU 344 VAL 345 ARG 346 ARG 347 GLU 348 HIS 349 ALA 350 SER 351 ILE 352 ASP 353 ALA 354 GLN 355 SER 356

Ligands

Unit 4	ZN 1001
Unit 5	ZN 2001
Unit 6	ZN 3001