1AVF - Sequence, Chains, Asymmetric and Biological Units

• Title: ACTIVATION INTERMEDIATE 2 OF HUMAN GASTRICSIN FROM HUMAN STOMACH
• Keywords: ASPARTYL PROTEASE, GASTRICSIN, ASPARTIC PROTEINASE, INTERMEDIATE, ACTIVATION, ACID
• Experiment: X-ray diffraction
• Number of Models: 1

Database	ID code	Status	Coordinate files
			Header	Asymmetric unit	Biological unit
PDB	1AVF	released	available	available	Quaternary Structure Server

Asymmetric unit from PDB

Unit	Type	Name	Chain ID	Residues	Atoms	Hetatoms
1	Protein	GASTRICSIN	P	21	168	0
2	Protein	GASTRICSIN	A	322	2431	0
3	Protein	GASTRICSIN	Q	22	176	0
4	Protein	GASTRICSIN	J	323	2443	0
5	Ligand	GASTRICSIN	A	1	0	1
6	Water			467	0	467
total				1156	5218	468

Proteins

Unit 1	ALA 1 VAL 2 VAL 3 LYS 4 VAL 5 PRO 6 LEU 7 LYS 8 LYS 9 PHE 10 LYS 11 SER 12 ILE 13 ARG 14 GLU 15 THR 16 MET 17 LYS 18 GLU 19 LYS 20 GLY 21
Unit 2	VAL 2 THR 3 TYR 4 GLU 5 PRO 6 MET 7 ALA 8 TYR 9 MET 10 ASP 11 ALA 12 ALA 13 TYR 14 PHE 15 GLY 16 GLU 17 ILE 18 SER 19 ILE 20 GLY 21 THR 22 PRO 23 PRO 24 GLN 25 ASN 26 PHE 27 LEU 28 VAL 29 LEU 30 PHE 31 ASP 32 THR 33 GLY 34 SER 35 SER 36 ASN 37 LEU 38 TRP 39 VAL 40 PRO 41 SER 42 VAL 43 TYR 44 CYS 45 GLN 46 SER 47 GLN 48 ALA 49 CYS 50 THR 51 SER 52 HIS 53 SER 54 ARG 55 PHE 56 ASN 57 PRO 58 SER 59 GLU 60 SER 61 SER 62 THR 63 TYR 64 SER 65 THR 66 ASN 67 GLY 68 GLN 69 THR 70 PHE 71 SER 72 LEU 73 GLN 74 TYR 75 SER 77 GLY 78 SER 79 LEU 80 THR 81 GLY 82 PHE 83 PHE 84 GLY 85 TYR 86 ASP 87 THR 88 LEU 89 THR 90 VAL 91 GLN 92 SER 93 ILE 94 GLN 95 VAL 96 PRO 97 ASN 98 GLN 99 GLU 100 PHE 101 GLY 102 LEU 103 SER 104 GLU 105 ASN 106 GLU 107 PRO 108 GLY 109 THR 110 ASN 111 PHE 112 VAL 113 TYR 114 ALA 115 GLN 116 PHE 117 ASP 118 GLY 119 ILE 120 MET 121 GLY 122 LEU 123 ALA 124 TYR 125 PRO 126 ALA 127 LEU 128 SER 129 VAL 130 ASP 131 GLU 132 ALA 133 THR 134 THR 135 ALA 136 MET 137 GLN 138 GLY 139 MET 140 VAL 141 GLN 142 GLU 143 GLY 144 ALA 145 LEU 146 THR 147 SER 148 PRO 149 VAL 150 PHE 151 SER 152 VAL 153 TYR 154 LEU 155 SER 156 ASN 157 GLY 163 GLY 164 ALA 165 VAL 166 VAL 167 PHE 168 GLY 169 GLY 170 VAL 171 ASP 172 SER 173 SER 174 LEU 175 TYR 176 THR 177 GLY 178 GLN 179 ILE 180 TYR 181 TRP 182 ALA 183 PRO 184 VAL 185 THR 186 GLN 187 GLU 188 LEU 189 TYR 190 TRP 191 GLN 192 ILE 193 GLY 194 ILE 195 GLU 196 GLU 197 PHE 198 LEU 199 ILE 200 GLY 201 GLY 202 GLN 203 ALA 204 SER 205 GLY 206 TRP 207 CYS 208 SER 209 GLU 210 GLY 211 CYS 212 GLN 213 ALA 214 ILE 215 VAL 216 ASP 217 THR 218 GLY 219 THR 220 SER 221 LEU 222 LEU 223 THR 224 VAL 225 PRO 226 GLN 227 GLN 228 TYR 229 MET 230 SER 231 ALA 232 LEU 233 LEU 234 GLN 235 ALA 236 THR 237 GLY 238 ALA 239 GLN 240 GLU 241 ASP 242 GLU 243 TYR 244 GLY 245 GLN 246 PHE 247 LEU 248 VAL 249 ASN 250 CYS 251 ASN 252 SER 253 ILE 254 GLN 255 ASN 256 LEU 257 PRO 258 SER 259 LEU 260 THR 261 PHE 262 ILE 263 ILE 264 ASN 265 GLY 266 VAL 267 GLU 268 PHE 269 PRO 270 LEU 271 PRO 272 PRO 273 SER 274 SER 275 TYR 276 ILE 277 LEU 278 SER 279 ASN 280 ASN 281 GLY 282 TYR 283 CYS 284 THR 285 VAL 286 GLY 287 VAL 288 GLU 289 PRO 290 THR 291 TYR 292 LEU 293 SER 294 SER 295 GLN 296 ASN 297 GLY 298 GLN 299 PRO 300 LEU 301 TRP 302 ILE 303 LEU 304 GLY 305 ASP 306 VAL 307 PHE 308 LEU 309 ARG 310 SER 311 TYR 312 TYR 313 SER 314 VAL 315 TYR 316 ASP 317 LEU 318 GLY 319 ASN 320 ASN 321 ARG 322 VAL 323 GLY 324 PHE 325 ALA 326 THR 327 ALA 328 ALA 329
Unit 3	ALA 1 VAL 2 VAL 3 LYS 4 VAL 5 PRO 6 LEU 7 LYS 8 LYS 9 PHE 10 LYS 11 SER 12 ILE 13 ARG 14 GLU 15 THR 16 MET 17 LYS 18 GLU 19 LYS 20 GLY 21 LEU 22
Unit 4	VAL 2 THR 3 TYR 4 GLU 5 PRO 6 MET 7 ALA 8 TYR 9 MET 10 ASP 11 ALA 12 ALA 13 TYR 14 PHE 15 GLY 16 GLU 17 ILE 18 SER 19 ILE 20 GLY 21 THR 22 PRO 23 PRO 24 GLN 25 ASN 26 PHE 27 LEU 28 VAL 29 LEU 30 PHE 31 ASP 32 THR 33 GLY 34 SER 35 SER 36 ASN 37 LEU 38 TRP 39 VAL 40 PRO 41 SER 42 VAL 43 TYR 44 CYS 45 GLN 46 SER 47 GLN 48 ALA 49 CYS 50 THR 51 SER 52 HIS 53 SER 54 ARG 55 PHE 56 ASN 57 PRO 58 SER 59 GLU 60 SER 61 SER 62 THR 63 TYR 64 SER 65 THR 66 ASN 67 GLY 68 GLN 69 THR 70 PHE 71 SER 72 LEU 73 GLN 74 TYR 75 GLY 76 SER 77 GLY 78 SER 79 LEU 80 THR 81 GLY 82 PHE 83 PHE 84 GLY 85 TYR 86 ASP 87 THR 88 LEU 89 THR 90 VAL 91 GLN 92 SER 93 ILE 94 GLN 95 VAL 96 PRO 97 ASN 98 GLN 99 GLU 100 PHE 101 GLY 102 LEU 103 SER 104 GLU 105 ASN 106 GLU 107 PRO 108 GLY 109 THR 110 ASN 111 PHE 112 VAL 113 TYR 114 ALA 115 GLN 116 PHE 117 ASP 118 GLY 119 ILE 120 MET 121 GLY 122 LEU 123 ALA 124 TYR 125 PRO 126 ALA 127 LEU 128 SER 129 VAL 130 ASP 131 GLU 132 ALA 133 THR 134 THR 135 ALA 136 MET 137 GLN 138 GLY 139 MET 140 VAL 141 GLN 142 GLU 143 GLY 144 ALA 145 LEU 146 THR 147 SER 148 PRO 149 VAL 150 PHE 151 SER 152 VAL 153 TYR 154 LEU 155 SER 156 ASN 157 GLY 163 GLY 164 ALA 165 VAL 166 VAL 167 PHE 168 GLY 169 GLY 170 VAL 171 ASP 172 SER 173 SER 174 LEU 175 TYR 176 THR 177 GLY 178 GLN 179 ILE 180 TYR 181 TRP 182 ALA 183 PRO 184 VAL 185 THR 186 GLN 187 GLU 188 LEU 189 TYR 190 TRP 191 GLN 192 ILE 193 GLY 194 ILE 195 GLU 196 GLU 197 PHE 198 LEU 199 ILE 200 GLY 201 GLY 202 GLN 203 ALA 204 SER 205 GLY 206 TRP 207 CYS 208 SER 209 GLU 210 GLY 211 CYS 212 GLN 213 ALA 214 ILE 215 VAL 216 ASP 217 THR 218 GLY 219 THR 220 SER 221 LEU 222 LEU 223 THR 224 VAL 225 PRO 226 GLN 227 GLN 228 TYR 229 MET 230 SER 231 ALA 232 LEU 233 LEU 234 GLN 235 ALA 236 THR 237 GLY 238 ALA 239 GLN 240 GLU 241 ASP 242 GLU 243 TYR 244 GLY 245 GLN 246 PHE 247 LEU 248 VAL 249 ASN 250 CYS 251 ASN 252 SER 253 ILE 254 GLN 255 ASN 256 LEU 257 PRO 258 SER 259 LEU 260 THR 261 PHE 262 ILE 263 ILE 264 ASN 265 GLY 266 VAL 267 GLU 268 PHE 269 PRO 270 LEU 271 PRO 272 PRO 273 SER 274 SER 275 TYR 276 ILE 277 LEU 278 SER 279 ASN 280 ASN 281 GLY 282 TYR 283 CYS 284 THR 285 VAL 286 GLY 287 VAL 288 GLU 289 PRO 290 THR 291 TYR 292 LEU 293 SER 294 SER 295 GLN 296 ASN 297 GLY 298 GLN 299 PRO 300 LEU 301 TRP 302 ILE 303 LEU 304 GLY 305 ASP 306 VAL 307 PHE 308 LEU 309 ARG 310 SER 311 TYR 312 TYR 313 SER 314 VAL 315 TYR 316 ASP 317 LEU 318 GLY 319 ASN 320 ASN 321 ARG 322 VAL 323 GLY 324 PHE 325 ALA 326 THR 327 ALA 328 ALA 329

Ligands

Unit 5

NA 330