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Sequence, Chains, Asymmetric and Biological Units

Title CRYSTAL STRUCTURE OF C14LINKMID/IQN17: A CROSS-LINKED INHIBI HIV-1 ENTRY BOUND TO THE GP41 HYDROPHOBIC POCKET
Keywords GLYCOPROTEIN, HIV ENTRY, INHIBITOR, CROSS-LINK, GP41, COILED
Experiment X-ray diffraction
Number of Models  1


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        Header     Asymmetric unit     Biological unit  

PDB   1GZL     released     available     available     Quaternary Structure Server  


Asymmetric unit from PDB
 Unit     Type     Name   Chain ID   Residues   Atoms   Hetatoms 
1  Protein   FUSION PROTEIN BETWEEN THE HYDROPHOBIC POCKET OF AND GENERAL CONTROL PROTEIN GCN4-PIQI  A 46 381 3
2  Protein   FUSION PROTEIN BETWEEN THE HYDROPHOBIC POCKET OF AND GENERAL CONTROL PROTEIN GCN4-PIQI  B 46 381 3
3  Protein   ENVELOPE GLYCOPROTEIN GP41  C 12 117 0
4  Protein   ENVELOPE GLYCOPROTEIN GP41  D 12 117 0
5  Ligand   FUSION PROTEIN BETWEEN THE HYDROPHOBIC POCKET OF AND GENERAL CONTROL PROTEIN GCN4-PIQI  A 1 0 1
6  Ligand   FUSION PROTEIN BETWEEN THE HYDROPHOBIC POCKET OF AND GENERAL CONTROL PROTEIN GCN4-PIQI  B 1 0 1
7  Ligand   ENVELOPE GLYCOPROTEIN GP41  C 1 0 7
8  Ligand   ENVELOPE GLYCOPROTEIN GP41  D 1 0 7
9 Water     77 0 77
total       197 996 99

Proteins
Unit 1 ACE0 ARG1 MET2 LYS3 GLN4 ILE5 GLU6 ASP7 LYS8 ILE9 GLU10 GLU11 ILE12 GLU13 SER14 LYS15 GLN16 LYS17 LYS18 ILE19 GLU20 ASN21 GLU22 ILE23 ALA24 ARG25 ILE26 LYS27 LYS28 LEU29 LEU30 GLN31 LEU32 THR33 VAL34 TRP35 GLY36 ILE37 LYS38 GLN39 LEU40 GLN41 ALA42 ARG43 ILE44 LEU45
Unit 2 ACE0 ARG1 MET2 LYS3 GLN4 ILE5 GLU6 ASP7 LYS8 ILE9 GLU10 GLU11 ILE12 GLU13 SER14 LYS15 GLN16 LYS17 LYS18 ILE19 GLU20 ASN21 GLU22 ILE23 ALA24 ARG25 ILE26 LYS27 LYS28 LEU29 LEU30 GLN31 LEU32 THR33 VAL34 TRP35 GLY36 ILE37 LYS38 GLN39 LEU40 GLN41 ALA42 ARG43 ILE44 LEU45
Unit 3 TRP628 GLU629 GLU630 TRP631 ASP632 ARG633 GLU634 ILE635 GLU636 ASN637 TYR638 THR639
Unit 4 TRP628 GLU629 GLU630 TRP631 ASP632 ARG633 GLU634 ILE635 GLU636 ASN637 TYR638 THR639

Ligands
Unit 5 CL1046
Unit 6 CL1046
Unit 7 N2P1640
Unit 8 N2P1640

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Perl script:    PDBscan.pl  (15 Sep 2016)
Author:    Peter Slickers  (slickers@leibniz-fli.de),  IMB Jena,  Germany