Jena Library of Biological Macromolecules - Home Page [Image Library Home] [Image Library Entry]

Sequence, Chains, Asymmetric and Biological Units

Title COMPLEX OF VANCOMYCIN WITH DI-ACETYL-LYS-D-ALA-D-ALA
Keywords PEPTIDE-ANTIBIOTIC COMPLEX, GLYCOPEPTIDE, ANTIBIOTIC, VANCOM CELL WALL PRECURSOR, STRUCTURAL PROTEIN-ANTIBIOTIC COMPLEX
Experiment X-ray diffraction
Number of Models  1


   Database       ID code    StatusCoordinate files
        Header     Asymmetric unit     Biological unit  

PDB   1FVM     released     available     available     Quaternary Structure Server  


Asymmetric unit from PDB
 Unit     Type     Name   Chain ID   Residues   Atoms   Hetatoms 
1  Protein   VANCOMYCIN  A 7 8 72
2  Protein   VANCOMYCIN  B 7 8 72
3  Protein   VANCOMYCIN  C 7 8 72
4  Protein   VANCOMYCIN  D 7 8 72
5  Protein   VANCOMYCIN  E 7 8 72
6  Protein   VANCOMYCIN  F 7 8 72
7  Other macromolecule   DI-ACETYL-LYS-D-ALA-D-ALA  G 3 0 26
8  Other macromolecule   DI-ACETYL-LYS-D-ALA-D-ALA  H 3 0 26
9  Other macromolecule   DI-ACETYL-LYS-D-ALA-D-ALA  I 3 0 26
10  Other macromolecule   DI-ACETYL-LYS-D-ALA-D-ALA  J 3 0 26
11  Other macromolecule   DI-ACETYL-LYS-D-ALA-D-ALA  K 3 0 26
12  Other macromolecule   DI-ACETYL-LYS-D-ALA-D-ALA  L 3 0 26
13  Ligand    M 2 0 21
14  Ligand    N 2 0 21
15  Ligand    O 2 0 21
16  Ligand    P 2 0 21
17  Ligand    Q 2 0 21
18  Ligand    R 2 0 21
19 Water     111 0 112
total       183 48 826

Proteins
Unit 1 MLU1 OMZ2 ASN3 GHP4 GHP5 OMY6 3FG7
Unit 2 MLU1 OMZ2 ASN3 GHP4 GHP5 OMY6 3FG7
Unit 3 MLU1 OMZ2 ASN3 GHP4 GHP5 OMY6 3FG7
Unit 4 MLU1 OMZ2 ASN3 GHP4 GHP5 OMY6 3FG7
Unit 5 MLU1 OMZ2 ASN3 GHP4 GHP5 OMY6 3FG7
Unit 6 MLU1 OMZ2 ASN3 GHP4 GHP5 OMY6 3FG7

Other macromolecules
Unit 7 DLS1 DAL2 DAL3
Unit 8 DLS1 DAL2 DAL3
Unit 9 DLS1 DAL2 DAL3
Unit 10 DLS1 DAL2 DAL3
Unit 11 DLS1 DAL2 DAL3
Unit 12 DLS1 DAL2 DAL3

Ligands
Unit 13 BGC1 RER2
Unit 14 BGC1 RER2
Unit 15 BGC1 RER2
Unit 16 BGC1 RER2
Unit 17 BGC1 RER2
Unit 18 BGC1 RER2

Go to    [Image Library Home]    [Image Library Entry]
Perl script:    PDBscan.pl  (15 Sep 2016)
Author:    Peter Slickers  (slickers@leibniz-fli.de),  IMB Jena,  Germany