1B04 - Sequence, Chains, Asymmetric and Biological Units

• Title: STRUCTURE OF THE ADENYLATION DOMAIN OF AN NAD+ DEPENDENT LIGASE
• Keywords: LIGASE, DNA REPLICATION
• Experiment: X-ray diffraction
• Number of Models: 1

Database	ID code	Status	Coordinate files
			Header	Asymmetric unit	Biological unit
PDB	1B04	released	available	available	Quaternary Structure Server

Asymmetric unit from PDB

Unit	Type	Name	Chain ID	Residues	Atoms	Hetatoms
1	Protein	PROTEIN (DNA LIGASE)	A	310	2464	0
2	Protein	PROTEIN (DNA LIGASE)	B	311	2472	0
3	Water			190	0	190
total				811	4936	190

Proteins

Unit 1

ASP 2 ARG 3 GLN 4 GLN 5 ALA 6 GLU 7 ARG 8 ARG 9 ALA 10 ALA 11 GLU 12 LEU 13 ARG 14 GLU 15 LEU 16 LEU 17 ASN 18 ARG 19 TYR 20 GLY 21 TYR 22 GLU 23 TYR 24 TYR 25 VAL 26 LEU 27 ASP 28 ARG 29 PRO 30 SER 31 VAL 32 PRO 33 ASP 34 ALA 35 GLU 36 TYR 37 ASP 38 ARG 39 LEU 40 MET 41 GLN 42 GLU 43 LEU 44 ILE 45 ALA 46 ILE 47 GLU 48 GLU 49 GLN 50 TYR 51 PRO 52 GLU 53 LEU 54 LYS 55 THR 56 SER 57 ASP 58 SER 59 PRO 60 THR 61 GLN 62 ARG 63 ILE 64 GLY 65 GLY 66 PRO 67 PRO 68 LEU 69 GLU 70 ALA 71 PHE 72 ARG 73 LYS 74 VAL 75 ALA 76 HIS 77 ARG 78 VAL 79 PRO 80 MET 81 MET 82 SER 83 LEU 84 ALA 85 ASN 86 ALA 87 PHE 88 GLY 89 GLU 90 GLY 91 ASP 92 LEU 93 ARG 94 ASP 95 PHE 96 ASP 97 ARG 98 ARG 99 VAL 100 ARG 101 GLN 102 GLU 103 VAL 104 GLY 105 GLU 106 ALA 107 ALA 108 TYR 109 VAL 110 CYS 111 GLU 112 LEU 113 ALA 114 ILE 115 ASP 116 GLY 117 LEU 118 ALA 119 VAL 120 SER 121 VAL 122 ARG 123 TYR 124 GLU 125 ASP 126 GLY 127 TYR 128 PHE 129 VAL 130 GLN 131 GLY 132 ALA 133 THR 134 ARG 135 GLY 136 ASP 137 GLY 138 THR 139 THR 140 GLY 141 GLU 142 ASP 143 ILE 144 THR 145 GLU 146 ASN 147 LEU 148 LYS 149 THR 150 ILE 151 ARG 152 SER 153 LEU 154 PRO 155 LEU 156 ARG 157 LEU 158 LYS 159 GLU 160 PRO 161 VAL 162 SER 163 LEU 164 GLU 165 ALA 166 ARG 167 GLY 168 GLU 169 ALA 170 PHE 171 MET 172 PRO 173 LYS 174 ALA 175 SER 176 PHE 177 LEU 178 ARG 179 LEU 180 ASN 181 GLU 182 GLU 183 ARG 184 LYS 185 ALA 186 ARG 187 GLU 190 LEU 191 PHE 192 ALA 193 ASN 194 PRO 195 ARG 196 ASN 197 ALA 198 ALA 199 ALA 200 GLY 201 SER 202 LEU 203 ARG 204 GLN 205 LEU 206 ASP 207 PRO 208 LYS 209 VAL 210 ALA 211 ALA 212 SER 213 ARG 214 GLN 215 LEU 216 ASP 217 LEU 218 PHE 219 VAL 220 TYR 221 GLY 222 LEU 223 ALA 224 ASP 225 ALA 226 GLU 227 ALA 228 LEU 229 GLY 230 ILE 231 ALA 232 SER 233 HIS 234 SER 235 GLU 236 ALA 237 LEU 238 ASP 239 TYR 240 LEU 241 GLN 242 ALA 243 LEU 244 GLY 245 PHE 246 LYS 247 VAL 248 ASN 249 PRO 250 GLU 251 ARG 252 ARG 253 ARG 254 CYS 255 ALA 256 ASN 257 ILE 258 ASP 259 GLU 260 VAL 261 ILE 262 ALA 263 PHE 264 VAL 265 SER 266 GLU 267 TRP 268 HIS 269 ASP 270 LYS 271 ARG 272 PRO 273 GLN 274 LEU 275 PRO 276 TYR 277 GLU 278 ILE 279 ASP 280 GLY 281 ILE 282 VAL 283 ILE 284 LYS 285 VAL 286 ASP 287 SER 288 PHE 289 ALA 290 GLN 291 GLN 292 ARG 293 ALA 294 LEU 295 GLY 296 ALA 297 THR 298 ALA 299 LYS 300 SER 301 PRO 302 ARG 303 TRP 304 ALA 305 ILE 306 ALA 307 TYR 308 LYS 309 PHE 310 PRO 311 ALA 312 GLU 313

Unit 2

MET 1 ASP 2 ARG 3 GLN 4 GLN 5 ALA 6 GLU 7 ARG 8 ARG 9 ALA 10 ALA 11 GLU 12 LEU 13 ARG 14 GLU 15 LEU 16 LEU 17 ASN 18 ARG 19 TYR 20 GLY 21 TYR 22 GLU 23 TYR 24 TYR 25 VAL 26 LEU 27 ASP 28 ARG 29 PRO 30 SER 31 VAL 32 PRO 33 ASP 34 ALA 35 GLU 36 TYR 37 ASP 38 ARG 39 LEU 40 MET 41 GLN 42 GLU 43 LEU 44 ILE 45 ALA 46 ILE 47 GLU 48 GLU 49 GLN 50 TYR 51 PRO 52 GLU 53 LEU 54 LYS 55 THR 56 SER 57 ASP 58 SER 59 PRO 60 THR 61 GLN 62 ARG 63 ILE 64 GLY 65 GLY 66 PRO 67 PRO 68 LEU 69 GLU 70 ALA 71 PHE 72 ARG 73 LYS 74 VAL 75 ALA 76 HIS 77 ARG 78 VAL 79 PRO 80 MET 81 MET 82 SER 83 LEU 84 ALA 85 ASN 86 ALA 87 PHE 88 GLY 89 GLU 90 GLY 91 ASP 92 LEU 93 ARG 94 ASP 95 PHE 96 ASP 97 ARG 98 ARG 99 VAL 100 ARG 101 GLN 102 GLU 103 VAL 104 GLY 105 GLU 106 ALA 107 ALA 108 TYR 109 VAL 110 CYS 111 GLU 112 LEU 113 ALA 114 ILE 115 ASP 116 GLY 117 LEU 118 ALA 119 VAL 120 SER 121 VAL 122 ARG 123 TYR 124 GLU 125 ASP 126 GLY 127 TYR 128 PHE 129 VAL 130 GLN 131 GLY 132 ALA 133 THR 134 ARG 135 GLY 136 ASP 137 GLY 138 THR 139 THR 140 GLY 141 GLU 142 ASP 143 ILE 144 THR 145 GLU 146 ASN 147 LEU 148 LYS 149 THR 150 ILE 151 ARG 152 SER 153 LEU 154 PRO 155 LEU 156 ARG 157 LEU 158 LYS 159 GLU 160 PRO 161 VAL 162 SER 163 LEU 164 GLU 165 ALA 166 ARG 167 GLY 168 GLU 169 ALA 170 PHE 171 MET 172 PRO 173 LYS 174 ALA 175 SER 176 PHE 177 LEU 178 ARG 179 LEU 180 ASN 181 GLU 182 GLU 183 ARG 184 LYS 185 ALA 186 ARG 187 GLU 190 LEU 191 PHE 192 ALA 193 ASN 194 PRO 195 ARG 196 ASN 197 ALA 198 ALA 199 ALA 200 GLY 201 SER 202 LEU 203 ARG 204 GLN 205 LEU 206 ASP 207 PRO 208 LYS 209 VAL 210 ALA 211 ALA 212 SER 213 ARG 214 GLN 215 LEU 216 ASP 217 LEU 218 PHE 219 VAL 220 TYR 221 GLY 222 LEU 223 ALA 224 ASP 225 ALA 226 GLU 227 ALA 228 LEU 229 GLY 230 ILE 231 ALA 232 SER 233 HIS 234 SER 235 GLU 236 ALA 237 LEU 238 ASP 239 TYR 240 LEU 241 GLN 242 ALA 243 LEU 244 GLY 245 PHE 246 LYS 247 VAL 248 ASN 249 PRO 250 GLU 251 ARG 252 ARG 253 ARG 254 CYS 255 ALA 256 ASN 257 ILE 258 ASP 259 GLU 260 VAL 261 ILE 262 ALA 263 PHE 264 VAL 265 SER 266 GLU 267 TRP 268 HIS 269 ASP 270 LYS 271 ARG 272 PRO 273 GLN 274 LEU 275 PRO 276 TYR 277 GLU 278 ILE 279 ASP 280 GLY 281 ILE 282 VAL 283 ILE 284 LYS 285 VAL 286 ASP 287 SER 288 PHE 289 ALA 290 GLN 291 GLN 292 ARG 293 ALA 294 LEU 295 GLY 296 ALA 297 THR 298 ALA 299 LYS 300 SER 301 PRO 302 ARG 303 TRP 304 ALA 305 ILE 306 ALA 307 TYR 308 LYS 309 PHE 310 PRO 311 ALA 312 GLU 313