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Sequence, Chains, Asymmetric and Biological Units

Title CRYSTAL STRUCTURE OF THE EBOLA VIRUS MEMBRANE-FUSION SUBUNIT, GP2, FROM THE ENVELOPE GLYCOPROTEIN ECTODOMAIN
Keywords MEMBRANE FUSION SUBUNIT, VIRAL PROTEIN
Experiment X-ray diffraction
Number of Models  1


   Database       ID code    StatusCoordinate files
        Header     Asymmetric unit     Biological unit  

PDB   1EBO     released     available     available     Quaternary Structure Server  


Asymmetric unit from PDB
 Unit     Type     Name   Chain ID   Residues   Atoms   Hetatoms 
1  Protein   EBOLA VIRUS ENVELOPE PROTEIN CHIMERA CONSISTING OF A FRAGMENT OF GCN4 ZIPPER CLONED N-TERMINAL TO A FRAGMENT OF GP2  A 112 901 0
2  Protein   EBOLA VIRUS ENVELOPE PROTEIN CHIMERA CONSISTING OF A FRAGMENT OF GCN4 ZIPPER CLONED N-TERMINAL TO A FRAGMENT OF GP2  B 112 881 0
3  Protein   EBOLA VIRUS ENVELOPE PROTEIN CHIMERA CONSISTING OF A FRAGMENT OF GCN4 ZIPPER CLONED N-TERMINAL TO A FRAGMENT OF GP2  C 111 893 0
4  Protein   EBOLA VIRUS ENVELOPE PROTEIN CHIMERA CONSISTING OF A FRAGMENT OF GCN4 ZIPPER CLONED N-TERMINAL TO A FRAGMENT OF GP2  D 112 876 0
5  Protein   EBOLA VIRUS ENVELOPE PROTEIN CHIMERA CONSISTING OF A FRAGMENT OF GCN4 ZIPPER CLONED N-TERMINAL TO A FRAGMENT OF GP2  E 111 881 0
6  Protein   EBOLA VIRUS ENVELOPE PROTEIN CHIMERA CONSISTING OF A FRAGMENT OF GCN4 ZIPPER CLONED N-TERMINAL TO A FRAGMENT OF GP2  F 113 894 0
7  Ligand   EBOLA VIRUS ENVELOPE PROTEIN CHIMERA CONSISTING OF A FRAGMENT OF GCN4 ZIPPER CLONED N-TERMINAL TO A FRAGMENT OF GP2  D 1 0 1
8  Ligand   EBOLA VIRUS ENVELOPE PROTEIN CHIMERA CONSISTING OF A FRAGMENT OF GCN4 ZIPPER CLONED N-TERMINAL TO A FRAGMENT OF GP2  F 1 0 1
9  Ligand   EBOLA VIRUS ENVELOPE PROTEIN CHIMERA CONSISTING OF A FRAGMENT OF GCN4 ZIPPER CLONED N-TERMINAL TO A FRAGMENT OF GP2  A 1 0 1
10  Ligand   EBOLA VIRUS ENVELOPE PROTEIN CHIMERA CONSISTING OF A FRAGMENT OF GCN4 ZIPPER CLONED N-TERMINAL TO A FRAGMENT OF GP2  D 1 0 1
11  Ligand   EBOLA VIRUS ENVELOPE PROTEIN CHIMERA CONSISTING OF A FRAGMENT OF GCN4 ZIPPER CLONED N-TERMINAL TO A FRAGMENT OF GP2  B 1 0 1
total       676 5326 5

Proteins
Unit 1 GLN3 ILE4 GLU5 ASP6 LYS7 ILE8 GLU9 GLU10 ILE11 LEU12 SER13 LYS14 ILE15 TYR16 HIS17 ILE18 GLU19 ASN20 GLU21 ILE22 ALA23 ARG24 ILE25 LYS26 LYS27 LEU28 ILE29 GLY30 GLU31 ALA32 ASP51 GLY52 LEU53 ILE54 GLU55 GLY56 LEU57 ARG58 GLN59 LEU60 ALA61 ASN62 GLU63 THR64 THR65 GLN66 ALA67 LEU68 GLN69 LEU70 PHE71 LEU72 ARG73 ALA74 THR75 THR76 GLU77 LEU78 ARG79 THR80 PHE81 SER82 ILE83 LEU84 ASN85 ARG86 LYS87 ALA88 ILE89 ASP90 PHE91 LEU92 LEU93 GLN94 ARG95 TRP96 GLY97 GLY98 THR99 CYS100 HIS101 ILE102 LEU103 GLY104 PRO105 ASP106 CYS107 ARG108 ILE109 GLU110 PRO111 HIS112 ASP113 TRP114 THR115 LYS116 ASN117 ILE118 THR119 ASP120 LYS121 ILE122 ASP123 GLN124 ILE125 ILE126 HIS127 ASP128 PHE129 VAL130 ASP131 LYS132
Unit 2 GLN3 ILE4 GLU5 ASP6 LYS7 ILE8 GLU9 GLU10 ILE11 LEU12 SER13 LYS14 ILE15 TYR16 HIS17 ILE18 GLU19 ASN20 GLU21 ILE22 ALA23 ARG24 ILE25 LYS26 LYS27 LEU28 ILE29 GLY30 GLU31 ALA32 ASP51 GLY52 LEU53 ILE54 GLU55 GLY56 LEU57 ARG58 GLN59 LEU60 ALA61 ASN62 GLU63 THR64 THR65 GLN66 ALA67 LEU68 GLN69 LEU70 PHE71 LEU72 ARG73 ALA74 THR75 THR76 GLU77 LEU78 ARG79 THR80 PHE81 SER82 ILE83 LEU84 ASN85 ARG86 LYS87 ALA88 ILE89 ASP90 PHE91 LEU92 LEU93 GLN94 ARG95 TRP96 GLY97 GLY98 THR99 CYS100 HIS101 ILE102 LEU103 GLY104 PRO105 ASP106 CYS107 ARG108 ILE109 GLU110 PRO111 HIS112 ASP113 TRP114 THR115 LYS116 ASN117 ILE118 THR119 ASP120 LYS121 ILE122 ASP123 GLN124 ILE125 ILE126 HIS127 ASP128 PHE129 VAL130 ASP131 LYS132
Unit 3 GLN3 ILE4 GLU5 ASP6 LYS7 ILE8 GLU9 GLU10 ILE11 LEU12 SER13 LYS14 ILE15 TYR16 HIS17 ILE18 GLU19 ASN20 GLU21 ILE22 ALA23 ARG24 ILE25 LYS26 LYS27 LEU28 ILE29 GLY30 GLU31 ALA32 ASP51 GLY52 LEU53 ILE54 GLU55 GLY56 LEU57 ARG58 GLN59 LEU60 ALA61 ASN62 GLU63 THR64 THR65 GLN66 ALA67 LEU68 GLN69 LEU70 PHE71 LEU72 ARG73 ALA74 THR75 THR76 GLU77 LEU78 ARG79 THR80 PHE81 SER82 ILE83 LEU84 ASN85 ARG86 LYS87 ALA88 ILE89 ASP90 PHE91 LEU92 LEU93 GLN94 ARG95 TRP96 GLY97 GLY98 THR99 CYS100 HIS101 ILE102 LEU103 GLY104 PRO105 ASP106 CYS107 ARG108 ILE109 GLU110 PRO111 HIS112 ASP113 TRP114 THR115 LYS116 ASN117 ILE118 THR119 ASP120 LYS121 ILE122 ASP123 GLN124 ILE125 ILE126 HIS127 ASP128 PHE129 VAL130 ASP131
Unit 4 GLN3 ILE4 GLU5 ASP6 LYS7 ILE8 GLU9 GLU10 ILE11 LEU12 SER13 LYS14 ILE15 TYR16 HIS17 ILE18 GLU19 ASN20 GLU21 ILE22 ALA23 ARG24 ILE25 LYS26 LYS27 LEU28 ILE29 GLY30 GLU31 ALA32 ASP51 GLY52 LEU53 ILE54 GLU55 GLY56 LEU57 ARG58 GLN59 LEU60 ALA61 ASN62 GLU63 THR64 THR65 GLN66 ALA67 LEU68 GLN69 LEU70 PHE71 LEU72 ARG73 ALA74 THR75 THR76 GLU77 LEU78 ARG79 THR80 PHE81 SER82 ILE83 LEU84 ASN85 ARG86 LYS87 ALA88 ILE89 ASP90 PHE91 LEU92 LEU93 GLN94 ARG95 TRP96 GLY97 GLY98 THR99 CYS100 HIS101 ILE102 LEU103 GLY104 PRO105 ASP106 CYS107 ARG108 ILE109 GLU110 PRO111 HIS112 ASP113 TRP114 THR115 LYS116 ASN117 ILE118 THR119 ASP120 LYS121 ILE122 ASP123 GLN124 ILE125 ILE126 HIS127 ASP128 PHE129 VAL130 ASP131 LYS132
Unit 5 GLN3 ILE4 GLU5 ASP6 LYS7 ILE8 GLU9 GLU10 ILE11 LEU12 SER13 LYS14 ILE15 TYR16 HIS17 ILE18 GLU19 ASN20 GLU21 ILE22 ALA23 ARG24 ILE25 LYS26 LYS27 LEU28 ILE29 GLY30 GLU31 ALA32 ASP51 GLY52 LEU53 ILE54 GLU55 GLY56 LEU57 ARG58 GLN59 LEU60 ALA61 ASN62 GLU63 THR64 THR65 GLN66 ALA67 LEU68 GLN69 LEU70 PHE71 LEU72 ARG73 ALA74 THR75 THR76 GLU77 LEU78 ARG79 THR80 PHE81 SER82 ILE83 LEU84 ASN85 ARG86 LYS87 ALA88 ILE89 ASP90 PHE91 LEU92 LEU93 GLN94 ARG95 TRP96 GLY97 GLY98 THR99 CYS100 HIS101 ILE102 LEU103 GLY104 PRO105 ASP106 CYS107 ARG108 ILE109 GLU110 PRO111 HIS112 ASP113 TRP114 THR115 LYS116 ASN117 ILE118 THR119 ASP120 LYS121 ILE122 ASP123 GLN124 ILE125 ILE126 HIS127 ASP128 PHE129 VAL130 ASP131
Unit 6 GLN3 ILE4 GLU5 ASP6 LYS7 ILE8 GLU9 GLU10 ILE11 LEU12 SER13 LYS14 ILE15 TYR16 HIS17 ILE18 GLU19 ASN20 GLU21 ILE22 ALA23 ARG24 ILE25 LYS26 LYS27 LEU28 ILE29 GLY30 GLU31 ALA32 ASP51 GLY52 LEU53 ILE54 GLU55 GLY56 LEU57 ARG58 GLN59 LEU60 ALA61 ASN62 GLU63 THR64 THR65 GLN66 ALA67 LEU68 GLN69 LEU70 PHE71 LEU72 ARG73 ALA74 THR75 THR76 GLU77 LEU78 ARG79 THR80 PHE81 SER82 ILE83 LEU84 ASN85 ARG86 LYS87 ALA88 ILE89 ASP90 PHE91 LEU92 LEU93 GLN94 ARG95 TRP96 GLY97 GLY98 THR99 CYS100 HIS101 ILE102 LEU103 GLY104 PRO105 ASP106 CYS107 ARG108 ILE109 GLU110 PRO111 HIS112 ASP113 TRP114 THR115 LYS116 ASN117 ILE118 THR119 ASP120 LYS121 ILE122 ASP123 GLN124 ILE125 ILE126 HIS127 ASP128 PHE129 VAL130 ASP131 LYS132 THR133

Ligands
Unit 7 ZN150
Unit 8 ZN150
Unit 9 ZN150
Unit 10 CL151
Unit 11 CL150

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Perl script:    PDBscan.pl  (15 Sep 2016)
Author:    Peter Slickers  (slickers@leibniz-fli.de),  IMB Jena,  Germany